NC_004608 AY049772 1 ATCGGTGTACACCGATTAC-TTCTCTATCCCCCTATCGGTGTATCGGTGT 49 |||||||||||||||||*|*|||||||*|||||||||||||||||||||| 1 ATCGGTGTACACCGATTGCCTTCTCTAGCCCCCTATCGGTGTATCGGTGT 50 50 CTTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCCATAGGGGCACTCAGCTATAAT 99 **||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||||| 51 ACTATATATACTAGAGCTACTAAAAGCCTCTAGGGGCACTCAGCTATAAT 100 100 ATTACCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGGTTACTTTAACTTTTCT 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*||||||| 101 ATTACCTGAGTGCCCCGCGACCGGTGTATTGGGTTTGCTTTAGCTTTTCT 150 150 GCTTTTGTGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAG 199 ||||||**|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GCTTTTTGGGTACCCTTATCTTTAGTCGTTCAATCAGAAGCGCTCCTCAG 200 200 CGCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGGACACTCTGAACC 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 201 CGCTATGTTAATTCAAATTTGAATTATAAAGCAAGTGCACACTCTGAACC 250 250 CACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGTGCAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 CACTAACAATGTGGGATCCATTGTTGAACGACTTTCCCAAATCAGTGCAT 300 300 GGATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAACAAGTTCAAGAGAA 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||| 301 GGATTCCGGTGCATGTTGGCAATAAAGTATTTGCAGCAAATTCAAGAGAA 350 350 TTACCCTTCTAATTCTCTAGGTTACTCGTACCTTACAGGGTTAATTCAGG 399 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 351 TTACCCTTCTAATTCTCTAGGTTACTCGTACCTTACAGGGTTAATTAAGG 400 400 TATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGAATACTGCATTCT 449 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*|||| 401 TATTGCGCATCCGGAATCATGCCAAAGCGGACCTACGA-TACTGCCTTCT 449 450 CTACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCCGCTC 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 450 CTACCCCGATATCGAATGCACGGAGGAGATTGAACTTCGATACCCCGCTC 499 500 ATGCTGCCTGCCTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGGAGGCG 549 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 500 ATGCTCCCTGCCTCTGCGGGAGGTGTCCCTACCAACATGAAAAGGAGGCG 549 550 TTGGACCAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTACCGACTGTATA 599 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||| 550 TTGGACAAACCGCCCCATGTGGAGGAAACCTCGGTTTTATCGGCTGTATA 599 600 GGTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCA 649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 600 GGTCCCCTGATGTCCCTCGTGGTTGTGAGGGACCATGTAAAGTTCAATCA 649 650 TTTGAAGCAAAGG----ATATTGCCCCCACAGGCAAAGTGATTTGCATAT 695 |||||*|||||||****|||||||||**|||||||||||||||||||||| 650 TTTGA-GCAAAGGCATGATATTGCCCATACAGGCAAAGTGATTTGCATAT 698 696 CGGACGTNACTAAAAGTAATGGAATTACNCCTCGTTTAGGCAAACGTTTT 745 |*|||||*||||*|*|||||||||||||*|*||||*|*|||||||||||| 699 CCGACGTGACTAGAGGTAATGGAATTACACATCGTATTGGCAAACGTTTT 748 746 TGTTGCATCAAGTCCGTGAACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAA 795 ||***|||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 749 TG---CATCAAGTCCGTGTACATTACTGGGAAGGTTTGGATGGACGAAAA 795 796 CATTAAGTCCAAAAATCACACGAATACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTG 845 |||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||| 796 CATTAAGTCCAAAAATCACACCAACACTGTGATGTTCAAGTTATGTCGTG 845 846 ACAGACGACCATTTGGTACACCC-ATGGATTTTGGTCAAGTGTTCAACAT 894 |||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||| 846 ACAGACGACCATTTGGTACACCCCATGGATTT-GGTCAAGTGTTCAACAT 894 895 GTATGACAACGAGCCCAGTACAGCCACTGTGAAGAACGATCTGCGTGATC 944 ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||| 895 GTATGACAACGAGCCCAGTACAGCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATC 944 945 GTTATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAGTGCCACTGTTACTGGTGGCCAATAT 994 ||||||||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||||||| 945 GTTATCAAGTCTTGCGAAAGTTTAATGCCACCGTTACTGGTGGCCAATAT 994 995 GCTTGTAAAGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTCTTCAAGGTTAATAATTA 1044 ||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 995 GCTTGTAAGGAACAAGCCATGGTGAATCGTTTTTTCAAGGTTAATAATTA 1044 1045 TGTTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGA 1094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1045 TGTTGTTTACAACCACCAGGAGGCAGCGAAGTATGAGAACCATACTGAGA 1094 1095 ACGCATTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTAT 1144 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1095 ACGCATTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTGTAT 1144 1145 GCAACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATATTGAATTAATA 1194 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1145 GCAACACTTAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATATTGAATTAATA 1194 1195 AAGATTGTATTGAGCATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAAGTGGA 1244 |||*|||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 1195 AAGTTTGTATTGAACATTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACCAGGTGGA 1244 1245 GTTTTATTGTACAGGAAATCCGATGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCT 1294 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1245 GTTTTATTGTACAGGAAATCCGACGCGAAATATAAAATATTTGCTAAGCT 1294 1295 AATGACCCCTAAATTATTTAAAAACTTAAATAATTGGTTACGGAAGATCG 1344 ||||||||||||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||| 1295 AATGACCCCTAAATTATTTAGAAACCTAAATAATTGGTTACGGAAGATCG 1344 1345 ATAAGATCATCCCAGAAGTCGCCTTCATATAATGGTAGAGCTTCAAGTCC 1394 |||||||||||||||||||||||*|||*||||||||||||||||||*||| 1345 ATAAGATCATCCCAGAAGTCGCCGTCAAATAATGGTAGAGCTTCAATTCC 1394 1395 AGGAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGATTGAACAT 1444 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1395 AGGAAGCACTTGTGCATCCCCAGTGCTTTCTTCAACCTGTGGTTGAACAT 1444 1445 -ATGCGCAGCTTGGTGACCATTCATTCTGGACTCTGCTAGAATTGGACTG 1493 *||||||||||||||*|||||*||||*|||||*|||||*||||||||||| 1445 TATGCGCAGCTTGGTCACCAT-CATTTTGGACCCTGCTCGAATTGGACTG 1493 1494 TGGTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGAC 1543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1494 TGGTGCATGATCTTGAAAGAGAGGGGATTTTGCACCTCCCAGATATAGAC 1543 1544 GCCACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGCGAAAATCCA 1593 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1544 GCCACTCCTGAGTTGAGCTGCAGTGATGTACTCCCCTGTGCGAAAATCCA 1593 1594 TAGTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACACTTCAGGTC 1643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|*|**|| 1594 TAGTTACGGCAGTTGATATGGATGTAATAGCTACACCCACAGGTTAAATC 1643 1644 AATTCGAGATCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCT 1693 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1644 AATTCGAGAGCGTCGAATTGCTCTCTTCTTGGCGACCCTGTGTTGAACCT 1693 1694 TGATTGACGGTGGAGAACAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATT 1743 ||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1694 TGATTGACGGAGGAGACCAGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATT 1743 1744 CTTTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACT 1793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1744 CTTTGAAGCCCACTGTTTAAGCGCAGCATTGTTCTCTTCATCCAAGTACT 1793 1794 CTTTATAGGAGGACTTGGGACCAGGGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATA 1843 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1794 CTTTATAGGAGGACTTGGGACCAGCGTTACACAGAAAGATGGTGGGGATA 1843 1844 CCACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTC 1893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1844 CCACCTTTAATTTTAGTGGGCTTCCCGTACTTGACGTTAGACTGCCAGTC 1893 1894 TCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAA 1943 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1894 TCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGTGGATCAA 1943 1944 CGTCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTT 1993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1944 CGTCATCGATGACGTTGTACCATGCCTCGTTAGAGTATGTTTTGTCGTTT 1993 1994 AGATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCA 2043 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1994 AGATCCAAATGGCCGCAAAGATAATTATGAGGACCTATGGCACGTGCCCA 2043 2044 CATGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATAACTATACTAATAGGTC 2093 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||| 2044 CATGGTTTTACCCGTGCGACTATCTCCTTCAATGACAATACTAATAGGTC 2093 2094 TATCTGGCCGC---GCGGCATCTCTCACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAA 2140 |||||||||||***||||*||||||*|||||||||||||||||||||||| 2094 TATCTGGCCGCACAGCGGGATCTCTGACATTTCTTTCAGCCCATGAAGAA 2143 2141 ATGTAGCTTGGAACCTTGTCGAATGACTCCAATGTAAAAGGCGACTCATA 2190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2144 ATGTAGCTTGGAACCTTGTCGAATGACTCCAATGTAAAAGGCGACTCATA 2193 2191 TGCCTGTGTAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAGTTAT 2240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2194 TGCCTGTGTAGGCTCTGTGAATATCCGAGACAAATTACAATTTAAATTAT 2243 2241 GAAATTGTAAAATGAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTCAATATAAGGAGG 2290 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 2244 GAAATTGTAAAATAAAATCCTTAGGAGCCTTTTCCTTTAATATAAGGAGG 2293 2291 GCCTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGC 2340 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2294 GCCTCCAACTTTGATCCAGAGTTGAGTGCCTCGGCGTATGCGTCGTTGGC 2343 2341 AGATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAAGGTTCCAT 2390 ||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||||||| 2344 AGATTGTTTACCTCCTCTAGCTGATCGACCATCGATTTGGAAGGTTCCAT 2393 2391 GATCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAG 2440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2394 GATCAAGAATGTCTCCGTCTTTCTCCATGTATGTTTTAACATCTGAGCAG 2443 2441 CTTTTAGCTCGCTGAATGTTCGGATGGTAATATGCCGATCTGCATCTGGA 2490 |||||||||**||||||||||||||||||||*|||*||||*||||||||| 2444 CTTTTAGCTGCCTGAATGTTCGGATGGTAATGTGCTGATCGGCATCTGGA 2493 2491 ATGGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTTTTCGTTTGTTGTTTCCCTTCGAACT 2540 ||*|||||||||||||||||||||**|||||||*||*||||||||||||| 2494 ATAGAGGTCGAAGAACCTTTGGTTCCTCGTTTGGTGCTTCCCTTCGAACT 2543 2541 GAAGCAGAACATGGAGATGAGGTTGTCCATCTTCATGGAGTTCTCGACAG 2590 ||||||||||||||||||*|||*||||||||||||||*|||||*|||||| 2544 GAAGCAGAACATGGAGATAAGGCTGTCCATCTTCATGAAGTTCACGACAG 2593 2591 ATGCGGATGAACTTCTTGTTAACTGGTGTTGACAAGGCTAGAAGTTGTTC 2640 |||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||| 2594 ATGCGGATGAATTTCTTGTTAACAGGTGTTGACAAGGCTAGTAGTTGTTC 2643 2641 AAGAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGT 2690 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2644 TAGAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGGACATTTGGGATATGTCAAGAAATAGT 2693 2691 TTTTTGCGTTTATAGCAAAACGACCTTCCCTTGGCATATTTGAAGTCGTT 2740 ||||||||||*||||||||||||||*|||||*|||||*|||*|||||||| 2694 TTTTTGCGTTAATAGCAAAACGACCATCCCTGGGCATTTTTTAAGTCGTT 2743 2741 TTTGT 2745 ||||| 2744 TTTGT 2748