NC_003664 AY090557 1 ACCGGATGGCCGCGGGGTTTTTTTAAAGGCCCATTCA-TTTGGGCCGATT 49 ||||||||||||||*|*|||||||||*||||||||||*|||||||||*|* 1 ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTTAA-GGCCCATTCAGTTTGGGCCGCT- 48 50 CTTTTGGGCCTTCACATTTAATTTAAATGAGTGTAAAATTGGCCCAATCA 99 |||||||||||||||*||||||||*|*|||**|||||*|||||||||||| 49 CTTTTGGGCCTTCACCTTTAATTTTATTGAAAGTAAATTTGGCCCAATCA 98 100 GATTACGTTTGACGAGCTAAGATATTTACGACTACTTAGTGCCCAAGTTG 149 ***|*|*||||||*|||||||||||||||*||||||||**|||||||*|| 99 TGATGCATTTGACAAGCTAAGATATTTACAACTACTTAACGCCCAAGCTG 148 150 TATAACGGCTATAAATTAAACGTGCATATGTCGATAACTTTAATTCAAAA 199 *||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 149 CATAACGGCTATAAATTAAACGTGCATATGTCGTTAACTTTAATTCAAAA 198 200 TGCCTAAGCGCGATGCCCCATGGCGCCACATGGCAAGTACGTCTAAGATT 249 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||***||||||| 199 TGCCTAAGCGCGATGCCCCATGGCGCCACATGTCTAGTACAGTTAAGATT 248 250 AGCCGGGGTGTTAATAATTCTCCTCGGGCAGGAGTTGGGCCAAAATCCAA 299 ||||||||||||||||*|||||||||*||||*||||||||||***||*|| 249 AGCCGGGGTGTTAATAGTTCTCCTCGAGCAGAAGTTGGGCCACGGTCTAA 298 300 TAAGGCCGCTGATTGGGTAAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAAGATAT 349 *||||||*||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 299 CAAGGCCTCTGACTGGGTAAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAAGATAT 348 350 ACAGGATGTACAGAACCCCCGATGTTCCAAGGGGCTGTGAAGGCCCATGT 399 |**||||*||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 349 ATCGGATTTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGGGGTTGTGAAGGCCCATGT 398 400 AAAGTCCAATCGTTTGAACAGCGTCACGACATCTCCCATACTGGGAAGGT 449 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||| 399 AAAGTCCAATCGTTTGAACAGCGTCACGATATCTCCCATACTGGTAAGGT 448 450 GATGTGCGTCTCTGATGTGACACGTGGTAACGGTATTACACACCGTGTGG 499 ||||||*|||||*|||||*||*||||||||||||||||||||*||||||| 449 GATGTGTGTCTCCGATGTCACCCGTGGTAACGGTATTACACATCGTGTGG 498 500 GTAAGCGTTTCTGTGTTAAGTCTGTGTATATACTTGGTAAGATATGGATG 549 |||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||| 499 GTAAGCGTTTCTGTGTTAAGTCTGTGTATATTCTGGGTAAGATATGGATG 548 550 GATGAGAACATCAAGTTGAAGAACCACACAAACAGTGCTATGTTTTGGTT 599 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||| 549 GATGAGAACATCAAGTTGAAGAACCACACGAACAGTGCCATGTTTTGGTT 598 600 GGTCAGGGATCGTAGACCGTATGGTACCCCAATGGATTTTGGTCAGGTGT 649 |||*|||||*||||||||||||||*|||||*|||||*|||||*||||||| 599 GGTGAGGGACCGTAGACCGTATGGCACCCCTATGGACTTTGGCCAGGTGT 648 650 TCAACATGTTCGACAACGAGCCCAGTACTGCCACCGTGAAGAACGATCTT 699 |*||||||||||||||||||||*||*||*|||||*|||||*||||||||* 649 TTAACATGTTCGACAACGAGCCTAGCACCGCCACTGTGAAAAACGATCTC 698 700 CGTGATCGTTTTCAAGTTATGCACAAGTTTTACGCCAAGGTTACGGGTGG 749 |||||||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||*||*||||| 699 CGTGATCGTTTTCAAGTTATGCACAAGTTCTATGCTAAGGTCACAGGTGG 748 750 ACAATACGCAAGTAACGAACAGGCGCTGGTCAAGCGGTTCTGGAAGGTCA 799 ||||||||||||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||||||| 749 ACAATACGCAAGCAACGAGCAGGCGCTTGTCAAGCGGTTCTGGAAGGTCA 798 800 ACAATCACGTCGTTTACAACCATCAAGAAGCCGGGAAGTACGAGAATCAT 849 |||||||*|||||*||*|||||||||||||||||*||||||||||||||| 799 ACAATCATGTCGTCTATAACCATCAAGAAGCCGGAAAGTACGAGAATCAT 848 850 ACTGAGAACGCACTATTACTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCC 899 ||*||||||||*||*|||*|||||||||||||||||||||||||*||||| 849 ACGGAGAACGCCCTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAACCC 898 900 AGTGTATGCAACTTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAA 949 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 899 CGTGTATGCAACTTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGAATCGATAACAA 948 950 ATTAATAAAGTTTGTATTTTATTGAATGATCTTCGAGTACAGCATTTACA 999 |||||||||*||||*|||||||||||||||**|||||||||||||||||| 949 ATTAATAAATTTTGAATTTTATTGAATGATTCTCGAGTACAGCATTTACA 998 1000 TATTGTCTGTCTGTTGCGAATCGAACAGCTCTAATTACATTATTAATTGA 1049 ||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 999 TATTGTTTGTCTGTTGCGAATCGAACAGCTCTAATTACATTATTAACTGA 1048 1050 AATAACGCCTAACTGATCAATATACAACACTACTAAATATTTAAATCTAT 1099 |||||||||||*|||||||||*|||||||**|*||||||||||||||||| 1049 AATAACGCCTAGCTGATCAATGTACAACATAAGTAAATATTTAAATCTAT 1098 1100 TTAAATATGTCATCCCAGAAGCTCTCAGGGATGTCGTCCAGATTTGGAAG 1149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1099 TTAAATATGTCATCCCAGAAGCTCTCAGGGATGTCGTCCAGATTTGGAAG 1148 1150 TTGAGATAAGCCTTGTGAAGACCCAGTACTCTCCTCAGGTTGTGATTGAA 1199 |||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||*||||||*||||| 1149 TTGAGATAAGCCTTGTGGAGACCCAATACTCTCCTCAAGTTGTGGTTGAA 1198 1200 CCGGATCTGTACGTGGTACACTCTGGTCCTCGTGTACAGTATGTCCTCGA 1249 |||*||*||*||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||| 1199 CCGTATTTGGACGTGGTAGACTCTGGTCCTCGTGTATAGTATGTCCTCGA 1248 1250 CATTGTACATCTTGAAATAAAGGGGATTTGATATTTCCCAGATATACACG 1299 |*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1249 CGTTGTACATCTTGAAATAAAGGGGATTTGATATTTCCCAAATATACACG 1298 1300 CCATTCTCTGCCTGATGTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCAT 1349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1299 CCATTCTCTGCCTGATGTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCAT 1348 1350 GTCCTGCGCAGTCAATGTGTACGAAAATGGAGCACCCGCACTGCAAATCA 1399 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||| 1349 GTCCTGCGCAATCAATGTGTACGAAAATGGAGCAGCCGCACTGTAAATCA 1398 1400 ATTCGTCTTCTTCGGATAGCTCTCTTTTTAGCAGCCCGATGTTGAACTTT 1449 ||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1399 ATTCGTCTTCTTCGTATAGCTCTCTTCTTAGCAGCCCGATGTTGAACTTT 1448 1450 GATAGAGGGGGGAGTTGAGAAAGATGAATTGCGCATTGTGCTTTGTCCAA 1499 |||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||| 1449 GATAGAGGGGGGAGTTGAGGAAGATGAATTGTGCATTGTGCTTTGTCCAA 1498 1500 CTATCTAATGCTGAGTTTTCCTGTTTGTTTAGGAAACATTTATAGCTGGC 1549 |||**|||||||||||||||*|**||||**|||||||||||||||||||| 1499 CTACTTAATGCTGAGTTTTCATCCTTGTCGAGGAAACATTTATAGCTGGC 1548 1550 CCCCTCGCCA--GGATTGCAAAGCAC-GATGCATGGGATACCACCTTTAA 1596 |||||||||***||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||| 1549 CCCCTCGCCCAGGGATTGCAGAGCACCGATGCATGGGATACCACCTTTAA 1598 1597 TTTGAACCGGCTTTCCGTACTTGCAGTTTGATTGCCAATCCCTTTGGGCC 1646 |||||||*|||||||||||*||*||||||||||||||||||*|||||||| 1599 TTTGAACTGGCTTTCCGTATTTACAGTTTGATTGCCAATCCTTTTGGGCC 1648 1647 CCAATCAATTCTTTCCAGTGCTTTAGTTTTAGATAATGCGGTGCGACATC 1696 |||||||||||||||||||||||||**||||||||*|||||||||||||| 1649 CCAATCAATTCTTTCCAGTGCTTTAACTTTAGATAGTGCGGTGCGACATC 1698 1697 ATCAATGACGTTATACTGCACATCGTTTGAGTAGACCTTTGAATTGAAAT 1746 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 1699 ATCAATGACGTTATAATGCACATCGTTTGAGTAGACCTTTGAATTGAAAT 1748 1747 CGAGGTGACCACTCAAGTAATTATGGGACCCCAATGTACGTGCCCACATT 1796 |||||||||||||||||*|||||||||||||*||||*||||||||||||| 1749 CGAGGTGACCACTCAAGGAATTATGGGACCCTAATGCACGTGCCCACATT 1798 1797 GCCTTCCCCGTCCTTGAATCACCCTCGATTATTATACTGATAGGTCTCTC 1846 |**||*||**|*|**||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1799 GTTTTGCCACTTCGAGAATCACCCTCGATTATTATACTGATAGGTCTCTC 1848 1847 CGGCCGCGCAGCGGCATCTCTCCCGAAATAATCATTGACCCAGTCTTGCA 1896 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||**|||||*||||||| 1849 CGGCCGCGCAGCGGCATCTCTCCCGAAATAGTCATCTACCCAATCTTGCA 1898 1897 TCTCGACAGGAACGTTAGTGAACGATGAGAGGGGAAACGGAGGAACCCAA 1946 ||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1899 TCTCGACAGGCACGTTAGTGAACGACGAGAGGGGAAACGGAGGAACCCAA 1948 1947 GGTTCTGGAGCCTTAACGAAAATACGCTCTAGATTAGATTTAATATTATG 1996 ||||||||||||||**|||||||||||||||*|||*||**||||*||||| 1949 GGTTCTGGAGCCTTTGCGAAAATACGCTCTAAATTTGACCTAATGTTATG 1998 1997 ATGTTGAAGCACGAAATCTTTGGGTTGTTCCTCTCTTAATATATTGAGTG 2046 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1999 ATGTTGAAGCACGAAATCTTTGGGTTGTTCCTCCCTTAATATATTGAGTG 2048 2047 CTTCCATGACTGATCCTGCGTTGAGAACCTTGGCGTACGTGTCGTTGGCA 2096 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2049 CTTCCATGACAGATCCTGCGTTGAGAACCTTGGCGTACGTGTCGTTGGCA 2098 2097 GATTGCTGACCTCCTCTTGCTGATCTTCCATCGATCTGGAAAACTCCATG 2146 |||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||| 2099 GATTGCTGACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATCTGGAAAACTCCATG 2148 2147 ATCAACGAAGTCTCCGTCTTTCTCCACGTATGATTTGACGTCTGAGGAGC 2196 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||*|||| 2149 ATCAACGAAGTCTCCGTCTTTTTCCACGTATGATTTGACATCTGATGAGC 2198 2197 TCTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGAT 2246 |||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||**|||||||* 2199 TCTTAGCTCCCTGTATGTTTGGATGGAAATGTGCTGACCTACTTGGGGAG 2248 2247 ACGAGGTCGAAGAACTTGTTGTTCTTGCAGTTGTATTTACCTTCGAACTG 2296 ||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||*||||||||||| 2249 ACGAGGTCGAAGAACTTGTTATTTTTGCAGTTGTATTTTCCTTCGAACTG 2298 2297 GATGAGCACGTGGAGATGAGGTTCCCCATTTTCGTGTAGTTCTCTTGATA 2346 |||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||*||*| 2299 GATGAGCACGTGGAGATGAGGTTGCCCATCTTCGTGTAGTTCTCTCGAGA 2348 2347 CACGAATGAATAATTTGTTTGTTGGTGTGTTCAGAGCTAGTAATTGGGAA 2396 |||||||||*||||||*||*|||||||||||*||*||||*||*||||||| 2349 CACGAATGATTAATTTATTAGTTGGTGTGTTTAGGGCTAATATTTGGGAA 2398 2397 AGTGCTTCTTCTTTGGAAAGAGAGCAGTGAGGATATGTTAGAAAATAATT 2446 |||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||*||||||||||| 2399 AGTGCTTCTTCTTTGGAAAGAGAACAGTGTGGATATGTCAGAAAATAATT 2448 2447 TTTGGAATTTACTCGGAAATGTCTGGGGAGTGGCATATTTGTAATAATAG 2496 ||||||||||||||||||||||*|*||**||||||||||||||||||||| 2449 TTTGGAATTTACTCGGAAATGTTTAGGCGGTGGCATATTTGTAATAATAG 2498 2497 CTGGGCACCGATTGGGGACTCTCTAAAACT-CTAAAGCAATTGGGGACTG 2545 *||||||||||||||||||||||||||**|*||**||||||||||||||| 2499 TTGGGCACCGATTGGGGACTCTCTAAACTTGCTCTAGCAATTGGGGACTG 2548 2546 GGGTCCTATATATACTAGAACCCTCTATAGAACTTTCAATCTCGTTCACA 2595 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2549 GGGTCCTATATATACTAGAACCCTCTATAGAACTTTCAATCTCGTTTACA 2598 2596 CACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT 2622 |||||||||||||||||*||||||||| 2599 CACGTGGCGGCCATCCGATATAATATT 2625