NC_003609 AJ421523 1 TGACTTGGTCAATTGGTACCAATTGATCTCTCTCCTGGTATCGGTACATT 50 *****************|||***||**|*|*|***********|*|**|| 1 -----------------ACCGGATGGCCGCCC-----------GAAATTT 22 51 GGTACCAATATATATGGTGGTACCTAATGGCATTATTGTAATTACTTTAA 100 *||************||||||*||************************** 23 CGT------------GGTGGTCCC-------------------------- 34 101 TGTTGAATTTAAAATTCAAATTGGTAAAGCGGCCATCCGTCTAATATTAC 150 *************************************************| 35 -------------------------------------------------C 35 151 CGGATGGCCGCGCGAAATTTCGTGGTGGGCCCCCCTTGTCGGCCAATAGA 200 |**|||*|*||*********||||||***||||||*|||||||||||**| 36 CCCATGTCGGC---------CGTGGTC--CCCCCCATGTCGGCCAATGAA 74 201 GTTCGTGCCTTGAAAGTTAGATAAGTGGATGTTGACGTCA-CTTTTGTCT 249 ***|||||||||||*||||||||||||||***||||||***||||||||| 75 TAACGTGCCTTGAATGTTAGATAAGTGGAAAGTGACGTTTGCTTTTGTCT 124 250 TTATATACGTCAGCCCTAATTTTAAAGGTTAAACATGTGGGATCCTTTAC 299 |||||||||||||||||||||||||*|||**||*|||||||||||||||* 125 TTATATACGTCAGCCCTAATTTTAACGGTGTAAGATGTGGGATCCTTTAG 174 300 TTAACGATTTCCCTGAAACCGTACACGGTTTTCGGTGTATGCTAGCGGTT 349 ||||||||||||||||||||||*|||||||||*||||||||*|||||||| 175 TTAACGATTTCCCTGAAACCGTTCACGGTTTTAGGTGTATGTTAGCGGTT 224 350 AAATACCTTCTTCTGGTTGAGGCTACATACTCTCCGGATACGGTGGGTTA 399 ||*|||||*||*||*|||||**||||*|||*||||*|||||*||*||*|| 225 AAGTACCTCCTACTTGTTGAATCTACGTACGCTCCAGATACTGTTGGGTA 274 400 CGATCTAATACGCGATCTTATAGGTGTTGTTCGTGCGAAGAATTATGTCG 449 ||||||**|||||||||||||*||*||||||||*||*|||||*||||||| 275 CGATCTTGTACGCGATCTTATTGGAGTTGTTCGAGCTAAGAACTATGTCG 324 450 AAGCGACCAGCAGATATAGGGATTTTCACTCCCGCATTCAGGGCACGTCG 499 |||||*||*|||||||||||*||||||||*||||**|*||*||*|||*|| 325 AAGCGTCCTGCAGATATAGGAATTTTCACACCCGTCTCCAAGGTACGGCG 374 500 CCGTCTGAACTTCGACGGCCCGTATGTCAGCCGTGTGAATGTCCCCATTG 549 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||*||*||*|||||||| 375 CCGTCTGAACTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCGAGTGCCCCCATTG 424 550 CCCAAGGCACAAGCAAAGAGAGATCATGGGCTCAAAGGCCCATGTATCGG 599 |||**|*|||||*||||**|||||||||||||||**|||||||||||||| 425 CCCTCGTCACAAACAAAAGGAGATCATGGGCTCAGCGGCCCATGTATCGG 474 600 AAGCCCAGGATATACAGGATGTACAGAAGCCCTGATGTACCTAAGGGGTG 649 |||||||||||*|||||*|||||||||||*||||||||*||*|||||||| 475 AAGCCCAGGATGTACAGAATGTACAGAAGTCCTGATGTTCCCAAGGGGTG 524 650 TGAAGGCCCGTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAGAAGAAAGATGATGTTGGTC 699 ||||||*|||||||||||*|||||*||*||||*|||**||||||||||*| 525 TGAAGGTCCGTGTAAGGTACAGTCATTTGAGACGAAGAATGATGTTGGGC 574 700 ACTCTGGTAAAATGTTATGTATCTCAGATATTACTCGTGGTAATGGACTT 749 |*|||||||***||*|*|||*|*||*|||||*||*||||||||||||||| 575 ATTCTGGTACTCTGCTCTGTGTTTCTGATATCACCCGTGGTAATGGACTT 624 750 ACACATCGTGTTGGGAAGAGGTTTTGTATTAAATCAGTCTATATCATTGG 799 ||*|||||||||||||||||*||||||||*|||||*||*|||||*||||| 625 ACTCATCGTGTTGGGAAGAGATTTTGTATAAAATCTGTTTATATTATTGG 674 800 AAAGATATGGATGGATGAGAACATTAAGCTCAAGAATCACACTAATAACG 849 *||*||*|||||||||||*||*||||||***||||||||||||||*|||| 675 TAAAATCTGGATGGATGACAATATTAAGACGAAGAATCACACTAACAACG 724 850 TGATCTTCTGGCTTGTTAGAGATAGGCGCCCTGTGTCCGTTCCTTATGGT 899 ||*|*||||||*|*|||||*|||||*||*||||**||***|||||||||* 725 TGTTATTCTGGTTAGTTAGGGATAGACGTCCTGGTTCAACTCCTTATGGA 774 900 TTCCAAGAGGCGTTTAATATGTATGAAAATGAACCTAGTACGGCTACTAT 949 |||||||||||*||*||||||**|*|||||||*||*|||||*||*||||| 775 TTCCAAGAGGCATTCAATATGATTCAAAATGAGCCCAGTACAGCCACTAT 824 950 CAAACAGGATTTGAGAGATCGCTTGCAGGTTTTACACAAGTTCACTGGTA 999 *||||||||*|||||||||||*||||||||*|||||*|*|||||*||**| 825 TAAACAGGAGTTGAGAGATCGTTTGCAGGTGTTACATAGGTTCAGTGCGA 874 1000 CGGTTACAGGTGGGCAATATGCGTCTAAGGAACAAGCTATGATCAAGCGT 1049 |*|||||||||||*|||||||*|||*||||||||||||||*||||||*|* 875 CTGTTACAGGTGGACAATATGTGTCCAAGGAACAAGCTATCATCAAGAGG 924 1050 TTCTGGAGGTTGAATCATCATGTCACATACAATCACCAAGAGGCTGCTAA 1099 |||||||*||||||||||||||||||*||||||||*||*|||***||||| 925 TTCTGGAAGTTGAATCATCATGTCACTTACAATCATCAGGAGCAAGCTAA 974 1100 ATATGAGAACCATACTGAAAATGCTTTGTTATTGTATATGGCCTGTACTC 1149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 975 ATATGAGAACCATACTGAAAATGCTTTGTTATTGTATATGGCGTGTACTC 1024 1150 ATGCCAGTAATCCAGTGTATGCTACATTGAAAATCAGAGTGTATTTCTAT 1199 ||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||* 1025 ATGCCAGTAATCCAGTGTATGCCACATTAAAAATCAGAGTGTATTTCTAC 1074 1200 GATTCAGTACAGAATTAATAAAGCTTGAATTTTATATCAGTAAATTGTTG 1249 |||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||| 1075 GATTCAGTACAAAATTAATAAAGCTTAAATTTTATATCTGTAAATTGTTG 1124 1250 TACATACTCTGTTCCATCTAATACATCGTACAATACGTGATCAACTGCCC 1299 ||||*|*||*|||||*||*|||||||**||*|||||*|||||*|||||*| 1125 TACACATTCAGTTCCTTCGAATACATTATATAATACATGATCTACTGCTC 1174 1300 TAATTACATTGTTAATTGAAATTACACTCAAATCATCTAAATACTTCAAC 1349 |||||||||||||||||||*|||||||*|||||*||||||*||||||||| 1175 TAATTACATTGTTAATTGATATTACACCCAAATTATCTAAGTACTTCAAC 1224 1350 ACTTGTGTCCTAAATAAAATTAAGAAATGCGAGGTCTGATGATGTGAGAG 1399 ||||||||||||||||***|*|||||||||*|*||||||*|||||*||*| 1225 ACTTGTGTCCTAAATACCCTCAAGAAATGCAAAGTCTGAGGATGTAAGCG 1274 1400 AGTCCAAATCTTGAAAGTCAGGAAGCACTTGTGTAGACCCAGTTGAGATC 1449 |||||||||||||||||**||||||||||||||||****|||||||***| 1275 AGTCCAAATCTTGAAAGAGAGGAAGCACTTGTGTATGTGCAGTTGATTCC 1324 1450 TGAGATTGTGGTTGAATTGGATCTGTGCTGTTATTATGTCCTGATCCATG 1499 ||||*||||||||||||||*||||||***||||||||*|||||||||||| 1325 TGAGGTTGTGGTTGAATTGTATCTGTAAAGTTATTATATCCTGATCCATG 1374 1500 TTGAACGGTCGTTGTGCGTGGCTCGTGATTTTGAAATAAAGGGGATTTGG 1549 ||||**||*|||||*|||||**||||||||||||||||*||||||||*|| 1375 TTGAGTGGCCGTTGCGCGTGTGTCGTGATTTTGAAATATAGGGGATTGGG 1424 1550 CACTGTCCAGATATACGCGCCACTCCTTGCCTGAGCTGCAGTGATGGTGA 1599 ||||||||||*|||||||*|||*||||||||||||||||||||||||||* 1425 CACTGTCCAGGTATACGCACCATTCCTTGCCTGAGCTGCAGTGATGGTGT 1474 1600 CCCCTGTGCGTGAATCCATGATTTGCACACCCTAAACTGACGTATATAGA 1649 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||***||||||*||||| 1475 CCCCTGTGCGTGAATCCATGATTTGCACACCCCAATGCGACGTAAATAGA 1524 1650 ACACCCACAGTTCAGATCAATCCTCCGCCTGCGAGGTGCTCTCTTCTTCT 1699 ||||||*|||||||||||||||||||*||*|||||||||||||*|||||| 1525 ACACCCGCAGTTCAGATCAATCCTCCTCCGGCGAGGTGCTCTCCTCTTCT 1574 1700 CTGATCTGTGTCGCACCTTGATGGGTACTGGAGTAGAGTGGGCTGTAGAG 1749 ||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||*|||||| 1575 CTGATCTGTGTCGCACCTTGATGGGTACCTGAGTAGAGTGGGCCGTAGAG 1624 1750 GGTGATGAAGGTTGCATTTCTAATTGCCCAGGCCTTTAGGGCAGCATTCT 1799 |||||*|||||*|||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||| 1625 GGTGACGAAGGCTGCATTTTTAATTGCCCAGGCTTTTAGGGCAGCATTCT 1674 1800 TCTCCTCGTCTAAATATTCTGTGTATGATGACGTTGGGCCTGGATTGCAG 1849 |*||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1675 TGTCCTCGTCTAAATACTCGGTGTATGATGACGTTGGGCCTGGATTGCAG 1724 1850 AGGAAGATTGTTGGGATACCACCTTTAATTTGAATTGGTTTCCCGTACTT 1899 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1725 AGGAAGATTGTTGGGATACCTCCTTTAATTTGAATTGGTTTCCCGTACTT 1774 1900 GGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAACTCTTTAAAGTGCT 1949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1775 GGTGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAACTCTTTAAAGTGCT 1824 1950 TTAGATAGTGGGGATCCACGTCATCAATGACGTTGTACCATGCCTCGTTG 1999 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1825 TTAGATAGTGGGGATCCACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCCTCGTTG 1874 2000 CTGTAAACCTTGGGGCTTAAGTCAAGGTGGCCGCAAAGGTAATTATGACG 2049 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||| 1875 CTGTAAACCTTGGGGCTTAAGTCAAGATGGCCGCAAAGGTAGTTATGACG 1924 2050 TGGATGTAGAGACCTGGCCCACATGGTCTTCCCTGTCCTGCTATCCCCCT 2099 ||||***|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1925 TGGACTCAAAGACCTGGCCCACATGGTCTTCCCTGTCCTGCTATCCCCTT 1974 2100 CTATCACAATACTCATGGGCCTCCACGGCCGCGCAGCGGAATCCCTGACG 2149 ||||||||||*||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1975 CTATCACAATGCTAATGGGCCTCCATGGCCGCGCAGCGGAATCCCTGACG 2024 2150 TTCTCGGCAGCCCATTCCTCAAGTTGCTCTGGAACTTGATCAAAGGAAGA 2199 |||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||*||||| 2025 TTCTCGGCAGCCCATCCCTCAAGTTGCTCTGGAACTTGATCAAATGAAGA 2074 2200 AGATAAAAAAGGAGAAACAAATTCCTCCAACGGAGGAGCAAAAATCCTAT 2249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2075 AGATAAAAAAGGAGAAACAAATTCCTCCAACGGAGGAGCAAAAATCCTAT 2124 2250 CTAAATTACTATTTAAATTATGAAATTGTAAAACAAAATCTTTGGGAGCT 2299 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2125 CTAAATTGCTATTTAAATTATGAAATTGTAAAACAAAATCTTTGGGAGCT 2174 2300 TTCTCCCTTAATATAGACAAGGCCGATGACTTGGACCCTGAGTTGATTGC 2349 |||||||||||||||*|*|**|||||||||||*||*|||||||||||||| 2175 TTCTCCCTTAATATACAGAGTGCCGATGACTTAGATCCTGAGTTGATTGC 2224 2350 CTCGGCATATGCGTCGTTGGCAGACTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTC 2399 |||||||||*||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2225 CTCGGCATACGCGTCGGTGGCAGACTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTC 2274 2400 CATCGACCTGGAAAATTCCAAAATCAACGACGTCCCCGTCTTTTTCCATG 2449 |||||||||||||*|*||||||||||||||*|||*||||||||*|||||* 2275 CATCGACCTGGAACACTCCAAAATCAACGATGTCTCCGTCTTTCTCCATA 2324 2450 TAGGCCTTGACGTCCGACGAGCTCTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAA 2499 ||||*||||||*||*||||||||*|||||**||||||||||*|||||||| 2325 TAGGTCTTGACATCTGACGAGCTTTTAGCCGCCTGAATGTTGGGATGGAA 2374 2500 ATGTGCTGACCTAGTTGGGGATACGAGATCGAAGAATCGTTGATTTGTGC 2549 ||||||||||||**||||||||||*||*|||||||||||||||||||||| 2375 ATGTGCTGACCTGCTTGGGGATACTAGGTCGAAGAATCGTTGATTTGTGC 2424 2550 ATCTGTATTTTCCTTCGAATTGCAGGAGGACGTGGAGATGAGGGCTCCCA 2599 |**|||||||*||*|||||*||*|*||||||||||||||||||||||||| 2425 AGTTGTATTTCCCCTCGAACTGGATGAGGACGTGGAGATGAGGGCTCCCA 2474 2600 TCTTCGTGTAATTCTCTGCAAATTCTGATGAATAATTTATTGGTTGGTGT 2649 |*||**||||**||||||||*||*||*||||||****|*||*|||||||| 2475 TTTTGATGTAGCTCTCTGCAGATCCTTATGAATTTAATGTTAGTTGGTGT 2524 2650 ATCTAGGGCTTTTAATTGGGAAAGTGCCTCTTCTTTGGTAAGAGAGCAGT 2699 *|*||****||*||||||||**||*||*|||||||||***|**|||||*| 2525 GTTTAATTTTTGTAATTGGGTTAGGGCTTCTTCTTTGTCGATGGAGCATT 2574 2700 GTGGGTAAGTGAGGAAGTAATTTTTAG----------------------- 2726 |||||||*||||||||*||||||||*|*********************** 2575 GTGGGTATGTGAGGAAATAATTTTTGGCTTTTAAAGAGAAACGCCCAGCT 2624 -------------------------------------------------- ************************************************** 2625 CTAGGCATGTTGACTTGGTCAATTGGGGGGCACTTCAAACTCCTGCTGAA 2674 2727 -------------------AATTTAT---------------------TTG 2736 *******************|||||||*********************||| 2675 TGGGGGGGCATTGGGGGGCAATTTATATTCTGGGGGGCATGGCATTATTG 2724 2737 AAAACGCTTC------------------------GG---AGGAGCCAT-- 2757 *||***||||************************||***||**|||||** 2725 TAATTACTTCAATTTTAAATTCAAAATTCAAATTGGTAAAGCGGCCATCC 2774 ---------- ********** 2775 GTATAATATT 2784