NC_004609 AY049771 1 ATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATTGGTGTA 50 |||||||||||||||||**|||||||*||||||||||||||||||||||| 1 ATCGGTGTACACCGATTCATTCTCTAGCCCCCTATCGGTGTATTGGTGTA 50 51 CTATATATAGTAAAGTTACTAGGGGCTCTCAGATATAATATTACCTGAGA 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 CTATATATAGTAAAGTTACTAGGGGCTCTCAGATATAATATTACCTGAGA 100 101 GCCCCGCGATCGGTGTATCGGTTT-AGAGCACGTGGGTGGTCC-TCTAAT 148 |||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||||||*||||*| 101 GCCCCGCGACCGGTGTATCGGTTTTAGAGCACGTGGGTGGTCCCTCTATT 150 149 ACGTGG-GCACTATGGAGTCTCGCTCGAAGCTTGTTTATTGAACGACTAC 197 ||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 ACGTGGCGCACTCTGGAGTCTCGCTCGAAGCTTGTTTATTGAACGACTAC 200 198 TTAGAGTTACAGGTAACCG-ATGAGTGACCGTTCGTACATGGACAAATTT 246 |||||*|||||||||||||*||**|||||||||||||||||||||||||* 201 TTAGAATTACAGGTAACCGGATAGGTGACCGTTCGTACATGGACAAATTG 250 247 GTCTTTTCCTCAAAAAGACCGTTTTTGC-ATTCGGTGTTCAACTTTTAAT 295 ||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||*||||||||||| 251 GTCTTTTCCTCAAAAAGACCGTTTATGCCATTCGGTGTACAACTTTTAAT 300 296 GCCTAAGACCGGGAAACCCTTGGGGTATTTATGTCATTTCATTTGAAATG 345 |||||||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 GCCTAAGGCCGCGAAACCCTTGGGGTATTTATGTCATTTCATTTGAAATG 350 346 ACTTTAATTTGAAATCGTTTTTCTTTAAAAAACGATATTCGTCCAATTTG 395 ||||||||||||||||||||||||*|||||**||||*||||||||||||| 351 ACTTTAATTTGAAATCGTTTTTCTATAAAA--CGATCTTCGTCCAATTTG 398 396 TCCATACTAAGCTATACGCACAATGTCGTTCGTTTAATTTTATTTAAACA 445 |||||||||*|||||||||||||||||||||*||||*||||||||||||* 399 TCCATACTATGCTATACGCACAATGTCGTTCATTTATTTTTATTTAAACT 448 446 TTTCAATATCTTCATCTACATATAAATCAAAACATGAACGTGAGTTTTCA 495 ||||||||||||||||||*||||||||*||*||||||||||||||||||| 449 TTTCAATATCTTCATCTATATATAAATGAAGACATGAACGTGAGTTTTCA 498 496 ACCATGAAATGTTTACTCGTAATTATCGCACCCCTTTTAAATTACGCCAT 545 |||||||||||||||**||*|||||||||||||||||||||||||||||| 499 ACCATGAAATGTTTAACCGGAATTATCGCACCCCTTTTAAATTACGCCAT 548 546 GATAATTTTGGTTATAGATGGCAGCCTATGACACCGTCAAGAGGACGTTT 595 **||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 549 AGTAATTTTGGTTATAGATGGCAGCCTATGACCCCGTCAAGAGGACGTTT 598 596 ACGTCTTCATAAGCCTAGTGCTTCACGTAAATTATCATATGACCGAGTTG 645 |||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||*| 599 ACGTCTTAATAAGCCTAGTGCCTCACGTAAATTATCATATGACCGCGTGG 648 646 AACGGGAAATGCGCACCAATTCTATCGTTGAGGTTCAACATGGAAGCCAT 695 |||||||||||||*||||||||*||*|||||||||||||||||||||||| 649 AACGGGAAATGCGTACCAATTCCATTGTTGAGGTTCAACATGGAAGCCAT 698 696 ATGTCCCTTGAGAAGAATACGGATGTATTTTCATTTGTGCAATACCCTGT 745 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 699 ATGTCCCTTGAGAAGAATACGGATGTATCTTCATTTGTGCAATACCCTGT 748 746 TCGTGGAATAAACGGTGACGGACGTTGTAGGGATTACATCAAGTTACTTA 795 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 749 TCGTGGAATCAACGGTGACGGACGTTGTAGGGATTACATCAAGTTACTTA 798 796 AACTTGATGTCTCTGGTGTGATAAACATCAAGTCTTCGAATGGAGACCAA 845 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 799 AACTTGATGTCTCTGGTGTGATAAACATTAAGTCTTCGAATGGAGACCAA 848 846 AGCATGGAACCAGGTGACAAGTTAAGTGGGCTATTTATTCTGACTGTCTT 895 |||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||| 849 AGCATGGAACCAGGTGACAGGTTAAGTGGCCTATTTATTCTGACTGTCTT 898 896 GCTTGATAAGAAACCCTATCTTCCAGAAGGTGTGAACAAGTTACCCTCCT 945 |||*||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*||*| 899 GCTAGACAAGAAACCCTACCTTCCAGAAGGTGTGAATAAGTTACCGTCAT 948 946 TTGCGGAGTTATTTGGACCTTATTCTGCTGCATATGCGAATATACACCTC 995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 949 TTGCGGAGTTATTTGGACCTTATTCTGCTGCATATGCGAATATACACCTC 998 996 TTAGATTCCCAGAAGCCCCGCTTCAAGGTCCTTGGGACAATAAAGAAGTT 1045 ||*|||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 999 TTGGATTCTCAGAAGCCCCGCTTCAAAGTCCTTGGGACAATAAAGAAGTT 1048 1046 CGTGAACTGCACATCAGGGACAATATATGGTCCTTTGAAATTAAATATGC 1095 *|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1049 TGTGAACTGCACATCAGGGACAATATATGGCCCTTTGAAATTAAATATGC 1098 1096 CGTTGTCCCGGCGAAAGTGTCCTTTGTGGACTACGTTCAAGGACCCTGAT 1145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1099 CGTTGTCCCGGCGAAAGTGTCCTTTGTGGACTACGTTCAAGGACCCTGAT 1148 1146 CAGGGTAACTGTGGTGGAAATTATAAGAAT-TTTCC-----TGCTATTGT 1189 ||||||||*|||||||||||||||||||||*|||||*****||||||||| 1149 CAGGGTAATTGTGGTGGAAATTATAAGAATATTTCCAAAAATGCTATTGT 1198 1190 ATTGAGCTATGCATTTATATCCATGCATAGCCTAGTTGTGGAACCATATT 1239 |||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||||||||||||| 1199 ATTGAGCTATGCATTTATATCAATGCATAGCCTAATTGTGGAACCATATT 1248 1240 TTCAATTTGAATTGAAATACGTTGGATAAAATAAATAAAGATTTATTTAT 1289 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1249 TTCAATTTGAATTGAAATACGTTGGATAAAATAAATAAAGATTTATTTAT 1298 1290 TTTCACTATGTTACAACACTTTGTTCACATTAGAACGTTGACTTATGAGA 1339 ||*||||||||||||||**||||||||||||||||||||||||||||||| 1299 TTACACTATGTTACAACTGTTTGTTCACATTAGAACGTTGACTTATGAGA 1348 1340 CATTTGCTAATAGTCGTCTCTATAATGTCCTCTATTTCTCTCTTGCTCAT 1389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1349 CATTTGCTAATAGTCGTCTCTATAATGTCCTCTATTTCTCTTTTGCTCAT 1398 1390 TGCGTTAGACTGGGTCTGAGATATTGAATCTCCAGGATCCAATGATGCCT 1439 ||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1399 TGCGTTGGATTGGGTCTGAGATATTGAATCTCCAGGATCCAATGATGCCT 1448 1440 CTGGCAATTTGTGCAAATGTCTAAGTGGGTAATCTGCGTCTGAAGCGCTC 1489 *|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*|||| 1449 TTGGCAATTTGTGCAAATGTCTAAGTGGGTAATCTGCGTCCGAAGTGCTC 1498 1490 GTGTTGTCTAGAATACTGGGCCTCTCGTTATTTGTGTAACGCATGGAGCT 1539 |||||||||||||||*|||||||*||||||*|||||||*||||||||*|| 1499 GTGTTGTCTAGAATATTGGGCCTGTCGTTACTTGTGTATCGCATGGAACT 1548 1540 ACTCCGTCCAATAGATGACCTTGTAGCCCAAGTCTCACCTGGCTGTAGCA 1589 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1549 GCTCCGTCCAATAGATGACCTTGTAGCCCAAGTCTCACCTGGCTGTAGCA 1598 1590 TAATGGGCCTATGGCCAGTATTTGGATATGGACCCTGATTGGGTCCTGGA 1639 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1599 TAATGGGCCTATGGCCAGTATTTGGATATGGACCCTGATTGGGTCCTGGA 1648 1640 TTAAGCAAACGCCTAATGGGCTTGGGCTTCTCAACAGACCAAAAGTCCAC 1689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1649 TTAAGCAAACGCCTAATGGGCTTGGGCTTCTCAACAGACCAAAAGTCCAC 1698 1690 ACAGTCTGCAGTGTAGTCTTTAGACAATATGTTTATTGTCGGGGGTTTAA 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1699 ACAGTCTGCAGTGTAGTCTTTAGACAATATGTTTATTGTCGGGGGTTTAA 1748 1740 ACCTTATGTCTGTTGAGTGCTTTGCGGAAGACAATTTCAGTTTGGCCCTT 1789 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|| 1749 ACCTTATGTCTGTTGAGTGTTTTGCGGAAGACAATTTCAGTTTGGCCTTT 1798 1790 ATCTGGGCAAATGTTGTTCCGTCGATCACGTTTGAGTCTTCGACCTTGTA 1839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1799 ATCTGGGCAAATGTTGTTCCGTCGATCACGTTTGAGTCTTCAACCTTGTA 1848 1840 CACTATCTCCCATGGTGTTTCATCCTTTAGAGAGAAGAAGGATGATGAGA 1889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1849 CACTATCTCCCATGGTGTTTCATCCTTTAGAGAGAAGAAGGATGACGAGA 1898 1890 AATAATGGAGATCGACGTTACATGCAATTGGGAAGGTGAAAGCAGCTTGT 1939 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1899 AATAATGGAGATCGACGTTACATGCAATTGGGAAGGTGAAAGCAGCTTGT 1948 1940 GCTGCTTGTTCATAGCTTAGCCTTGTGTCACGAATTGTGACGATGACCGT 1989 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1949 GCTGCTTGTTCATAGCTTAGCCTTGTGTCACGAATTGTGACTATGACCGT 1998 1990 TCCCTTGGCGTTGAACGGAACTTGGTTTCTGTACTCGATCACAGCATGGT 2039 |||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1999 TCCCTTGGCATTGAACGGAACTTGGTTTCTGTACTCGATCACAGCATGAT 2048 2040 CGACCTTCATGCATCTACCCATTATCTGGACAGTCTTCTGTTCCAGATAA 2089 ||||||||||||||||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||| 2049 CGACCTTCATGCATCTGCCCATAATCTGGACGGTCTTCTGTTCCAGATAA 2098 2090 GAAGGAAATTGTAATTTGATGGGCATCTCGTTGTTGGATAGTCTGTATTC 2139 ||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||***||||||||||| 2099 GATGGAAATTGTAACTTGATGGGCATCTCGTTGTTGCTCAGTCTGTATTC 2148 2140 GCAACTCTTTGTCTCCACATATTTGTTATTAATCAACTGCCCC------- 2182 ||||||||||||||||||||||||*|||||||*|*|||||*||******* 2149 GCAACTCTTTGTCTCCACATATTTATTATTAA-CGACTGCTCCTGAATAA 2197 2183 -------------------------------------CTGAAAATGACCA 2195 *************************************|||||||*||**| 2198 TTCTCCATTATTCAGAAATTGTGTTGCGAATTAATCCCTGAAAAGGAATA 2247 2196 CACACCCGGAAATTATTCTAATAATTTCAATTAG--CGCGCAGCGGCAAT 2243 ||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||| 2248 CACACCCGGAAATTATTCTAATAATTTCAATTAGGCCGCGCAGCGGCAAT 2297 2244 GAGAAGAGTTTACAATTATAATCATAATTTAAACCAAACAAATATAAAAA 2293 |||***||||||*|*|||*|||||||||*|||||||||||***|*||||| 2298 GAGGGTAGTTTATATTTAAAATCATAATCTAAACCAAACAGGGA-AAAAA 2346 2294 ACAGCTATTACCTGATTTTTGTAAT-ACTCCCAGAAAATAAGAGCACTGG 2342 |||**||*|||||||||*|*|**||*|*||||||||||*|**||||||*| 2347 ACATTTAATACCTGATTGTGGGTATCAATCCCAGAAAACACAAGCACTTG 2396 2343 ATGTGCACAGAGGAAGTAACAAATATTTTATTAAATATTTGTTGTTGTGA 2392 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2397 ATGTGCACAGAGGAAGTAACAAATATTTTATTAAATATTTGTTGTTGTGA 2446 2393 TAATTGTGATTGATTCTATCAATCGATTTAAATAATTGAGTAACATGCGC 2442 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|**|||||||| 2447 TAATTGTGATTGATTCTATCAATCGATTTAAATAATTGTGAGACATGCGC 2496 2443 AGGATTGGGTCCTGGATATTAAATAGGGGATTATTTAATATCCCTAAATG 2492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2497 AGGATTGGGTCCTGGATATTAAATAGGGGATTATTTAATATCCCTAAATG 2546 2493 TACATATCTGGTGCCTCCATCGTTTCGGTGTCTAAGCGCATGTTTCTAGA 2542 *||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2547 GACATATCTGGTGCCTCCAGCGTTTCGGTGTCTAAGCGCATGTTTCTAGA 2596 2543 GCGAGAAACTTGTTTCTAGACGAGAGATGCTTAGCAAAACGCAAAATGCT 2592 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 2597 GCGAGAAACTTGTTTCTAGA-GAGAGATGCTTAGCAAAACGCAAAATGCT 2645 2593 AGGCAAAAGAGCGTGTCGTTTCGA 2616 |||||||||||||||||||||||| 2646 AGGCAAAAGAGCGTGTCGTTTCGA 2669