NC_001344 AY494850
   1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAATGAGGAATCTTTGGATAG 50
     |||||||||*|*|||||||||||*|||||||||||||||||**|||||||
   1 CATGCACACTTGAAAGCTTATGCTAAAATTAATGAGGAATCACTGGATAG 50

  51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100

 101 CTAACGTTACTAATTACATTTCTCGGCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCG 150
     ||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||*|||||*||*
 101 CTAACGTTACTAATTATATTTCTCGGCTTCGTACTTGGTTATCAACACCT 150

 151 GAAAAGTACCGAGGCCGTGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200
     |||||*||**|||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||
 151 GAAAAATATAGAGGCCGAGATGCCCCGACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200

 201 AATCCAAGCGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGAACTAGAAAAC 250
     ||||||||*||||*|||||||||||||||||*||**|||||||*||||||
 201 AATCCAAGTGGCTAAGGGAGGCAGAAAAACAACTCAGGGAACTGGAAAAC 250

 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300

 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350
     |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||
 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCCGGGAAAGGAGAGCCCCTACACCCCAACG 350

 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400

 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAAGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450
     |||||||||||||||||||||||||*||||||*||*||*||*||||||||
 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAGGCATCATTTAGGAAAATTGTCAGG 450

 451 TTTATATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500
     |||*||*|||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||
 451 TTTGTACCAAATGAAGGGATGTACGTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500

 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATTTACAAGTAGTAAATGAGTGCCCTTCC 550
     ||||||||||||||||||||*|*|*|*|**||*|*||*||||||||||||
 501 ATATTTCGGATACTCATTTTAAATCAGAGATAATTAACGAGTGCCCTTCC 550

 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600
     |||||||||||||||*||||||||||||||||*|||||||||||||||||
 551 CGAAATTGGAAATATCTGACTCCAGCCAAATTCTGGCCCAAGAGCATTTC 600

 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAAGCGAAATATCCTGACAACGTGA 650
     ||||||||||||||||||||||||||||*|*||*||*||||||||*||||
 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAACCAAAGTACCCTGACAATGTGA 650

 651 TGCAGCATGAGGCAATAGTAGGTAAATATTTGAACAGGCTCTATGAAGCA 700
     ||||*|||||**|||||||||||||||||||*|*||||||||||||||||
 651 TGCAACATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700

 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTCAAAGGCAA 750
     |||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*|||||**|
 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCAAAACATTTGGTCACATTTAAAGGTCA 750

 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800
     |||||||||||||||||**||*|||||||||||*|||||||*****||*|
 751 GCCTTATAATTGGGAACAGCAGTACCTTGTCAATCAACATCTTAAGCCAG 800

 801 ATGGGACAACAACCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGAGG 850
     |||||*|||||*||*|||||||||||||||***||||||*|*||||||||
 801 ATGGGGCAACATCCCGCAAAATCAATGGACACTCGGAGAGTAGAAGGAGG 850

 851 AGAGCTCCTGCTAAATCAATTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900
     |||*||**||*||*|*|||*|*||*||**|*|||||*||||||||*||||
 851 AGAACTTTTGTTACAACAACTTGCCGGAAGAATGATACCGAAAGGAACTG 900

 901 TAACATGGTCGGGCAAATTTCCAACAATAGATCATCTATTAGACCATGTG 950
     |*||||||||*|||||*|||||||||*||||||||*|*||||||||||||
 901 TCACATGGTCAGGCAAGTTTCCAACATTAGATCATGTGTTAGACCATGTG 950

 951 CAAACAATGGAGGAGGTAAACACTCTTCAACAACAGGGCGCTTGGCCTGC 1000
     |||||||||||||||*|||||||*||*||||||||*||*||*|||||***
 951 CAAACAATGGAGGAGATAAACACCCTCCAACAACAAGGGGCATGGCCACA 1000

1001 TGGGGCGGGAAGACGATTGGGACTGACCAATCCTACTCCTCACGAGACGC 1050
     *|||||*|||||**||*||||**||***|||||*||||||||*||||**|
1001 AGGGGCAGGAAGGAGAGTGGGGTTGCAGAATCCCACTCCTCAAGAGATTC 1050

1051 CTCAGCCTCAGTGGACTCCCGAGGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100
     ||||*||*||||||*|||||||*||||||||*|*||||||*||*|||||*
1051 CTCAACCCCAGTGGTCTCCCGAAGAAGATCAGAGAGCTCGAGAAGCTTTC 1100

1101 CGTCGATATCAAGAAGAAAGGCCACCGGAAACCACCACCATTGCTCCTAC 1150
     ****|||||||*||*|||*|*|||||||||***||||||||||||||*||
1101 AAAAGATATCAGGACGAACGTCCACCGGAAGTGACCACCATTGCTCCAAC 1150

1151 GTCACCAACTCCGTGGAAGCTACAACCAGGGGACGATCCACTCCTGGAAA 1200
     *|||||**|||*||||||*||*|||||*||*||||||||*|||||*|*||
1151 ATCACCTCCTCAGTGGAAACTGCAACCGGGAGACGATCCTCTCCTCGGAA 1200

1201 ACAAGTCTTTACTCGAGACTCATCCTCTTTACCAGAATCCCGAGCCAGCC 1250
     |**|*||**|*||*||*||*|||||*||*|||||||||||*||*|||||*
1201 ATCATTCGCTGCTGGACACGCATCCGCTGTACCAGAATCCGGAACCAGCG 1250

1251 GTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCCCTCAAGAAGAAGAAAATGCCTGGTAC 1300
     *|*|||||*||||||||*||*||*|||||||||||***||||*|||||||
1251 ATACCTGTCATAAAGACACCCCCTCTCAAGAAGAA---AATGTCTGGTAC 1297

1301 CTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTTTCT 1350
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1298 CTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTTTCT 1347

1351 TGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTACGGAGGCTAGATTGGTGGTGGATT 1400
     |||||||||||||||||||||||||**||||||||||*||||||||||||
1348 TGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTGAGGAGGCTAGACTGGTGGTGGATT 1397

1401 TCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATACTGG 1450
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1398 TCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATACTGG 1447

1451 AGCCCAAATCTCTCAACATTACGTCGGATCCTGCCCGTGGGGATGCCCAG 1500
     ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||
1448 AGCCCAAATCTCTCAACATTACGTAGGATCCTGCCCGTGGGGATGCCCAG 1497

1501 GATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATCCTG 1550
     |||||||*|||||*|*||||||||||||||||||||||||*|||||||||
1498 GATTTCTTTGGACCTGTCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTTTTAATCCTG 1547

1551 CTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACATGTCTATTATTTT 1600
     |||||||*||||||||||||*|||||||||||||||**|||||*||||||
1548 CTAGTAGTAGCAGGCTTGCTATATCTGACGGACAACGGGTCTACTATTTT 1597

1601 AGAAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGTCCTTTTCTCCTCCATCTCTT 1650
     ||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||
1598 AGGAAAGCTCCAATGGGCGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTT 1647

1651 CACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGACTT 1700
     ||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||*||||||||||
1648 CACTACTGCCCTCGGATCCGAAATCTCTCGTCGCTTTAACGTTTGGACTT 1697

1701 TTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCACCTT 1750
     |*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1698 TCACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCACCTT 1747

1751 AACTCAATTAGCCACGCTGTCTGTTCTTTTCTACAAGAATTAGGAATACG 1800
     |||*|||||||||||*|||||||*||||||*||||||||*|||||*|**|
1748 AACGCAATTAGCCACTCTGTCTGCTCTTTTTTACAAGAACTAGGAGTGAG 1797

1801 CATAAACTTTGATAAGACTACTCCGTCTCCTGTAAATGACATAAGATTCC 1850
     *|||||||||||*||*||*||*||*||*||*||*|||||*||*|||||||
1798 AATAAACTTTGACAAAACAACGCCATCACCCGTCAATGAAATTAGATTCC 1847

1851 TCGGTTACCAGATTGATCAGAAATTCATGAAGATCGAAGAAAGCAGATGG 1900
     ||||*||*||*|||||||||||*|*|*|||||||*|||||***|||||||
1848 TCGGCTATCAAATTGATCAGAAGTACCTGAAGATTGAAGACGACAGATGG 1897

1901 ATAGAACTAAGGACTGTTATCAAGAAAATAAAAATAGGTGCATGGTATGA 1950
     |**|||*|*||*|||||*||*||||||||||||*|*||||*|||||||||
1898 AAGGAATTGAGAACTGTAATAAAGAAAATAAAAGTGGGTGAATGGTATGA 1947

1951 CTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAACTTTGTGTTACCAT 2000
     |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|
1948 CTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTAAACTTTGTGTTACCCT 1997

2001 TTACTAAAGGTAACATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATTACT 2050
     ||||*|||||*||*|**|||||||||||||||||||||||||||||||||
1998 TTACAAAAGGGAATACAGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATTACT 2047

2051 AACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCAGCTTATAGGACTTTATTGTACAA 2100
     |||*||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||*||
2048 AACCAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCTGCTTATAGGACTTTGTTGTATAA 2097

2101 ATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTAGCCATTCGACCAAAGTCCTCTGTAC 2150
     |*||||*|||||*||*||||||||****||***|||||||||||||||||
2098 ACTAACAATGGGAGTATGTAAATTGCAAATAAAACCAAAGTCCTCTGTAC 2147

2151 CTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACTCCAACACATGGCGCAATATCC 2200
     ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||
2148 CTTTGCCACGTGTAGCCACAGACGCTACTCCAACACATGGCGCAATATCC 2197

2201 CATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGGGATAT 2250
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||
2198 CATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGAGACAT 2247

2251 ACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAAGATAATGATTAAAC 2300
     ||||||||||||||||||||||**|||||||||*|||*||||||||||*|
2248 ACATATACAGGAATTGCTGATGACATGTTTAGCCAAGTTAATGATTAAGC 2297

2301 CCAGATGTATACTCTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTATCAG 2350
     |**|*|||*|*||*||*||||||||*||||||||*||*||||||||||||
2298 CTCGCTGTTTGCTATCTGATTCTACCTTTGTTTGTCATAAACGTTATCAG 2347

2351 ACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTGCTATCTCCTAT 2400
     |||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||***|||||
2348 ACGTTGCCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTTCTAAAGCCTAT 2397

2401 ACAGTTGTACTTTGTTCCAAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCCCATCCA 2450
     |||*|||||||||||*|||||*|||||*||||||||||||||||||||*|
2398 ACAATTGTACTTTGTCCCAAGCAAATATAATCCTGCTGACGGCCCATCTA 2447

2451 GGCACAGACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCGAAA 2500
     ||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2448 GGCATAAACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCGAAA 2497

2501 GCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCCCTC 2550
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2498 GCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCCCTC 2547

2551 TCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTTGTC 2600
     ||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||
2548 TCCTTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTTGTC 2597

2601 AGCCTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTAT 2650
     *****|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2598 GTGTGTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTAT 2647

2651 ATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTGCCA 2700
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||
2648 ATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTGTATGATCTGCCA 2697

2701 GATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGATCTTGTAAGGGATGCTAAAGACGC 2750
     ||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||*|||||*||
2698 GATGATTTCTTTCCAAAAATAGATGATCTTGTTAGGGATGCGAAAGATGC 2747

2751 TTTAGAACCTTACTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGATTG 2800
     |||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2748 TTTGGAACCTTATTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGATTG 2797

2801 CAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACTCAGGGT 2850
     |*|||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||
2798 CCACTCATTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTTTGGCAGACTACACAGGGT 2847

2851 ATGCATGAAATTGCTGAATCCTTAAGAGCAGTAATACCACCTACCACTGC 2900
     |||||||||||*||||||*|*||||||*||||*||*||*|||||*||||*
2848 ATGCATGAAATCGCTGAAGCTTTAAGAACAGTTATTCCCCCTACTACTGT 2897

2901 TCCTGTACCTACTGGATATCTCATTCAACACGAGGAGGCTGAAGAGATAC 2950
     *|||||||||***||*|||*|*|||||||||||*|||||*||*||*||*|
2898 ACCTGTACCTCAGGGTTATTTAATTCAACACGAAGAGGCAGAGGAAATTC 2947

2951 CCTTAGGTGATTTATTTAAACATCAGGAAGAAAGAATAGTCAGTTTTCAA 3000
     |**|*||*|||||||||||||||||*||||||||*|||||*|||||*||*
2948 CTCTGGGGGATTTATTTAAACATCAAGAAGAAAGGATAGTTAGTTTCCAG 2997

3001 CCAGACTATCCTATTACAGCAAGAATT 3027
     ||*||*|||||*||||||||*||||||
2998 CCTGATTATCCAATTACAGCTAGAATT 3024