NC_001344 AY294656 1 CATGCACACCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAATGAGGAATCTTTGGATAG 50 |||||*||**|*||||||||||||||||||||*||||||||**||||||| 1 CATGCTCATTTGAAAGCTTATGCAAAAATTAACGAGGAATCACTGGATAG 50 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 |||||||||||||*||||||||||||||*|*||||||||||||||||||| 51 GGCTAGGAGATTGATTTGGTGGCATTACCATTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACTAATTACATTTCTCGGCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCG 150 ||*|*||||||||*||*||||||||**|*|||||||||||*||||||||* 101 CTCAAGTTACTAACTATATTTCTCGCTTGCGTACTTGGTTATCAACTCCT 150 151 GAAAAGTACCGAGGCCGTGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 ||*||*||**|||||*|*||||||||*||||||||||||||||||||||| 151 GAGAAATATAGAGGCAGAGATGCCCCGACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGCGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTTCGGGAACTAGAAAAC 250 ||||||*|*||||||||||||||||||||||*||*||||*|||||||||| 201 AATCCATGTGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACAACTACGGGTACTAGAAAAC 250 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTACACCCCAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAAGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||||*|||||||| 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAGGCATCACTTAGGGAAATTGTCAGG 450 451 TTTATATCAAATGAAGGGTTGTACCTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTG 500 **||||||||||||||||*|||||*||||||||*||||||||||||||*| 451 ACTATATCAAATGAAGGGCTGTACATTTAACCCCGAATGGAAAGTACCAG 500 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATTTACAAGTAGTAAATGAGTGCCCTTCC 550 ||||||||||||||||||||*|*|||*|*|||||*||||||||||||||| 501 ATATTTCGGATACTCATTTTAACTTAGATGTAGTTAATGAGTGCCCTTCC 550 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTCTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCTGTCCAGGCAGGGGTTAAAGCGAAATATCCTGACAACGTGA 650 |||||||||||||||||*||||||||||*|*||*|||||||||||*|||| 601 CTACTTTCCTGTCCAGGTAGGGGTTAAACCAAAGTATCCTGACAATGTGA 650 651 TGCAGCATGAGGCAATAGTAGGTAAATATTTGAACAGGCTCTATGAAGCA 700 ||||*|||||**|||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||| 651 TGCAACATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTTACATTCAAAGGCAA 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||**| 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCTAAACATTTGGTAACATTTAAAGGTCA 750 751 GCCTTATAATTGGGAACTTCAATACCTTGTCAAGCAACATCAAGTTCCTG 800 |||||||||||||||||**|||*||||||||||*||||||||**||**|| 751 GCCTTATAATTGGGAACAGCAACACCTTGTCAATCAACATCATATTTATG 800 801 ATGGGACAACAACCAGCAAAATCAATGGACGTGCGGAGAATCGAAGGAGG 850 |||||*|||||*||||||||||||||||||||**|**|*||*|||||||| 801 ATGGGGCAACATCCAGCAAAATCAATGGACGTCAGACGGATAGAAGGAGG 850 851 AGAGCTCCTGCTAAATCAATTAGCAGGCCGCATGATTCCGAAAGGGACTG 900 |||**|*|||*||||*|||*|*||*||**|*|||||*||*|||||||||* 851 AGAAATACTGTTAAACCAACTTGCCGGAAGGATGATCCCAAAAGGGACTT 900 901 TAACATGGTCGGGCAAATTTCCAACAATAGATCATCTATTAGACCATGTG 950 |*||||||||*|||||*||||||||**|||||||**|*|||||||||||| 901 TGACATGGTCAGGCAAGTTTCCAACGCTAGATCACGTGTTAGACCATGTG 950 951 CAAACAATGGAGGAGGTAAACACTCTTCAACAACAGGGCGCTTGGCCTGC 1000 |||||||||||||||*|||||||*||*||**|*|||||*||||||||||| 951 CAAACAATGGAGGAGATAAACACCCTCCAGAATCAGGGAGCTTGGCCTGC 1000 1001 TGGGGCGGGAAGACGATTGGGACTGACCAATCCTACTCCTCACGAGACGC 1050 ||||||||||||**||*|*|||*|**|*|||||*||||||||*||||**| 1001 TGGGGCGGGAAGGAGAGTAGGATTATCAAATCCGACTCCTCAAGAGATTC 1050 1051 CTCAGCCTCAGTGGACTCCCGAGGAAGATCAAAAAGCTCGCGAGGCTTTT 1100 |||||||*||||||||||||||||||||*||||||||*|||||*|||||| 1051 CTCAGCCCCAGTGGACTCCCGAGGAAGACCAAAAAGCACGCGAAGCTTTT 1100 1101 CGTCGATATCAAGAAGAAAGGCCACCGGAAACCACCACCATTGCTCCTAC 1150 ||*||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||**| 1101 CGCCGTTATCAAGAAGAAAGACCACCGGAAACCACCACCATTCCTCCGTC 1150 1151 GTCACCAACTCCGTGGAAGCTACAACCAGGGGACGATCCACTCCTGGAAA 1200 *||*||**|||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||*|| 1151 TTCCCCTCCTCAGTGGAAGCTACAACCCGGGGACGATCCACTCCTGGGAA 1200 1201 ACAAGTCTTTACTCGAGACTCATCCTCTTTACCAGAATCCCGAGCCAGCC 1250 |**|||||*|*||||||||||||||*||*||||||****|*||*|||||* 1201 ATCAGTCTCTCCTCGAGACTCATCCGCTATACCAGT---CAGAACCAGCG 1247 1251 GTGCCTGTGATAAAGACTCCTCCCCTCAAGAAGAAGAAAATGCCTGGTAC 1300 |||||*||||||||*|||||*|||*|***|||||||||||||*||||||| 1248 GTGCCAGTGATAAAAACTCCCCCCTT---GAAGAAGAAAATGTCTGGTAC 1294 1301 CTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTTTCT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1295 CTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCTTTTTCT 1344 1351 TGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTACGGAGGCTAGATTGGTGGTGGATT 1400 ||||||||||||||||*||||||||**||||||||||||||||||||||| 1345 TGTTGATAAAAATTCTAGAAATACTGAGGAGGCTAGATTGGTGGTGGATT 1394 1401 TCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATACTGG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1395 TCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGATACTGG 1444 1451 AGCCCAAATCTCTCAACATTACGTCGGATCCTGCCCGTGGGGATGCCCAG 1500 ||||||||||||||*|||||||||*|||||*||||||||||||||||||| 1445 AGCCCAAATCTCTCCACATTACGTAGGATCTTGCCCGTGGGGATGCCCAG 1494 1501 GATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATCCTG 1550 |||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1495 GATTTCTTTGGACCTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATCCTG 1544 1551 CTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACATGTCTATTATTTT 1600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||*|||||| 1545 CTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACGGGTCTACTATTTT 1594 1601 AGAAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGTCCTTTTCTCCTCCATCTCTT 1650 ||*||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||| 1595 AGGAAAGCTCCAATGGGCGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTT 1644 1651 CACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGACTT 1700 ||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||*|||||||||| 1645 CACTACTGCCCTCGGATCCGAAATCTCTCGTCGCTTTAACGTTTGGACTT 1694 1701 TTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCACCTT 1750 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1695 TCACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGTCACCTT 1744 1751 AACTCAATTAGCCACGCTGTCTGTTCTTTTCTACAAGAATTAGGAATACG 1800 |||*|||||||||||||||||||*||||||*|||||||*|||||||||*| 1745 AACGCAATTAGCCACGCTGTCTGCTCTTTTTTACAAGAGTTAGGAATAAG 1794 1801 CATAAACTTTGATAAGACTACTCCGTCTCCTGTAAATGACATAAGATTCC 1850 *|||||||||||*||*||*||*||*|||||*||*|||||*|||||||||| 1795 AATAAACTTTGACAAAACCACGCCTTCTCCGGTGAATGAAATAAGATTCC 1844 1851 TCGGTTACCAGATTGATCAGAAATTCATGAAGATCGAAGAAAGCAGATGG 1900 |||||||||||||||||*|*||*|||||||||||*||||||||||||||| 1845 TCGGTTACCAGATTGATGAAAATTTCATGAAGATTGAAGAAAGCAGATGG 1894 1901 ATAGAACTAAGGACTGTTATCAAGAAAATAAAAATAGGTGCATGGTATGA 1950 |*||||*||||||||||*|||||||||||||||*||||*|*||||||||| 1895 AAAGAATTAAGGACTGTAATCAAGAAAATAAAAGTAGGAGAATGGTATGA 1944 1951 CTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAACTTTGTGTTACCAT 2000 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||*||*| 1945 CTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTGGGCATTTGAATTTTGTCTTGCCTT 1994 2001 TTACTAAAGGTAACATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATTACT 2050 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1995 TTACTAAAGGTAATATTGAAATGTTAAAACCAATGTATGCTGCTATTACT 2044 2051 AACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCAGCTTATAGGACTTTATTGTACAA 2100 |||*||||*||||||||||||||||||*|*|||||||||||*||*||*|| 2045 AACCAAGTAAACTTTAGCTTCTCTTCATCCTATAGGACTTTGTTATATAA 2094 2101 ATTAACTATGGGTGTTTGTAAATTAGCCATTCGACCAAAGTCCTCTGTAC 2150 |*||||*||||||||*|||||||||***||****|||||||||||||||| 2095 ACTAACAATGGGTGTGTGTAAATTAAGAATAAAGCCAAAGTCCTCTGTAC 2144 2151 CTTTGCCACGTGTAGCCACAGATGCTACTCCAACACATGGCGCAATATCC 2200 ||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||| 2145 CTTTGCCACGTGTAGCTACAGATGCTACCCCAACACATGGCGCAATATCC 2194 2201 CATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGGGATAT 2250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 2195 CATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCTTTTTCAAAGGTCAGAGATAT 2244 2251 ACATATACAGGAATTGCTGATGGTATGTTTAGCTAAGATAATGATTAAAC 2300 ||||*|*||||||*|**|||||***||||||||*|||||||||||||||| 2245 ACATGTTCAGGAACTATTGATGTCTTGTTTAGCCAAGATAATGATTAAAC 2294 2301 CCAGATGTATACTCTCCGATTCTACTTTTGTTTGCCACAAACGTTATCAG 2350 |**|*|||*|**|*||*|||||*||||||||||||||*||*||||||||| 2295 CACGCTGTCTCTTATCTGATTCAACTTTTGTTTGCCATAAGCGTTATCAG 2344 2351 ACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAACTGCTATCTCCTAT 2400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||****||||| 2345 ACGTTACCATGGCATTTTGCTATGTTGGCCAAACAATTGCTCAAACCTAT 2394 2401 ACAGTTGTACTTTGTTCCAAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCCCATCCA 2450 |||*|||||||||||*||*||*|||||*|||||||||||||||||||||| 2395 ACAATTGTACTTTGTCCCGAGCAAATATAATCCTGCTGACGGCCCATCCA 2444 2451 GGCACAGACCGCCTGATTGGACGGCTCTTACATACACCCCTCTCTCGAAA 2500 ||||*|*|||*|||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||| 2445 GGCATAAACCTCCTGATTGGACGGCTTTTCCATACACCCCTCTCTCGAAA 2494 2501 GCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCCCTC 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2495 GCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACACCCCTC 2544 2551 TCCTTCGGAGCTGCCTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTTGTC 2600 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2545 TCCTTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTATCTTTACGTCTACATTGCTGTTGTC 2594 2601 AGCCTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTAT 2650 ****|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2595 GTGTTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTAT 2644 2651 ATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTATATGATCTGCCA 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||| 2645 ATATGGATATCAATGCTTCTAGAGCCTTAGCCAATGTGTATGATCTACCA 2694 2701 GATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGATCTTGTAAGGGATGCTAAAGACGC 2750 ||||||||||||||||||||*|||||||||||*||*|||||||||||||| 2695 GATGATTTCTTTCCAAAAATAGATGATCTTGTTAGAGATGCTAAAGACGC 2744 2751 TTTAGAACCTTACTGGAAATCTGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGATTG 2800 ||||||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2745 TTTAGAGCCTTATTGGAAATCAGATTCAATAAAGAAACATGTTTTGATTG 2794 2801 CAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACTCAGGGT 2850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||* 2795 CAACTCACTTTGTGGATCTTATTGAAGACTTCTGGCAGACTACACAGGGC 2844 2851 ATGCATGAAATTGCTGAATCCTTAAGAGCAGTAATACCACCTACCACTGC 2900 |||||||||||*||*||||||||||||||*||*|||||*||*||*|||*| 2845 ATGCATGAAATAGCCGAATCCTTAAGAGCTGTTATACCTCCCACTACTAC 2894 2901 TCCTGTACCTACTGGATATCTCATTCAACACGAGGAGGCTGAAGAGATAC 2950 ||||||*||**|*||*|||||*|||||*|||||*||*||||||||||||| 2895 TCCTGTTCCACCGGGTTATCTTATTCAGCACGAAGAAGCTGAAGAGATAC 2944 2951 CCTTAGGTGATTTATTTAAACATCAGGAAGAAAGAATAGTCAGTTTTCAA 3000 |*||*||*||||||||||||||*||*||||||||*|||||*||*||*||| 2945 CTTTGGGAGATTTATTTAAACACCAAGAAGAAAGGATAGTGAGCTTCCAA 2994 3001 CCAGACTATCCTATTACAGCAAGAATT 3027 ||*||||||||*|||||*||*|||||| 2995 CCCGACTATCCGATTACGGCTAGAATT 3021