NC_004608 AJ512498 1 ATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATCGGTGTC 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAGCTATAATA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TTACCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTCTG 150 ***||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 ---CCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTCTG 48 151 CTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAGC 200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 49 CTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAATCGCTCCTCAGC 98 201 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAA-----GTGGACACTCTG 245 |||||||||||||||||||||||||||||||||*****|||||||||||| 99 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAAGCAAGTGGACACTCTG 148 246 AACCCACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGT 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*| 149 AACCCACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCACATCACT 198 296 GCATGGATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAACAAGTTCAAG 345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 199 GCATGGATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAGCAAGTTCAAG 248 346 AGAATTACCCTTCTAATTCTCTAGGTTACTCGTACCTTACAGGGTTAATT 395 |||||||*||*|||||||||||*||||**|*||||||||||*|||||||| 249 AGAATTATCCATCTAATTCTCTTGGTTTTTTGTACCTTACAAGGTTAATT 298 396 CAGGTATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGAATACTGCA 445 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||*||* 299 CAGGTATTGCGCATCCGGAATCATGCCCAAGCGGACCTACGA-TACGGCC 347 446 TTCTCTACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCC 495 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 348 TTCCCTACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTAAACTTCGATACCCC 397 496 GCTCATGCTGCCTGCCTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGGA 545 ||||*||||||||||*||||*||||||||||||||||||||||||*||*| 398 GCTCGTGCTGCCTGCGTCTGTGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAGAGAA 447 546 GGCGTTGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTG 595 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 448 GACGTTGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTG 497 596 TATAGGTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCA 645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 498 TATAGGTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCA 547 646 ATCATTTGAAGCAAAGG----ATATTGCCCCCACAGGCAAAGTGATTTGC 691 |||||||||*|||||||****|||||||||*||||||||||||||||||| 548 ATCATTTGA-GCAAAGGCATGATATTGCCCACACAGGCAAAGTGATTTGC 596 692 ATATCGGACGTNACTAAAAGTAATGGAATTACNCCTCGTTTAGGCAAACG 741 |||||*|||||*||||*|*|||||||||||||*|*||||*|*|||||||| 597 ATATCTGACGTGACTAGAGGTAATGGAATTACACATCGTATTGGCAAACG 646 742 TTTTTGTTGCATCAAGTCCGTGAACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACG 791 *|||||***|||||||||||||*|||||||*||*|||||||||||||||| 647 ATTTTG---CATCAAGTCCGTGTACATTACGGGTAAGGTTTGGATGGACG 693 792 AAAACATTAAGTCCAAAAATCACACGAATACTGTGATGTTCAAGTTATGT 841 ||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 694 AAAATATTAAGTCCAAAAATCACACGAACACTGTGATGTTCAAGTTATGT 743 842 CGTGACAGACGACCATTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAA 891 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 744 CGTGACAGACGACCTTTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAA 793 892 CATGTATGACAACGAGCCCAGTACAGCCACTGTGAAGAACGATCTGCGTG 941 ||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 794 CATGTATGACAATGAGCCCAGTACAGCTACTGTGAAGAACGATCTGCGTG 843 942 ATCGTTATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAA 991 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 844 ATCGTTATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAA 893 992 TATGCTTGTAAAGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTCAAGGTTAATAA 1041 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 894 TATGCTTGTAATGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTCAAAGTTAATAA 943 1042 TTATGTTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTG 1091 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 944 TTATGTTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAATCATACTG 993 1092 AGAACGCATTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTG 1141 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 994 AGAACGCATTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTG 1043 1142 TATGCAACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTA 1191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1044 TATGCAACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTA 1093 1192 ATAAAGATTGTATTGAGCATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGT 1241 ||||||*|||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1094 ATAAAGTTTGTATTGAACATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGT 1143 1242 GGAGTTTTATTGTACAGGAAATCCGATGCGAAATATAAAATATTTGCTAA 1291 |||||||||***|||||||||||*||*||||||||||||||||||||||| 1144 GGAGTTTTACA-TACAGGAAATCTGACGCGAAATATAAAATATTTGCTAA 1192 1292 GCTAATGACCCCTAAATTATTTAAAAACTTAAATAATTGGTTACGGAAGA 1341 |||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||**||||||||| 1193 GCTAATGACTCCTAAATTATTTAGAAACTTAAATAATTGTCTACGGAAGA 1242 1342 TCGATAAGATCATCCCAGAAGTCGCCTTCATATAATGGTAGAGCTTCAAG 1391 ||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||||||||||||| 1243 TCGATAAGATCATCCCAGAAGTCGCCGTCAAATAATGGTAGAGCTTCAAG 1292 1392 TCCAGGAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGATTGAA 1441 |||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||*|||*||||| 1293 TCCAGGAAGTACTTGTGCATCCCCGGTGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAA 1342 1442 CAT-ATGCGCAGCTTGGTGACCATTCATTCTGGACTCTGCTAGAATTGGA 1490 |||*||||||||*|||||*|||||*||||||||||*|||||||||||||| 1343 CATTATGCGCAGTTTGGTCACCAT-CATTCTGGACCCTGCTAGAATTGGA 1391 1491 CTGTGGTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATA 1540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 1392 CTGTGGTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCATATATA 1441 1541 GACGCCACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGCGAAAAT 1590 ||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 1442 GACGCCACTCTTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTACTCCCCTGTGCGAAAAT 1491 1591 CCATAGTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACACTTCAG 1640 ||||||||*|||||||||||*||||*||||||||||||||||||**|*|| 1492 CCATAGTTGCGGCAGTTGATGTGGACGTAATAGCTACACCCACAGGTTAG 1541 1641 GTCAATTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAA 1690 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1542 ATCAATTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGATGAA 1591 1691 CCTTGATTGACGGTGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGC 1740 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1592 CCTTGATTGACGGTGGAGAACAATGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGC 1641 1741 ATTCTTTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGT 1790 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1642 ATTTTTTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGT 1691 1791 ACTCTTTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGG 1840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1692 ACTCTTTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGG 1741 1841 ATACCACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCA 1890 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1742 ATACCACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCA 1791 1891 GTCTCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGAT 1940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1792 GTCTCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGAT 1841 1941 CAACGTCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCG 1990 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||*|*|| 1842 CAACGTCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGGTAGAGTATGTTTGGCCG 1891 1991 TTTAGATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGC 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1892 TTTAGATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGC 1941 2041 CCACATGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACTATACTAATAG 2090 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1942 CCACATGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACAATACTAATAG 1991 2091 GTCTATCTGGCCGCGCGGC---ATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGAA 2137 ||||||||||||||||*||***||||||||||||||||||||||||||*| 1992 GTCTATCTGGCCGCGCAGCGGGATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGGA 2041 2138 GAAATGTAGCTTGGAACCTTGTCGAATGACTCCAATGTAAAAGGCGACTC 2187 ||||||||*||*||||||||||*||||||||||**|||||||||||||** 2042 GAAATGTATCTCGGAACCTTGTTGAATGACTCCGGTGTAAAAGGCGACAT 2091 2188 ATATGCCTGTGTAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGT 2237 |||||||||***|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2092 ATATGCCTGGACAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGT 2141 2238 TATGAAATTGTAAAATGAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTCAATATAAGG 2287 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||| 2142 TATGAAATTGTAAAATAAAATCCTTAGGAGCCTTTTCTTTCAATATAAGG 2191 2288 AGGGCCTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTT 2337 |||*|||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2192 AGGCCCTCCAATTTTGATCCAGAATTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTT 2241 2338 GGCAGATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAAGGTTC 2387 ||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||| 2242 GGCAGATTGTTTACCTCCTCGAGCTGATCGGCCATCGATTTGGAAGGTTC 2291 2388 CATGATCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAG 2437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2292 CATGATCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAG 2341 2438 CAGCTTTTAGCTCGCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCT 2487 ||||||||||||**||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2342 CAGCTTTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCTGATCTGCATCT 2391 2488 GGAATGGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGA 2537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2392 GGAATGGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGA 2441 2538 ACTGAAGCAGAACATGGAGATGAGGTTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGA 2587 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2442 ACTGAAGCAGAACATGGAGATGAGGCTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGA 2491 2588 CAGATGCGGATGAACTTCTTGTTAACTGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTG 2637 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 2492 CAGATGCGGATGAACTTCTTGTTAACAGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTG 2541 2638 TTCAAGAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAAT 2687 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2542 TTCAAGAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAAT 2591 2688 AGTTTTTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTTGGCATATTTGAAGTC 2737 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 2592 AGTTTTTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTAGGCATATTTGAAGTC 2641 2738 GTTTTTGT------------------------------------------ 2745 ||||||||****************************************** 2642 GTTTTTGTATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTA 2691 -------------------------------------------------- ************************************************** 2692 TCGGTGTCTTATATATACTATAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAG 2741 ---------- ********** 2742 CTATAATATT 2751