NC_004608 AJ512497 1 ATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATCGGTGTC 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAGCTATAATA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TTACCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTCTG 150 ***||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*|| 2 ---CCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTGCTTTAGCTTTTTTG 48 151 CTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAGC 200 |||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 49 CTTTTTGGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAGC 98 201 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGGACACTCTGAACCC 250 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||||||| 99 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCATGTGCACACTCTGAACCC 148 251 ACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGTGCATG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 149 ACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGTGCATG 198 301 GATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAACAAGTTCAAGAGAAT 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 199 GATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAGCAAGTTCAAGAGAAT 248 351 TACCCTTCTAATTCTCTAGGTTACTCGTACCTTACAGGGTTAATTCAGGT 400 ||*||*|||||||||*|*|||||*|||||||||||||||||||||||||| 249 TATCCCTCTAATTCTGTTGGTTATTCGTACCTTACAGGGTTAATTCAGGT 298 401 ATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGAATACTGCATTCTC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||| 299 ATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGA-TACTGCCTTCTC 347 451 TACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCCGCTCA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 348 TACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAAATTCGATACCCCGCTCA 397 501 TGCTGCCTGCCTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGGAGGCGT 550 ||||*||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||| 398 TGCTCCCTGCCTCTGCGCGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGAAGGCGT 447 551 TGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 448 TGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATAG 497 601 GTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 498 GTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCAT 547 651 TTGAAGCAAAGG----ATATTGCCCCCACAGGCAAAGTGATTTGCATATC 696 ||||*|||*|||****|*|||||||*|||||||||||||||||||||||| 548 TTGA-GCAGAGGCATGACATTGCCCACACAGGCAAAGTGATTTGCATATC 596 697 GGACGTNACTAAAAGTAATGGAATTACNCCTCGTTTAGGCAAACGTTTTT 746 ||||||*||||*|*|||||||||||||*|*||||*|*||||||||||||| 597 GGACGTGACTAGAGGTAATGGAATTACACATCGTATTGGCAAACGTTTTT 646 747 GTTGCATCAAGTCCGTGAACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAAC 796 |***|||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 647 G---CATCAAGTCCGTGTACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAAC 693 797 ATTAAGTCCAAAAATCACACGAATACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTGA 846 |||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 694 ATTAAGTCCAAAAGTCACACGAACACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTGA 743 847 CAGACGACCATTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAACATGT 896 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 744 CAGACGACCATTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAACATGT 793 897 ATGACAACGAGCCCAGTACAGCCACTGTGAAGAACGATCTGCGTGATCGT 946 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 794 ATGACAACGAGCCCAGTACAGCTACTGTGAAGAACGATCTGCGTGATCGT 843 947 TATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAATATGC 996 ||||||||*|||||||||||||*||||||*|||||*|||||||||||||| 844 TATCAAGTATTGCGAAAGTTTAATGCCACCGTTACGGGTGGCCAATATGC 893 997 TTGTAAAGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTCAAGGTTAATAATTATG 1046 ||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||| 894 TTGTAAGGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTTTTCAAAGTTAATAATTATG 943 1047 TTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGAAC 1096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 944 TTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGAAC 993 1097 GCATTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTATGC 1146 ||||||||||||||*||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 994 GCATTATTATTGTATATGGCACGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTATGC 1043 1147 AACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTAATAAA 1196 |||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1044 AACTCTTAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATATTGAATTAATAAA 1093 1197 GATTGTATTGAGCATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGTGGAGT 1246 |*|||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1094 GTTTGTATTGAACATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAGGTGGAGT 1143 1247 TTTATTGTACAGGAAATCCGATGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCTAA 1296 ||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1144 TT-ATTGTACAGGAAATCCGACGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCTAA 1192 1297 TGACCCCTAAATTATTTAAAAACTTAAATAATTGGTTACGGAAGATCGAT 1346 ||||||||||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||| 1193 TGACCCCTAAATTATTTAGAAACCTAAATAATTGGTTACGGAAGATCGAT 1242 1347 AAGATCATCCCAGAAGTCGCCTTCATATAATGGTAGAGCTTCAAGTCCAG 1396 |||||||||||||||||||||*|||*|||*||||||||||||||*||||| 1243 AAGATCATCCCAGAAGTCGCCGTCAAATAGTGGTAGAGCTTCAATTCCAG 1292 1397 GAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGATTGAACAT-A 1445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*| 1293 GAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGGTTGAACATTA 1342 1446 TGCGCAGCTTGGTGACCATTCATTCTGGACTCTGCTAGAATTGGACTGTG 1495 |||||||||||||||||||*||||||||||*|||||*||||||||||||| 1343 TGCGCAGCTTGGTGACCAT-CATTCTGGACCCTGCTCGAATTGGACTGTG 1391 1496 GTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGACGC 1545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1392 GTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGACGC 1441 1546 CACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGCGAAAATCCATA 1595 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1442 CACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTACTCCCCTGTGCGAAAATCCATA 1491 1596 GTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACACTTCAGGTCAA 1645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|*||*|||| 1492 GTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACAGGTTAGATCAA 1541 1646 TTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCTTG 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1542 TTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCTTG 1591 1696 ATTGACGGTGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCT 1745 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1592 ATTGACGGAGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCT 1641 1746 TTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACTCT 1795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1642 TTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACTCT 1691 1796 TTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATACC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1692 TTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAAAAAGATGGTGGGGATACC 1741 1846 ACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTCTC 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1742 ACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTCTC 1791 1896 TTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAACG 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1792 TTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAACG 1841 1946 TCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTTAG 1995 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1842 TCATCGATGACGTTGTACCAAGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTTAG 1891 1996 ATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCACA 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1892 ATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCACA 1941 2046 TGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACTATACTAATAGGTCTA 2095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1942 TGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACAATACTAATAGGTCTA 1991 2096 TCTGGCCGCGCGGC---ATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAAAT 2142 |||||||||||*||***||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1992 TCTGGCCGCGCAGCGGGATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCAAGAAGAAAT 2041 2143 GTAGCTTGGAACCTTGTCGAATGACTCCAATGTAAAAGGCGACTCATATG 2192 |||||||||||||||||**||||||||||*||||||||||||||*||||| 2042 GTAGCTTGGAACCTTGTTAAATGACTCCAGTGTAAAAGGCGACTGATATG 2091 2193 CCTGTGTAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGTTATGA 2242 |||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2092 CCTGTACAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGTTATGA 2141 2243 AATTGTAAAATGAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTCAATATAAGGAGGGC 2292 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2142 AATTGTAAAATAAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTTAATATAAGGAGGGC 2191 2293 CTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGCAG 2342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2192 CTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGCAG 2241 2343 ATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAAGGTTCCATGA 2392 ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||*||||||||| 2242 ATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCGGCCATCGATTTGGAAAGTTCCATGA 2291 2393 TCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAGCT 2442 |||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 2292 TCAAGGATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGATTTAACATCTGAGCAGCT 2341 2443 TTTAGCTCGCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCTGGAAT 2492 |||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2342 TTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCTGGAAT 2391 2493 GGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACTGA 2542 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2392 GGAGGTCGAAGAACCCTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACTGA 2441 2543 AGCAGAACATGGAGATGAGGTTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGACAGAT 2592 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 2442 AGCAGAACATGGAGATGAGGCTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGACAGAT 2491 2593 GCGGATGAACTTCTTGTTAACTGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTGTTCAA 2642 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2492 GCGGATGAATTTCTTGTTAACTGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTGCTCAA 2541 2643 GAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGTTT 2692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2542 GAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGTTT 2591 2693 TTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTTGGCATATTTGAAGTCGTTTT 2742 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2592 TTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTAGGCATATTTGAAGTCGTTTT 2641 2743 TGT----------------------------------------------- 2745 |||*********************************************** 2642 TGTATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATTGGT 2691 -------------------------------------------------- ************************************************** 2692 GTCTTATATATACTAAAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAGCTATA 2741 ----- ***** 2742 ATATT 2746