NC_001439 AJ544531 1 TGGCATATTTGTAAATATGCGAGTGTCTCCAAATGAGTTTGCGAGTGTCT 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 CCAATTGAGGCTCCTCAAACTCTCGCTATGCAATTGGAGACTGGAGTACA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 ATATATACTAGAACCCTCAATCTCTTGAATTATCACATCCATACACGTGG 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 CGGCCATCCGATATAATATTACCGGATGGCCGCCCGCGCCCCTTTATATC 200 ********************|||||||*|||||||||||||||||||*|| 1 --------------------ACCGGATTGCCGCCCGCGCCCCTTTATTTC 30 201 CGTACTGCTCCACGTGGTGCTTTAATTTAAATTAAAGATGTCTATTTTTG 250 |||||***|*||||||**|||||||||||||||**|*||||*|*|||||| 31 CGTACGCTTTCACGTGCCGCTTTAATTTAAATTTCACATGTAT-TTTTTG 79 251 ACTGACCAATGCTTTTGCATGTGAGAAGCTTAGATATTTGTGTAAAACTT 300 |||||||||||*|*||||*|*|||**|||*|||||||||||**||||||| 80 ACTGACCAATGATATTGCGTTTGACGAGCCTAGATATTTGT--AAAACTT 127 301 GGCGACTAAGTTTTACCTTCGTTTATAAATTTAAATTAAATGTATGCCCA 350 ||*||||||||||||||||*|*|||||||||||||||||||**||||||| 128 GGTGACTAAGTTTTACCTTTGCTTATAAATTTAAATTAAATTGATGCCCA 177 351 TTCCATGTGTAAGTCCAGAATGCCTAAGCGTGATGCGCCGTGGCGTCATA 400 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*| 178 TTCCACGTGTAAGTCCAGAATGCCTAAGCGTGATGCGCCATGGCGTCAAA 227 401 TGGCGGGAACCTCCAAGGTTTCCCGTTCTGGCAATTATTCTCCAAGTGGT 450 ||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||*|**|| 228 TGGCGGGAACCTACAAGGTTTCCCGTTCTGGCAATTATTCACCAGGGAGT 277 451 GGAATGGGCTCAAAATCCAACAAGGCCAATGCATGGGTCAACAGGCCCAT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 278 GGAATGGGCTCAAAATCCAACAAGGCCAATGCATGGGTCAACAGGCCCAT 327 501 GTATAGAAAGCCAAGGATATATCGGATGTACAAAAGCCCAGATGTGCCAA 550 ||||||*|||||*|||||||||||||||||||*||||||||||||*||*| 328 GTATAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTACAGAAGCCCAGATGTACCCA 377 551 AGGGATGTGAAGGACCTTGCAAGGTCCAATCATATGAACAACGCCATGAT 600 |||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||*|||||| 378 AGGGATGTGAAGGACCTTGTAAGGTCCAATCTTATGAACAACGACATGAT 427 601 ATATCTCATGTTGGTAAGGTTATGTGTATATCCGATATCACACGTGGGAA 650 ||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||*|||||*|| 428 ATTTCTCATGTTGGTAAGGTGATGTGTATATCCGATATTACTCGTGGTAA 477 651 TGGTATTACCCATCGTGTTGGTAAACGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATA 700 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||| 478 TGGTATTACCCATCGTGTGGGTAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATA 527 701 TTTTAGGTAAGATATGGATGGATGAAAACATCATGCTTAAGAACCATACC 750 |||||||*|||||*||||||||||||||*||||*|||*|||||*||*||* 528 TTTTAGGGAAGATTTGGATGGATGAAAATATCAAGCTCAAGAATCACACG 577 751 AATAGTGTCATTTTTTGGTTGGTCCGTGACCGTAGACCATATGGAACCCC 800 ||*|||||*||*||||||||*||*||*||||||||||||||*||*||*|| 578 AACAGTGTGATATTTTGGTTAGTTCGGGACCGTAGACCATACGGCACGCC 627 801 TATGGATTTTGGTCAAGTTTTTAACATGTTTGACAATGAACCTAGTACTG 850 ||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||*|||| 628 TATGGATTTTGGACAAGTGTTTAACATGTTTGACAATGAACCTAGCACTG 677 851 CTACGGTCAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAAGTTATGCATAGGTTC 900 |*|||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||*|*||| 678 CGACGGTAAAGAATGATCTTCGTGATCGTTATCAAGTTATGCATCGATTC 727 901 AATGCAAAGGTGTCTGGTGGTCAATATGCAAGCAACGAGCAAGCCTTGGT 950 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 728 AATGCAAAGGTGACTGGTGGTCAATATGCAAGCAACGAGCAAGCCTTGGT 777 951 AAGGCGTTTTTGGAAGGTGAACAACCATGTCGTCTATAACCACCAGGAAG 1000 ||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 778 AAGGCGATTTTGGAAGGTGAACAATCATGTCGTCTATAACCACCAGGAAG 827 1001 CAGGAAAATACGAGAATCATACGGAGAATGCGTTATTGTTGTATATGGCA 1050 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 828 CAGGAAAATACGAGAATCATACGGAAAATGCGTTATTGTTGTATATGGCA 877 1051 TGTACACATGCCTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTA 1100 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 878 TGTACACATGCATCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTA 927 1101 TTTCTATGATTCGATAACCAATTAATAAAATTTATATTTTATATCATGAT 1150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||| 928 TTTCTATGATTCGATAACCAATTAATAAAATTTATATTCTATTTCATGAT 977 1151 TCTCAAGTACAGTATTTACATATGATTTGTTTGTTGCGAACTGAACAGCT 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 978 TCTCAAGTACAGTATTTACATATGATTTGTCTGTTGCGAACTGAACAGCT 1027 1201 CGAATGACATTGTTTATTCCTATTACGCCTAACCTATGTAAATACAATAA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1028 CGAATGACATTGTTTATTCCTATTACGCCTAACCTATGTAAATACAATAA 1077 1251 AACTAAGAGTCTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAATCG 1300 |||*||**|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1078 AACCAAATGTCTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAATCG 1127 1301 ATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGAATGCTTTGTGGAGATCCAGTGCT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1128 ATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGAATGCTTTGTGGAGATCCAGTGCT 1177 1351 TTCCTGAGGTTGTGATTGAACCTGACTTGGATGTGGTATATCCTTGTCCG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1178 TTCCTGAGGTTGTGATTGAACCTGACTTGGATGTGGTATATCCTTGTCCG 1227 1401 TGTGTATGCTGGATCTTCCACCCGCATGATCTTGAAATAAAGGGGATTTG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1228 TGTGTATGCTGGATCTTCCACCCGCATGATCTTGAAATAAAGGGGATTTG 1277 1451 GTACCTCCCAAATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGATGCGCAGTGATGTTC 1500 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1278 GTACCTCCCAAATAAAAACGGGATTCTCTGCCTGATGCGCAGTGATGTTC 1327 1501 TCCCCTGTGCGTGAATCCATGATCTGCGCACTTGATATGGTAAAATATGG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1328 TCCCCTGTGCGTGAATCCATGATCTGCGCACTTGATATGGTAAAATATGG 1377 1551 AACAGCCGCAGTTCAAGTCAATGCGTCGTCGACGAATGGCTTTATGTTTG 1600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 1378 AACAGCCGCAGTTCAAGTCAATGCGTCGTCGACGAATGGCTTTACGTTTG 1427 1601 GCAATCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGGCTGTGAGGGTGACGAAGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1428 GCAATCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGGCTGTGAGGGTGACGAAGA 1477 1651 TCGCATTATGAATGGTCCAGTTGTGTAAAGCTCGGTTTTCCTCTTTGTTG 1700 |||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||*| 1478 TCGCATTATGAATAGTCCAGTTGTGTAAAGCTCGGTTTTCTTCTTTGTCG 1527 1701 AGGAAGTCTTTATAACTGGAACCCTCACCTGGATTGCACAGCACGATTGA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1528 AGGAAGTCTTTATAACTGGAACCCTCACCTGGATTGCACAGCACGATTGG 1577 1751 TGGTATTCCTCCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTGGATT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1578 TGGTATTCCTCCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTTGATT 1627 1801 GCCAGTCCTTTTGTGCCCCAATTAGCTCTTTCCAGTGCTTTAACTTCAAA 1850 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1628 GCCAGTCCTTTTGTGCCCCAATTAGTTCTTTCCAGTGCTTTAACTTCAAA 1677 1851 TAATTGGGGCTTATGTCATCAATGACGTTGTATTCCACTGAGTTGGAATA 1900 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||| 1678 TAATTGGGGCTTATGTCATCAATGACGTTGTATTTCACTGCGTTGGAATA 1727 1901 GACACGTGAATTAAAGTCCAAATGACCGCTCAAATAATTATGTGGGCCTA 1950 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||| 1728 GACACGTGAATTAAAGTCCAAGTGACCGCTCAAATAATTATGTGGTCCTA 1777 1951 ATGCACGAGCCCACATTGTCTTTCCAGTTCGTGAATCACCTTCGACGATG 2000 |*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||||| 1778 AAGCACGAGCCCACATTGTCTTTCCGGTTCGTGAATCACCCTCGACGATG 1827 2001 ATACTAATAGGTCTTTCTGGCCGCGCAGCGGAACCCCTTCCGAAATAGTC 2050 ||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1828 ATACTAATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGAACCCCTTCCGAAATAGTC 1877 2051 GTCAACCCAGTCTTGCATAACAACCGGAATATTGACGAATGATGACAACG 2100 |||||||||*|||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 1878 GTCAACCCATTCTTGCATAACAACCGGAACATTGATGAATGATGACAACG 1927 2101 GAAATGGAGGAACCCATGGTTCCGGCACTTTGAAGAAGATCCGTTCGAGA 2150 ||||||||||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||||| 1928 GAAATGGAGGAACCCATGGTTCCGGCGCTTTGACGAAGATCCGTTCGAGA 1977 2151 TTAGAACGGATGTTGTGATTTTGAAGGACGTAATCTTTCGGTTGTTCTTC 2200 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1978 TTAGAACGGATGTTGTGATTATGAAGGACGTAATCTTTCGGTTGTTCTTC 2027 2201 CTTCAATATTGTCAAGGCAGATTCAATTGAATCTGCGTTTAATGCCTTTG 2250 |||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 2028 CTTTAATATCGTCAAGGCAGATTCAATTGAATCTGCGTTCAATGCCTTTG 2077 2251 CGTATGAGTCGTTGGCAGACTGCTGACCTCCTCTTGCAGATCTGCCGTCG 2300 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2078 CATATGAGTCGTTGGCAGACTGCTGACCTCCTCTTGCAGATCTGCCGTCG 2127 2301 ACTTGGAATTGTCCCCATTCGATTGTGACTCCATCTTTGTCGATGTATTC 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2128 ACTTGGAATTGTCCCCATTCGATTGTGACTCCATCTTTGTCGATGTATTT 2177 2351 TTTGACGTCGGAACTTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTG 2400 *||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2178 CTTGACGTCTGAACTTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTG 2227 2401 CTGACCTGGTTGTGGATACCAGGTCGAACAATCTTTTATTTGTGCAGATG 2450 *|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 2228 TTGACCTGGTTGAGGATACCAGGTCGAACAATCTTTTATTTGTGCAGACG 2277 2451 AATTTACCTTCGAACTGAATAAGCGCATGAAGATGGGGTTCACCATTATC 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 2278 AATTTACCTTCGAACTGAATAAGCGCATGAAGATGGGGTTCACCATTCTC 2327 2501 GTGACGTTCCTCACAGACCTTGATGAATTTCTTATTCGTCGTTGTATGAA 2550 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|*|||||||| 2328 GTGACGTTCCTCACAGACCTTGATGAATTTTTTATTCGTGGCTGTATGAA 2377 2551 TCTTTTGAAGTTGCGAAAGAGCTTCTTCTTTCGGTATAGTGCAACGAGGA 2600 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||| 2378 TCTTCTGAAGTTGCGAAAGAGCTTCTTCTTTCGGTATAGAGCAACGGGGA 2427 2601 TAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGACTGAACTCTAAATCTTTGAGGTGG--- 2647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*** 2428 TAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGACTGAACTCTAAATCTTTGAGGTGGTGG 2477 -------------------------------------------------- ************************************************** 2478 CATATTTGTAAATATGCGAGTGTCTCCGAATGAGTTTGCGAGTGTCTCCA 2527 -------------------------------------------------- ************************************************** 2528 ATTGAGCCCCCTCAAACTTACGCTATGCAATTGGAGACTGGAGTACAATA 2577 -------------------------------------------------- ************************************************** 2578 TATACTAGAACCCTTAATCTCTCTATTTATCAGATTCACACACGGGGCGG 2627 ----------------- ***************** 2628 CCATCCGATATAATATT 2644