NC_004635 AJ577395 1 TGGCATTTTTGTAATAATAAGGGGGTCACCGATTGAGGCTCTCTCAAACT 50 ***************************||||||||||||||||||||||| 1 ---------------------------ACCGATTGAGGCTCTCTCAAACT 23 51 TGCTCTAGCAATTGGGGAACGGGGTCTCATTTATACAAGAACCCTCAATA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 24 TGCTCTAGCAATTGGGGAACGGGGTCTCATTTATACAAGAACCCTCAATA 73 101 GAACTCTCAATCTCGTTCACACACGTGGCGGCCATCCGCAATAGTATTAC 150 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||*|||||| 74 GAACTCTCAATCTCGTTCGCACACGTGGCGGCCATCCGCAATAATATTAC 123 151 CGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCGCTTTTACTTTTCACGCGCGCCCGCTT 200 ||||||||||||||||||||||**|*||||||||*||||||||||*|||| 124 CGGATGGCCGCGCGATTTTTTCGCCCTTTACTTTCCACGCGCGCC-GCTT 172 201 TTCTCACTCGCGCTATCGTCCAATCATATTGCGCCTGCCGCGCCTAATTA 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 173 TTCTCACTCGCGCTATCGTCCAATCATATTGCGTCTGCCGCGCCTAATTA 222 251 TTTTAAACAACTTGGGCCCTAAGTTGTTGATGGGCCTATAAATGATAAAC 300 *||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||*||||*||*| 223 ATTTAAACAACTTGGGCCCTAAGTTGTTGTTGGGCCTATATATGAAAAGC 272 301 GGGTTTGGGCCACACACTTTAATTCAAAATGACTAAGCGCGATTCATCTT 350 |**||*||||***|***|||||||||*||||*|||||||*||**|**|*| 273 GTATT-GGGCTTTAGTGTTTAATTCAGAATGTCTAAGCGAGAAGCCCCGT 321 351 GGCGCTCGATGGCTGGAACCACAAAGGTTCGTCGCACGTTGAATTTCTCC 400 ||||*||*||*||*|||*****|||||**||*||*||**|*||||**||* 322 GGCGTTCAATAGCGGGAGTGTTAAAGGCCCGCCGTACTCTTAATTATTCT 371 401 CCACGTGGAGGTGGTGGCCCAAAACAGACACGGGCCTCAGAGTGGGTTAA 450 ||*||||*||*|***||||**||****|****||||*|*||||||||*|| 372 CCTCGTGCAGTTTTGGGCCGTAAGATTAACAAGGCCGCTGAGTGGGTCAA 421 451 TAGGCCTATGTATAGAAAGCCTTTGATCTACCGGACTTTAAGGACGCCCG 500 *|||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 422 CAGGCCCATGTACAGAAAGCCTTTGATCTACCGGACTTTAAGGACGCCCG 471 501 ATGTTCCAAGAGGTTGTGAAGGCCCGTGCAAGGTCCAGTCCTATGAACAG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 472 ATGTTCCAAGAGGTTGTGAAGGCCCGTGCAAGGTCCAGTCCTATGAACAG 521 551 CGTCATGATATCTCCCACGTCGGTAAGGTGATGTGTATTTCTGATGTCAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 522 CGTCATGATATCTCCCACGTCGGTAAGGTGATGTGTATTTCTGATGTCAC 571 601 TCGTGGTAATGGCATTACCCACCGTGTGGGTAAGCGTTTCTGTGTTAAGT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 572 TCGTGGTAATGGCATTACCCACCGTGTGGGTAAGCGTTTCTGTGTTAAGT 621 651 CTGTGTATACTTTAGGGAAGATTTGGATGGATGAGAACATCAAGCTCAAG 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 622 CTGTGTATACTTTAGGGAAGATTTGGATGGATGAGAACATCAAGCTCAAG 671 701 AACCACACGAACAGTGTAATGTTCTGGTTGGTCAGGGATCGTCGACCCTA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 672 AACCACACGAACAGTGTAATGTTCTGGTTGGTCAGGGATCGTCGACCCTA 721 751 TGGCACTCCAATGGACTTTGGCCAGGTGTTTAACATGTATGACAACGAGC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 722 TGGCACTCCAATGGACTTTGGCCAGGTGTTTAACATGTATGACAACGAGC 771 801 CTAGCACCGCCACGATTAAGAACGATCTCCGTGATCGTTATCAGGTTATG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 772 CTAGCACCGCCACGATTAAGAACGATCTCCGTGATCGTTATCAGGTTATG 821 851 CACAGGTTCTATGGTAAAGTCACTGGGGGTCAATATGCCAGCAACGAGCA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 822 CACAGGTTCTATGGTAAAGTCACTGGGGGTCAATATGCCAGCAACGAGCA 871 901 GGCTTTGGTCAGGCGATTCTGGAAGATTAACAATCATGTTGTATACAACC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 872 GGCTTTGGTCAGGCGATTCTGGAAGATTAACAATCATGTTGTATACAACC 921 951 ACCAAGAGGCTGGCAAGTACGAGAATCACACTGAGAACGCGTTATTATTG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 922 ACCAAGAGGCTGGCAAGTACGAGAATCACACTGAGAATGCGTTATTATTG 971 1001 TATATGGCATGTACACATGCCTCTAACCCTGTGTATGCGACATTGAAAAT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 972 TATATGGCATGTACACATGCCTCTAACCCTGTGTATGCGACATTGAAAAT 1021 1051 TCGAATCTATTTTTACGATTCGATTACGAATTAATAAAATTTGAATTTTA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1022 TCGAATCTATTTTTACGATTCGATTACGAATTAATAAAATTTGAATTTTA 1071 1101 TTTCATGAAGAACAATTACATATCGTACATGAGCATTGTCTGTTGCAAAT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1072 TTTCATGAAGAACAATTACATATCGTACATGAGCATTGTCTGTTGCAAAT 1121 1151 CGAACAGCTCTGATTACATTGTTAATTGAAATTACGCCTAAGTTGTCTAA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1122 CGAACAGCTCTGATTACATTGTTAATTGAAATTACGCCTAAGTTGTCTAA 1171 1201 GTACATGTTGACTAAATGCTTGAATCTAACTAAATAAGTTAACCCAGAAG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1172 GTACATGTTGACTAAATGCTTGAATCTAACTAAATAAGTTAACCCAGAAG 1221 1251 CTGTCGTCGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGTAGGCTTTGTGGAGA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1222 CTGTCGTCGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGTAGGCTTTGTGGAGA 1271 1301 CCCAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGTACCTGATCTGGATGTGATATAC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1272 CCCAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGTACCTGATCTGGATGTGATATAC 1321 1351 TCTGGTCTTGGAGAACAGCAGTTCCTCTACGCTGTCGATCTTGAAATAAA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1322 TCTGGTCTTGGAGAACAGCAGTTCCTCTACGCTGTCGATCTTGAAATAAA 1371 1401 GGGGATTTTCTATCTCCCAGATATAGACGCCATTCTCTGCCTGACGTGCG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1372 GGGGATTTTCTATCTCCCAGATATAGACGCCATTCTCTGCCTGACGTGCG 1421 1451 GTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCCGTGCAGCCGATGTGTA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1422 GTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCCGTGCAGCCGATGTGTA 1471 1501 AGTAAATGGAGCACCCGCAATCTAGATCAATCCTGCGCCTCCTGATGGCC 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1472 AGTAAATGGAGCACCCGCAATCTAGATCAATCCTGCGCCTCCTGATGGCC 1521 1551 CTCTTCTTGGCTTGCCTGTGTGCCTTCTTGATACAGGGGGGCCGTGAGGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1522 CTCTTCTTGGCTTGCCTGTGTGCCTTCTTGATACAGGGGGGCCGTGAGGG 1571 1601 TGATGAATTTAGCATTCTTGTTTGTCCAAATCCTGAGAGCTGAGTTTTCC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1572 TGATGAATTTAGCATTCTTGTTTGTCCAAATCCTGAGAGCTGAGTTTTCC 1621 1651 TCTTTGTCCAGGAAATCTTTATAGCTGGCACCCTCACCAGGATTGCAAAG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1622 TCTTTGTCCAGGAAATCTTTATAGCTGGCACCCTCACCAGGATTGCAAAG 1671 1701 CACGATTGATGGGATCCCGCCTTTAATTTGAAGTGGCTTGCCGTACTTAC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1672 CACGATTGATGGGATCCCGCCTTTAATTTGAAGTGGCTTGCCGTACTTAC 1721 1751 AATTTGACTGCCAGTCCTTCTGGGCCCCCAGAAGTTCTTTCCAGTGCTTT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1722 AATTTGACTGCCAGTCCTTCTGGGCCCCCAGAAGTTCTTTCCAGTGCTTT 1771 1801 GGCTTTAGATATTGCGGTGCGACGTCATCAATGACGTTATACTCCACTTC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1772 GGCTTTAGATATTGCGGTGCGACGTCATCAATGACGTTATACTCCACTTC 1821 1851 GTTGGAAAAGACACGGGCATTGAAGTCTAGGTGGCCACTGAGATAGTTAT 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1822 GTTGGAAAAGACACGGGCATTGAAGTCTAGGTGGCCACTGAGATAGTTAT 1871 1901 GTGGGCCTAACGAACGAGCCCACATCGTCTTCCCTGTCCTCGAGTCACCT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1872 GTGGGCCTAACGAACGAGCCCACATCGTCTTCCCTGTCCTCGAGTCACCT 1921 1951 TCTACTATGATACTCACAGGTCTCTCTGGCCGCGCAGGATCCGTTCCAAA 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1922 TCTACTATGATACTCACAGGTCTCTCTGGCCGCGCAGCATCCGTTCCAAA 1971 2001 ATAACCGTCTGCCCATGCTTGCATCTCGTCTGGAACTGCATTGAAAGAGG 2050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1972 ATAACCGTCTGCCCATGCTTGCATCTCGTCTGGAACTGCATTGAAAGAGG 2021 2051 AGAGGGGAAACGGAGGAGACCATGGCTCCGGAGCCTTAGCGAATATCCTT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2022 AGAGGGGAAACGGAGGAGACCATGGCTCCGGAGCCTTAGCGAATATCCTT 2071 2101 TCTAAGTTGGAACGGATGTTATGATTCTGCAAAACGAAGTCTTTTGGCTG 2150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2072 TCTAAGTTGGAACGGATGTTATGATTCTGCAAAACGAAGTCTTTTGGCTG 2121 2151 TTCTTCTTTCAAAACCGCCATGGCAGATTCAACAGAATCTGCATTTAACG 2200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2122 TTCTTCTTTCAAAACCGCCATGGCAGATTCAACAGAATCTGCATTTAACG 2171 2201 CCTTGGCATATGAATCATTAGCAGACTGGCAGCCTCCTCTAGCACTTCTG 2250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2172 CCTTGGCATATGAATCATTAGCAGACTGGCAGCCTCCTCTAGCACTTCTG 2221 2251 CCGTCGATCTGGAATTCTCCCCATTCCAGTGTATCTCCGTCCTTTGCGAT 2300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2222 CCGTCGATCTGGAATTCTCCCCATTCCAGTGTATCTCCGTCCTTTGCGAT 2271 2301 ATAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGTATGTTTGGATGGA 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2272 ATAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGTATGTTTGGATGGA 2321 2351 AATGTGCTGACCTGGTTGGGGATACCAGGTCGAATAATCTGTTATTCTCG 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2322 AATGTGCTGACCTGGTTGGGGATACCAGGTCGAATAATCTGTTATTCTCG 2371 2401 CATGCATATTTTCCCTCGAACTGCATGAGCACATGGAGATGAGGCTTCCC 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2372 CATGCATATTTTCCCTCGAACTGCATGAGCACATGGAGATGAGGCTTCCC 2421 2451 ATTCTGATGAAGCTCTCTGCAAATTTTGATGAACTTCTTATTCACTGGCG 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2422 ATTCTGATGAAGCTCTCTGCAAATTTTGATGAACTTCTTATTCACTGGCG 2471 2501 TGGAAAGATTTAGCAATTGTGAAAGTGCCTCTTCTTTGGTTA-TAGAACA 2549 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 2472 TGGAAAGATTTAGCAATTGTGAAAGTGCCTCTTCTTTGGTTAGTAGAACA 2521 2550 GTCTGGATAAGTGATAAAATAGTTTTTGGCATTTATTTTGAAACGTTTAA 2599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2522 GTCTGGATAAGTGATAAAATAGTTTTTGGCATTTATTTTGAAACGTTTAA 2571 2600 TCGA-------------------------- 2603 ||||************************** 2572 TCGATGGCATTTTTGTAATAATAGGGGGTC 2601