NC_004608 AJ416349 1 ATCGGTGTACACCGATTACTTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATCGGTGTC 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAGCTATAATA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TTACCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTCTG 150 ***|||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||* 2 ---CCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGTTTCCTTTAACTTTTCTA 48 151 CTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAGC 200 |||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 49 CTTTTTGGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAGC 98 201 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGGACACTCTGAACCC 250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 99 GCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGCACACTCTGAACCC 148 251 ACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGTGCATG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 149 ACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCACTGCATG 198 301 GATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAACAAGTTCAAGAGAAT 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 199 GATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAGCAAGTTCAAGAGAAT 248 351 TACCCTTCTAATTCTCTAGGTTACTCGTACCTTACAGGGTTAATTCAGGT 400 ||*||||||||||||||*||||*|||*||*|||||||||||||||||||| 249 TATCCTTCTAATTCTCTTGGTTTCTCATATCTTACAGGGTTAATTCAGGT 298 401 ATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGAATACTGCATTCTC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 299 ATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGA-TACTGCATTCTC 347 451 TACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCCGCTCA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 348 TACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCCGCTCA 397 501 TGCTGCCTGCCTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGGAGGCGT 550 ||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||*||*||| 398 TGCTCCCTGCTTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAGAGAAGACGT 447 551 TGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATAG 600 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 448 TGGACCAACCGTCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATAG 497 601 GTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 498 GTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCAT 547 651 TTGAAGCAAAGG----ATATTGCCCCCACAGGCAAAGTGATTTGCATATC 696 ||||*|||*|||****|||||||||*|||||||||||||||||||||||| 548 TTGA-GCAGAGGCATGATATTGCCCACACAGGCAAAGTGATTTGCATATC 596 697 GGACGTNACTAAAAGTAATGGAATTACNCCTCGTTTAGGCAAACGTTTTT 746 ||||||*||||*|*|||||||||||||*|*||||*|*||||||||||||| 597 GGACGTGACTAGAGGTAATGGAATTACACATCGTATTGGCAAACGTTTTT 646 747 GTTGCATCAAGTCCGTGAACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAAC 796 |***|||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 647 G---CATCAAGTCCGTGTACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAAC 693 797 ATTAAGTCCAAAAATCACACGAATACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTGA 846 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 694 ATTAAGTCCAAAAATCACACGAACACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTGA 743 847 CAGACGACCATTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAACATGT 896 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||| 744 CAGACGACCATTTGGTACACCCATGGATTTTGGTCAAGTTTTTAACATGT 793 897 ATGACAACGAGCCCAGTACAGCCACTGTGAAGAACGATCTGCGTGATCGT 946 |||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 794 ATGACAACGAGCCAAGTACAGCTACTGTGAAGAACGATCTGCGTGATCGT 843 947 TATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAATATGC 996 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 844 TATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAATGCCACTGTTACTGGTGGCCAATATGC 893 997 TTGTAAAGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTCAAGGTTAATAATTATG 1046 ||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||| 894 TTGTAAGGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTTTTCAAAGTTAATAATTATG 943 1047 TTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGAAC 1096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 944 TTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGAAC 993 1097 GCATTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTATGC 1146 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 994 GCATTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTATGC 1043 1147 AACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTAATAAA 1196 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1044 AACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATATTGAATTAATAAA 1093 1197 GATTGTATTGAGCATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGTGGAGT 1246 |*|||||||||*||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||| 1094 GTTTGTATTGAACATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACTAGGTGGAGT 1143 1247 TTTATTGTACAGGAAATCCGATGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCTAA 1296 ||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1144 TT-ATTGTACAGGAAATCCGACGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCTAA 1192 1297 TGACCCCTAAATTATTTAAAAACTTAAATAATTGGTTACGGAAGATCGAT 1346 ||||*|||||||||||||*|||||||||||||||**|||*|||||||||| 1193 TGACTCCTAAATTATTTAGAAACTTAAATAATTGTCTACTGAAGATCGAT 1242 1347 AAGATCATCCCAGAAGTCGCCTTCATATAATGGTAGAGCTTCAAGTCCAG 1396 |||||||||||||||||||||*|||*|||*|||*||||||||||*||||| 1243 AAGATCATCCCAGAAGTCGCCGTCAAATAGTGGAAGAGCTTCAATTCCAG 1292 1397 GAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGATTGAACAT-A 1445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||*| 1293 GAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATTA 1342 1446 TGCGCAGCTTGGTGACCATTCATTCTGGACTCTGCTAGAATTGGACTGTG 1495 ||||*||||||||*||*||*||||||||||*|||||*||||*|||||||| 1343 TGCGGAGCTTGGTTACTAT-CATTCTGGACCCTGCTCGAATCGGACTGTG 1391 1496 GTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGACGC 1545 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1392 GTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGGTATAGACGC 1441 1546 CACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGCGAAAATCCATA 1595 ||*||||||||||||*||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1442 CATTCCTGAGTTGAGTTGCAGTGATGCTCTCCCCTGTGCGAAAATCCATA 1491 1596 GTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACACTTCAGGTCAA 1645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1492 GTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACACTTCAGGTCAA 1541 1646 TTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCTTG 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1542 TTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCTTG 1591 1696 ATTGACGGTGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCT 1745 ||||||||*|||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||| 1592 ATTGACGGAGGAGAACAGTGGTTCCTTGAGGGTGTAGAACTCCGCATTCT 1641 1746 TTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACTCT 1795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1642 TTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACTCT 1691 1796 TTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATACC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1692 TTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATACC 1741 1846 ACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTCTC 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1742 ACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTCTC 1791 1896 TTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAACG 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1792 TTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAACG 1841 1946 TCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTTAG 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1842 TCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTTAG 1891 1996 ATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCACA 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1892 ATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCACA 1941 2046 TGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACTATACTAATAGGTCTA 2095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1942 TGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACGATACTAATAGGTCTA 1991 2096 TCTGGCCGCGCGGC---ATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAAAT 2142 |||||||||||*||***||||||||||||||||||||||||||||||||| 1992 TCTGGCCGCGCAGCGGGATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAAAT 2041 2143 GTAGCTTGGAACCTTGTCGAATGACTCCAATGTAAAAGGCGACTCATATG 2192 ||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*|||||| 2042 GTAGCTGGGAACCTTGTCGAATGACTCCAGTGTAAAAGGCGACACATATG 2091 2193 CCTGTGTAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGTTATGA 2242 ||||***||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 2092 CCTGAACAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAATTATGA 2141 2243 AATTGTAAAATGAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTCAATATAAGGAGGGC 2292 |||||||||||*||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||| 2142 AATTGTAAAATAAAATCCTTAGGAGCCTTTTCTTTTAATATAAGGAGGGC 2191 2293 CTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGCAG 2342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2192 CTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGCAG 2241 2343 ATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAAGGTTCCATGA 2392 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2242 ATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCGGCCATCGATTTGGAAGGTTCCATGA 2291 2393 TCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAGCT 2442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2292 TCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAGCT 2341 2443 TTTAGCTCGCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCTGGAAT 2492 |||||||**|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2342 TTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCGGCATCTGGAAT 2391 2493 GGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACTGA 2542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2392 GGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACTGA 2441 2543 AGCAGAACATGGAGATGAGGTTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGACAGAT 2592 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||| 2442 AGCAGAACATGGAGATGAGGCTGTCCATCTTCATGGAGTTCACGACAGAT 2491 2593 GCGGATGAACTTCTTGTTAACTGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTGTTCAA 2642 |||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||| 2492 GCGGATGAATTTCTTGTTAACAGGTGTTGACAAGGCTAGTAGTTGTTCAA 2541 2643 GAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGTTT 2692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2542 GAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGTTT 2591 2693 TTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTTGGCATATTTGAAGTCGTTTT 2742 ||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*|||*|||||||||| 2592 TTTGCGTTAATAGCAAAACGACCATCCCTTGGCATTTTTAAAGTCGTTTT 2641 2743 TGT----------------------------------------------- 2745 *||*********************************************** 2642 GGTATCGGTGTACACCGATTGCCTTCTCTAGCCCCCTATCGGTGTATCGG 2691 -------------------------------------------------- ************************************************** 2692 TGTACTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCTCTAGGGGCACTCAGCTAT 2741 ------ ****** 2742 AATATT 2747