NC_004611 AY428769 1 TAATATTACCGAATGGCCGCGCAAATTTTTAGGTGGGCCCTCAACCAATG 50 *******||||||||||||||||||||||||*|||||*||*|*||||||| 1 -------ACCGAATGGCCGCGCAAATTTTTATGTGGGACCGCGACCAATG 43 51 AAATTCACGCTACATGGCCTATTTAGTGCGTGGGGATCAATAAATAGACT 100 |||||||*|||*|*||||*|||*||*|||*|||||**|**|||||||||| 44 AAATTCAAGCTTCGTGGCTTATGTAATGCATGGGGTCCTTTAAATAGACT 93 101 TGCTCACCAAGTTTGGATCCACAAACATGTGGGATCCATTATTGCACGAA 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 94 TGCTCACCAAGTTTGGATCCACAAACATGTGGGATCCATTATTGCACGAA 143 151 TTTCCCGAAAGCGTTCATGGTCTAAGGTGCATGCTAGCTGTAAAATATCT 200 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 144 TTTCCAGAAAGCGTTCATGGTCTAAGGTGCATGCTAGCTGTAAAATATCT 193 201 CCAAGAGATAGAAAAGAACTATTCACCAGACACAGTCGGCTACGATCTTA 250 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||* 194 CCAAGAGATAGAAAAGAACTATTCCCCAGACACAGTCGGATACGATCTTG 243 251 TTCGAGATCTCATTCTTGTTCTCCGAGCAAAGAACTATGGCGAAGCGACC 300 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244 TCCGAGATCTCATTCTTGTTCTCCGAGCAAAGAACTATGGCGAAGCGACC 293 301 AGCAGATATCATCATTTCAACGCCCGCATCGAAGGTACGCCGACGTCTCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||| 294 AGCAGATATCATCATTTCAACGCCCGCATCGAAAGTACGCCGTCGTCTCA 343 351 ACTTCGACAGCCCCTATGGAGCTCGTGCAGTTGTCCCCATTGCCCGCGTC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 344 ACTTCGACAGCCCCTATGGAGCTCGTGCAGTTGTCCCCATTGCCCGCGTC 393 401 ACCAAAGCAAAGGCCTGGACCAACAGGCCGATGAACAGAAAACCCAGAAT 450 ||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 394 ACAAAAGCAAAGGCCTGGACAAACAGGCCGATGAACAGAAAACCCAGAAT 443 451 GTACAGAATGTATAGAAGTCCCGACGTGCCAAGGGGCTGTGAAGGCCCTT 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 444 GTACAGAATGTATAGAAGTCCCGACGTGCCAAGGGGATGTGAAGGCCCTT 493 501 GTAAAGTGCAGTCCTTTGAATCTAGGCACGATGTCTCTCATATTGGCAAA 550 |*||*|||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||| 494 GCAAGGTGCAGTCCTTCGAATCCAGGCACGATGTCTCTCATATTGGCAAA 543 551 GTCATGTGTGTTAGTGATGTTACCCGAGGAACTGGACTCACACATCGCGT 600 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 544 GTCATGTGCGTTAGTGATGTTACCCGAGGAACTGGACTCACACATCGCGT 593 601 AGGGAAGCGATTCTGTGTGAAATCTGTCTATGTGCTGGGAAAGATATGGA 650 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 594 AGGAAAGCGATTCTGTGTGAAATCTGTCTATGTGCTGGGGAAGATATGGA 643 651 TGGATGAAAACATCAAGACAAAAAACCATACTAACAGTGTCATGTTTTTT 700 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||| 644 TGGATGAAAACATCAAGACGAAAAACCATACTAACAGTGTTATGTTTTTT 693 701 CTGGTTCGTGACCGTCGTCCTACAGGATCTCCCCAGGATTTCGGGGAAGT 750 *||||*|||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*|||||||| 694 TTGGTCCGTGACCGTCGTCCTACAGGATCCCCCCAAGATTTTGGGGAAGT 743 751 GTTTAATATGTTTGACAATGAACCGAGCACAGCAACGGTGAAGAACATGC 800 *|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 744 TTTTAACATGTTTGACAATGAACCGAGCACAGCAACGGTGAAGAACATGC 793 801 ATCGTGATCGTTATCAAGTCTTACGGAAGTGGCATGCGACTGTGACGGGA 850 |||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||||||||||||||| 794 ATCGTGATCGTTATCAAGTGTTAAGGAAGTGGCATGCGACTGTGACGGGA 843 851 GGAACATATGCATCTAAGGAGCAAGCATTAGTTAGGAAGTTTGTTAGGGT 900 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 844 GGAACATATGCATCTAGGGAGCAAGCATTAGTTAGGAAGTTTGTTAGGGT 893 901 TAATAATTATGTTGTTTATAATCAACAAGAGGCCGGCAAGTATGAGAATC 950 ||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 894 TAATAATTATGTCGTTTACAATCAACAAGAGGCCGGCAAGTATGAGAATC 943 951 ATACTGAAAACGCATTAATGTTGTATATGGCCTGTACTCACGCATCAAAT 1000 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 944 ATACTGAAAACGCATTAATGTTGTACATGGCCTGTACTCACGCATCAAAT 993 1001 CCTGTATATGCTACTTTGAAAATCCGGATCTACTTTTATGATTCGGCCAC 1050 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||*||| 994 CCTGTATATGCTACTTTGAAAATCCGGATCTATTTCTATGATTCGGTCAC 1043 1051 AAATTAATAAATATCCAGTTTTATATCATACGAAGTCCATACATCAATTG 1100 |||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||*| 1044 AAATTAATAAATATCGAGTTTTATATCATATGAAGTCCATACATCAATCG 1093 1101 TTTGCTCCAATACATTATCCAATACATGATAAACTGCTCTTATTACATTA 1150 |*||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1094 TCTGTTCCAATACATTATCCAATACATGATAAACTGCTCTTATTACATTA 1143 1151 TAAATTCCTATGACACCTAACATATCCAGGTACTTAAGGACCTGGGTTTT 1200 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1144 TAAATTCCTATGACACCTAACATATCC-GGTACTTAAGGACCTGGGTTTT 1192 1201 GAAGACTCTCAAGAAAATCCCAATCTGAGGGCGTAAGCCCGTCCAGATTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1193 GAAGACTCTCAAGAAAATCCCAATCTGAGGGCGTAAGCCCGTCCAGATTT 1242 1251 TGAAAGTTAGAAAACACTTGTGAAGTCCCAGGGCTTTCCGCAGGTTGTGG 1300 *||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||| 1243 GGAAAGTTAGAAAACACTTGTGAAGCCCCAGTGCTTTCCGCAGGTTGTGG 1292 1301 TTGAACTGTATTTGAATCTTGATTATGTCGTGCTGTGTTAGGAAGGGCCT 1350 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1293 TTGAATTGTATTTGAATCTTGATTATGTCGTGCTGTGTTAGGAAGGGCCT 1342 1351 GCTGTCGTGTTTCAAAATTTTGAAATACAGGGGATTTCGAATTTCCCAGG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1343 GCTGTCGTGTTTCAAAATTTTGAAATACAGGGGATTTCGAATTTCCCAGG 1392 1401 TATATACGCCACTCTCTGCTCGATCCGCAGTGATGTATTCCCCTGTGCGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1393 TATATACGCCACTCTCTGCTCGATCCGCAGTGATGTATTCCCCTGTGCGT 1442 1451 GAATCCGTGATCATGGCAGTTGATCGATATGTAATACGAACAACCACACG 1500 ||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||||||||||||||| 1443 GAATCCGTGATCATGGCAGTTGATTGATACGTAATACGAACAACCACACG 1492 1501 GTAGATCAACTCGCCTCCTGCGAATGCTCTTCTTCTTCTTCTGGGAGAGC 1550 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1493 GAAGATCAACTCGCCTCCTGCGAATGCTCTTCTTCTTCTTCTGGGGGAGC 1542 1551 GATGTTTTCGCGACCGGAATAGAGTGGTTCTTCGAGTGTGATGAAGACTG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1543 GATGTTTTCGCGACCGGAATAGAGTGGTTCTTCGAGTGTGATGAAGACTG 1592 1601 CATTCTTGATTGCCCACTGCTTCAGTGCTGCATTTTTTTCTTCATCCAGA 1650 ||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||*|||||*|||||| 1593 CATTCTTGATTGCCCAGTGCTTCAGTGCGGCATTCTTCTCTTCGTCCAGA 1642 1651 TATTCCTTATAGCTGCTGTTTGGACCTTTATTGCACAGGAAGATAGTGGG 1700 |||||||*||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||| 1643 TATTCCT-ATAGCTGCTGTTCGGACCTTTATTGCACAGGAATATAGTGGG 1691 1701 AATTCCACCTTTAATCATGACCGGCTTTCCGTACTTCGTGTTGCTTTGGC 1750 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*| 1692 AATTCCACCTTTAATCATGACTGGCTTTCCGTACTTCGTGTTGCTTTGCC 1741 1751 AGTCACGCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGGGGA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1742 AGTCACGCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAATGCTTTAGATAGTGGGGA 1791 1801 TCAACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCATCATTGCTATAGACCTTTGG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1792 TCAACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCATCATTGCTATACACCTTTGG 1841 1851 GCTCAGATCAAGATGTCCACACAAGTAATTGTGTGGTCCTAAGCACCGAG 1900 |||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1842 GCTGAGATCTAGATGTCCACACAAGTAATTGTGTGGTCCTAAGCAACGAG 1891 1901 CCCACATCGTTTTGCCCGTCCTACTATCCCCCTCTATGACTATGCTTATG 1950 |||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||* 1892 CCCACATTGTTTTGCCCGTCCTACTATCCCCCTCTATGACTACACTTATT 1941 1951 GGCCTAAAAGGCCGCGCAGCGGCACACACAACATTAGACGAGACCCAATC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||*||*||*||||*||||||*|| 1942 GGCCTAAAAGGCCGCGCAGCGGCACACACGACGTTCGACGTGACCCAGTC 1991 2001 GACGAGGTCTGCCGGAACTCTGTCGAAGGATGAAATTGAAAATGGAGAAA 2050 ||||||*||||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*| 1992 GACGAGTTCTGGCGGAACTCTGTCGAAGGAAGAAATTGAAAATGGAGAGA 2041 2051 CATAAACCTCGGAAGGAGGTTGAAAAATACGATCTAAATTGGTATTTAAA 2100 |*||||||||*|||*|||||||||||||*|||||||||||*|||*|*||| 2042 CGTAAACCTCTGAACGAGGTTGAAAAATGCGATCTAAATTTGTAATCAAA 2091 2101 TTGTGAAACTGCAGAACGTAATCTTTTGGGGCTAATTCCTTTAATACTCT 2150 |||||||||||||*|||*||*||*|||||*||*|*|||*|||||||||*| 2092 TTGTGAAACTGCAAAACATAGTCCTTTGGTGCAAGTTCTTTTAATACTTT 2141 2151 CAAAGCATCGTCTTTATTTCCCGTGTTAATCGCCTGGGCATATGCATCGT 2200 ||**|||||*|||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||| 2142 CATGGCATCTTCTTTATTTCCTGTGTTAATCGCCTGAGCATATGCATCGT 2191 2201 TCGCCGTTTGTTGACCACCACGGGCAGATCGTCCATCGATCTGGAAAACA 2250 ||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 2192 TCGCCGTTTGCTGACCACCACGAGCAGATCGTCCATCGATCTGGAAAACA 2241 2251 CCCCATTCTAGAACGTCTCCATCTTTGGCGATGTAGTTTTTGACGTCCGA 2300 |||||||||||||*||||||*||||||*|||||||***|||||||||||| 2242 CCCCATTCTAGAATGTCTCCGTCTTTGTCGATGTATGCTTTGACGTCCGA 2291 2301 CGCTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCGACTTG 2350 *|||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2292 TGCTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGTTGACCGACTTG 2341 2351 GGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTTTTGCACTGGAATTTCCCTTCG 2400 ||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||| 2342 GGGACACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTTTTGCATTGGAATTTTCCTTCG 2391 2401 AATTGGATGAGAACATGGATATGCGGAGACCCATCTTCGTGAAGCTCTCT 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||* 2392 AATTGGATGAGAACATGGATATGCGGAGACCCATCCTCGTGAAGCTCTCG 2441 2451 ACAGATCTTGATGAATTTCTTCTTCGTCGGGGTTTCTAGGGTTTGCAATT 2500 ||||||||||||||||||||||***||*||||||||*||||||||*|||| 2442 ACAGATCTTGATGAATTTCTTCGAAGTTGGGGTTTCGAGGGTTTGTAATT 2491 2501 GGGAGAGTGCCTCTTCTTTAGTTAGAGAGCACTTTGGATATGTGAGGAAA 2550 ||||*|||||||||||*||*||*|||||||||||||||||*||||||||| 2492 GGGAAAGTGCCTCTTCCTTTGTAAGAGAGCACTTTGGATACGTGAGGAAA 2541 2551 TAGTTTTTGGCATTTACTCTAAAACGACGTGGCGAAGCCATAAAACTTGT 2600 ||||||||*|||||||*|||||||||||*|||||*||||||||||||*|| 2542 TAGTTTTTCGCATTTATTCTAAAACGACTTGGCGGAGCCATAAAACTAGT 2591 2601 CGTTTTGATTCGGCGTCCCTCAACTTA-TCTATATGATTGGTGTCTGGAG 2649 |||||*|||*|||*|||*||||||||**|||||*|*|||||||||||||| 2592 CGTTTCGATCCGGTGTCTCTCAACTTTCTCTATGTAATTGGTGTCTGGAG 2641 2650 TCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTTTGAAAAGA 2699 |||*||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||| 2642 TCCCATATATAGGTAAGACACCATATGGCAGAATTGTAATTTTGAAAAGA 2691 2700 AAATTACTTTAATTCAAATTCCCTAAAGCGGCCATTCGTA------- 2739 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||******* 2692 AAATTACTTTAATTCAAATTCCCTAAAGCGGCCATTCGTATAATATT 2738