NC_003556 AJ438937 1 GTTGACTGGTCAATCGGTGTCTCTCAAAGTTCTATGCAATCGGTGTCTCT 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 GGAGTCTTATTTATAGTAGAGACTCCAAATGGCATAAATGGTAATTATTG 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 GGGGTAGGAGCGTGTCTTTTTGAATTTCAAATCGCCAAAGCGGCCATCCG 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 TATAATATTACCGGATGGCCGCCGATTTTTTTTGTGGCCCCTCCCTGTCG 200 *********|||||||||||||||||||||||**|||*|||||||||||* 1 ---------ACCGGATGGCCGCCGATTTTTTTAATGGGCCCTCCCTGTCT 41 201 GCTGATCCTGACCGTTCCTCAACGCTTAATTAAATACTGGTCCCCGTACG 250 |||||||||||||*|*|*|**|*||*||||||||||||*||*|||*||*| 42 GCTGATCCTGACCATCCTTTGAAGCCTAATTAAATACTTGTTCCC-TAAG 90 251 TCTTTAA-GTATTTAA-TACTTGCGCCCTAAGCTTTATACGTGTATAATG 298 |||||***||||||||*|||*|**||||||*||||||||||||||||||| 91 TCTTTTCCGTATTTAAATACGTATGCCCTA-GCTTTATACGTGTATAATG 139 299 TGGGATCCATTAGTTAACGAGTTCCCTGAAACCGTACACGGTTTTAGGTG 348 |||||||||||**|||||||*||*|||||||||||||||||||||||||| 140 TGGGATCCATTGCTTAACGAATTTCCTGAAACCGTACACGGTTTTAGGTG 189 349 TATGCTTGCAATTAAATACCTACAGCTTGTAGAATCTACGTATTCTCCAG 398 |||||||*||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||| 190 TATGCTTTCAATTAAATACCTACAGCTTGTAGAAAATACGTATTCTCCAG 239 399 ATACGGTAGGTCGCGATCTTATTCGTGACCTAATACTTGTTATTCGTGCT 448 |*||*||||||||*||||||||*||||||||*||||||||*||*||*||| 240 ACACCGTAGGTCGTGATCTTATACGTGACCTTATACTTGTCATACGAGCT 289 449 AAGAATTATGTCGAAGCGTCCTGCAGATATAGTGATTTCCACACCCGCCT 498 |||||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||| 290 AAGAACTATGTCGAAGCGTCCTGCCGATATAGTGATTTCCACGCCCGCCT 339 499 CCAAGGTACGTCGCCGTCTGAACTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCG 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 340 CCAAGGTACGTCGCCGTCTGAACTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCG 389 549 AATGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAGAAGGAGATCATGGGCTCAACG 598 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 390 AATGCCCCCACTGTCCTCGTCACAAACAGAAGGAGATCATGGGCTCAAAG 439 599 GCCCATGTATCGGAAGCCCAGGATGTTCCGAATGTACAGAAGCCCTGATA 648 ||||||||**||||||||||||||||*|*||||||||||||||||||||| 440 GCCCATGTTCCGGAAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAGAAGCCCTGATA 489 649 TCCCTAAGGGCTGTGAAGGCCCGTGTAAGGTCCAGTCGTTTGAGAAGAAA 698 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 490 TCCCCAAGGGCTGTGAAGGCCCGTGTAAGGTCCAGTCATTTGAGAAGAAA 539 699 AATGATGTTGGTCATTCTGGTACTTTGTTATGTGTTTCTGATGTTACTCG 748 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||*||||||||||| 540 AATGATGTTGGTCATTCTGGTACTTTGTTAAGTGTGTCCGATGTTACTCG 589 749 TGGTAACGGTCTTACTCATCGTTCTGGCAAGAGATTTTGTATAAAATCTT 798 |||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||*||||||| 590 TGGTAACGGTCTTACTCATCGATCTGGGAAGAGATTTTGTATTAAATCTT 639 799 GTTATATTATTGGTAAAATCTGGATGGATGAAAACATCAAGACTAAGAAT 848 ||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||* 640 GTTACATTATTGGTAAAATCTGGATGGATGAAAACATCAAGACTAAAAAC 689 849 CACACTAACACTGTCATGTTCTGGTTAGTTAGGGATAGACGTCCCCTTAC 898 ||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||| 690 CACACTAACACTGTCATGTTTTGGTTAGTTAGAGATAGACGTCCCCTTAC 739 899 AACCCCGTATGGATTTCAAGAGGCATTCAACATGTTTGATAACGAACCCA 948 *||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 740 GACTCCGTATGGATTTCAAGAGGCTTTCAACATGTTTGATAACGAACCCA 789 949 GTACAGCTACTATCAAGCAGGACCTAAGAGATCGTCTGCAGGTGTTACAC 998 ||||*||*||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 790 GTACTGCAACAATCAAGCAGGACCTTAGAGATCGTCTGCAGGTGTTACAC 839 999 AAGTTCCAGGCTACTGTCACTGGTGGACAGTATGCGTCCAAGGAACAGGC 1048 |||||*||*||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 840 AAGTTTCATGCCACTGTCACCGGTGGACAGTATGCGTCCAAGGAACAGGC 889 1049 TGTGATCAAGAAGTTCTGGAAGATCAATCATCATGTTACTTACAATCATC 1098 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||||||||||||| 890 TGTGATCAAGAAGTTCTGGAAGCTCAATCATCATGTGACTTACAATCATC 939 1099 AGGAGCAGGCTAAATATGAGAATCATACTGAGAACGCATTAATATTGTAT 1148 |*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 940 AAGAGCAGGCTAAATATGAGAACCATACTGAGAACGCATTAATATTGTAT 989 1149 ATGGCTAGTACTCATGCCAGTAATCCCGTGTATGCAACTTTGAAAATCAG 1198 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 990 ATGGCTAGTACTCATGCCAGTAATCCCGTGTATGCAACCTTGAAAATCAG 1039 1199 GTTCTATTTTTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAATTTTATATTTTATAT 1248 |*|||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1040 GATCTATTTCTATGATTCTGTTCAGAATTAATAAATTTTATATTTTATAT 1089 1249 CATGAAATGTCCGTACATACAATGTTCCTTGTAATCTATTATACAATACA 1298 |||||||||||*|||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||| 1090 CATGAAATGTCTGTACATACATTGTTCCTTGCAATCTATTATACAATACA 1139 1299 TGATCAACTGCTCTAATTACATTATTAATTGAAATCACACCCAGACTATC 1348 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||*|||||* 1140 TGATCAACTGCCCTAATTACATTATTAATTGAAATCACACCCAAACTATA 1189 1349 TAAGTAGTTCATCACTTGTGTCCTAAAGACCCTCAAGAAATGCCATGTCT 1398 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||*|||| 1190 TAAGTAGTTCATCACTTGGGTCCTAAAGACCCTCAAGAAACGCCACGTCT 1239 1399 GAGGATGTAAGCGGCTCCAGATCTTGAAAATGAGGAAACACTTGTGCAAA 1448 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1240 GAGGATGTAAGCGACTCCAGATCTTGAAAATGAGGAAACACTTGTGCAAA 1289 1449 CCCAGCTGGGATCTGAGGTTGTGGTTGAACTGTATCTGTATTGTTATTAC 1498 |||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|* 1290 CCCAGGTGGGATCTTAGGTTGTGGTTGAACTGTATCTGTATTGTTATGAT 1339 1499 GTCTTGGTCCCTGTTGAATGATCGTTGATTGTGCCTCGTAATCTTGAAAT 1548 ||||||*|*||||||||||||*|||||||*||||||*||*||*||||||| 1340 GTCTTGATTCCTGTTGAATGACCGTTGATCGTGCCTGGTGATTTTGAAAT 1389 1549 AGAGGGGATTTGGAACCCTCCAGATATACTCTCCATTCTGTGCCTGAGCT 1598 |||||||||||||*|||*|||||||||||*|*|||*||||*||||||||| 1390 AGAGGGGATTTGGTACCGTCCAGATATACGCGCCACTCTGCGCCTGAGCT 1439 1599 GCAGTGATGAGTATCCCTGTGCGTGAATCCATAGTTTGCACAGTCAAGTC 1648 |||||*||||***|||||||||||||||||||*||||||||||||*|||| 1440 GCAGTAATGATGGTCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTTGCACAGTCTAGTC 1489 1649 CCACGAAGATAGAACACCCGCAGTTTAGATCAATCCTCCTCCTGCGGTTC 1698 |||||*|||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1490 CCACGTAGATAGAACACCCGCAGTTCAGATCAATCCTCCTCCTGCGGTTC 1539 1699 TTCTTCTTCGATTTGGCTATCCTGTGCTGGACTTTGATGGGAACCTGAAT 1748 |||||||||***|||||||||||||||||||||||||||||*||||||*| 1540 TTCTTCTTC---TTGGCTATCCTGTGCTGGACTTTGATGGGTACCTGAGT 1586 1749 AGAGTGGGCTGTAGAGGGTGACGAAGGTTGCATTTTTAACTGCCCAGGCT 1798 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1587 AGAGTGGGCTGTAGAGGGTGACGAAGGTTGCATTCTTAACTGCCCAGGCT 1636 1799 TTTAATGCGGAATTCTTTTCTTCGTCCAGAAATTCCGTATATGAAGACGT 1848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1637 TTTAATGCGGAATTCTTTTCTTCGTCCAGAAATTCCGTATATGAAGACGT 1686 1849 TGGACCTGGATTGCAGAGGAAGATTGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAA 1898 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1687 TGGTCCTGGATTGCAGAGGAAGATTGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAA 1736 1899 TTGGCTTCCCGTACTTCGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATG 1948 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1737 TTGGTTTCCCGTACTTCGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATG 1786 1949 AATTCTTTAAAATGCTTTAGATAGTGGGGGTCTACATCATCAACGACGTT 1998 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1787 AATTCTTTAAAATGCTTTAGGTAGTGGGGGTCTACATCATCAACGACGTT 1836 1999 GTACCATGCGTCGTTGCTGTAGATCTTCGGACTCAGATCCAGATGACCGC 2048 ||||||*|||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||*| 1837 GTACCAGGCGTCGTTGCTGTAGATTTTTGGACTCAGATCCAGATGACCAC 1886 2049 ATAGGTAGTTATGTGGACCTAACGACCTAGCCCACATCGTTTTTCCTGTC 2098 |||||||||||||*||||||||*||||||||||||||*||*||*|||||| 1887 ATAGGTAGTTATGAGGACCTAATGACCTAGCCCACATTGTCTTGCCTGTC 1936 2099 CTACTGTCACCCTCTATGACAATACTAATCGGTCTCCATGGCCGCGCAG- 2147 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1937 CTACTATCACCCTCTATGACAATACTAATCGGTCTCCATGGCCGCGCAGC 1986 2148 --AAGACTTCACGTTTTCTGCAGCCCATTCCTCAAGTTCTTCAGGAACTT 2195 **|||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1987 GGAAGACTTTACGTTTTCTGCAGCCCATTCCTCAAGTTCTTCAGGAACTT 2036 2196 GATCAAATGAAGAACTAGAAAAAGGACAAACAAAAACCTCCAATGGAGGA 2245 ||||||||||||||***|**|||||||||||||||||||||||*|||||| 2037 GATCAAATGAAGAAGCTGTGAAAGGACAAACAAAAACCTCCAACGGAGGA 2086 2246 GCAAAAATCCTATCTAAATTTGAATTTAAATTATGAAATTGTAAAACAAA 2295 ||||||||*|||||||||||***||||||||||||*||*|||||*|||*| 2087 GCAAAAATTCTATCTAAATTACTATTTAAATTATGGAACTGTAATACATA 2136 2296 ATCTTTGGGAGCTTTCTCCCTTAATATATTGAGTGCCGATGACTTTGATC 2345 |||**|*||*|||***|||*|*|**|***|*||*|||**||||||***|| 2137 ATCCATAGGGGCTAGTTCCTTGATGACCCTAAGAGCCTCTGACTTACTTC 2186 2346 CTGAGTTGATTGCCTCGGCATATGCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCC 2395 |*|*|||*|||||||*|||*||*|||||*|||||*|||||****||*||* 2187 CAGTGTTAATTGCCTGGGCGTAAGCGTCATTGGCTGATTGCTGTCCACCT 2236 2396 CTAGCTGATCTTCCATCGACTTGGAAAACTCCAAAATCAAGGATGTCTCC 2445 ||*||***|||*|||||||**|||||**||||**|*||***||**|**|| 2237 CTTGCACTTCTCCCATCGATCTGGAATTCTCCCCAGTCGGAGAATTGACC 2286 2446 GTCTTTCTCCATGTAGGACTTGACATCTGACGAGCTTTTAGCCGCCTGAA 2495 |||*|||||*||||||||||||||*||*||***|**||||||**|||||| 2287 GTCCTTCTCGATGTAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAA 2336 2496 TGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTACTTGGGGATACGAGGTCGAAGAAT 2545 ||||***|||||||||||*|||||||*||||||||||*|||||||||||| 2337 TGTTGCAATGGAAATGTGTTGACCTATTTGGGGATACCAGGTCGAAGAAT 2386 2546 CGTTGATTTTTGCATTGGTATTTTCCTTCGAATTGGATGAGGATGTGGAG 2595 |***|||||*||||||||*||||*|||||||||||*|**|||***||*|* 2387 CTCGGATTTGTGCATTGGAATTTCCCTTCGAATTGAAGAAGGGAATGCAA 2436 2596 ATGAGGGCTCCCATCTTCATGTAATTCACGGCAGATTCTTATGAATTTTT 2645 *|||||***|||*|||||||||**|||**|*||*|**||||||||||||| 2437 GTGAGGAGACCCGTCTTCATGTTGTTCTTGACAAACCCTTATGAATTTTT 2486 2646 TTGATATCGGTGTTTGGAGTTGCTTGATTTGTGAGAGTGCTTCTCCTTTA 2695 |***||**||||||||||**|*****|*|||*||*|||||||||*|**|* 2487 TGTTTACTGGTGTTTGGATATTTCGTAATTGGGAAAGTGCTTCTTCGATC 2536 2696 GTAAGAGAGCAGTGTGGGTATGTGAGGAAATAATTCTTTGCATTTATTTT 2745 ||*|**|||||*||*||*||*||||||||||||||*||***|||||||** 2537 GTTAATGAGCATTGAGGATAGGTGAGGAAATAATTTTTGCTATTTATTCG 2586 2746 AAAACGATTTGGGGCAGGCAT----------------------------- 2766 |||*||*|||||*|**|*|||***************************** 2587 AAATCGTTTTGGTGGTGCCATATTTACTAATATGCCCTTGTACACCGATT 2636 -------------------------------------------------- ************************************************** 2637 GGGAGAGAAAACTTCTGTGCCATGTATCGGTGTAATGGGGTACAATATAT 2686 -------------------------------------------------- ************************************************** 2687 AGGTGTACACCAAATGGCATAATTGTAAATTATGAAAGTAGGAGCGTGCT 2736 ------------------------------------------ ****************************************** 2737 TTTGAAATTCAAAATTGCCAAAGCGGCCATCCGTTTAATATT 2778