NC_003665 DQ336354 1 ACCGGATGGCCGCGGGGTTTTTTTAAGGC-CCATTCATTTGGGCCGTTTC 49 ||||||||||||||*|*|*|||*|****|*|||****|||******|||* 1 ACCGGATGGCCGCGCGATCTTTCTCTCTCTCCACGTGTTTAATGAATTTA 50 50 TTTTGGGCCTTGACCTTTATT---TTAAATGTGTTGAGTCATTTTTTGT- 95 *||*|*||****|**|**|*|***|*||*|||||||||***|||*||*|* 51 GTT-GAGCGCGAATTTGAAGTCCGTGAATTGTGTTGAGCGCTTTATTTTA 99 96 GTTCCGCTTTGGGATGGCCGCCACGTGGTTCAATTTAATACCGTCAAAAT 145 ||||||||*|*||||||||||||||||**|*|||*|||*|||||**||*| 100 GTTCCGCTATCGGATGGCCGCCACGTGTATTAATATAAGACCGTTGAATT 149 146 AAATATGATAAGCGGAACTTTATCGAATTTCAGTGTGTGTTTTT-GACCA 194 |||||||||||||||||||||*|||||||||****|||||||||*|**|* 150 AAATATGATAAGCGGAACTTTCTCGAATTTCGCATTGTGTTTTTTGTGCT 199 195 CATATAACTATGAAATTCGACCGTTAGATTGCACTTGATATTTGAATTAA 244 *||*|||*||||||||||||||||||||||||||*|||||*|*||**||* 200 GAT-TAATTATGAAATTCGACCGTTAGATTGCACATGATAGT-GACGTAT 247 245 TGATTAACATGCTCGATTT-TATGTCAGTTGTACAAGTATTTGATGTGTG 293 ||*|*|*|*||*|*||*|**|*|||||*|*|||||||||||||*|*||*| 248 TGGTCATCGTGATTGAATAATGTGTCATTAGTACAAGTATTTGTTTTGGG 297 294 TGCAATCGTACAACGTTTATATCGTGGACCAATCATATATTAACTGTACA 343 |||||||*|**|||*|*|*||*|||||||||*|*|*|||||*||||||*| 298 TGCAATCATGAAACATATGTAACGTGGACCAGTTAAATATTGACTGTATA 347 344 ATTAAAATAACGCATTGCTGCAACTACTGCTATGTATATAAGGTATATGA 393 |**||*|||||*|*|***|||||*||||*||||*|||||||||****||| 348 AACAAGATAACCCGTGTATGCAATTACTACTATCTATATAAGGCGATTGA 397 394 TATTGAT--TTTTGAATATATCCTATTAACAATTTTGATCATGTATTTCA 441 |||||||**||||*||***|||**|*|||*||||||||*|||||||||*| 398 TATTGATAATTTTAAAACCATC--AATAAGAATTTTGAACATGTATTTTA 445 442 ATGGTAACAAGCGTCGTTGGTTGTCCACCAATCGCCGTAATTACTTACGA 491 ||**|||*|||||||||||||||||||||||*||*|||||||*|*|*||| 446 ATAATAATAAGCGTCGTTGGTTGTCCACCAACCGTCGTAATTTCGTGCGA 495 492 TTTCCTACGTTTAAAAGGTCACATGCTGTGGTACGCAATGATGTGAAACG 541 |*|*|||||||||||||*||||||*|||||*||||||||||||*|||||| 496 TATTCTACGTTTAAAAGATCACATTCTGTGATACGCAATGATGGGAAACG 545 542 TCGATTTGGTATATCAAACAAGGCACATGACGATAGTAAGATGACCTCTC 591 ||*|||*|||||*||||**||**||*|||||||||||||||||||||||| 546 TCCATTAGGTATTTCAACAAACCCAGATGACGATAGTAAGATGACCTCTC 595 592 ATAGGATCCACGAAAACCAATATGGGCCTGACTTCGTATTGGGCCATAAC 641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 596 ATAGGATCCACGAAAACCAATATGGGCCTGACTTCGTATTGGGCCATAAC 645 642 TCAGCGCTGTCCACTTTTATAACTTACCCGACTCTTGGTAAAACTGAGCC 691 |||||||||||||||||||**||||||||||||||||||||||||||||| 646 TCAGCGCTGTCCACTTTTAATACTTACCCGACTCTTGGTAAAACTGAGCC 695 692 CAACCGTACTAAATCATACATTAAGTTGAAACGTCTACGTTTTAAAGGTA 741 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 696 CAACCGTACTAAATCATACATTAAGTTGAAACGTCTACGTTTTAAAGGTA 745 742 CTGTTAAGATAGAACGTGTTCCTGCTGATTTGAACATGAACGGAATGCCT 791 |||||||||||*|||||||||||||||||||*|||*||*|||||*||||| 746 CTGTTAAGATACAACGTGTTCCTGCTGATTTCAACTTGTACGGATTGCCT 795 792 GCTAAGATAGAGGGCGTATTTTCTCTGGTTATTGTTGTTGATCGTAAACC 841 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 796 GCTAAGAAAGAGGGCGTATTTTCTCTGGTTATTGTTGTTGATCGTAAACC 845 842 TCATTTGAGCCCTTCCGGCAGTCTGTACACATTCGATGAGTTATTTGGTG 891 |||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 846 TCATTTGGACCCTTCCGGCAGTCTGTACACATTCGATGAGTTATTTGGTG 895 892 CTAGGATTCATAGCCATGGAAATTTGGCGATAACCCCTTCTCTGATGGAT 941 |||||||*|||||||||||||||||**|||||**|||||||**||*|||| 896 CTAGGATCCATAGCCATGGAAATTTACCGATATACCCTTCTTCGAAGGAT 945 942 CGTTTTTATATACGCCATGTTGTTAAACGTGTATTGCCTGTGGAGAAAGA 991 ||*|||||*|||||*|||||||*|||||||||*|||*|*||||||||*|| 946 CGGTTTTACATACGTCATGTTGCTAAACGTGTCTTGTCAGTGGAGAAGGA 995 992 CAGTAACATGATTGACGTTGATGGGACGACAACATTATCTAGCAGGCGTT 1041 *|||||**||**|||||||||*||||**||||||*|*||||**||||||| 996 TAGTAATTTGTATGACGTTGAGGGGATTACAACACTGTCTAATAGGCGTT 1045 1042 ATAATTGTTGGGCAAATTTTAGAGACCTCGATCATGAATCATGTAATGGT 1091 |||||||*|||||||||||||||||**||||||||||||||||||||||| 1046 ATAATTGCTGGGCAAATTTTAGAGATTTCGATCATGAATCATGTAATGGT 1095 1092 GTATATGCGAACATAAGCAAGAACGCTCTCTTAGTTTATTATTGTTGGAT 1141 ||||||||*||||||***|||||*||*||*|||**||||||||||||||| 1096 GTATATGCTAACATACAGAAGAATGCCCTATTATGTTATTATTGTTGGAT 1145 1142 GTCAGATACCGTTTCCAAAGCATCTACATTTGTATCATTTGACCTTGACT 1191 |||*||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||*| 1146 GTCGGAAACAGTTTCCAAAGCATCTACATTTGTATCATTTGATCTCGATT 1195 1192 ATATTGGATAATTATAAATATGAATTTGTAAAGTATAT--TCGATAAGTT 1239 |||||||*|||*||||*||||*||||||*|||*|||||**|*|||||||| 1196 ATATTGGTTAAATATACATATCAATTTGCAAATTATATATTTGATAAGTT 1245 1240 TAAATTCGATAATAAATTCAGATAGTTCTTTCTAACCGTGCAG-CATCTG 1288 *||||**|*||||||||*****||*||||*|**|||**|***|*||*||* 1246 AAAATATGTTAATAAATAGTCCTA-TTCTATTAAACACTCAGGACAGCT- 1293 1289 TAATTTATTTCAAAGACTTAGGTTCAGAAGGAGTACAATTGGTATTAATA 1338 ||||||||||*||||||||*||||||||*|||||||||||||||||*||| 1294 TAATTTATTTTAAAGACTTTGGTTCAGATGGAGTACAATTGGTATTGATA 1343 1339 CATTCTTGTACTGTTGTCCTAACAATTTCATTTAATTGGGCTAACGATAA 1388 ||||||||*|||||*|*|*|||||||*||||||||||||||*|||||||| 1344 CATTCTTGGACTGTCGACTTAACAATCTCATTTAATTGGGCCAACGATAA 1393 1389 AGTAATGTTGGACTGTGTTCTCTGTGCCGCAACGATCGACGCTGATTCTC 1438 *||||||||||||||*||*||||||||*||||||||*||||||||||||| 1394 GGTAATGTTGGACTGCGTCCTCTGTGCTGCAACGATTGACGCTGATTCTC 1443 1439 CTGGATCTAGTATAACTGTATCCAATCTGTTTAGGTTCTTATATGGATAT 1488 ||||*|||||*||*|**||*|||||||||||*||*|*|||||||||||*| 1444 CTGGGTCTAGAATTAACGTGTCCAATCTGTTCAGATCCTTATATGGATGT 1493 1489 GGATCGTTGCCTCGTTCTGTGTCCACACATGAATTGCTGAGACCAATTGT 1538 *||||||||||*|||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||| 1494 AGATCGTTGCCCCGTTCGGAGTCCACACATGAATTGCTGAGACCAATTGT 1543 1539 ACTTCTTGAGGCCCATGACTCACCTGCTTTAATTTCTATTGGGCCGTTAA 1588 ||||||*||*|||||*|||||*||*|*|||||||||||||||||*||||| 1544 ACTTCTGGATGCCCACGACTCTCCAGGTTTAATTTCTATTGGGCAGTTAA 1593 1589 GCCCAAAGCTTCTTGTCGAAGCGCATCTGAGTAATTTCCTCTCCCATGAC 1638 |||||||*||***|||||||||||||||||*|||||||||||||||||** 1594 GCCCAAATCTGGATGTCGAAGCGCATCTGACTAATTTCCTCTCCCATGTG 1643 1639 CCATAACCTACATGAACGAAATCGATATCCTTATCTGTGAATTGCTTCGA 1688 ||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||||**||||||||||| 1644 CCGTAACCCACATGAACAAAATCGATATCCTTATCTGAAAATTGCTTCGA 1693 1689 CAAAATATTAACTGTTGGTGCCCGGAAGGGGATGTCTACTGAGTGTTTTG 1738 |||*||*|||||||*||||||||*|||*||*||*|||||||||||||||| 1694 CAATATTTTAACTGGTGGTGCCCCGAAAGGNATATCTACTGAGTGTTTTG 1743 1739 CTGTGGAGAGTTTCAACTTGCCCTTGAATTTGGCGAAATGTGTCCTTTGG 1788 |||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1744 CTGTGGATAGTTTTAACTTGCCCTTGAATTTGGCGAAATGGGTCCTTTGG 1793 1789 TGTACATTCGTATCGCTAACTCTATAGTACAATTTCCATGGAATCGGGTC 1838 ||*|||||||||||||||||*|**|||||*||||||||||||||*||||| 1794 TGCACATTCGTATCGCTAACCCGGTAGTATAATTTCCATGGAATTGGGTC 1843 1839 CTTAAGCGAAAAGAAAGAAGAAGAGAAATAATGTAAGTCTATGTTACATC 1888 |||*||*||||||||*||*||*||||||||||||||*||||||||||||| 1844 CTTCAGTGAAAAGAATGACGACGAGAAATAATGTAAATCTATGTTACATC 1893 1889 TAATTGGGAAAGTCCATGACGCCTGCAGTGACTCGTTGTCGGTCATTCGT 1938 ||||||||||*|||||||||||*||||*||||||||||||*|||||||*| 1894 TAATTGGGAAGGTCCATGACGCTTGCAATGACTCGTTGTCCGTCATTCTT 1943 1939 TTGTCATGAATTTCAACTATAACAGACCCAGTTGCATTTATAGGAACCTG 1988 ||||||||*|||||*|||||*|||||*||*||*||*|||||*||*||*|| 1944 TTGTCATGTATTTCTACTATGACAGATCCTGTGGCGTTTATTGGGACTTG 1993 1989 CTGTCTGTATTCGATGACGCAGTGGTCGATTTTCATACAGCTGCGACTAA 2038 |||||||||||||||||||||*||*||*||||||||*|||||*||||||| 1994 CTGTCTGTATTCGATGACGCAATGATCTATTTTCATGCAGCTCCGACTAA 2043 2039 GTTTAGCAGTGATCTGCGACGCCGCAGAAGGAAATTGCAGAACAATTTCG 2088 ||||||||*|*||*||*||*||||*|||*||||||||*|||||||||||* 2044 GTTTAGCACTAATTTGAGATGCCGTAGATGGAAATTGTAGAACAATTTCA 2093 2089 GTCAAGTCATGAGACAGCTGATATTCATCCCTGTGC-GACTCAACATAAT 2137 ||*|**||||||||||**|||||||||||*||*||**||||||||||||| 2094 GTTAGATCATGAGACAATTGATATTCATCTCTTTGGAGACTCAACATAAT 2143 2138 TAAAAGCATTTGGAGGAACAACCAACTGAGA-ACTCATTATAATAAAAAT 2186 |||||||***|*****|*|**||*|*||****||||*|*||*|**|**|| 2144 TAAAAGCCGAT-----ACCTCCCTATTGGTTTACTCTTCATTAATATTAT 2188 2187 AGGCTGCGCAGCT-GAATCGATAACTGA---AATTACTAAGTGTAAACGA 2232 ****|*|||***|*||*|*****|*|||***|||||*|***||||||||| 2189 TTTTTTCGCGCGTCGACTTAGCTATTGACCTAATTATTCGATGTAAACGA 2238 2233 TATGAAACCACTAAGAGAGATTGACAGAAGATAATATGTGTTTGTTCTGT 2282 ||||||||||||||||||||||*||*********||**||**||*|**|| 2239 TATGAAACCACTAAGAGAGATTTACTC-------TACTTGGGTGATTCGT 2281 2283 CTAACAAT-TATGGAAAATTTATGACAATATGATAATCAGACGGAACTGG 2331 ||*|||*|*|*|*|**|*||||****||||**|**|||||*|**||*||* 2282 CTTACAGTCTTTTGTTATTTTAAACAAATACTACTATCAGTCATAATTGA 2331 2332 TTATTTATAGACAGTTT-----GTAATGTGAGTATATTTCATGATATAGT 2376 **|***|||*|*|**|******|*|*|*|||||*|||***|*||*|||*| 2332 CCAAACATAAATATCTGCCTAAGAATTCTGAGTTTATAG-AGGAAATACT 2380 2377 TGCCAACGATGTCGTTTTGTAATATAATGGCATTCATGTTAATATTGGCA 2426 |***|*|||*||||||||*|||***|*||*|||*|*|||*|||*|**||| 2381 TCTTAGCGACGTCGTTTTTTAACTGACTG-CATCCTTGTAAATTTAAGCA 2429 2427 GTGGCATATTTGTAATAATAGCTGGGCACCGATTGGGGACTCTCTAAAAC 2476 *||||||||||||||||||||*||||||||||||||||*||*|||*|||| 2430 ATGGCATATTTGTAATAATAGTTGGGCACCGATTGGGGTCT-TCTCAAAC 2478 2477 T--CTAAAGCAATTGGGGACTGGGGTCCTATATATACTAGAACCCTCTAT 2524 |**||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 2479 TTACTAAAGCAATTGGGGACTGGGGTCTTATATATACTAGAACCCTCTAT 2528 2525 AGAACTTTCAATCTCGTTCACA-CACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT 2573 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||| 2529 AGAACTTTCAATCTCGTTCACAACACGTGGCGGCCATCCGATATAATATT 2578