NC_005234 AY168577 1 TAGTAGTAGACTCCGCAAGAAATAGCAGTTAAATAACAGCATGATCATGT 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 TAGTAGTAGACTCCGCAAGAAATAGCAGTTAAATAACAGCATGATCATGT 50 51 GGGGTTTACTATTGACAATGATTTTGATCGATTTTGGGGCATCCTTAAGG 100 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||| 51 GGGGTTTACTATTGACAATGATTTTGATCGATTTTGGGACATCCTTGAGG 100 101 AATGTCTATGACATGAAAATAGAATGCCCACATTCAATCAACTTTGGGGA 150 |||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 101 AATGTTTATGACATGAAAATAGAATGCCCACATTCAATCAACTTCGGGGA 150 151 GAGTAGTGTAACAGGTAAGGTGGAGCTGCCACCCCTTCTGCTTACAGATG 200 |||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 151 GAGCAGTGTGACAGGTAAGGTGGAGCTGCCACCCCTTCTGCTCACAGATG 200 201 CAGAGGCCTTGGTCCCGGAAAGTTCTTGTAACATGGACAACCATCAGTCC 250 |||||||||||||*||*||*|||||||||||||||||*|||||||||||| 201 CAGAGGCCTTGGTTCCAGAGAGTTCTTGTAACATGGATAACCATCAGTCC 250 251 ATGTCAATTATACAAAAAGTGACAAAAGTAAGCTGGAGAAAAAAGGCAGA 300 ||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||*||||| 251 ATGTCAATTATACAAAAAGTAACAAAAGTGAGCTGGAGAAAAAAAGCAGA 300 301 CAAAGCCCAAGCTGCCAAGGACTCATTTGAGACAACATCAAGTGAGGTTA 350 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*| 301 CAAAGCCCAAGCTGCCAAGGACTCATTTGAAACAACATCAAGTGAGGTCA 350 351 ACTTAAAGGGAACATGTGCATTGAGTCATAGGATGGTTGAAGAATCTTAC 400 |**||||*||*||||||*|||||||*||*|||||||||||||||||*||| 351 ATCTAAAAGGGACATGTACATTGAGCCACAGGATGGTTGAAGAATCCTAC 400 401 AGAAATAGGAGATCAGTAATATGTTATGACTTGTCTTGCAATTCAACACA 450 ||*||||||||||||||*|||||*||||||||||||||*||||||||||| 401 AGGAATAGGAGATCAGTGATATGCTATGACTTGTCTTGTAATTCAACACA 450 451 TTGCAAGCCAACGATGCATATGATTGTACCTGTGCACTCATGCAACATGA 500 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 451 TTGCAAGCCAACAATGCATATGATTGTACCTGTGCACTCATGCAATATGA 500 501 TGAAAAGCTGCCTGGTTGGGCTTGGGCCTTATAGAATCCAAATCGTCTAT 550 |||||||||||*|||||||*||*|||||||||*||||*|||*|*|||||* 501 TGAAAAGCTGCTTGGTTGGACTCGGGCCTTATCGAATTCAAGTTGTCTAC 550 551 GAGAGAACCTACTGTACAACTGGTATACTAACAGAAGGGAAGTGTTTTGT 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||| 551 GAGAGAACCTACTGTACAACTGGTATACTAACAGAAGGAAAATGTTTTGT 600 601 GCCAGACCAGAGTATTGTTAATGTTATCAAGAATGGGGTGTTCGACATCG 650 |||||||||*|||||*||||||||*|||||*||*|||||*||*||*||*| 601 GCCAGACCAAAGTATCGTTAATGTCATCAAAAACGGGGTATTTGATATTG 650 651 CAAGTGTGAGCATTGTCTGTTTTTTCATCAGAGTTAAAGGGACCAACTAC 700 ||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||*|||||| 651 CAAGTGTGAGCATTGTCTGTTTTTTCATTAGAGTCAAAGGGACAAACTAC 700 701 AAGATAATGGCAAGTATTAAAACAGCAACTGCAAATAACTGTAATGACAC 750 ||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 701 AAAATAATGGCAAGTATTAAAACGGCAACTGCAAATAACTGTAATGACAC 750 751 TGACAACAAGGTTCAAGGATATTACCTTTGTATTGTCGGGGGAAATTCTT 800 ||||||*|||||||||||*|||||*|||||||||||*||*||*||||||| 751 TGACAATAAGGTTCAAGGGTATTATCTTTGTATTGTTGGTGGGAATTCTT 800 801 CTCCTGTGTATGCACCTTCAACCACTGATTTTAGATCTATGGAGGCACTT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 801 CTCCTGTGTATGCACCTTCAACCACTGATTTTAGATCTATGGAGGCACTT 850 851 GCTAGCCTTTTAAGAGCTCCTCATGGTGAAGACCATGATTTATCTGGAGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 851 GCTAGCCTTTTAAGAGCTCCTCATGGTGAAGACCATGATTTATCTGGAGA 900 901 AGAGGTGGCAACTTACTCAATTGCCGGGCAAATTGAAGGCAAAATCCCAC 950 ||||||*||||||||*|||||||||||*||*||||||||||||||*|||| 901 AGAGGTTGCAACTTATTCAATTGCCGGACAGATTGAAGGCAAAATTCCAC 950 951 ATACTGCAAATGCAGCAAACATGCTGTTTACTGCATTCTCAGGAATCCCT 1000 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||| 951 ACACTGCAAATGCAGCAAACATGCTGTTTACTGCATTCTCAGGTATTCCT 1000 1001 AGTTACTCTTCATTAAGTGTTTTTATCGGAAGTCAGGACGGACCTGTTAT 1050 ||||||||||||||||||||*|*|||*|||||||||||*||*|||||**| 1001 AGTTACTCTTCATTAAGTGTCTATATTGGAAGTCAGGATGGGCCTGTCGT 1050 1051 ATATAGCCCAGGATTGTTTCCTAGGTTGAACCAATCTTCATGTGATAAGA 1100 *||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||||* 1051 TTATAGCCCAGGATTATTTCCTAAGTTGAACCAATCTTCATGTGATAAGG 1100 1101 TTGCACTACCATTAATATGGGAAGGATATATAGATCTGCCTGGCTATTAT 1150 |||||*|||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1101 TTGCATTACCATTGATATGGGAAGGGTATATAGATCTGCCTGGCTATTAT 1150 1151 GAAACAGTTCACCCATGTAATGTCTTTTGTGTGTTATCTGGCCCAGGGGC 1200 |||||||||||||||||||||||*|||||||||*|*|||||||||||||| 1151 GAAACAGTTCACCCATGTAATGTTTTTTGTGTGCTGTCTGGCCCAGGGGC 1200 1201 ATCATGTGAGGCATTCTCAGAAGGTGGTATTTTCAACATTACATCCCCTA 1250 |||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1201 ATCATGTGAGGCATTTTCAGAAGGTGGTATTTTCAATATTACATCCCCTA 1250 1251 CTTGCCTTGTGTCAAAGCAAAATAGGTTCAGAGCTGCTGAGCAGCAAGTC 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1251 CTTGCCTTGTGTCAAAGCAAAATAGGTTCAGAGCTGCTGAGCAGCAAGTA 1300 1301 AACTTTGTGTGCCAGCGAGTTGACCAAGATATTGTCATCTACTGTAATGG 1350 ||*||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 1301 AATTTTGTGTGCCAGCGAGTTGACCAAGACATTGTTATCTACTGTAATGG 1350 1351 ACAAAAGAAGACAATTTTAACTAAGACATTAGTGATTGGGCAGTGTATTT 1400 ||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1351 ACAAAAAAAGACAATTTTGACTAAGACATTAGTGATTGGGCAGTGTATTT 1400 1401 ACTCAGTGACTAGTTTATTTTCAATAATGCCTGGGGTAGCACATTCAATT 1450 |*||||||||*|||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1401 ATTCAGTGACAAGTCTATTTTCAATAATGCCTGGGGTAGCACATTCAATT 1450 1451 GCAATTGAATTATGTGTACCAGGGTTCCATGGTTGGGCAACTGCTGCTCT 1500 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1451 GCAATTGAATTGTGTGTACCAGGGTTCCATGGTTGGGCAACTGCTGCTCT 1500 1501 TCTCACTACATTCTGCTTTGGCTGGATACTGATCCTTTCCATTACATTAG 1550 |||*||*||||||||||||||*||||||*||||||*|||||||||||||| 1501 TCTTACCACATTCTGCTTTGGATGGATATTGATCCCTTCCATTACATTAG 1550 1551 CTGTGTTGGTTGTCCTGAAGTTTTTTGCCGCAATCTTACATAATAGCTCT 1600 ||||*|||||*|||*|*|||||||||||*||||||||||||||||||||| 1551 CTGTATTGGTGGTCTTAAAGTTTTTTGCAGCAATCTTACATAATAGCTCT 1600 1601 CAAGAAAACCGGTTTAAAATTATCTTAAGAAAGATTAAAGAAGAATTTGA 1650 |||||||||||*|||||*||||||*||||||||||||||||||||||||| 1601 CAAGAAAACCGTTTTAAGATTATCCTAAGAAAGATTAAAGAAGAATTTGA 1650 1651 AAAGACTAAAGGCTCAATGGTCTGTGAAGTGTGCAAGTATGAGTGTGAAA 1700 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1651 AAAGACTAAAGGCTCAATGGTTTGTGAAGTGTGCAAGTATGAGTGTGAAA 1700 1701 CAGGGAAGGAGCTTAAAGCCCATAATTTATCTTGCCCTCAGTCACAGTGT 1750 |||||||*||||||||||||||*|||||*||*|||||||||||||||||| 1701 CAGGGAAAGAGCTTAAAGCCCACAATTTGTCCTGCCCTCAGTCACAGTGT 1750 1751 CCTTATTGCTTTACACACTGTGAGCCTACAGAATCTGCCTTTCAAGCACA 1800 ||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||||| 1751 CCTTATTGTTTTACACATTGTGAGCCTACAGAATCTGCCTTTCAGGCACA 1800 1801 TTATAAAGTGTGCCAAGCAACACACAGATTTAGGGATGATTTAAAGAAAA 1850 |||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||*| 1801 TTATAAAGTGTGCCAGGCAACACACAGATTTAGGGATGATTTGAAGAAGA 1850 1851 CAATAACACCTCAATCAACAAGCCCAGGTTGTTACCGGACATTAAATCTT 1900 |||||||||||||*||*||||||||*||*|||||*||||||||||||||* 1851 CAATAACACCTCAGTCTACAAGCCCTGGGTGTTATCGGACATTAAATCTC 1900 1901 TTTAGGTATAAAAGTAGATGTTACATCTTTACAGTGTGGGTGACCTTACT 1950 |||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*|||||*|||*|*|| 1901 TTTAGATATAAAAGTAGGTGTTACATCTTTACAGTATGGGTAACCCTGCT 1950 1951 AATCATTGAATCAATCATGTGGGCAGCTAGTGCATCAGAAACTGTCTTGG 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*| 1951 AATCATTGAATCAATCATGTGGGCAGCTAGTGCATCAGAAAATGTCTTAG 2000 2001 AGCCAAGCTGGAATGACAATGCACATGGTGTTGGCGTTGTCCCAATGCAT 2050 |*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 2001 AACCAAGCTGGAATGACAATGCACATGGTGTTGGTGTTGTCCCAATGCAT 2050 2051 ACTGACCTGGAACTTGATTTCTCTCTTCCATCAAGTTCTAAGTACACATA 2100 ||||||||||||||*|||||*||*|||||||||||*||||||||*||||| 2051 ACTGACCTGGAACTAGATTTTTCCCTTCCATCAAGCTCTAAGTATACATA 2100 2101 TAAGAGAAAACTGACAAGTCCATTGAATCAAGAACAATCAGTAGATCTTC 2150 |||*||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||| 2101 TAAAAGAAAATTGACAAGTCCATTAAATCAAGAACAATCAGTTGATCTTC 2150 2151 ACATAGAGATAGAGAGTCAAGGGATCTCTACAAGTGTTCATGCATTAGGT 2200 |||||||||||||*|||||*|||||*||*||||||||||||||||||||* 2151 ACATAGAGATAGAAAGTCAGGGGATTTCCACAAGTGTTCATGCATTAGGA 2200 2201 CATTGGTTTGATGGAAGGCTTAACCTAAAGACATCTTTTCATTGTTATGG 2250 ||||||||||||||*|||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2201 CATTGGTTTGATGGGAGGCTTAACTTAAAGACATCTTTTCATTGTTATGG 2250 2251 TGCATGTACTAAGTATGAATACCCTTGGCACACGGCAAAATGCCACTTTG 2300 ||||||||||||||||||||||||*|||||*||*||*|||||*||||||| 2251 TGCATGTACTAAGTATGAATACCCCTGGCATACAGCGAAATGTCACTTTG 2300 2301 AAAGAGATTTCGAATATGAGAACAATTGGGGGTGTAATCCTGCTGATTGC 2350 |||||||*|||||*||||||||||*||||||*|||||||||||||||||| 2301 AAAGAGACTTCGAGTATGAGAACAGTTGGGGCTGTAATCCTGCTGATTGC 2350 2351 CCTGGGATTGGTACTGGCTGTACTGCATGCGGGCTATACATTGACCAGCT 2400 |||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||*||||||||||| 2351 CCTGGGATTGGTACTGGTTGTACTGCATGCGGACTATATATTGACCAGCT 2400 2401 TAAACCTGTAGGCAGTGCATATAAGCTGATCACAGTCCGTTACAGCCGTA 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2401 TAAACCTGTAGGCAGTGCATATAAGCTGATCACAGTCCGTTACAGCCGTA 2450 2451 AAGTATGTGTTCAGTTTGGTGAAGAAAATCTATGCAAGACAATTGATATG 2500 |||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||*||| 2451 AAGTATGTGTTCAATTTGGTGAAGAAAACCTATGCAAGACAATTGACATG 2500 2501 AATGATTGCTTTGTTACAAGACATGTTAAAGTATGTATCATCGGTACAGT 2550 ||||||||||||||*|||||||||||*||||||||*|||||*||*||||| 2501 AATGATTGCTTTGTCACAAGACATGTCAAAGTATGCATCATAGGCACAGT 2550 2551 TTCAAAGTTCTCGCAAGGTGATACCCTAGTATTCCTAGGCCCTATGGAAG 2600 ||||||*||*||*|||||||||||*|||||||||||*||*|||||||||| 2551 TTCAAAATTTTCACAAGGTGATACTCTAGTATTCCTGGGTCCTATGGAAG 2600 2601 GTGGGGGTTTGATATTTAAGGATTGGTGCACTAGCACATGCCAATTTGGT 2650 |||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*||| 2601 GTGGGGGCTTGATATTTAAGGATTGGTGCACTAGTACATGTCAATTCGGT 2650 2651 GATCCAGGAGACATTATGAGTCCTAAAGACAAAGGTTTCAGCTGCCCTGA 2700 |||||||||||*|||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||| 2651 GATCCAGGAGATATTATGAGTCCCAAAGATAAAGGTTTCAGCTGCCCTGA 2700 2701 CTTCACAGGCCATTTCCGGAAAAAATGCAACTTTGCAACAACACCTGTGT 2750 *||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 2701 TTTTACAGGCCATTTCCGGAAAAAATGCAACTTCGCAACAACACCTGTGT 2750 2751 GCGAGTATGATGGTAATATGGTCTCTGGGTATAAGAAAGTAATGGCAACT 2800 |||||||||||||*||*||||||||*|||||||||||||||||||||||* 2751 GCGAGTATGATGGCAACATGGTCTCCGGGTATAAGAAAGTAATGGCAACC 2800 2801 ATTGATTCCTTTCAATCATTTAACACTAGTTCAATTCATTATACAGATGA 2850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2801 ATTGATTCCTTTCAATCATTTAACACTAGTTCAATTCATTATACAGATGA 2850 2851 AAGGATTGAGTGGAAAGACCCGGATGGAATGCTTAAGGACCACCTTAATA 2900 |||||||||*|||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||| 2851 AAGGATTGAATGGAAAGACCCTGATGGAATGCTCAAGGACCACCTTAATA 2900 2901 TACTTGTCACAAAGGATATTGACTTTGAAAACCTTGGAGAGAACCCGTGT 2950 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||* 2901 TACTTGTCACAAAGGATATTGACTTCGAAAACCTTGGGGAGAACCCGTGC 2950 2951 AAAGTAGGACTTCAAACATCATCAATAGAAGGTGCATGGGGTTCTGGGGT 3000 ||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2951 AAGGTAGGACTCCAAACATCATCAATAGAAGGTGCATGGGGTTCTGGGGT 3000 3001 TGGTTTCACTCTCACTTGTCAAATCTCACTGACAGAGTGTTCACGCTTTC 3050 |||||||||*||||||||*||||||||||||||*||*||||||||||||| 3001 TGGTTTCACCCTCACTTGCCAAATCTCACTGACTGAATGTTCACGCTTTC 3050 3051 TAACATCAATCAAAGCATGTGACATGGCAATTTGTTATGGTGCACAAAGT 3100 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3051 TAACATCAATTAAAGCATGTGACATGGCAATTTGTTATGGTGCACAAAGT 3100 3101 GTTACACTCATTAGAGGCCAAAACACAGTGAAGGTTTCCGGGAAGGGTGG 3150 |||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||||||||*||||| 3101 GTTACACTCATCAGAGGCCAAAATACAGTAAAGGTTTCCGGGAAAGGTGG 3150 3151 GCATAGTGGCTCTTCATTCAAGTGTTGCCATGGAACAGATTGCTCTCAAC 3200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3151 GCATAGTGGCTCTTCATTCAAGTGTTGCCATGGAACAGATTGCTCTCAAC 3200 3201 AGGGGCTACAAGCAAGTGCACCGCACCTGGATAAGGTCAATGGGATTGTT 3250 |*|||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||| 3201 AAGGGCTGCAAGCAAGTGCACCACACCTGGATAAAGTCAATGGGATTGTT 3250 3251 GAACAAGAGAGTGAGAAGGTTTATGATGATGGTGCACCACAATGTGGCAT 3300 ||||||||||||||*||*||*||||||||||||||||||||*|||||||| 3251 GAACAAGAGAGTGAAAAAGTGTATGATGATGGTGCACCACAGTGTGGCAT 3300 3301 TTCATGCTGGTTTGTTAAGTCTGGGGAGTGGATAACAGGAATTTTCAATG 3350 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 3301 TTCATGCTGGTTTGTTAAGTCTGGAGAGTGGATAACAGGAATTTTCAATG 3350 3351 GGAATTGGATTGTCATAGTTGTGCTTGTTTTCTTCTTCATATTGTCCTTA 3400 ||||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||||*|*|||*|| 3351 GGAATTGGATTGTCATAGTTGTGCTTATTTTTTTCTTCATACTATCCCTA 3400 3401 ATCTTACTTAGTCTTCTATGTCCCATTCGTAAGCATAAACGCTCATAAGT 3450 ||*||*|||||||||*|*||||||||||||||||||||*||*||||||*| 3401 ATTTTGCTTAGTCTTTTGTGTCCCATTCGTAAGCATAAGCGTTCATAAAT 3450 3451 ACATA-------------TTAGCTTGTCCTTGTATATAGCTTTCAACAAT 3487 |||||*************||||**|*|*|*||||||||||*||*|||||| 3451 ACATACCAGAGAAACCCATTAGTATATTCCTGTATATAGCCTTTAACAAT 3500 3488 GCAATTTTATATATCAGTTTAAACTTCTGTACTTATTAACTTTTTACATT 3537 |||||||||||*|*||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 3501 GCAATTTTATACACCAGTTTAAACTTCTATACTTATTAACTTTTTACATT 3550 3538 TATCAACCTAGTTATCTAAAAAAAATAACTCCTTCATTACTATAAACCTT 3587 |||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||* 3551 TATTAACCTAGTTATCTAAAAAAAATAACTCCTTCATTACTATAAATCTC 3600 3588 AGTCCTTTAGTACGTGGGTATTTCTATATCTTGCGGAGCATACTACTA 3635 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3601 AGTCCTTTAGTACGTGGGTATTTCTATATCTTGCGGAGCATACTACTA 3648