NC_004608 AY271895 1 ATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATCGGTGTC 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAGCTATAATA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TTACCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTCTG 150 ***||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 2 ---CCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTGTG 48 151 CTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAGC 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 49 CTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAAC 98 201 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGGACACTCTGAACCC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGGACACTCTGAACCC 148 251 ACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGTGCATG 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*|||||| 149 ACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCTAAATCACTGCATG 198 301 GATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAACAAGTTCAAGAGAAT 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 199 GATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAGCAAGTTCAAGAGAAT 248 351 TACCCTTCTAATTCTCTAGGTTACTCGTACCTTACAGGGTTAATTCAGGT 400 ||*||*|||||||||||*||||**|*||||||||*||||||||||||||| 249 TATCCATCTAATTCTCTTGGTTTTTTGTACCTTAAAGGGTTAATTCAGGT 298 401 ATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGAATACTGCATTCTC 450 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||*||*||||| 299 ATTGCGCATCCGGAATCATGCCCAAGCGGACCTACGA-TACGGCCTTCTC 347 451 TACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCCGCTCA 500 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||* 348 TACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTAAACTTCGATACCCCGCTCG 397 501 TGCTGCCTGCCTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGGAGGCGT 550 ||||||||||*||||*||||||||||||||||||||||||*||*||*||| 398 TGCTGCCTGCGTCTGTGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAGAGAAGACGT 447 551 TGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 448 TGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATAG 497 601 GTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 498 GTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCAT 547 651 TTGAAGCAAAGG----ATATTGCCCCCACAGGCAAAGTGATTTGCATATC 696 ||||*|||||||****|||||||||*|||||||||||||||||||||||| 548 TTGA-GCAAAGGCATGATATTGCCCACACAGGCAAAGTGATTTGCATATC 596 697 GGACGTNACTAAAAGTAATGGAATTACNCCTCGTTTAGGCAAACGTTTTT 746 *|||||*||||*|*|||||||||||||*|*||||*|*||||||||*|||| 597 TGACGTGACTAGAGGTAATGGAATTACACATCGTATTGGCAAACGATTTT 646 747 GTTGCATCAAGTCCGTGAACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAAC 796 |***|||||||||||||*|||||||*||*||||||||||||||||||||* 647 G---CATCAAGTCCGTGTACATTACGGGTAAGGTTTGGATGGACGAAAAT 693 797 ATTAAGTCCAAAAATCACACGAATACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTGA 846 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 694 ATTAAGTCCAAAAATCACACGAACACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTGA 743 847 CAGACGACCATTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAACATGT 896 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 744 CAGACGACCTTTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAATATGT 793 897 ATGACAACGAGCCCAGTACAGCCACTGTGAAGAACGATCTGCGTGATCGT 946 |||||||*||||||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||| 794 ATGACAATGAGCCCAGTACAGCTACTGGGAAGAACGATCTGCGTGATCGT 843 947 TATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAATATGC 996 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 844 TATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAATATGC 893 997 TTGTAAAGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTCAAGGTTAATAATTATG 1046 ||||||*||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||| 894 TTGTAAGGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTTAAAGTTAATAATTATG 943 1047 TTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGAAC 1096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 944 TTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGAAC 993 1097 GCATTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTATGC 1146 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 994 GCATTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTATGC 1043 1147 AACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTAATAAA 1196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1044 AACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTAATAAA 1093 1197 GATTGTATTGAGCATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGTGGAGT 1246 |*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1094 GTTTGTATTGAACATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGTGGAGT 1143 1247 TTTATTGTACAGGAAATCCGATGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCTAA 1296 ||||***||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1144 TTTACA-TACAGGAAATCCGACGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCTAA 1192 1297 TGACCCCTAAATTATTTAAAAACTTAAATAATTGGTTACGGAAGATCGAT 1346 ||||*|||||||||||||*|||||||||||||||**|||||||||||||| 1193 TGACTCCTAAATTATTTAGAAACTTAAATAATTGTCTACGGAAGATCGAT 1242 1347 AAGATCATCCCAGAAGTCGCCTTCATATAATGGTAGAGCTTCAAGTCCAG 1396 |||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||||||||||||| 1243 AAGATCATCCCAGAAGTCGCCGTCAAATAATGGTAGAGCTTCAAGTCCAG 1292 1397 GAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGATTGAACAT-A 1445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||*| 1293 GAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATTA 1342 1446 TGCGCAGCTTGGTGACCATTCATTCTGGACTCTGCTAGAATTGGACTGTG 1495 |||||||||||||*|||||*||||||||||*||||||||||||||||||| 1343 TGCGCAGCTTGGTCACCAT-CATTCTGGACCCTGCTAGAATTGGACTGTG 1391 1496 GTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGACGC 1545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1392 GTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGACGC 1441 1546 CACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGCGAAAATCCATA 1595 |||||*|||||||||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||| 1442 CACTCTTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTACTCCCCTGTGCGAGAATCCATA 1491 1596 GTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACACTTCAGGTCAA 1645 |||*|||||||||||*|||||||||||||||||*|||||**|*||*|||| 1492 GTTGCGGCAGTTGATGTGGATGTAATAGCTACAACCACAGGTTAGATCAA 1541 1646 TTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCTTG 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1542 TTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCTTG 1591 1696 ATTGACGGTGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCT 1745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1592 ATTGACGGTGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCT 1641 1746 TTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACTCT 1795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1642 TTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACTCT 1691 1796 TTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATACC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1692 TTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATACC 1741 1846 ACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTCTC 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1742 ACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTCTC 1791 1896 TTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAACG 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1792 TTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAACG 1841 1946 TCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTTAG 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1842 TCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTTAG 1891 1996 ATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCACA 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1892 ATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCACA 1941 2046 TGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACTATACTAATAGGTCTA 2095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1942 TGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACAATACTAATAGGTCTA 1991 2096 TCTGGCCGCGCGGC---ATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAAAT 2142 |||||||||||*||***||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1992 TCTGGCCGCGCAGCGGGATCTCTGACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAAAT 2041 2143 GTAGCTTGGAACCTTGTCGAATGACTCCAATGTAAAAGGCGACTCATATG 2192 ||||||*||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||**||||| 2042 GTAGCTCGGAACCTTGTTGAATGACTCCAGTGTAAAAGGCGACATATATG 2091 2193 CCTGTGTAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGTTATGA 2242 ||||***||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2092 CCTGGACAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGTTATGA 2141 2243 AATTGTAAAATGAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTCAATATAAGGAGGGC 2292 ||||||||*||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2142 AATTGTAATATAAAATCCTTAGGAGCCTTTTCTTTCAATATAAGGAGGGC 2191 2293 CTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGCAG 2342 ||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2192 CTCCAATTTTGATCCAGAATTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGCAG 2241 2343 ATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAAGGTTCCATGA 2392 |||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2242 ATTGTTTACCTCCTCGAGCTGATCGGCCATCGATTTGGAAGGTTCCATGA 2291 2393 TCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAGCT 2442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2292 TCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAGCT 2341 2443 TTTAGCTCGCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCTGGAAT 2492 |||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2342 TTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCTGGAAT 2391 2493 GGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACTGA 2542 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2392 GGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTTGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACTGA 2441 2543 AGCAGAACATGGAGATGAGGTTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGACAGAT 2592 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||*|| 2442 AGCAGAACATGGAGATGAGGCTGTCCATCTTCATGGAGTTCGCGACAAAT 2491 2593 GCGGATGAACTTCTTGTTAACTGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTGTTCAA 2642 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2492 GCGGATGAACTTCTTGTTAACAGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTGTTCAA 2541 2643 GAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGTTT 2692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2542 GAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGTTT 2591 2693 TTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTTGGCATATTTGAAGTCGTTTT 2742 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2592 TTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTAGGCATATTTGAAGTCGTTTT 2641 2743 TGT----------------------------------------------- 2745 |||*********************************************** 2642 TGTATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATCGGT 2691 -------------------------------------------------- ************************************************** 2692 GTCTTATATATACTAGAACTACTAAAAGTCCATAGGGGCACTCAGCTATA 2741 ----- ***** 2742 ATATT 2746