NC_003481 AY789694 1 GTAAAAGAAAAGGAACAACCCTGTTGTTGTTCGACGCTATACTAAATATA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||| 1 GTAAAAGAAAAGGAACAACCCTGTTGTTGTTCGACACTAAACTAAATATA 50 51 TATTATCTTATTAGTGCATTTCTTTTACCGCTTCACAGTATGCCGAACGT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 TATTATCTTATTAGTGCATTTCTTTTACCGCTTCACAGTATGCCGAACGT 100 101 TTCTTTGACTGCTAAGGGTGGAGGACACTACATCGAGGATCAATGGGATA 150 |||||||||||*|||||||||*||*||*||*|*||||||||||||||||| 101 TTCTTTGACTGTTAAGGGTGGGGGGCATTATAACGAGGATCAATGGGATA 150 151 CACAAGTTGTGGAAGCCGGAGTATTTGACGATTGGTGGGTCCACGTAGAA 200 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||| 151 CACAAGTTGTGGAAGCCGGAGTGTTTGACGATTGGTGGGTTCACGTAGAA 200 201 GCCTGGAATAAATTTCTAGACAATTTACGTGGTATCAACTTTAGCGTTGC 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||| 201 GCCTGGAATAAATTTCTAGACAATTTACGTGGTATTAACTTCAGCGTTGC 250 251 TTCCTCTCGGTCGCAAGTCGCTGAATACTTAGCTGCGTTAGATCGTGATC 300 ||||||||||||||||||**||||*||||||||||||||||||||||||| 251 TTCCTCTCGGTCGCAAGTTTCTGACTACTTAGCTGCGTTAGATCGTGATC 300 301 TACCTGCTGATGTAGACAGACGGTTTGCAGGTGCTAGGGGACAAATTGGT 350 ||||||||||**||||||||*|*|||||||||*||||*|||**|||*||| 301 TACCTGCTGACATAGACAGAAGATTTGCAGGTTCTAGAGGAACAATCGGT 350 351 TCACCCAATTATCTTCCTGCGCCAAAATTCTTTCGTCTCGATAAGCGAAC 400 |*||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 351 TTACCCAATTATCTTCCTGCACCAAAATTCTTTCGTCTCGATAAGCGAAC 400 401 TATCGCTGAACTGACTAGACTCTCTCGTCTTACGGATCAGCCGCACAACA 450 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 TATTGCTGAACTGACTAGACTCTCTCGTCTTACGGATCAGCCGCACAACA 450 451 ATCGCGATATAGAACTTAACCGAGCGAAAAGAGCCACAACTAACCCATCT 500 ||||||||*||||*||||*||||*||||||||||||||||||*||||||| 451 ATCGCGATGTAGAGCTTAGCCGAACGAAAAGAGCCACAACTACCCCATCT 500 501 CCCCCGGCGCAGGCACCGTCGGAGAATCTCACTCTTCGTGATGTTCAACC 550 ||||||||||||||||*||*|||||*||**|||||||||||||||||||| 501 CCCCCGGCGCAGGCACTGTTGGAGACTCCTACTCTTCGTGATGTTCAACC 550 551 GTTAAAGGATAGTGCGTTGCATTATCAATACGTGTTGATTGACCTACAGA 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 551 GTTAAAGGATAGTGCGTTGCATTATCAATACGTGTTGATTGATCTACAGA 600 601 GTGCGAGACTCCCGGTGTATACCAGGAAGACTTTCGAACGTGAACTCGCT 650 ||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 601 GTGCTAGACTCCCAGTGTATACCAGGAAGACTTTCGAACGTGAACTCGCT 650 651 TTGGAATGGATCATTCCAGATGCCGAGGAAGCGTGACCTGCTGTCGAAGC 700 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 651 TTGGAATGGACCATTCCAGATGCCGAGGAAGCGTGACCTGCTGTTGAAGC 700 701 GGTAAAAGGATGTACATATGTATCTTATTTATTTTGTTTATCTATTTTCT 750 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||*||||| 701 GGTAAAAGGATGTACATATGTATCTTAATTATTTTGTTTATTTACTTTCT 750 751 TTTGCTTTTAGTTTTTGCTTTTTACGCATTAACTAGATGTATTGACTTTA 800 |||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 751 TTTACTTTTAGTTTTTGCTTTTTACGCTTTAACTAGATGTATTGACTTTA 800 801 GCCATGGACATGACGAAAACTGTTGAGGAAAAGAAAACAAATGGAACTGA 850 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 801 GCCATGGACATGACGAAGACTGTTGAGGAAAAGAAAACAAATGGAACTGA 850 851 TTCAGTGAAAGGTGTTTTTGAAAACTCGACGATTCCCAAAGTTCCGACTG 900 |||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||*|*|||| 851 TTCAGTGAAAGATGTTTTTGAGAACTCGACGATTCCCAAAGTTTCAACTG 900 901 GACAGGAAATGGGTG------GTGACGGTTCTTCTACTTCTAAATTAAAG 944 |||||||||||||*|******||||||*|||||||||||||*||||||*| 901 GACAGGAAATGGGCGCACACGGTGACGATTCTTCTACTTCTGAATTAAGG 950 945 GAAACTCTGAAAGTTGCCGATCAGACTCCATTGTCCGTTGACAATGGTGC 994 ||||||||*|***|||||*||||||||||||||||||||||*|||||||| 951 GAAACTCTAA---TTGCCAATCAGACTCCATTGTCCGTTGATAATGGTGC 997 995 CAAATCCAAATTGGATTCCTCTGATAGACAAGTTCCTGGAGTTGCCGATC 1044 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||************* 998 CAAATCCAAATTGGATTCTTCTGATAGACAAGTTCCT------------- 1034 1045 AGACTCCATTGTCCGTTGACAATGGTGCCAAATCCAAA-TTGGATTCCTC 1093 ******************************||||||||*||||***|**| 1035 ------------------------------AATCCAAAGTTGGCAACAAC 1054 1094 TGATAGACAAGTTCCTGGACCTGAGTTGAAACCCAACGTTAAGAAGTCCA 1143 ||*|*||*|||*******|||*||||||||***|||**|*|||||||||| 1055 TG-TGGAGAAGAA-----ACCGGAGTTGAA---CAAAATGAAGAAGTCCA 1095 1144 AGAAGAAAAGAATCCAAAAACCTGCTCAACCGAGTGGGCCCAATGACCTT 1193 |*||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1096 AAAAGAAAAGAAACCAAAAACCTGCTCAACCGAGTAGGCCCAATGACCTT 1145 1194 AAAGGCGGGACTAAGGGATCATCTCAAGTGGGTGAAAATGTGAGTGAGAA 1243 |||||***||||||||||**|*|||||||||||||*|||||||||||||| 1146 AAAGGAAAGACTAAGGGAAAACCTCAAGTGGGTGAGAATGTGAGTGAGAA 1195 1244 CTATACTGGGATTTCTAAGGAAGCAGCTAAGCAAAAGCAGAAGACGCCCA 1293 ||||||||||*||*|||*||||||||||||*|||||||*|||||||||*| 1196 CTATACTGGGGTTCCTATGGAAGCAGCTAATCAAAAGCCGAAGACGCCTA 1245 1294 AGTCTGTGAAAATGCAAAGCAATCTGGCCGATAAGTTCAAAGCGAATGAT 1343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1246 AGTCTGTGAAAATGCAAAGCAATCTGGCCGATAAGTTCAAAGCGAATGAC 1295 1344 ACTCGTAGATCGGAATTAATTAACAAGTTTCAGCAATTTGTGCATGAAAC 1393 |||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|| 1296 ACTCGTAGATCAGAATTGATTAACAAGTTTCAGCAATTTGTGCATGAGAC 1345 1394 CTGTCTTAAATCTGATTTTGAGTACACTGGTCGACAGTATTTCAGAGCTA 1443 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1346 TTGTCTTAAATCTGATTTTGAGTACACTGGTCGACAGTATTTCAGAGCTA 1395 1444 GATCAAATTTCTTTGAAATGATTAAGCTCGCATCCTTGTATGACAAACAT 1493 ||||*||||||||*||||||||||*|||||||||||||||*|||||*||| 1396 GATCCAATTTCTTCGAAATGATTAGGCTCGCATCCTTGTACGACAAGCAT 1445 1494 CTAAAGGAATGTATGGCGCGAGCCTGCACCCTAGAACGTGAACGATTGAA 1543 |||||*||*||*||||||||||||||||||*|||||||*||||||||||| 1446 CTAAAAGATTGCATGGCGCGAGCCTGCACCTTAGAACGAGAACGATTGAA 1495 1544 GCGTAAGTTACTCCTAGTACGAGCTTTGAAACCAGCAGTTGACTTCCTTA 1593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||| 1496 GCGTAAGTTACTCCTAGTACGAGCTTTGAAACCAGCAGTGGATTTCCTTA 1545 1594 CGGGAATCATCTCTGGAGTTCCTGGCTCAGGAAAATCAACCATTGTGCGT 1643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1546 CGGGAATCATCTCTGGAGTTCCTGGCTCAGGAAAATCAACCATTGTGCGT 1595 1644 ACTTTGCTCAAAGGTGAATTTCCGGCTGTTTGTGCTTTGGCCAATCCTGC 1693 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 1596 ACTTTGCTCAAAGGTGAATTTCCGGCTGTTTGTGCTTTAGCCAATCCTGC 1645 1694 CTTAATGAACGACTATTCTGGTATTGAAGGCGTTTACGGGTTAGATGACC 1743 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1646 CTTAATGAACGATTATTCTGGTATTGAAGGCGTTTACGGGTTAGATGACC 1695 1744 TGTTGCTTTCTGCAGTTCCGATAACGTCTGATTTATTGATCATAGATGAA 1793 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1696 TGTTGCCTTCTGCAGTTCCGATAACGTCTGATTTATTGATCATAGATGAA 1745 1794 TATACACTTGCTGAGAGCGCGGAAATCCTGTTGTTACAACGAAGACTCAG 1843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1746 TATACACTTGCTGAGAGCGCGGAAATCCTGTTGTTACAACGAAGACTCAG 1795 1844 AGCCTCTATGGTGTTGTTAGTCGGGGATGTAGCTCAAGGAAAAGCCACCA 1893 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1796 AGCCTCTATGGTGTTGTTGGTCGGGGATGTAGCTCAAGGAAAAGCCACCA 1845 1894 CTGCTTCCAGTATTGAGTATTTAACTCTGCCGGTGATCTACAGATCAGAG 1943 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1846 CTGCTTCTAGTATTGAGTATTTAACTCTGCCGGTGATCTACAGATCAGAG 1895 1944 ACGACTTATCGTTTGGGACAAGAGACTGCTTCGCTTTGCAGCAAGCAGGG 1993 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||| 1896 ACGACTTATCGTTTGGGACAAGAGACTGCTTCACTTTGCAGTAAGCAGGG 1945 1994 TAACAGAATGGTTTCAAAGGGTGGAAGGGACACAGTGATCATTACTGATT 2043 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1946 TAACAGAATGGTTTCAAAGGGTGGAAAGGACACAGTGATCATTACTGATT 1995 2044 ACGATGGCGAAACAGATGAAACGGAGAAAAATATCGCTTTTACTGTCGAT 2093 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1996 ACGATGGCGAAACAGATGAAACAGAGAAAAATATCGCTTTTACTGTCGAT 2045 2094 ACAGTTCGAGATGTGAAAGATTGCGGGTACGATTGTGCCCTGGCAATTGA 2143 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2046 ACAGTTCGAGATGTGAAAGATTGTGGGTACGATTGTGCCCTGGCAATTGA 2095 2144 TGTGCAAGGGAAAGAATTCGATTCAGTGACTTTATTCCTAAGGAACGAAG 2193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2096 TGTGCAAGGGAAAGAATTCGATTCAGTGACTTTATTCCTAAGGAACGAAG 2145 2194 ACCGGAAAGCTTTAGCAGATAAGCATTTGCGTTTAGTCGCTTTGAGCAGA 2243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2146 ACCGGAAAGCTTTAGCAGATAAGCATTTGCGTTTAGTCGCTTTGAGCAGA 2195 2244 CATAAGTCGAAGTTAATCATCAGGGCCGACGCGGAAATTCGTCAAGCATT 2293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 2196 CATAAGTCGAAGTTAATCATCAGGGCCGACGCGGAAATTCGCCAAGCATT 2245 2294 CCTGACAGGTGATATTGACTTGAGCTCTAAGGCGAGTAACTCTCATCGTT 2343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2246 CCTGACAGGTGATATTGACTTGAGCTCTAAGGCGAGTAACTCTCATCGTT 2295 2344 ATTCTGCAAAACCGGATGAAGACCACAGTTGGTTCAAGGCCAAATAAGTA 2393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2296 ATTCTGCAAAACCGGATGAAGACCACAGTTGGTTCAAGGCCAAATAAGTA 2345 2394 TTGGCCAATTGTCGCCGGAATCGGTGTCGTTGGATTGTTTGCGTATTTGA 2443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2346 TTGGCCAATTGTCGCCGGAATCGGTGTCGTTGGATTGTTTGCGTATTTGA 2395 2444 TCTTTTCAAATCAAAAACATTCTACGGAATCCGGTGATAATATTCACAAA 2493 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||* 2396 TCTTTTCAAATCAAAAACACTCTACGGAATCCGGTGATAATATTCACAAG 2445 2494 TTCGCCAACGGAGGTAGTTACAGAGACGGGTCAAAGAGTATAAGTTATAA 2543 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2446 TTCGCTAACGGAGGTAGTTACAGAGACGGGTCAAAAAGTATAAGTTATAA 2495 2544 TCGTAATCATCCTTTTGCCTATGGCAATGCCTCATCCCCTGGAATGTTGT 2593 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2496 TCGCAATCATCCTTTTGCCTATGGCAATGCCTCATCCCCTGGAATGTTGC 2545 2594 TGCCCGCAATGCTTACCATCATCGGAATCATTTCCTATTTATGGCGAACA 2643 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2546 TGCCCGCAATGCTTACCATCATCGGAATCATTTCCTATTTATGGCGAACA 2595 2644 AGAGATTCCGTGCTCGGAGACTCAGGCGGAAACAACTCCTGTGGAGAAGA 2693 *|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||*|| 2596 CGAGATTCCGTGCTCGGAAACTCAGGCGGAAACAACTCCTGCGGAGAGGA 2645 2694 CTGTCAGGGCGAATGTCTTAACGGACATTCTCGACGATCATTACTATGCG 2743 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2646 CTGTCAGGGCGAGTGTCTTAACGGACATTCTCGACGATCATTACTATGCG 2695 2744 ATATTGGCTAGTCTTTTTATCATTGCTCTATGGCTATTGTATATATATCT 2793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2696 ATATTGGCTAGTCTTTTTATCATTGCTCTATGGCTATTGTATATATATCT 2745 2794 AAGCAGTATACCTACGGAGACTGGTCCCTACTTCTATCAAGATCTGAACT 2843 |||||||*||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||*|||| 2746 AAGCAGTGTACCTACGGAAACTGGTCCTTACTTCTATCAAGATCTAAACT 2795 2844 CTGTGAAGATCTATGGAATAGGGGCTACGAACCCAGAAGTTATTGCGGCC 2893 |||||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||| 2796 CTGTGAAGATCTATGGAGTAGGGGCTACGAATCCAGAAGTTATTGCGGCC 2845 2894 ATCCACCATTGGCAGAAGTACCCTTTTGGGGAATCTCCGATGTGGGGAGG 2943 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2846 ATCCACCATTGGCAGAAGTACCCTTTTGGGGAGTCTCCGATGTGGGGAGG 2895 2944 TTTAATCAGTGTTTTGAGTATTCTTCTTAAACCGCTGACATTAGTTTTTG 2993 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*| 2896 TTTAGTCAGTGTTTTGAGTATTCTTCTTAAACCGCTGACGTTGGTTTTAG 2945 2994 CGTTAAGCTTTTTTCTCTTACTTTCTTCAAAAAGGT-------------- 3029 |||||||||||||||||||*|||||||||||||*||************** 2946 CGTTAAGCTTTTTTCTCTTGCTTTCTTCAAAAAAGTGAAAAAAAAAAAAA 2995 3030 -------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTTGATCAGATCATTCAAA 3072 *******||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2996 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGTTTGATCAGATCATACAAA 3045 3073 TCTGATGGTGCCCATCAACCATATGATGGGAGTGTTTGCAAGTCCACTAT 3122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 3046 TCTGATGGTGCCCATCAACCATATGATGGGAGTGTTTACAAGTCCACTAT 3095 3123 AATCGAACTTGAAAA-CAATGCCTGAATTGGAAACCATGAATCTTAACGG 3171 |||||||||||||||*|**||||||||||||||||||||||||||||||| 3096 AATCGAACTTGAAAAACCCTGCCTGAATTGGAAACCATGAATCTTAACGG 3145 3172 ATTCTGGAGAGAAAATTTAGGAATTGGTATGTAAGCTACAACTTCCGGTA 3221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3146 ATTCTGGAGAGAAAATTTAGGAATTGGTATGTAAGCTACAACTTCCGGTA 3195 3222 GCTGCGTCACACTTTAAGAGTGTGCATACTGAGCCGAAGCTCAGCTTCGG 3271 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3196 GCTGCGTCACACTTTAAGAGTGTGCATACTGAGCCGAAGCTCAGCTTCGG 3245 3272 TCCCCCAAGGGAAGACCA 3289 |||||||||||||||||| 3246 TCCCCCAAGGGAAGACCA 3263