NC_003619 AY871098 1 AGAGCAATCGGGGCATCTAATAATTCTAGAAAAACAACGATATACTCAAG 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 AGAGCAATCGGGGCATCTAATAATTCTAGAAAAACAACGATATACTCAAG 50 51 AAATACTATTTCAGGCATGTCAACCGCAAGGAGTGCTGCTTCTGAATTCG 100 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 51 AAATACTATTTCAGGCATGTCGACCGCAAGGAGTGCTGCTTCTGAATTCG 100 101 TCAAAAGCTATGGCACAAGAGACAACAGAGCAATCAATGATTGCTATTCT 150 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 101 TCAAAAGCTATGGCACAAGTGACAACAGAGCAATCAATGATTGCTATTCT 150 151 GTCTTCTCTGGAGAAGGTGTCAACTTTCTCAATTTGTTCATGCATAACAA 200 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GTCTTCTCTGGAGAAGGTATCAACTTTCTCAATTTGTTCATGCATAACAA 200 201 TGCAGGTATTAAATCTGCATTCAGCATCAACGATTTGGGCAGGAATGAGG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201 TGCAGGTATTAAATCTGCATTCAGCATCAACGATTTGGGCAGGAATGAGG 250 251 ATATCAAAATCCATGAAGCTGAAGTTATTGATTCATGCCATGATTATCAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 ATATCAAAATCCATGAAGCTGAAGTTATTGATTCATGCCATGATTATCAT 300 301 TACTTTGAGAAGTTTGGGTTAGACATAATATTCTGTGAGCATGAAATGAG 350 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 301 TACTTTGAGAAGTTTGGATTAGACATAATATTCTGTGAGCATGAAATGAG 350 351 CCTGGTTGTGGGGAAACCAGGTGTGAAGAATACAGGCTGCAAATTCACAA 400 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 CCTGGTTGTGAGGAAACCAGGTGTGAAGAATACAGGCTGCAAATTCACAA 400 401 TGCACAACCAAATTTTCAATCCTAATTCTGATACACTTGCTTTAACTCCT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 TGCACAACCAAATTTTCAATCCTAATTCTGATACACTTGCTTTAACTCCT 450 451 GGAACAGTCTCAGAAAATGAGTTCTATGAAAAAATCAAAATAAGATCAAA 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 451 GGAACAGTCTCAGAAAATGAGTTCTATGAAAAAAGCAAAATAAGATCAAA 500 501 TGGACTACTTCCCTCTGGATGGTATCAAGATGAATGCTGTAAAAACAACT 550 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 TGGACTACTTCCCTCCGGATGGTATCAAGATGAATGCTGTAAAAACAACT 550 551 TTTACATAGCTACAAATGGAGATTTGACTCTTGACTACGGGTTTTCTGTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||| 551 TTTACATAGCTACAAATGGAGATTTGACTCTCGACTATGGGTTTTCTGTT 600 601 ATGGGAAAGACAACATCCTATTGGAGAGAAAGTATCTCTAGGGAGAAGAT 650 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 601 ATGGGAAAGACAACATCCTACTGGAGAGAAAGTATCTCTAGGGAGAAGAT 650 651 TTTGTCTGTTAAGCAGAAGTGTTTACCTGATAACACTGTCCCTACCAACA 700 |||||||||||||||*||||||||||||||||**|||||||||||||||| 651 TTTGTCTGTTAAGCAAAAGTGTTTACCTGATAGTACTGTCCCTACCAACA 700 701 GGCTCCTATCTACATCAACTGTAAAAGGTATTCAGCTAGGATCTGAACTA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 701 GGCTCCTATCTACATCAACTGTAAAAGGTATTCAGCTAGGATCCGAACTA 750 751 GCCCCAGACACCACAGTGATACTATCACTTAAGCAAAATCTGAACGTTGA 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 751 GCCCCAGACACCACAGTGATACTATCACTTAAGCAAAATCTGAACGTTGA 800 801 CTTAAAATCTCAATACCGCGTTTCGTTTCATGGCATCCAAGAGGAAGGTG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 801 CTTAAAATCTCAATACCGCGTTTCGTTTCATGGCATCCAAGAGGAGGGTG 850 851 CTTTTGCAAGGACTTTCTGTGTTCCTTTTGAAAACAAATCCAGGATGATA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 851 CTTTTGCAAGGACTTTCTGTGTTCCTTTTGAAAACAAATCCAGGATGATA 900 901 TGCCTATACGCAAAAACTGTTGTGGATAACAGTAATGAAAGGACTACTCT 950 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 901 TGTCTATACGCAAAAACTGTTGTGGATAACAGTAATGAAAGGACTACTCT 950 951 GATTATAAAGGTAGTTACAAAAACTATTGAATCCCATCTAGTCATTCCTA 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 951 GATTATAAAGGTAGTTACAAAAACTATTGAATCTCATCTAGTCATTCCTA 1000 1001 TCAGGAATCACATAAATTGTGTAAAGAAAATTGGAGCCAGGATAGGGCTT 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1001 TCAGGAATCACATAAATTGTGTAAAGAAAATTGGAGCCAGGATAGGGCTT 1050 1051 GTTGATTCTATTGAAAGTGATCCTAACTATAATCAGATGATTGTTAAAGA 1100 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1051 GTTGATTCTGTTGAAAGTGATCCTAACTATAATCAGATGATTGTTAAAGA 1100 1101 GTTATTGGGTGTTCATACTCAATTTGCTATCAATTTATCCTTGGTCATAA 1150 |||*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1101 GTTGTTGGGTGTTTATACTCAATTTGCTATCAATTTATCTTTGGTCATAA 1150 1151 AGAAGCCGATCATTGTGTTCAAAATGTATGATATTGAGTTGAACAACAAT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||| 1151 AGAAGCCGATCATTGTGTTCAAAATGTATGACATTGAATTGAACAACAAT 1200 1201 CATATAGACGTTTATGGAAGGATCCTGAATTACCAGACAGATGCAGAGGG 1250 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|| 1201 CATATAGACGTTTATGGCAGGATCCTGAATTACCAGACAGATGCAGAAGG 1250 1251 AAATGCCTATTTCCTTTCAAAAACCCTTGAAGTTCTTCCCAAATCACTTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1251 AAATGCCTATTTCCTTTCAAAAACCCTTGAAGTTCTTCCTAAATCACTTT 1300 1301 CCACTCTGAGTTACTTAGGAAGCATTGCACCAATTCAATGGGAGGAATCT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1301 CCACTCTGAGTTACTTAGGAAGCATTGCACCAATTCAGTGGGAGGAATCT 1350 1351 TTGGAGCACCAGCATTTCATTGTGAAGCCAGAGTAATTCAGGTTTATGTC 1400 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1351 TTGGAGTACCAGCATTTCATTGTGAAGCCAGAGTAATTCAGGTTTATGTC 1400 1401 CTTGTTCTACTTAAGTTTATTGTGTGCATGTTATTTAATAAGCAACTAAT 1450 |||||||||||||||*||||||||*|||||||||*|||||||||*||||| 1401 CTTGTTCTACTTAAGGTTATTGTGCGCATGTTATCTAATAAGCAGCTAAT 1450 1451 AAGTGTTTGCTTGTTTAAAGTATATAAGTATTTTAAGTATTACAGTATAA 1500 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1451 AAGTGTTTGCTTGTCTAAAGTATATAAGTATTTTAAGTATTACAGTATAA 1500 1501 TGTTATCAAATATAAGTTTATATAAATAAAATAAGCTAATACTAATAAGT 1550 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1501 TGTTATCAAATATAAGTTTATATAAATAAAATAATCTAATACTAATAAGT 1550 1551 GTAAGTTTAATAATCGAATATAAATTAAATAAATAAAAACCCATAAAAAT 1600 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 1551 GTAAGTTTAATAATCAAATATAAATTAAATAAATAAAAACCCATAAAAAT 1600 1601 CAAAAAACGGAAAACCAAAAAGACCTCGAAAGAGGCAATCTTGGCTTAAC 1650 |||||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1601 CAAAAAATGAAAAACCAAAAAGACCTCGAAAGAGGCAATCTTGGCTTAAC 1650 1651 TGCTTTAATTAAACTCATTTATCAAAAGTTTTTTA-CACGGAATTCATGT 1699 |||||||||||||***||||||||||||*||||||*|**||||||||||| 1651 TGCTTTAATTAAATGTATTTATCAAAAGCTTTTTAACTTGGAATTCATGT 1700 1700 TTCATGGAATTTGAGATCTTTCGAGTATTTTAATCTCATTTATCAACTTA 1749 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1701 TTCATGGAATTTAAGATCTTTCGAGTATTTTAATCTCATTTATCAACTTA 1750 1750 CATGATTTAATCAACATGAGGAACTATACTGAATTTGGATCCCTTGAGTC 1799 *|||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||* 1751 TATGATTTAATCAACATGAGGAACTATACTGAATTTAGATCCCTTAAGTA 1800 1800 CTGTAAATTAATCCGAGCTAGATAATCAATTCCAGAAATAAAGCAAATCT 1849 |||**|*|||||||||*|||||||||||*||||*||||||||||||||*| 1801 CTGCGAGTTAATCCGAACTAGATAATCAGTTCCGGAAATAAAGCAAATTT 1850 1850 ATGTTCAAGACCGGCCAATCGGTTGCCTCCGAAGAGGTCTTTTTTGGTTT 1899 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||| 1851 ATGTTCAAGACCGGCCAATAGGTTGCCTCCGAAGAGGTCTTTTTTGATTT 1900 1900 TTTGATTTTTTGATTTTTTTGGGTTTTTTGTTATTTATTTATTTTACTTA 1949 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1901 TTTGATTTTTTGATTTTTTTGGGTTTTT-GTTATTTATTTATTTTACTTA 1949 1950 TTAATTATTATTTGGTTTATTTATTATCTTACTCTTATATTTATTTTAAA 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1950 TTAATTATTATTTGGTTTATTTATTATCTTACTCTTATATTTATTTTAAA 1999 2000 CACAAACACAATAACACAATAAGTAAAGTAACATTTAAATTTAATACACA 2049 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||*| 2000 CACAAACACAATAACACAACAAGTAAAGTAACATTTAAATTTAATACATA 2049 2050 ATGTAAACACATAAAGAACTTATAAACACACAAAAGAGCTTATATTACTT 2099 ||*||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2050 ATATAAACACACAGAGAACTTATAAACACACAAAAGAGCTTATATTACTT 2099 2100 AACAACCACACATAAACTTAGATACATATTAACATGCATAAACACCTTAT 2149 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2100 AACAACCACACATAAACTTAGGTACATATTAACATGCATAAACACCTTAT 2149 2150 ATGAAACAATTTACAATTCCAGCGAAGGACCAGCCTTTGAACTCTTCTTC 2199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2150 ATGAAACAATTTACAATTCCAGCGAAGGACCAGCCTTTGAACTCTTTTTC 2199 2200 TTAGAATGTTCACCATAATCATCCATTGAGAGACTGGCACTGAAAGCTTT 2249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2200 TTAGAATGTTCACCATAATCATCCATTGAGAGACTGGCACTGAAAGCTTT 2249 2250 GTCCATGTATTTGACTTGTTCATCATATTTCTTGAGTGAGATAGAGCTGG 2299 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2250 GTCCATATATTTGACTTGTTCATCATATTTCTTGAGTGAGATAGAGCTGG 2299 2300 CTGTTCCAGGGTTGCTCTCACTCAATAGCTTTACAGCTGATTTAAACATT 2349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2300 CTGTTCCAGGGTTGCTCTCACTCAATAGCTTTACAGCTGATTTAAACATT 2349 2350 TCCTCTAGTTCATTTTTGAATTCAATCTGTGAAGCAGAAAGTACTTTGGC 2399 *||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 2350 ACCTCTAGTTCATTTTTAAATTCAATCTGTGAAGCAGAAAGTACTTTGGC 2399 2400 TACTTTGCAAACCTGTTCATAAGTAGAAAAGTTCTTAATTCCTAATTTCT 2449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2400 TACTTTGCAAACCTGTTCATAAGTAGAAAAGTTCTTAATTCCTAATTTCT 2449 2450 CTTTCTTCACATTTTGATAATAAGCCAGAGGGAATATAATTGGTGCCAGA 2499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2450 CTTTCTTCACATTTTGATAATAAGCCAGAGGGAATATAATTGGTGCCAGA 2499 2500 CCTGTCATGCTAGACAAGAGAGGTAGAGGACCTCCAATGCAGAGCATCAT 2549 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2500 CCTGTCATGCTAGACAAGAGAGGCAGAGGACCTCCAATGCAGAGCATCAT 2549 2550 CCTTAAAGCACATGTATCGAAAGATGCAGGGACATTTAATCCATAAGCTG 2599 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2550 CCTTAAAGCACATGTATCAAAAGATGCAGGGACATTTAATCCATAAGCTG 2599 2600 CCACTAATGGTAATTCCATTATTTTATTGTACATCTCCTGCTTAGCAGCA 2649 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2600 CTACTAATGGTAATTCCATTATTTTATTGTACATCTCCTGCTTAGCAGCA 2649 2650 TCATTCTTGCTCTTCTCAACCATACTAGCCATTTTGGTCCTGATGAAAGC 2699 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2650 TCATTCTTGCTCTTTTCAACCATACTAGCCATTTTAGTCCTGATGAAAGC 2699 2700 TTCTGTCCTTTTGAAGGTCCAGTCATCTGGCCCTACATCAGTATTTGTAG 2749 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 2700 TTCTGTCCTTTTGAAGGTCCAGTCATCTGGCCCTACGTCAGTATTTGTAG 2749 2750 CAACAATAGTTTTACCACAAAAAACATACTTACCACTTTTACAAGCAGCA 2799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||| 2750 CAACAATAGTTTTACCACAAAAAACATACTTACCACTCTTGCAAGCAGCA 2799 2800 AAGATCTGCTTCCTGCACTTCAAAATATTCAAACAGTTTGTAAAAGTTAT 2849 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||*|||||*|||||||| 2800 AAGATCTGCTTCCTGCACTTCAGAATATTCAAACAATTTGTGAAAGTTAT 2849 2850 TTCAAGATTTTTGTTGGTGTCATAGAAAGCTTTAAAGCTAAATCCGGGAG 2899 |||||||*|||||||*|*||||||*||||||||||||||||||||||||| 2850 TTCAAGAGTTTTGTTAGCGTCATAAAAAGCTTTAAAGCTAAATCCGGGAG 2899 2900 TGGAATCTTCTGTTTCAATTTCAACATCTGCAGAGCCACCAGCCAAAAGT 2949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2900 TGGAATCTTCTGTTTCAATTTCAACATCTGCAGAGCCACCAGCCAAAAGT 2949 2950 TCTTTGATTTTCTTCTCGGTGAGTTGCTTGACGTTAGACATGGTGTTTAC 2999 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2950 TCTTTGATTTTTTTCTCGGTGAGTTGCTTGACGTTAGACATGGTGTTTAC 2999 3000 TCTGGAAACGTCTAGTATATTGACTTTGAATGAATTTTATTAGCGCCTCG 3049 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3000 TCTGGAAACGTCTAGTATATTGACTTTGAATGAATTTTATTAGCGCCTCG 3049 3050 ATTGCTCT 3057 |||||||| 3050 ATTGCTCT 3057