NC_005234 AY961616 1 TAGTAGTAGACTCCGCAAGAAATAGCAGTTAAATAACAGCATGATCATGT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 TAGTAGTAGACTCCGCAAGAAATAGCAGTTAAATAACAGCATGATCATGT 50 51 GGGGTTTACTATTGACAATGATTTTGATCGATTTTGGGGCATCCTTAAGG 100 |||||||||||||||||*|||***|||||**|*|||||||||||*|*||| 51 GGGGTTTACTATTGACACTGAGCCTGATCAGTCTTGGGGCATCCCTGAGG 100 101 AATGTCTATGACATGAAAATAGAATGCCCACATTCAATCAACTTTGGGGA 150 |||||*||||||*|*|*||||||*||*|||||*||||||||||||||*|| 101 AATGTGTATGACCTCAGAATAGAGTGTCCACACTCAATCAACTTTGGAGA 150 151 GAGTAGTGTAACAGGTAAGGTGGAGCTGCCACCCCTTCTGCTTACAGATG 200 |||*||||||||||||||||||||**|*||*|||*|*|**|||||*|||| 151 GAGCAGTGTAACAGGTAAGGTGGAATTACCCCCCATCCCACTTACTGATG 200 201 CAGAGGCCTTGGTCCCGGAAAGTTCTTGTAACATGGACAACCATCAGTCC 250 |||||*|*||*|||||*|||||*||*||*||||||||||||||*|||||* 201 CAGAGACGTTAGTCCCTGAAAGCTCCTGCAACATGGACAACCACCAGTCA 250 251 ATGTCAATTATACAAAAAGTGACAAAAGTAAGCTGGAGAAAAAAGGCAGA 300 *|*|||||||*|||||||||||||||*||*||*|||||||||||*||||| 251 TTATCAATTACACAAAAAGTGACAAAGGTGAGTTGGAGAAAAAAAGCAGA 300 301 CAAAGCCCAAGCTGCCAAGGACTCATTTGAGACAACATCAAGTGAGGTTA 350 |||||**||*||*||||||||*||||||||*||*|||||||||||**|*| 301 CAAAGTTCAGGCAGCCAAGGATTCATTTGAAACCACATCAAGTGAAATCA 350 351 A-CTTAAAGGGAACATGTGCATTGAGTCATAGGATGGTTGAAGAATCTTA 399 |*||||||||||*||||**||*||***||||||||||||||||||||||| 351 ATCTTAAAGGGA-CATGCACACTGGCACATAGGATGGTTGAAGAATCTTA 399 400 CAGAAATAGGAGATCAGTAATATGTTATGACTTGTCTTGCAATTCAACAC 449 |||*|**||*|**|||||*|||||*||||||||*||*||*|||||||||| 400 CAGGAGCAGAAAGTCAGTCATATGCTATGACTTATCCTGTAATTCAACAC 449 450 ATTGCAAGCCAACGATGCATATGATTGTACCTGTGCACTCATGCAACATG 499 |*||*||*|||||*|||*||||||||||*|||||*||*||||||||*||| 450 ACTGTAAACCAACAATGTATATGATTGTTCCTGTCCATTCATGCAATATG 499 500 ATGAAAAGCTGCCTGGTTGGGCTTGGGCCTTATAGAATCCAAATCGTCTA 549 ||||||||||||||*||*||**|*||*|||||**|*||*||**|*||*|| 500 ATGAAAAGCTGCCTTGTGGGTTTAGGACCTTACCGGATTCAGGTTGTTTA 549 550 TGAGAGAACCTACTGTACAACTGGTATACTAACAGAAGGGAAGTGTTTTG 599 |||*|||||*|||||*||||||||||||*|*|*|||*||*|||||*|||| 550 TGAAAGAACATACTGCACAACTGGTATATTGATAGAGGGCAAGTGCTTTG 599 600 TGCCAGACCAGAGTATTGTTAATGTTATCAAGAATGGGGTGTTCGACATC 649 |*|||||||||||*|||*|||*|||*||*||*||||||||*||*|||||* 600 TACCAGACCAGAGCATTATTAGTGTGATAAAAAATGGGGTTTTTGACATT 649 650 GCAAGTGTGAGCATTGTCTGTTTTTTCATCAGAGTTAAAGGGACCAACTA 699 ||||||||*||*||||||||*||*|||||**|**|*||*||*|*||*||| 650 GCAAGTGTCAGTATTGTCTGCTTCTTCATTCGCATAAAGGGAAACAGCTA 699 700 CAAGATAATGGCAAGTATTAAAACAGCAACTGCAAATAACTGTAATGACA 749 *|||||||||*|||*|||*|*||||||||*|*||||*|||||||||||*| 700 TAAGATAATGACAAATATAARAACAGCAAATCCAAACAACTGTAATGATA 749 750 CTGACAACAAGGTTCAAGGATATTACCTTTGTATTGTCGGGGGAAATTCT 799 |||||||*||*||*||*||*|||||*||*||*|||||*||*|**||*||| 750 CTGACAATAAAGTACAGGGTTATTATCTCTGCATTGTAGGAGCCAACTCT 799 800 TCTCCTGTGTATGCACCTTCAACCACTGATTTTAGATCTATGGAGGCACT 849 ||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||*||*|||||||*||| 800 TCCCCTGTTTATGCACCCTCAACCACTGATTTTAGGTCAATGGAGGTACT 849 850 TGCTAGCCTTTTAAGAGCTCCTCATGGTGAAGACCATGATTTATCTGGAG 899 |||*|||||**|*|||*|||||||||||||||||||||||||*|||||*| 850 TGCCAGCCTGCTGAGATCTCCTCATGGTGAAGACCATGATTTGTCTGGTG 899 900 AAGAGGTGGCAACTTACTCAATTGCCGGGCAAATTGAAGGCAAAATCCCA 949 |*||*||*||||||||*||||||||*||*||**||||*||||||*|*||* 900 AGGAAGTTGCAACTTATTCAATTGCTGGTCAGGTTGAGGGCAAAGTTCCG 949 950 CATACTGCAAATGCAGCAAACATGCTGTTTACTGCATTCTCAGGAATCCC 999 ||*||||*||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||| 950 CACACTGAAAATGCAGCAAATATGCTATTTACTGCATTCTCAGGAATCCC 999 1000 TAGTTACTCTTCATTAAGTGTTTTTATCGGAAGTCAGGACGGACCTGTTA 1049 |||*|||||||||*|*|||||*|||***||||*|||*||||||*||||*| 1000 TAGCTACTCTTCACTGAGTGTATTTGCTGGAAATCAAGACGGAACTGTAA 1049 1050 TATATAGCCCAGGATTGTTTCCTAGGTTGAACCAATCTTCATGTGATAAG 1099 |*||||||||*||*|||||*||||**||*||||||||*||||||||*||* 1050 TCTATAGCCCTGGTTTGTTCCCTAAATTAAACCAATCCTCATGTGAAAAA 1099 1100 ATTGCACTACCATTAATATGGGAAGGATATATAGATCTGCCTGGCTATTA 1149 *|||||*|*||*||*||||||||||||||||||||**||||||||||*|| 1100 GTTGCATTGCCTTTGATATGGGAAGGATATATAGACTTGCCTGGCTACTA 1149 1150 TGAAACAGTTCACCCATGTAATGTCTTTTGTGTGTTATCTGGCCCAGGGG 1199 |||||||*|||||||*|||||||||||*|||||*||*||||||||||||| 1150 TGAAACAATTCACCCTTGTAATGTCTTCTGTGTTTTGTCTGGCCCAGGGG 1199 1200 CATCATGTGAGGCATTCTCAGAAGGTGGTATTTTCAACATTACATCCCCT 1249 ||||*|||||||||||*||||||||||||||*|||||*||*||||||||* 1200 CATCCTGTGAGGCATTTTCAGAAGGTGGTATCTTCAATATAACATCCCCG 1249 1250 ACTTGCCTTGTGTCAAAGCAAAATAGGTTCAGAGCTGCTGAGCAGCAAGT 1299 ||*||**|*||*|||||*||*|||*|||||||*|||||*|||||*||**| 1250 ACATGTTTGGTTTCAAAACAGAATCGGTTCAGGGCTGCAGAGCAACAGAT 1299 1300 CAACTTTGTGTGCCAGCGAGTTGACCAAGATATTGTCATCTACTGTAATG 1349 *|||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*||*|||||*||*| 1300 TAACTTTGTGTGCCAGCGAGTTGATCAAGACATTGTGATTTACTGCAACG 1349 1350 GACAAAAGAAGACAATTTTAACTAAGACATTAGTGATTGGGCAGTGTATT 1399 ||||*||||||||*||**|*||*||||||*||||||||||*||*||*||* 1350 GACAGAAGAAGACCATCCTGACAAAGACACTAGTGATTGGACAATGCATC 1399 1400 TACTCAGTGACTAGTTTATTTTCAATAATGCCTGGGGTAGCACATTCAAT 1449 ||||||||*||*||**|*||||||||*|||||*||*|||||||||||*|| 1400 TACTCAGTAACAAGCCTGTTTTCAATTATGCCCGGTGTAGCACATTCTAT 1449 1450 TGCAATTGAATTATGTGTACCAGGGTTCCATGGTTGGGCAACTGCTGCTC 1499 |||||||||||||||||||||*||*||*|||||*|||||*|||||||||| 1450 TGCAATTGAATTATGTGTACCTGGTTTTCATGGATGGGCTACTGCTGCTC 1499 1500 TTCTCACTACATTCTGCTTTGGCTGGATACTGATCCTTTCCATTACATTA 1549 |*||*||*|||||*|||||*||*||||||||*||||*|||*||*|||*|| 1500 TCCTGACCACATTTTGCTTCGGTTGGATACTAATCCCTTCTATCACACTA 1549 1550 GCTGTGTTGGTTGTCCTGAAGTTTTTTGCCGCAATCTTACATAATAGCTC 1599 |||*|**||*|||||*|*|||||||||||*||||||||*||*||*||*|| 1550 GCTATACTGATTGTCTTAAAGTTTTTTGCTGCAATCTTGCACAACAGTTC 1599 1600 TCAAGAAAACCGGTTTAAAATTATCTTAAGAAAGATTAAAGAAGAATTTG 1649 |||||||||*|||||||||*|*||*||*||||||||*||*||*||*|||| 1600 TCAAGAAAATCGGTTTAAAGTCATTTTGAGAAAGATAAAGGAGGAGTTTG 1649 1650 AAAAGACTAAAGGCTCAATGGTCTGTGAAGTGTGCAAGTATGAGTGTGAA 1699 ||||*|||||||||||||||||*|||||||||||*||*|||||*|||||| 1650 AAAAAACTAAAGGCTCAATGGTATGTGAAGTGTGTAAATATGAATGTGAA 1699 1700 ACAGGGAAGGAGCTTAAAGCCCATAATTTATCTTGCCCTCAGTCACAGTG 1749 |||||*|||||*||*|||||*||*|||||*||*|||||*||*|||||||| 1700 ACAGGAAAGGAACTCAAAGCACACAATTTGTCCTGCCCACAATCACAGTG 1749 1750 TCCTTATTGCTTTACACACTGTGAGCCTACAGAATCTGCCTTTCAAGCAC 1799 |||*||*|||||||||||||||||*|**||*||||||||*|||||*|||| 1750 TCCATACTGCTTTACACACTGTGAACTCACGGAATCTGCATTTCAGGCAC 1799 1800 ATTATAAAGTGTGCCAAGCAACACACAGATTTAGGGATGATTTAAAGAAA 1849 |*||||*|||*|||||*||*|||||*||||||||||||||*||*|||||| 1800 ACTATAGAGTCTGCCAGGCTACACATAGATTTAGGGATGACTTGAAGAAA 1849 1850 ACAATAACACCTCAATCAACAAGCCCAGGTTGTTACCGGACATTAAATCT 1899 ||||||||||||||*||||||||*||||||||*||*||*|||*||||||| 1850 ACAATAACACCTCAGTCAACAAGTCCAGGTTGCTATCGCACACTAAATCT 1899 1900 TTTTAGGTATAAAAGTAGATGTTACATCTTTACAGTGTGGGTGACCTTAC 1949 ||||||*|||||*||*||*|||||*||*|||||*||*||||||****|*| 1900 TTTTAGATATAAGAGCAGGTGTTATATTTTTACTGTCTGGGTGGTTCTTC 1949 1950 TAATCATTGAATCAATCATGTGGGCAGCTAGTGCATCAGAAACTGTCTTG 1999 |*||||||||||||||**|*|||||*||*|||||||||||*|*||||||| 1950 TTATCATTGAATCAATTCTTTGGGCTGCCAGTGCATCAGAGATTGTCTTG 1999 2000 GAGCCAAGCTGGAATGACAATGCACATGGTGTTGGCGTTGTCCCAATGCA 2049 ||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||||||| 2000 GAACCAAGTTGGAATGATAATGCACATGGTGTTGGTGTTGTCCCAATGCA 2049 2050 TACTGACCTGGAACTTGATTTCTCTCTTCCATCAAGTTCTAAGTACACAT 2099 *||*||**|||||*|*|||||*||||||||||||||*||*||*||||||| 2050 CACCGATTTGGAATTGGATTTTTCTCTTCCATCAAGCTCCAAATACACAT 2099 2100 ATAAGAGAAAACTGACAAGTCCATTGAATCAAGAACAATCAGTAGATCTT 2149 |*|||||||||*||||||||||**|*||*|||||||||||||||||*||| 2100 ACAAGAGAAAATTGACAAGTCCCATTAACCAAGAACAATCAGTAGACCTT 2149 2150 CACATAGAGATAGAGAGTCAAGGGATCTCTACAAGTGTTCATGCATTAGG 2199 ||*||*||||||||*||||||*||||*|||||||||||*|||||*||||| 2150 CATATTGAGATAGAAAGTCAAAGGATTTCTACAAGTGTACATGCTTTAGG 2199 2200 TCATTGGTTTGATGGAAGGCTTAACCTAAAGACATCTTTTCATTGTTATG 2249 *|||||||||||||||||**|*|||*||||*|||||*||||||||*|||| 2200 CCATTGGTTTGATGGAAGATTGAACTTAAAAACATCCTTTCATTGCTATG 2249 2250 GTGCATGTACTAAGTATGAATACCCTTGGCACACGGCAAAATGCCACTTT 2299 |||||||*||*||*||||||||*||*||||||||*||||*|||*||*||| 2250 GTGCATGCACCAAATATGAATATCCCTGGCACACAGCAAGATGTCATTTT 2299 2300 GAAAGAGATTTCGAATATGAGAACAATTGGGGGTGTAATCCTGCTGATTG 2349 |||||*||*||*||*|||||*||||*||||*|*|||||*|||||*||*|| 2300 GAAAGGGACTTTGAGTATGAAAACAGTTGGAGTTGTAACCCTGCAGACTG 2349 2350 CCCTGGGATTGGTACTGGCTGTACTGCATGCGGGCTATACATTGACCAGC 2399 *||*||*||*|||||||||||*||||||||*||*||||||*||||||||| 2350 TCCAGGCATAGGTACTGGCTGCACTGCATGTGGTCTATACCTTGACCAGC 2399 2400 TTAAACCTGTAGGCAGTGCATATAAGCTGATCACAGTCCGTTACAGCCGT 2449 |*||*|||||*||*|||||*|||||**||||*|||||*||||||||**|* 2400 TCAAGCCTGTTGGGAGTGCTTATAAATTGATTACAGTTCGTTACAGTAGG 2449 2450 AAAGTATGTGTTCAGTTTGGTGAAGAAAATCTATGCAAGACAATTGATAT 2499 |||||*||||||||*||||||||||||||*||*||*||*|**|||||||| 2450 AAAGTCTGTGTTCAATTTGGTGAAGAAAACCTTTGTAAAATCATTGATAT 2499 2500 GAATGATTGCTTTGTTACAAGACATGTTAAAGTATGTATCATCGGTACAG 2549 |||||||||||||||**||||*|||||*||||||||*||*||*||*||*| 2500 GAATGATTGCTTTGTATCAAGGCATGTGAAAGTATGCATTATAGGCACTG 2549 2550 TTTCAAAGTTCTCGCAAGGTGATACCCTAGTATTCCTAGGCCCTATGGAA 2599 |||||||||||||*||||||||*|||||*||*||*||*||*||*|||||* 2550 TTTCAAAGTTCTCACAAGGTGACACCCTGGTGTTTCTCGGTCCCATGGAG 2599 2600 GGTGGGGGTTTGATATTTAAGGATTGGTGCACTAGCACATGCCAATTTGG 2649 |||||*|||||*||||||||||||||||||||*|**|||||*||*||||| 2600 GGTGGAGGTTTAATATTTAAGGATTGGTGCACAACAACATGTCAGTTTGG 2649 2650 TGATCCAGGAGACATTATGAGTCCTAAAGACAAAGGTTTCAGCTGCCCTG 2699 ||||||*||*||*||*||||||||*||*||*||||||||*|||||*|||| 2650 TGATCCTGGGGATATAATGAGTCCCAAGGATAAAGGTTTTAGCTGTCCTG 2699 2700 ACTTCACAGGCCATTTCCGGAAAAAATGCAACTTTGCAACAACACCTGTG 2749 |*||||||||*||||||*||||||||||*||||||||*||*||*|||||| 2700 ATTTCACAGGTCATTTCAGGAAAAAATGTAACTTTGCTACTACCCCTGTG 2749 2750 TGCGAGTATGATGGTAATATGGTCTCTGGGTATAAGAAAGTAATGGCAAC 2799 ||*|||||||||||*||||||||*|||||*||*||*|||||||||||||| 2750 TGTGAGTATGATGGCAATATGGTTTCTGGATACAAAAAAGTAATGGCAAC 2799 2800 TATTGATTCCTTTCAATCATTTAACACTAGTTCAATTCATTATACAGATG 2849 |||||||||*||||||*||||*|||||*||*|**||*||||||||*|||| 2800 TATTGATTCTTTTCAAGCATTCAACACCAGCTACATACATTATACTGATG 2849 2850 AAAGGATTGAGTGGAAAGACCCGGATGGAATGCTTAAGGACCACCTTAAT 2899 ||*|||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||**|*||* 2850 AACGGATTGAGTGGAAAGACCCGGATGGGATGCTTAAAGACCATATAAAC 2899 2900 ATACTTGTCACAAAGGATATTGACTTTGAAAACCTTGGAGAGAACCCGTG 2949 ||||||||*||||||||*|||||*||||||||*||||||||*|||||*|| 2900 ATACTTGTTACAAAGGACATTGATTTTGAAAATCTTGGAGAAAACCCATG 2949 2950 TAAAGTAGGACTTCAAACATCATCAATAGAAGGTGCATGGGGTTCTGGGG 2999 ||||||*||*||*||||||*||||*|||||*|||||||||||||||||*| 2950 TAAAGTTGGGCTACAAACAGCATCTATAGAGGGTGCATGGGGTTCTGGAG 2999 3000 TTGGTTTCACTCTCACTTGTCAAATCTCACTGACAGAGTGTTCACGCTTT 3049 ||||*|||||*||*||*||*||*||||||*|*||*||*|||||||||||* 3000 TTGGGTTCACCCTTACCTGCCAGATCTCATTAACTGAATGTTCACGCTTC 3049 3050 CTAACATCAATCAAAGCATGTGACATGGCAATTTGTTATGGTGCACAAAG 3099 *||||*||*||*||*||||||||*|||||*|||||*|||||*||*||*|| 3050 TTAACGTCTATTAAGGCATGTGATATGGCCATTTGCTATGGGGCGCAGAG 3099 3100 TGTTACACTCATTAGAGGCCAAAACACAGTGAAGGTTTCCGGGAAGGGTG 3149 |||||||||**|||||||*||*||*|||||||||||*||*|||||*|||| 3100 TGTTACACTTGTTAGAGGACAGAATACAGTGAAGGTATCTGGGAAAGGTG 3149 3150 GGCATAGTGGCTCTTCATTCAAGTGTTGCCATGGAACAGATTGCTCTCAA 3199 |*||||||||*||*||*||||||||*||*|||||*||*||*|||||*||* 3150 GACATAGTGGATCCTCCTTCAAGTGCTGTCATGGTACTGACTGCTCCCAG 3199 3200 CAGGGGCTACAAGCAAGTGCACCGCACCTGGATAAGGTCAATGGGATTGT 3249 ||*|||||*|||||||||||*|||||||||||*||||||||*||*||||| 3200 CAAGGGCTTCAAGCAAGTGCTCCGCACCTGGACAAGGTCAACGGTATTGT 3249 3250 TGAACAAGAGAGTGAGAAGGTTTATGATGATGGTGCACCACAATGTGGCA 3299 |||*|||||*||*****|*||*|||||||||||||||||*||||||||*| 3250 TGAGCAAGAAAGCACACAAGTATATGATGATGGTGCACCTCAATGTGGAA 3299 3300 TTTCATGCTGGTTTGTTAAGTCTGGGGAGTGGATAACAGGAATTTTCAAT 3349 |*||*|||||||||*|*||*|||||*||||||||||**||*||*||*||| 3300 TCTCTTGCTGGTTTATAAAATCTGGAGAGTGGATAAAGGGTATCTTTAAT 3349 3350 GGGAATTGGATTGTCATAGTTGTGCTTGTTTTCTTCTTCATATTGTCCTT 3399 ||*||*||||||||*||*||||||*|**|||||||||||||||||||*|| 3350 GGAAACTGGATTGTTATTGTTGTGTTAATTTTCTTCTTCATATTGTCTTT 3399 3400 AATCTTACTTAGTCTTCTATGTCCCATTCGTAAGCATAAACGCTCATAAG 3449 *||*|||||*|||*|||||||*||*||*|||||*||*||*|||||*|||| 3400 GATATTACTCAGTTTTCTATGCCCTATCCGTAAACACAAGCGCTCCTAAG 3449 3450 TACATATTAGCTTGTCCTTGTAT---ATAGCTTTCAACA-ATGCAAT--- 3492 ||*||||*|**|||**||**|||***|||*|*|**|*||*||**|*|*** 3450 TATATATCATGTTGAACTC-TATCCCATATCCTATATCATATATATTACT 3498 3493 TTTATATATCAGTTTAAACTTCTGTACTTATTAACTTTTTACAT--TTAT 3540 |||*||*|*****|***|||**|*|*||||*||**|||**||*|**|||| 3499 TTTGTACACTCCATATTACTAATTTGCTTACTATGTTTACACCTAGTTAT 3548 3541 CAACCTAGTTATCTAAAAAAAATAACTCCTTCATTACTATAAACCTTAGT 3590 *||||||**|||||||||||||||*||||||*|*||||||||**|*|||| 3549 TAACCTATATATCTAAAAAAAATACCTCCTTTACTACTATAATTCCTAGT 3598 3591 CCTTTAGTACGTGGGTATTTCTATATCTTGCGGAGCATACTACTA 3635 ||||||**||||||||*|||||||||||||||||||*|||||||| 3599 CCTTTATCACGTGGGTGTTTCTATATCTTGCGGAGCCTACTACTA 3643