NC_001344 AY392760 1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAATGAGGAATCTTTGGATAG 50 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||**||||||| 1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCGAAAATTAATGAGGAATCGCTGGATAG 50 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAATTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACTAATTACATTTCTCGGCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCG 150 ||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||* 101 CTAACGTTACTAATTATATTTCTCGGCTACGTACTTGGTTGTCAACACCT 150 151 GAAAAGTACCGAGGCCGTGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 |||||*||**|||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GAAAAATATAGAGGCCGAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGCGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGAACTAGAAAAC 250 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*| 201 AATCCAAGTGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGCACTAGAAAGC 250 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCGTAGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAAGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450 |||||||||||||*|||||||||||*|||||||*|*|||||*|||||||| 401 CGCCTAGGAAATAGATTACCTGCTAGGCATCACCTTGGGAAATTGTCAGG 450 451 TTTATATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 *||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 451 ATTGTATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATTTACAAGTAGTAAATGAGTGCCCTTCC 550 |||||||||||||||||||||||*|*||||||*||||||||||||||||| 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATATGCAAGTAATAAATGAGTGCCCTTCC 550 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 551 CGAAATTGGAAATATCTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAAGCGAAATATCCTGACAACGTGA 650 ||||||||||||*||||||||||||||*||*||*|||||||||||*|||| 601 CTACTTTCCTGTACAGGCAGGGGTTAAGGCTAAGTATCCTGACAATGTGA 650 651 TGCAGCATGAGGCAATAGTAGGTAAATATTTGAACAGGCTCTATGAAGCA 700 ||||||||||**|||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||| 651 TGCAGCATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTCAAAGGCAA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||**| 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTTAAAGGTCA 750 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800 801 ATGGGACAACAACCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGAGG 850 |||||*|||***|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 801 ATGGGTCAAAGCCCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGGGG 850 851 AGAGCTCCTGCTAAATCAATTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900 |||*|||||||||*|*|||*|||||||||||||||||||||||||||||| 851 AGAACTCCTGCTACAACAACTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900 901 TAACATGGTCGGGCAAATTTCCAACAATAGATCATCTATTAGACCATGTG 950 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||**|||||||||||||| 901 TAACATGGTCAGGCAAATTTCCAACAATAGATCACGTATTAGACCATGTG 950 951 CAAACAATGGAGGAGGTAAACACTCTTCAACAACAGGGCGCTTGGCCTGC 1000 |||||||||||||||*|||||||*||*|||*|*||*||*||*|||||*|* 951 CAAACAATGGAGGAGATAAACACGCTCCAAAATCAAGGAGCATGGCCGGA 1000 1001 TGGGGCGGGAAGACGATTGGGACTGACCAATCCTACTCCTCACGAGACGC 1050 *|||||||||||**||***||**|*|||||||||*|||||||*||||**| 1001 AGGGGCGGGAAGGAGAGCAGGGTTAACCAATCCTGCTCCTCAAGAGATTC 1050 1051 CTCAGCCTCAGTGGACTCCCGAGGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100 |||||||**||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||| 1051 CTCAGCCCAAGTGGACTCCGGAAGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100 1101 CGTCGATATCAAGAAGAAAGGCCACCGGAAACCACCACCATTGCTCCTAC 1150 |||||*||*||*|||||*||*|||||||||||||||||||||*||||*|| 1101 CGTCGTTACCAGGAAGAGAGACCACCGGAAACCACCACCATTCCTCCAAC 1150 1151 GTCACCAACTCCGTGGAAGCTACAACCAGGGGACGATCCACTCCTGGAAA 1200 *||*|||||||*||||||*|||||||||||*||||||||||||||||*|| 1151 ATCGCCAACTCAGTGGAAACTACAACCAGGAGACGATCCACTCCTGGGAA 1200 1201 ACAAGTCTTTACTCGAGACTCATCCTCTTTACCAGAATCCCGAGCCAGCC 1250 ||||||||*|*||*|||||*|||||**|||||||||||||*||||||||| 1201 ACAAGTCTCTGCTAGAGACACATCCAATTTACCAGAATCCAGAGCCAGCC 1250 1251 G---TGCCTGTGATAAAGACTCCTCCCCTCAAGAAGAAGAAAATGCCTGG 1297 |***|||||||||||||||||||*||*|||||||||||***||||*|||| 1251 GCCGTGCCTGTGATAAAGACTCCCCCGCTCAAGAAGAA---AATGTCTGG 1297 1298 TACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTT 1347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1298 TACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTT 1347 1348 TCTTGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTACGGAGGCTAGATTGGTGGTGG 1397 |||||||||||||||||||*||||||||**||||||||||*||||||||| 1348 TCTTGTTGATAAAAATTCTAGAAATACTGAGGAGGCTAGACTGGTGGTGG 1397 1398 ATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATAC 1447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1398 ATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATAC 1447 1448 TGGAGCCCAAATCTCTCAACATTACGTCGGATCCTGCCCGTGGGGATGCC 1497 |||||||||||*|||||*|||*|||||||||||||||||*|||||||||| 1448 TGGAGCCCAAACCTCTCCACACTACGTCGGATCCTGCCCCTGGGGATGCC 1497 1498 CAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATC 1547 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1498 CAGGATTTCTCTGGACCTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATC 1547 1548 CTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACATGTCTATTAT 1597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||*||| 1548 CTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACGGGTCTACTAT 1597 1598 TTTAGAAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGTCCTTTTCTCCTCCATCT 1647 |||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||| 1598 TTTAGGAAAGCTCCAATGGGCGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCT 1647 1648 CTTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGA 1697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1648 CTTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGA 1697 1698 CTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCAC 1747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1698 CTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACTCTCGTCAC 1747 1748 CTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGTTCTTTTCTACAAGAATTAGGAAT 1797 ||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||*|||||*|| 1748 CTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGCACTTTTCTACAAGAGTTAGGGAT 1797 1798 ACGCATAAACTTTGATAAGACTACTCCGTCTCCTGTAAATGACATAAGAT 1847 |||*||*||||||||*||*||||||||*||*|||||*|||||*||*|||| 1798 ACGAATTAACTTTGACAAAACTACTCCATCACCTGTCAATGAAATCAGAT 1847 1848 TCCTCGGTTACCAGATTGATCAGAAATTCATGAAGATCGAAGAAAGCAGA 1897 ||||||||||*||*||||||||*||||*|||||||||||||||||||||| 1848 TCCTCGGTTATCAAATTGATCAAAAATACATGAAGATCGAAGAAAGCAGA 1897 1898 TGGATAGAACTAAGGACTGTTATCAAGAAAATAAAAATAGGTGCATGGTA 1947 ||||**|||*||||||||||*|||||||||||||||*|*||||*|||||| 1898 TGGAGTGAATTAAGGACTGTAATCAAGAAAATAAAAGTTGGTGAATGGTA 1947 1948 TGACTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAACTTTGTGTTAC 1997 |||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||| 1948 TGATTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTAAACTTTGTATTAC 1997 1998 CATTTACTAAAGGTAACATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATT 2047 ||||||||||||||||*||*||||||||*||||||||||||||||||||| 1998 CATTTACTAAAGGTAATATAGAAATGTTGAAACCAATGTATGCTGCTATT 2047 2048 ACTAACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCAGCTTATAGGACTTTATTGTA 2097 |||*|||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||*||||| 2048 ACTCACAAAGTAAACTTTAGCTTCTCTTCTGCTTATAGGACTTTGTTGTA 2097 2098 CAAATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTAGCCATTCGACCAAAGTCCTCTG 2147 *||||||||||||||||||||*||||||*|*|||**|||||||||||||| 2098 TAAATTAACTATGGGTGTTTGCAAATTATCGATTAAACCAAAGTCCTCTG 2147 2148 TACCTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACTCCAACACATGGCGCAATA 2197 |||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||*||||||| 2148 TACCTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACACCCACACATGCCGCAATA 2197 2198 TCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGGGA 2247 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||*|| 2198 TCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTACAAAGGTCAGAGA 2247 2248 TATACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAAGATAATGATTA 2297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2248 TATACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAGGATAATGATTA 2297 2298 AACCCAGATGTATACTCTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTAT 2347 ||||||||||||||||**||||||||||*||||||||||||||||||||| 2298 AACCCAGATGTATACTTACCGATTCTACCTTTGTTTGCCACAAACGTTAT 2347 2348 CAGACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTGCTATCTCC 2397 ||||||||||||||||||||||||*||*|*|||||||||*|||||||||| 2348 CAGACGTTACCATGGCATTTTGCTGTGCTAGCCAAACAATTGCTATCTCC 2397 2398 TATACAGTTGTACTTTGTTCCAAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCCCAT 2447 |||||**||||||||||||||*||*|||||*||||||||||||||||||| 2398 TATACCATTGTACTTTGTTCCGAGCAAATATAATCCTGCTGACGGCCCAT 2447 2448 CCAGGCACAGACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCG 2497 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2448 CCAGGCACAAACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCG 2497 2498 AAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCC 2547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2498 AAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACCTAAGAATTACACCC 2547 2548 CTCTCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTT 2597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2548 CTCTCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTT 2597 2598 GTCAGCCTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCT 2647 |||****||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2598 GTCGTGTTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCT 2647 2648 TATATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTG 2697 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||| 2648 TATATATGGATATCAATGCCTCTAGAGCCTTAGCCAATGTGTATGATCTG 2697 2698 CCAGATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGATCTTGTAAGGGATGCTAAAGA 2747 ||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||| 2698 CCTGATGATTTCTTTCCTAAAATTGATGATCTTGTAAGAGATGCTAAAGA 2747 2748 CGCTTTAGAACCTTACTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGA 2797 |||||||||*|||||*||||||||*||*||||||||||||||||||||*| 2748 CGCTTTAGAGCCTTATTGGAAATCAGACTCAATAAAGAAACATGTTTTAA 2797 2798 TTGCAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACTCAG 2847 |*||||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||||||||*||| 2798 TCGCAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAGGATTTTTGGCAGACTACACAG 2847 2848 GGTATGCATGAAATTGCTGAATCCTTAAGAGCAGTAATACCACCTACCAC 2897 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||*||*||*||*|| 2848 GGTATGCATGAAATCGCTGAATCCTTAAGAGCAGTTATTCCTCCAACTAC 2897 2898 TGCTCCTGTACCTACTGGATATCTCATTCAACACGAGGAGGCTGAAGAGA 2947 *||*||*||*||**|*||*|||||*|||||*|||||*||||||||||||| 2898 AGCACCAGTTCCCGCAGGTTATCTTATTCAGCACGAAGAGGCTGAAGAGA 2947 2948 TACCCTTAGGTGATTTATTTAAACATCAGGAAGAAAGAATAGTCAGTTTT 2997 |*||*||*||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||* 2948 TTCCTTTGGGTGATTTATTTAAACATCAAGAAGAAAGGATAGTCAGTTTC 2997 2998 CAACCAGACTATCCTATTACAGCAAGAATT 3027 ||||||||*||||||||*||*||*|||||| 2998 CAACCAGATTATCCTATCACTGCGAGAATT 3027