NC_004090 AJ564744 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTTTTAAAGTGGTCCCCACCACTAACAAA 50 ||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||||||||| 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTT--AAAGTGGTCCCCACCACTAACAAA 48 51 AATCCCCCACTTAGAACGCTCCCTCAAAGCCTATTTAATTCAAATCGACT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 49 AATCCCCCACTTAGAACGCTCCCTCAAAGCCTATTTAATTCAAATCGACT 98 101 ATAAATACTTGGTCCCTACGTTTTTAAATTAAAGCAATGTGGGATCCTCT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99 ATAAATACTTGGTCCCTACGTTTTTAAATTAAAGCAATGTGGGATCCTCT 148 151 TTTGAACGAGTTTCCCCCGAAACCTGTAACCACCCGGGGTCCTTTAAGGG 200 |||||||||*||||||**|||||*||||**|||****||||**|||**|| 149 TTTGAACGATTTTCCC--GAAAC-TGTA--CAC----GGTC--TTA--GG 185 201 TGTTAATGCCTTTTGCCCGTAAAATATTGTCAGTTAATTCCGAACAGACA 250 |||**||||***|||||*||||||||||||||||||||**|||||||||| 186 TGT--ATGC---TTGCC-GTAAAATATTGTCAGTTAAT--CGAACAGACA 227 251 TACTCTCCAGATACGGTTGGTTACGATCTTATACGAGATTTAATTTCCGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 228 TACTCTCCAGATACGGTTGGTTACGATCTTATACGAGATTTAATTTCCGT 277 301 AATTCGTGCTCGCAATTATGTCGAAGCGACCCGCCGATATAGTCATTTCC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 278 AATTCGTGCTCGCAATTATGTCGAAGCGACCCGCCGATATAGTCATTTCC 327 351 ACTCCCGCCTCGAAGGTACGACGCCGTCTGAACTTCGACACCCCCGTGAT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 328 ACTCCCGCCTCGAAGGTACGACGCCGTCTGAACTTCGACACCCCCGTGAT 377 401 GAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGTCACCAACAAAAGAAGGACGT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 378 GAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGTCACCAACAAAAGAAGGACGT 427 451 GGATCAACAGGCCCGTGTATCGCAAGCCCAGAGTCTTCAGAATGTACAGA 500 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 428 GGATCAACAGGCCCATGTATCGCAAGCCCAGAGTCTTCAGAATGTACAGA 477 501 AGCCCTGATGTGCCCAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAATCGTA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 478 AGCCCTGATGTGCCCAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAATCGTA 527 551 TGAACAGAAGCACGACATATCCCATGTGGGTAAAGTATTATGTGTTAGTG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 528 TGAACAGAAGCACGACATATCCCATGTGGGTAAAGTATTATGTGTTAGTG 577 601 ATGTCACTCGTGGTAGTGGTCTTACCCATCGTGTTGGTAAGAGATTCTGT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 578 ATGTCACTCGTGGTAGTGGTCTTACCCATCGTGTTGGTAAGAGATTCTGT 627 651 GTGAAGTCCGTTTATGTATTGGGTAAAATATGGATGGATGAAAATATCAA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 628 GTGAAGTCCGTTTATGTATTGGGTAAAATATGGATGGATGAAAATATCAA 677 701 AACGAAGAACCATACGAACACTGTGATGTTTTATCTTGTTCGTGACAGAA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 678 AACGAAGAACCATACGAACACTGTGATGTTTTATCTTGTTCGTGACAGAA 727 751 GGCCCTTTGGTACTGCCATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 728 GGCCCTTTGGTACTGCCATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGAT 777 801 AATGAGCCCAGTACTGCTACTGTCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 778 AATGAGCCCAGTACTGCTACTGTCAAGAATGATCTTCGAGATCGTTATCA 827 851 AGTTTTAAGGAAATTCACTTCAACAGTCACAGGTGGTCAATATGCTTCTA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 828 AGTTTTAAGGAAATTCACTTCAACAGTCACAGGTGGTCAATATGCTTCTA 877 901 AGGAACAGGCGTTAGTTAGGAAATTTATGAAGATTAATAATTATGTAGTT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 878 AGGAACAGGCGTTAGTTAGGAAATTTATGAAGATTAATAATTATGTAGTT 927 951 TATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGAAAATCATACTGAAAATGCCTT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 928 TATAATCATCAAGAAGCTGCTAAGTATGAAAATCATACTGAAAATGCCTT 977 1001 GTTATTGTATATGGCTTGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATACTACTT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 978 GTTATTGTATATGGCTTGTACTCATGCCAGTAATCCAGTGTATACTACTT 1027 1051 TGAAGATCAGAATCTATTTCTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAAGATTG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1028 TGAAGATCAGAATCTATTTCTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAAGATTG 1077 1101 AATTTTATTATATTTGAATGTGTTACATATTCTGTGTTTTCCAATACATC 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1078 AATTTTATTATATTTGAATGTGTTACATATTCTGTGTTTTCCAATACATC 1127 1151 CCATAATACATGATTACATGCTCTAATTACATTGTTAATACTAATTACAC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1128 CCATAATACATGATTACATGCTCTAATTACATTGTTAATACTAATTACAC 1177 1201 CCAAATTATCTAAATATTTCATACATTGAACCCTAAATACTCTTAAGAAA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1178 CCAAATTATCTAAATATTTCATACATTGAACCCTAAATACTCTTAAGAAA 1227 1251 CGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAGTCCAGATCTGGAAGATTAGAAAACA 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1228 CGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAGTCCAGATCTGGAAGATTAGAAAACA 1277 1301 CTGGTGTATTCCCAATGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAATTGTATTTGGA 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1278 CTGGTGTATTCCCAATGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAATTGTATTTGGA 1327 1351 TCGTTATGATGTCGTGGTTGGTGTTGAATGGTCTCTCGTGGTGCTTGGTT 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1328 TCGTTATGATGTCGTGGTTGGTGTTGAATGGTCTCTCGTGGTGCTTGGTT 1377 1401 ATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGATCGTCCAGGTATACACGCCACTCTC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1378 ATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGATCGTCCAGGTATACACGCCACTCTC 1427 1451 GCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCCCCTGTGCGAAAATCCATGATTTGCA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1428 GCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCCCCTGTGCGAAAATCCATGATTTGCA 1477 1501 CAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGCACCCGCACGTTAGATCAACTCTCCG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1478 CAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGCACCCGCACGTTAGATCAACTCTCCG 1527 1551 TCTCCGAATAGGCTTCCTCTTGGCTATTCTGTGTTGCACTTTGATTGGTA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1528 TCTCCGAATAGGCTTCCTCTTGGCTATTCTGTGTTGCACTTTGATTGGTA 1577 1601 CCTGAGTACAATGGGCTGTTGAGGGTGATGAATTCTGCATTCTTTAATGC 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1578 CCTGAGTACAATGGGCTGTTGAGGGTGATGAATTCTGCATTCTTTAATGC 1627 1651 CCAATCTTTTAAAGCTGAATTTTTATCCTCATTCAAGTACTCTTTATATG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1628 CCAATCTTTTAAAGCTGAATTTTTATCCTCATTCAAGTACTCTTTATATG 1677 1701 ATGATGTTGGTCCTGGATTGCAAAGGAAGATAGTTGGGATTCCACCTTTA 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1678 ATGATGTTGGTCCTGGATTGCAAAGGAAGATAGTTGGGATTCCACCTTTA 1727 1751 ATTTGAACTGGCTTCCCGTACTTAGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGC 1800 |||||||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1728 ATTTGAATTGGTTTCCCGTACTTAGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGC 1777 1801 CCCCATAAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGCGGGTCTACGTCATCAA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1778 CCCCATAAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGCGGGTCTACGTCATCAA 1827 1851 TGACGTTATACCAAGCATCATTACTGTATACTTTAGGGCTTAGATCAAGA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1828 TGACGTTATACCAAGCATCATTACTGTATACTTTAGGGCTTAGATCAAGA 1877 1901 TGTCCACACAAATAATTGTGTGGTCCCAATGATCTGGCCCACATTGTTTT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1878 TGTCCACACAAATAATTGTGTGGTCCCAATGATCTGGCCCACATTGTTTT 1927 1951 ACCTGTACGACTATCACCTTCTATCACAATACTTTTGGGTCCCCAAGGCC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1928 ACCTGTACGACTATCACCTTCTATCACAATACTTTTGGGTCTCCAAGGCC 1977 2001 GCGCAGCGGCACCACTCACATTCTCAGAAACCCACTCTTCAAGTTCTTCT 2050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1978 GCGCAGCGGCACCACTCACATTCTCAGAAACCCACTCTTCAAGTTCTTCT 2027 2051 GGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAAGAAATGGACAAACAAAAACCTCTAA 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2028 GGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAAGAAATGGACAAACAAAAACCTCTAA 2077 2101 AGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAATTACTATTTAAATTATGAAACTGTA 2150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2078 AGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAATTACTATTTAAATTATGAAACTGTA 2127 2151 AAACAAAATCTTTAGGAGCCTTTTCCTTTAATATATTGAGGGCCTCTGCT 2200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2128 AAACAAAATCTTTAGGAGCCTTTTCCTTTAATATATTGAGGGCCTCTGCT 2177 2201 TTGGACCCTGAATTGATTGCCTCGG-CATATGC-GTCGTTGGCAGTTTGG 2248 |||||||||||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||||| 2178 TTGGACCCTGAATTGATTGCCTCGGGCATATGCCGTCGTTGGCAGTTTGG 2227 2249 CAACCTCCTC-TAGCTGATCTTCCATCGATTTGGAAAACTCCATGATCAA 2297 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2228 CAACCTCCTCCTAGCTGATCTTCCATCGATTTGGAAAACTCCATGATCAA 2277 2298 GCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGCTTTAACATCTGTTGAGCTTTTA 2347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2278 GCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGCTTTAACATCTGTTGAGCTTTTA 2327 2348 GCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTACTTGGGGAGGTGAG 2397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2328 GCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTACTTGGGGAGGTGAG 2377 2398 ATCGAAGAATCTTTGATTCTTGCATTGGAATTTTCCTTCGAACTGGATGA 2447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2378 ATCGAAGAATCTTTGATTCTTGCATTGGAATTTTCCTTCGAACTGGATGA 2427 2448 GAACATGCAGGTGTGGAGTCCCATCTTCATGTAGCTCTCTGCAGATTCTG 2497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2428 GAACATGCAGGTGTGGAGTCCCATCTTCATGTAGCTCTCTGCAGATTCTG 2477 2498 ATGAATAGTTTATTTGTAGGTGTTTCTAGGGCTTTTAATTGGGAAAGTGC 2547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2478 ATGAATAGTTTATTTGTAGGTGTTTCTAGGGCTTTTAATTGGGAAAGTGC 2527 2548 TTCCTCTTTTGTGAGTGAGCAGTGAGGGTATGTTAGGAAATAATTTTTTG 2597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2528 TTCCTCTTTTGTGAGTGAGCAGTGAGGGTATGTTAGGAAATAATTTTTTG 2577 2598 CATTTATTCTGAATTTTGTAGGTGGAGGCATGTTGACTTGGTCAATTGGT 2647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2578 CATTTATTCTGAATTTTGTAGGTGGAGGCATGTTGACTTGGTCAATTGGT 2627 2648 GTCTCTCAAACTTGGATATGTAATTGGTGTCTGGGGTCTTATTTATATGT 2697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2628 GTCTCTCAAACTTGGATATGTAATTGGTGTCTGGGGTCTTATTTATATGT 2677 2698 AGACACCAAATGGCATTATTGTAATTTCTTAAAGAAATTCAAATTCCAAA 2747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2678 AGACACCAAATGGCATTATTGTAATTTCTTAAAGAAATTCAAATTCCAAA 2727 2748 AGCGGCCATCCGTATAATATT 2768 ||||||||||||||||||||| 2728 AGCGGCCATCCGTATAATATT 2748