NC_001344 AY494851 1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAATGAGGAATCTTTGGATAG 50 ||||||||**|||||||||||||*|||||*|||||||||||*|||||||| 1 CATGCACATTTAAAAGCTTATGCTAAAATAAATGAGGAATCATTGGATAG 50 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 |||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||| 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTATAACTGCTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACTAATTACATTTCTCGGCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCG 150 |||*||||||||||||*||||||||*||*|||||||||*|||||||*||* 101 CTAGCGTTACTAATTATATTTCTCGCCTTCGTACTTGGCTGTCAACACCT 150 151 GAAAAGTACCGAGGCCGTGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 |||||||||*||||**|*||||||||*||||||||||||||||||||||| 151 GAAAAGTACAGAGGTAGAGATGCCCCGACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGCGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGAACTAGAAAAC 250 ||||||||*||||*|||||||||||||||||*||**|||||||||||||| 201 AATCCAAGTGGCTAAGGGAGGCAGAAAAACAACTCAGGGAACTAGAAAAC 250 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTACACCCGAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAAGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||*||*|||||||| 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAGGCATCACTTAGGTAAATTGTCAGG 450 451 TTTATATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 *|||||*|||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||| 451 CTTATACCAAATGAAGGGATGTACGTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATTTACAAGTAGTAAATGAGTGCCCTTCC 550 |||||||||||||||||||**|*|*|*||*|**||||||||||||||||| 501 ATATTTCGGATACTCATTTCAAATCAGAAATTATAAATGAGTGCCCTTCC 550 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 |||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||||| 551 CGAAATTGGAAATATCTGACTCCAGCCAAGTTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAAGCGAAATATCCTGACAACGTGA 650 ||||||||||||||||||||||||||||*|*||*|||||||||||*|||| 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAACCAAAGTATCCTGACAATGTGA 650 651 TGCAGCATGAGGCAATAGTAGGTAAATATTTGAACAGGCTCTATGAAGCA 700 ||||*|||||**|||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||| 651 TGCAACATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTCAAAGGCAA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||*||**| 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTCACATTTAAGGGACA 750 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800 |||||||||||||||||**||||||||||||||*||||||||****|||| 751 GCCTTATAATTGGGAACAGCAATACCTTGTCAATCAACATCATAAGCCTG 800 801 ATGGGACAACAACCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGAGG 850 |||||*|||||*||*|||||||||||||||***||*||||||||*||||| 801 ATGGGGCAACATCCCGCAAAATCAATGGACACTCGAAGAATCGAGGGAGG 850 851 AGAGCTCCTGCTAAATCAATTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900 |||**|**||||*||*|||*|*||*||**|*|||||*||||||||*|||| 851 AGAATTATTGCTGAACCAACTTGCCGGAAGAATGATACCGAAAGGAACTG 900 901 TAACATGGTCGGGCAAATTTCCAACAATAGATCATCTATTAGACCATGTG 950 |*||||||||*|||||*|||||||||||||||||**|||||||||||||| 901 TCACATGGTCAGGCAAGTTTCCAACAATAGATCACGTATTAGACCATGTG 950 951 CAAACAATGGAGGAGGTAAACACTCTTCAACAACAGGGCGCTTGGCCTGC 1000 ||||||||||||||**|||||||*||*||*||||||||*||*|||||*** 951 CAAACAATGGAGGAAATAAACACCCTCCAGCAACAGGGAGCATGGCCACA 1000 1001 TGGGGCGGGAAGACGATTGGGACTGACCAATCCTACTCCTCACGAGACGC 1050 *|||||*|||||**||*|||||*|****|||||*||||||||*||||**| 1001 AGGGGCAGGAAGGAGAGTGGGATTACAGAATCCCACTCCTCAAGAGATTC 1050 1051 CTCAGCCTCAGTGGACTCCCGAGGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100 ||||*||*||||||*|||||||*||||||||*|||||**|*||*|||||* 1051 CTCAACCCCAGTGGTCTCCCGAAGAAGATCAGAAAGCCAGAGAAGCTTTC 1100 1101 CGTCGATATCAAGAAGAAAGGCCACCGGAAACCACCACCATTGCTCCTAC 1150 ****|||||||*|||||*||*|||||||||***|||||||||||*||*|| 1101 AAAAGATATCAGGAAGAGAGACCACCGGAAGTAACCACCATTGCACCAAC 1150 1151 GTCACCAACTCCGTGGAAGCTACAACCAGGGGACGATCCACTCCTGGAAA 1200 **|*||**|||*||||||*||*|||||*||*||||||||*|||||||*|| 1151 AACGCCTCCTCAGTGGAAACTTCAACCCGGAGACGATCCGCTCCTGGGAA 1200 1201 ACAAGTCTTTACTCGAGACTCATCCTCTTTACCAGAATCCCGAGCCAGCC 1250 ||*|*|||*|*||*||*||*|||||*||||||||||||||*||*|||||| 1201 ACCACTCTCTGCTGGACACGCATCCGCTTTACCAGAATCCAGAACCAGCC 1250 1251 GTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCCCTCAAGAAGAAGAAAATGCCTGGTAC 1300 ||*|||||*||*|||||*||*||*|||||||||*|***||||*||||||| 1251 GTCCCTGTCATCAAGACACCCCCTCTCAAGAAGGA---AATGTCTGGTAC 1297 1301 CTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTTTCT 1350 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1298 CTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATAGGATTACTGGTAAGCTTTTTCT 1347 1351 TGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTACGGAGGCTAGATTGGTGGTGGATT 1400 |||||||||||||||||||||||||**|||*||||||||||||||||||| 1348 TGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTGAGGAAGCTAGATTGGTGGTGGATT 1397 1401 TCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATACTGG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1398 TCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATACTGG 1447 1451 AGCCCAAATCTCTCAACATTACGTCGGATCCTGCCCGTGGGGATGCCCAG 1500 ||||||||*|||*|*|||||||||*||||*|||||||||||||||||||| 1448 AGCCCAAACCTCACCACATTACGTAGGATACTGCCCGTGGGGATGCCCAG 1497 1501 GATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATCCTG 1550 |||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1498 GATTTCTTTGGACCTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTTTTAATCCTG 1547 1551 CTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACATGTCTATTATTTT 1600 |||||||*||||||||||||*|||||||||||||||**|||||*|||||| 1548 CTAGTAGTAGCAGGCTTGCTATATCTGACGGACAACGGGTCTACTATTTT 1597 1601 AGAAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGTCCTTTTCTCCTCCATCTCTT 1650 ||*||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||| 1598 AGGAAAGCTCCAATGGGCGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTT 1647 1651 CACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGACTT 1700 ||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||*|||||||||| 1648 CACTACTGCCCTCGGATCCGAAATCTCTCGTCGCTTTAACGTTTGGACTT 1697 1701 TTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCACCTT 1750 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1698 TCACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCACCTT 1747 1751 AACTCAATTAGCCACGCTGTCTGTTCTTTTCTACAAGAATTAGGAATACG 1800 |||*|||||||||||*|||||||*||||||||||||||**|||||*|**| 1748 AACGCAATTAGCCACTCTGTCTGCTCTTTTCTACAAGAGCTAGGAGTGAG 1797 1801 CATAAACTTTGATAAGACTACTCCGTCTCCTGTAAATGACATAAGATTCC 1850 *|||||||||||*||||||||*||*||*|||||*|||||*||*||||||| 1798 AATAAACTTTGACAAGACTACGCCTTCACCTGTGAATGAAATCAGATTCC 1847 1851 TCGGTTACCAGATTGATCAGAAATTCATGAAGATCGAAGAAAGCAGATGG 1900 |||||||*||*||||||||***||*||||||||||||||||||||||||| 1848 TCGGTTATCAAATTGATCAACGATACATGAAGATCGAAGAAAGCAGATGG 1897 1901 ATAGAACTAAGGACTGTTATCAAGAAAATAAAAATAGGTGCATGGTATGA 1950 |*||||*||||*|||||*||*|||||||||||||||||||*||||||||| 1898 AAAGAATTAAGAACTGTAATAAAGAAAATAAAAATAGGTGAATGGTATGA 1947 1951 CTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAACTTTGTGTTACCAT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1948 CTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTAAACTTTGTGTTACCAT 1997 2001 TTACTAAAGGTAACATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATTACT 2050 ||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||| 1998 TTACAAAAGGTAACATAGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATAACT 2047 2051 AACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCAGCTTATAGGACTTTATTGTACAA 2100 |||*||||*||*||||||||||||||*||||||||||||||**||||*|| 2048 AACCAAGTGAATTTTAGCTTCTCTTCTGCTTATAGGACTTTGCTGTATAA 2097 2101 ATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTAGCCATTCGACCAAAGTCCTCTGTAC 2150 |*||||*|||||*||*||||||||****||***||||||||||||||||| 2098 ACTAACAATGGGAGTATGTAAATTGCAAATAAAACCAAAGTCCTCTGTAC 2147 2151 CTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACTCCAACACATGGCGCAATATCC 2200 |||||||||||||||||||*||||||||*||*|||||||||||||||||| 2148 CTTTGCCACGTGTAGCCACGGATGCTACACCCACACATGGCGCAATATCC 2197 2201 CATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGGGATAT 2250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 2198 CATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGAGATAT 2247 2251 ACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAAGATAATGATTAAAC 2300 ||||*|*|||||||||||||||**|||*||||||||||||||||||||*| 2248 ACATGTTCAGGAATTGCTGATGACATGCTTAGCTAAGATAATGATTAAGC 2297 2301 CCAGATGTATACTCTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTATCAG 2350 |**|*|||*|**|*||*||*||*||||||||||||||||||||||||||| 2298 CTCGCTGTTTGTTATCTGACTCCACTTTTGTTTGCCACAAACGTTATCAG 2347 2351 ACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTGCTATCTCCTAT 2400 |||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||***||||| 2348 ACGTTGCCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTTCTAAAGCCTAT 2397 2401 ACAGTTGTACTTTGTTCCAAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCCCATCCA 2450 ||*||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||| 2398 ACCGTTGTACTTTGTTCCAAGCAAATATAATCCTGCTGACGGCCCATCCA 2447 2451 GGCACAGACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCGAAA 2500 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2448 GGCACAAACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCGAAA 2497 2501 GCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCCCTC 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2498 GCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCCCTC 2547 2551 TCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTTGTC 2600 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2548 TCCTTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTTGTC 2597 2601 AGCCTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTAT 2650 *****||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2598 GTGTGTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTAT 2647 2651 ATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTGCCA 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2648 ATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTGCCT 2697 2701 GATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGATCTTGTAAGGGATGCTAAAGACGC 2750 |||||||||||||||||*||*||*||||||||*||||||||||||||||| 2698 GATGATTTCTTTCCAAAGATAGACGATCTTGTTAGGGATGCTAAAGACGC 2747 2751 TTTAGAACCTTACTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGATTG 2800 |||*||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2748 TTTGGAACCTTATTGGAAATCTGAATCAATAAAGAAACATGTTTTGATTG 2797 2801 CAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACTCAGGGT 2850 |*||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||* 2798 CCACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGATTTCTGGCAGACTACACAGGGC 2847 2851 ATGCATGAAATTGCTGAATCCTTAAGAGCAGTAATACCACCTACCACTGC 2900 ||||||||*||*||||||*|*||||||*||||*|||||*|||||*||||* 2848 ATGCATGAGATAGCTGAAGCTTTAAGAACAGTTATACCTCCTACTACTGT 2897 2901 TCCTGTACCTACTGGATATCTCATTCAACACGAGGAGGCTGAAGAGATAC 2950 *||*||||||***||*|||*|*|||||||||||*|||||*||*||*||*| 2898 ACCAGTACCTCAGGGTTATTTGATTCAACACGAAGAGGCAGAGGAAATTC 2947 2951 CCTTAGGTGATTTATTTAAACATCAGGAAGAAAGAATAGTCAGTTTTCAA 3000 |**|*||*|||||||||||||||||*||||||||*|||||*|||||*||* 2948 CTCTGGGAGATTTATTTAAACATCAAGAAGAAAGGATAGTTAGTTTCCAG 2997 3001 CCAGACTATCCTATTACAGCAAGAATT 3027 ||*||*|||||*||||||||*|||||| 2998 CCTGATTATCCAATTACAGCTAGAATT 3024