NC_004611 AY286316 1 TAATATTACCGAATGGCCGCGCAAATTTTTAGGTGGGCCCTCAACCAATG 50 *******||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1 -------ACCGAATGGCCGCGCAAATTTTTAGGTGGGCCCTCAACCAATA 43 51 AAATTCACGCTACATGGCCTATTTAGTGCGTGGGGATCAATAAATAGACT 100 ||||||**||||||||||*|*|||**||*|*|||||*||||||||||||| 44 AAATTCGAGCTACATGGCTTCTTTGCTGTGCGGGGACCAATAAATAGACT 93 101 TGCTCACCAAGTTTGGATCCACAAACATGTGGGATCCATTATTGCACGAA 150 |*|||||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 94 TACTCACTAAGTTTGGATCCACAAATATGTGGGATCCATTATTGCACGAA 143 151 TTTCCCGAAAGCGTTCATGGTCTAAGGTGCATGCTAGCTGTAAAATATCT 200 |||||*|||||||||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||| 144 TTTCCAGAAAGCGTTCATGGTGTCAGGTGCATGCTAGCTGTAAAATATCT 193 201 CCAAGAGATAGAAAAGAACTATTCACCAGACACAGTCGGCTACGATCTTA 250 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||* 194 CCAAGAGATAGAAAAGAACTATTCCCCAGACACAGTCGGATACGATCTTG 243 251 TTCGAGATCTCATTCTTGTTCTCCGAGCAAAGAACTATGGCGAAGCGACC 300 |*||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||| 244 TCCGAGATCTAATTCTTGTTCTTCGAGCAAAGAACTATGGTGAAGCGACC 293 301 AGCAGATATCATCATTTCAACGCCCGCATCGAAGGTACGCCGACGTCTCA 350 |||||||||||||*|||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 294 AGCAGATATCATCTTTTCAACGCCCGCATCGAAAGTACGCCGACGTCTCA 343 351 ACTTCGACAGCCCCTATGGAGCTCGTGCAGTTGTCCCCATTGCCCGCGTC 400 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 344 ACTTCGACAGCCCCTTTGGAGCTCGTGCAGTTGTCCCCATTGCCCGCGTC 393 401 ACCAAAGCAAAGGCCTGGACCAACAGGCCGATGAACAGAAAACCCAGAAT 450 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 394 ACAAAAGCAAAGGCCTGGACCAACAGGCCGATGAACAGAAAACCCAGAAT 443 451 GTACAGAATGTATAGAAGTCCCGACGTGCCAAGGGGCTGTGAAGGCCCTT 500 *|||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*|||| 444 ATACAGAATGTATAGAAGTCCCGACGTGCCAAGGGGATGCGAAGGTCCTT 493 501 GTAAAGTGCAGTCCTTTGAATCTAGGCACGATGTCTCTCATATTGGCAAA 550 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 494 GTAAGGTGCAGTCCTTTGAATCTAGGCACGATGTCTCTCATATTGGCAAA 543 551 GTCATGTGTGTTAGTGATGTTACCCGAGGAACTGGACTCACACATCGCGT 600 |||||||||||||||||||||||||||||**||||||||||*|||||||| 544 GTCATGTGTGTTAGTGATGTTACCCGAGGTTCTGGACTCACTCATCGCGT 593 601 AGGGAAGCGATTCTGTGTGAAATCTGTCTATGTGCTGGGAAAGATATGGA 650 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 594 AGGGAAGCGATTTTGTGTGAAATCTGTCTATGTGCTGGGGAAGATATGGA 643 651 TGGATGAAAACATCAAGACAAAAAACCATACTAACAGTGTCATGTTTTTT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 644 TGGATGAAAACATCAAGACAAAAAACCATACTAACAGTGTCATGTTTTTT 693 701 CTGGTTCGTGACCGTCGTCCTACAGGATCTCCCCAGGATTTCGGGGAAGT 750 *||||*||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*|||||||| 694 TTGGTCCGTGACCGTCGTCCTACAGGATCTCCACAAGATTTTGGGGAAGT 743 751 GTTTAATATGTTTGACAATGAACCGAGCACAGCAACGGTGAAGAACATGC 800 *|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 744 TTTTAACATGTTTGACAATGAACCGAGCACAGCAACGGTGAAGAACATGC 793 801 ATCGTGATCGTTATCAAGTCTTACGGAAGTGGCATGCGACTGTGACGGGA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 794 ATCGTGATCGTTATCAAGTCTTACGGAAGTGGCATGCTACTGTGACGGGA 843 851 GGAACATATGCATCTAAGGAGCAAGCATTAGTTAGGAAGTTTGTTAGGGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 844 GGAACATATGCATCTAAGGAGCAAGCATTAGTTAGCAAGTTTGTTAGGGT 893 901 TAATAATTATGTTGTTTATAATCAACAAGAGGCCGGCAAGTATGAGAATC 950 |||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||| 894 TAATAATTATGTTGTGTATAACCAACAAGAGGCCGGCAAGTATGAGAATC 943 951 ATACTGAAAACGCATTAATGTTGTATATGGCCTGTACTCACGCATCAAAT 1000 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 944 ATACTGAAAACGCATTAATGTTGTATATGGCCTGTACTCATGCATCAAAT 993 1001 CCTGTATATGCTACTTTGAAAATCCGGATCTACTTTTATGATTCGGCCAC 1050 |||||*||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||**|| 994 CCTGTGTATGCTACTTTGAAAATCCGGATCTATTTCTATGATTCGGTAAC 1043 1051 AAATTAATAAATATCCAGTTTTATATCATACGAAGTCCATACATCAATTG 1100 |||||||||||||||*||||||||||||||*|||||*|||||||||||*| 1044 AAATTAATAAATATCGAGTTTTATATCATATGAAGTACATACATCAATCG 1093 1101 TTTGCTCCAATACATTATCCAATACATGATAAACTGCTCTTATTACATTA 1150 ||||*||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1094 TTTGTTCCATTACATTATCCAATACATGATAAACTGCTCTTATTACATTA 1143 1151 TAAATTCCTATGACACCTAACATATCCAGGTACTTAAGGACCTGGGTTTT 1200 |||||||||||*|||||*|*|||||||||||||*||||||||||*||||| 1144 TAAATTCCTATTACACCAACCATATCCAGGTACCTAAGGACCTGTGTTTT 1193 1201 GAAGACTCTCAAGAAAATCCCAATCTGAGGGCGTAAGCCCGTCCAGATTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1194 GAAGACTCTCAAGAAAATCCCAATCTGAGGGCGTAAGCCCGTCCAGATTT 1243 1251 TGAAAGTTAGAAAACACTTGTGAAGTCCCAGGGCTTTCCGCAGGTTGTGG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1244 TGAAAGTTAGAAAACACTTGTGAAGTCCCAGGGCTTTCCGCAGGTTGTGG 1293 1301 TTGAACTGTATTTGAATCTTGATTATGTCGTGCTGTGTTAGGAAGGGCCT 1350 |||||*|||||||||||*|||||*||||||||||||*||||||||||*|| 1294 TTGAATTGTATTTGAATATTGATGATGTCGTGCTGTCTTAGGAAGGGTCT 1343 1351 GCTGTCGTGTTTCAAAATTTTGAAATACAGGGGATTTCGAATTTCCCAGG 1400 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1344 GCTGTTGTGTTTCAAAATTTTGAAATACAGGGGATTTCGAATTTCCCAGG 1393 1401 TATATACGCCACTCTCTGCTCGATCCGCAGTGATGTATTCCCCTGTGCGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||||| 1394 TATATACGCCACTCTCTGCTCGATCCGCAGTGATGGACTCCCCTGTGCGT 1443 1451 GAATCCGTGATCATGGCAGTTGATCGATATGTAATACGAACAACCACACG 1500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||* 1444 GAATCCGTGATCATGGCAGTTGATCGATATGTAATACGTACACCCACACT 1493 1501 GTAGATCAACTCGCCTCCTGCGAATGCTCTTCTTCTTCTTCTGGGAGAGC 1550 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||| 1494 GCAGATCAACTCGCCTCCTGCGAATGCTCTTCTTCTTCTTCTGTGGGAGC 1543 1551 GATGTTTTCGCGACCGGAATAGAGTGGTTCTTCGAGTGTGATGAAGACTG 1600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1544 GATGTTTTCGCGACCGGAATAGAGTGGTTCTTCGAGTGTGATAAAGACTG 1593 1601 CATTCTTGATTGCCCACTGCTTCAGTGCTGCATTTTTTTCTTCATCCAGA 1650 ||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*|||||| 1594 CATTCTTGATTGCCCAGTGCTTCAGTGCTGCGTTTTTTTCTTCGTCCAGA 1643 1651 TATTCCTTATAGCTGCTGTTTGGACCTTTATTGCACAGGAAGATAGTGGG 1700 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 1644 TATTCCTTATAGCTGGTGTTTGGACCTTTATTGCACAGGAAGATAGTGGG 1693 1701 AATTCCACCTTTAATCATGACCGGCTTTCCGTACTTCGTGTTGCTTTGGC 1750 |||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||*| 1694 AATTCCACCTTTAATCATGACTGGCTTTCCGTATTTCGTGTTGCTTTGCC 1743 1751 AGTCACGCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGGGGA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||| 1744 AGTCACGCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAATGTGGA 1793 1801 TCAACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCATCATTGCTATAGACCTTTGG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1794 TCAACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCCTCATTGCTATAGACCTTTGG 1843 1851 GCTCAGATCAAGATGTCCACACAAGTAATTGTGTGGTCCTAAGCACCGAG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||*|||| 1844 GCTCAGATCAAGATGTCCACACAAGTAATTGTGGGGTCCTAAACAACGAG 1893 1901 CCCACATCGTTTTGCCCGTCCTACTATCCCCCTCTATGACTATGCTTATG 1950 |||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1894 CCCACATTGTTTTGCCCGTTCTACTATCCCCCTCTATGACTATGCTTATG 1943 1951 GGCCTAAAAGGCCGCGCAGCGGCACACACAACATTAGACGAGACCCAATC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 1944 GGCCTAAAAGGCCGCGCAGCGGCACACACCACATTTGACGAGACCCAATC 1993 2001 GACGAGGTCTGCCGGAACTCTGTCGAAGGATGAAATTGAAAATGGAGAAA 2050 ||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1994 GACGAGTTCTGGCGGAACTCTGTCGAAGGATGAAATTGAAAATGGAGAAA 2043 2051 CATAAACCTCGGAAGGAGGTTGAAAAATACGATCTAAATTGGTATTTAAA 2100 ||||||*|||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 2044 CATAAATCTCAGAAGGAGGTTGAAAAATGCGATCTAAATTGGTATTTAAA 2093 2101 TTGTGAAACTGCAGAACGTAATCTTTTGGGGCTAATTCCTTTAATACTCT 2150 |||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||*| 2094 TTGTGAAACTGCAGAACATAATCCTTTGGGGCTAATTCCTTTAATACTTT 2143 2151 CAAAGCATCGTCTTTATTTCCCGTGTTAATCGCCTGGGCATATGCATCGT 2200 |||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 2144 CAACGCATCGTCTTTATTTCCCGTGTTAATCGCCTGAGCATATGCATCGT 2193 2201 TCGCCGTTTGTTGACCACCACGGGCAGATCGTCCATCGATCTGGAAAACA 2250 |*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 2194 TTGCCGTTTGTTGACCACCACGAGCAGATCGTCCATCGATCTGGAAAACA 2243 2251 CCCCATTCTAGAACGTCTCCATCTTTGGCGATGTAGTTTTTGACGTCCGA 2300 ||||||||||||||||||||*||||||*||||*||*|||||||||||*|| 2244 CCCCATTCTAGAACGTCTCCGTCTTTGTCGATATACTTTTTGACGTCTGA 2293 2301 CGCTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCGACTTG 2350 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2294 TGCTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCGACTTG 2343 2351 GGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTTTTGCACTGGAATTTCCCTTCG 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2344 GGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTTTTGCACTGGAATTTCCCTTCG 2393 2401 AATTGGATGAGAACATGGATATGCGGAGACCCATCTTCGTGAAGCTCTCT 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2394 AATTGGATGAGAACATGGATATGCGGAGACCCATCCTCGTGAAGCTCTCT 2443 2451 ACAGATCTTGATGAATTTCTTCTTCGTCGGGGTTTCTAGGGTTTGCAATT 2500 |||*||||||||||||||*|||***||*|||||||||||||||||||*|| 2444 ACATATCTTGATGAATTTTTTCGCAGTTGGGGTTTCTAGGGTTTGCAGTT 2493 2501 GGGAGAGTGCCTCTTCTTTAGTTAGAGAGCACTTTGGATATGTGAGGAAA 2550 ||||*|||||*||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2494 GGGAAAGTGCGTCCTCCTTAGTTAGAGAGCACTTTGGATATGTGAGGAAA 2543 2551 TAGTTTTTGGCATTTACTCTAAAACGACGTGGCGAAGCCATAAAACTTGT 2600 ||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||*|||||||||||| 2544 TAGTTTTTGGCATTTATTCTAAAACGACGTGGCGGAGACATAAAACTTGT 2593 2601 CGTTTTGATTCGGCGTCCCTCAACTTAT-CTATATGATTGGTGTCTGGAG 2649 ||||||||||||||||||||||||||*|*||||*|*|||||||||||||| 2594 CGTTTTGATTCGGCGTCCCTCAACTTCTTCTATGTAATTGGTGTCTGGAG 2643 2650 TCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTTTGAAAAGA 2699 ||||*|||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||| 2644 TCCTTTATATAGGTAAGACACCATATGGCAGAATTGTAATTTTGAAAAGA 2693 2700 AAATTACTTTAATTCAAATTCCCTAAAGCGGCCATTCGTA------- 2739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||******** 2694 AAATTACTTTAATTCAAATTCCCTAAAGCGGCCATTCGTTTAATATT 2740