NC_004609 DQ061273 1 ATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATTGGTGTA 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 CTATATATAGTAAAGTTACTAGGGGCTCTCAGATATAATATTACCTGAGA 100 *******************************************||||||| 2 -------------------------------------------CCTGAGA 8 101 GCCCCGCGATCGGTGTATCGGTTT-AGAGCACGTGGGTGGTCC-TCTAAT 148 |||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||||||*||||*| 9 GCCCCGCGACCGGTGTATCGGTTTTAGAGCACGTGGGTGGTCCCTCTATT 58 149 ACGTGG-GCACTATGGAGTCTCGCTCGAAGCTTGTTTATTGAACGACTAC 197 ||||||*|||||*|||||||||||||||*|||*|||||*||||||||||| 59 ACGTGGCGCACTCTGGAGTCTCGCTCGATGCTAGTTTAATGAACGACTAC 108 198 TTAGAGTTACAGGTAACCG-ATGAGTGACCGTTCGTACATGGACAAATTT 246 |||||*|||||||||||||*||**|||||||||||||||||||||||||* 109 TTAGAATTACAGGTAACCGGATAGGTGACCGTTCGTACATGGACAAATTC 158 247 GTCTTTTCCTCAAAAAGACCGTTTTTGC-ATTCGGTGTTCAACTTTTAAT 295 ||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||||||||||| 159 GTCTTTTCCTCAAAAAGACCGTTTTTGCCATTCGGTGTACAACTTTTAAT 208 296 GCCTAAGACCGGGAAACCCTTGGGGTATTTATGTCATTTCATTTGAAATG 345 ||*||||*||**|||||||||||||||||*||||||||||||*||||||| 209 GCTTAAGGCCCCGAAACCCTTGGGGTATTCATGTCATTTCATATGAAATG 258 346 ACTTTAATTTGAAATCGTTTTTCTTTAAAAAACGATATTCGTCCAATTTG 395 ||||||||||||||||||||||||*|||||**||||*||||||||||||| 259 ACTTTAATTTGAAATCGTTTTTCTATAAAA--CGATCTTCGTCCAATTTG 306 396 TCCATACTAAGCTATACGCACAATGTCGTTCGTTTAATTTTATTTAAACA 445 |||||||||*|||||||||||||||||||||*||||*||||||||||||* 307 TCCATACTATGCTATACGCACAATGTCGTTCATTTATTTTTATTTAAACT 356 446 TTTCAATATCTTCATCTACATATAAATCAAAACATGAACGTGAGTTTTCA 495 ||||||||||||||||||*||||||||*|||||*||||||||||||*||| 357 TTTCAATATCTTCATCTATATATAAATGAAAACGTGAACGTGAGTTGTCA 406 496 ACCATGAAATGTTTACTCGTAATTATCGCACCCCTTTTAAATTACGCCAT 545 |||||||||||||||**||*|||||||||||||||||||||||||||||| 407 ACCATGAAATGTTTAACCGGAATTATCGCACCCCTTTTAAATTACGCCAT 456 546 GATAATTTTGGTTATAGATGGCAGCCTATGACACCGTCAAGAGGACGTTT 595 **||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 457 AGTAATTTTGGTTATAGATGGCAGCCTATGACCCCGTCAAGAGGACGTTT 506 596 ACGTCTTCATAAGCCTAGTGCTTCACGTAAATTATCATATGACCGAGTTG 645 |||||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||*| 507 ACGTCTTAATAAGCCTAGTGCTTCACGTAAATTGTCATATGACCGCGTGG 556 646 AACGGGAAATGCGCACCAATTCTATCGTTGAGGTTCAACATGGAAGCCAT 695 ||||||||||*||*||||||||*||*|||||||||||||||||||||||| 557 AACGGGAAATTCGTACCAATTCCATTGTTGAGGTTCAACATGGAAGCCAT 606 696 ATGTCCCTTGAGAAGAATACGGATGTATTTTCATTTGTGCAATACCCTGT 745 |||||||||||||||||||||||*||||*||||||||||||||*|||||| 607 ATGTCCCTTGAGAAGAATACGGACGTATCTTCATTTGTGCAATTCCCTGT 656 746 TCGTGGAATAAACGGTGACGGACGTTGTAGGGATTACATCAAGTTACTTA 795 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 657 TCGTGGAATCAACGGTGACGGACGTTGTAGGGATTACATCAAGTTGCTTA 706 796 AACTTGATGTCTCTGGTGTGATAAACATCAAGTCTTCGAATGGAGACCAA 845 |||||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 707 AACTTGATGTCTCGGGTGTGATAAACATTAAGTCTTCGAATGGAGACCAA 756 846 AGCATGGAACCAGGTGACAAGTTAAGTGGGCTATTTATTCTGACTGTCTT 895 |||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||| 757 AGCATGGAACCAGGTGACAGGTTAAGTGGCCTATTTATTCTGACTGTCTT 806 896 GCTTGATAAGAAACCCTATCTTCCAGAAGGTGTGAACAAGTTACCCTCCT 945 |||*||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 807 GCTAGACAAGAAACCCTACCTTCCAGAAGGTGTGAACAAGTTACCCTCCT 856 946 TTGCGGAGTTATTTGGACCTTATTCTGCTGCATATGCGAATATACACCTC 995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 857 TTGCGGAGTTATTTGGACCTTATTCTGCTGCATATGCGAATATACACCTC 906 996 TTAGATTCCCAGAAGCCCCGCTTCAAGGTCCTTGGGACAATAAAGAAGTT 1045 ||*|||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 907 TTGGATTCTCAGAAGCCCCGCTTCAAAGTCCTTGGGACAATAAAGAAGTT 956 1046 CGTGAACTGCACATCAGGGACAATATATGGTCCTTTGAAATTAAATATGC 1095 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 957 CGTGAACTGCACATCAGGGACAATATATGGCCCTTTGAAATTAAATATGC 1006 1096 CGTTGTCCCGGCGAAAGTGTCCTTTGTGGACTACGTTCAAGGACCCTGAT 1145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1007 CGTTGTCCCGGCGAAAGTGTCCTTTGTGGACTACGTTCAAGGACCCTGAT 1056 1146 CAGGGTAACTGTGGTGGAAATTATAAGAAT-TTTCC-----TGCTATTGT 1189 ||||||||*|||||||||||||||||||||*|||||*****||||||||| 1057 CAGGGTAATTGTGGTGGAAATTATAAGAATATTTCCAAAAATGCTATTGT 1106 1190 ATTGAGCTATGCATTTATATCCATGCATAGCCTAGTTGTGGAACCATATT 1239 |||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||||||||||||| 1107 ATTGAGCTATGCATTTATATCAATGCATAGCCTAATTGTGGAACCATATT 1156 1240 TTCAATTTGAATTGAAATACGTTGGATAAAATAAATAAAGATTTATTTAT 1289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1157 TTCAATTTGAATTGAAATACGTTGGATAAAATAAATAAAGATTTATTTAT 1206 1290 TTTCACTATGTTACAACACTTTGTTCACATTAGAACGTTGACTTATGAGA 1339 *||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||*||*||| 1207 GTTCACTATGTTACAACTCTTTGTTCACATTAGAACGTTGACTAATTAGA 1256 1340 CATTTGCTAATAGTCGTCTCTATAATGTCCTCTATTTCTCTCTTGCTCAT 1389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1257 CATTTGCTAATAGTCGTCTCTATAATGTCCTCTATTTCTCTTTTGCTCAT 1306 1390 TGCGTTAGACTGGGTCTGAGATATTGAATCTCCAGGATCCAATGATGCCT 1439 ||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1307 TGCGTTGGATTGGGTCTGAGATATTGAATCTCCAGGATCCAATGATGCCT 1356 1440 CTGGCAATTTGTGCAAATGTCTAAGTGGGTAATCTGCGTCTGAAGCGCTC 1489 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1357 CTGGCAATTTGTGCAAATGTCTAAGTGGGTAATCTGCGTCCGAAGCGCTC 1406 1490 GTGTTGTCTAGAATACTGGGCCTCTCGTTATTTGTGTAACGCATGGAGCT 1539 |||||||||||||||*|||||||*||||||*|||||||*||||||||*|| 1407 GTGTTGTCTAGAATATTGGGCCTGTCGTTACTTGTGTATCGCATGGAACT 1456 1540 ACTCCGTCCAATAGATGACCTTGTAGCCCAAGTCTCACCTGGCTGTAGCA 1589 *|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1457 GCTCCGTCCAATAGATGATCTTGTAGCCCAAGTCTCACCTGGCTGTAGCA 1506 1590 TAATGGGCCTATGGCCAGTATTTGGATATGGACCCTGATTGGGTCCTGGA 1639 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1507 TAATGGGCCTATGGCCAGTATTTGGATATGGACCCTGATTGGGTCCTGGA 1556 1640 TTAAGCAAACGCCTAATGGGCTTGGGCTTCTCAACAGACCAAAAGTCCAC 1689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1557 TTAAGCAAACGCCTAATGGGCTTGGGCTTCTCAACAGACCAAAAGTCCAC 1606 1690 ACAGTCTGCAGTGTAGTCTTTAGACAATATGTTTATTGTCGGGGGTTTAA 1739 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1607 ACAATCTGCAGTGTAGTCTTTAGACAATATGTTTATTGTCGGGGGTTTAA 1656 1740 ACCTTATGTCTGTTGAGTGCTTTGCGGAAGACAATTTCAGTTTGGCCCTT 1789 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||*|| 1657 ACCTTATGTCTGTTGAGTGTTTTGCGGAAGACAATTTCAGTTTTGCCTTT 1706 1790 ATCTGGGCAAATGTTGTTCCGTCGATCACGTTTGAGTCTTCGACCTTGTA 1839 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||| 1707 ATCTGGGCAAATGTTGTTCCGTCGATCACGTTGGAGTCCTCGACCTTGTA 1756 1840 CACTATCTCCCATGGTGTTTCATCCTTTAGAGAGAAGAAGGATGATGAGA 1889 *|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1757 TACTATCTCCCATGGTGTTTCATCTTTTAGAGAGAAGAAGGATGATGAGA 1806 1890 AATAATGGAGATCGACGTTACATGCAATTGGGAAGGTGAAAGCAGCTTGT 1939 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1807 AATAATGGAGATCGACGTTACATGCAATTGGGAAAGTGAAAGCAGCTTGT 1856 1940 GCTGCTTGTTCATAGCTTAGCCTTGTGTCACGAATTGTGACGATGACCGT 1989 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||| 1857 GCTGCTTGTTCATAGCTTAGCCTTGTGTCACGAATTGTGACTATTACCGT 1906 1990 TCCCTTGGCGTTGAACGGAACTTGGTTTCTGTACTCGATCACAGCATGGT 2039 |||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||*| 1907 TCCCTTGGCATTGAACGGAACTTGATTTCTGTACTCAATCACAGCATGAT 1956 2040 CGACCTTCATGCATCTACCCATTATCTGGACAGTCTTCTGTTCCAGATAA 2089 ||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1957 CGACCTTCATGCATCTGCCCATTATCTGGACTGTCTTCTGTTCCAGATAA 2006 2090 GAAGGAAATTGTAATTTGATGGGCATCTCGTTGTTGGATAGTCTGTATTC 2139 ||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||***||||||||||| 2007 GATGGAAATTGTAACTTGATGGGCATCTCGTTGTTGCTCAGTCTGTATTC 2056 2140 GCAACTCTTTGTCTCCACATATTTGTTATTAATCAACTGCCCC------- 2182 ||||||||||||||||||||||||*|||||||*|*|||||*||******* 2057 GCAACTCTTTGTCTCCACATATTTATTATTAA-CGACTGCGCCTGAATAA 2105 2183 -------------------------------------CTGAAAATGACCA 2195 *************************************|||||||*||*|* 2106 TTATCCATTATTCAGAAATTGTGTTGCGAATTAATCCCTGAAAAGGAACT 2155 2196 CACACCCGGAAATTATTCTAATAATTTCAATTAG--CGCGCAGCGGCAAT 2243 *|||||*|||||||||||||*|||||||||||||**|||||||||||*|| 2156 TACACCAGGAAATTATTCTATTAATTTCAATTAGGCCGCGCAGCGGCTAT 2205 2244 GAGAAGAGTTTACAATTATAATCATAATTTAAACCAAACAAATATAAAAA 2293 |||***||||||*|*|||*|||||||||*|||||||||||***|*||||| 2206 GAGGTCAGTTTAGATTTAAAATCATAATCTAAACCAAACAGGGAAAAAAA 2255 2294 ACAGCTATTACCTGATTTTTGTAATACTCCCAGAAAATAAGAGCACTGGA 2343 |||**||*||||||||||*|**|****|*||||||||*|*|||||||*|| 2256 ACATTTAATACCTGATTTATCAA----TGCCAGAAAACACGAGCACTTGA 2301 2344 TGTGCACAGAGGAAGTAACAAATATTTTATTAAATATTTGTTGTTGTGAT 2393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2302 TGTGCACAGAGGAAGTAACAAATATTTTATTAAATATTTGTTGTTGTGAT 2351 2394 AATTGTGATTGATTCTATCAATCGATTTAAATAATTGAGTAACATGCGCA 2443 |||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 2352 AATTGAGATTGATTCTATCAATCGATTTAAATAATTGAGTAACATGCGGA 2401 2444 GGATTGGGTCCTGGATATTAAATAGGGGATTATTTAATATCCCTAAATGT 2493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2402 GGATTGGGTCCTGGATATTAAATAGGGGATTATTTAATATCCCTAAATGG 2451 2494 ACATATCTGGTGCCTCCATCGTTTCGGTGTCTAAGCGCATGTTTCTAGAG 2543 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2452 ACATATCTGGTGCCTCCAGCGTTTCGGTGTCTAAGCGCATGTTTCTAGAG 2501 2544 CGAGAAACTTGTTTCTAGACGAGAGATGCTTAGCAAAACGCAAAATGCTA 2593 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||**| 2502 CGAGAAACTTGTTTCTAGA-GAGAGATGCTTAGCAAAACGCAAAATGTAA 2550 2594 GGCAAAAGAGCGTGTCGTTTCGA--------------------------- 2616 |||||||||||||||||||||||*************************** 2551 GGCAAAAGAGCGTGTCGTTTCGAATTGGTGTACACCGATTCATTCTCTAG 2600 -------------------------------------------------- ************************************************** 2601 CCCCCTATCGGTGTATTGGTGTATTATATATAGTAAAGTTACTAGGGGCT 2650 --------------- *************** 2651 CTCAGATATAATATT 2665