NC_003469 AY789693 1 GTATGTAAGTTGCCTTTGGGTGTAAAATTTCTTGCATGCACATAATCGTA 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 GTATGTAAGTTGCCTTTGGGTGTAAAATTTCTTGCATGCACATAATCGTA 50 51 ATCGATTCTTCTTGATCTCTAAACAACACTTTCCCGTTAGCATGGCTAGC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 ATCGATTCTTCTTGATCTCTAAACAACACTTTCCCGTTAGCATGGCTAGC 100 101 GATGAGATTGTCCGCAATCTGATCTCCCGTGAGGAGGTGATGGGTAATTT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 GATGAGATTGTCCGCAATCTGATCTCCCGTGAGGAGGTGATGGGTAATTT 150 151 GATTAGCACAGCTTCTAGCTCAGTAAGGTCACCCTTACATGACGTACTGT 200 |||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GATTAGCACAGCTTCCAGTTCAGTAAGGTCACCCTTACATGACGTACTGT 200 201 GCTCGCACGTAAGGACCATCGTCGATTCCGTGGATAAGAAAGCGGTCAGT 250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 201 GCTCGCACGTAAGGACCATCGTCGATTCCGTGGAAAAGAAAGCGGTCAGT 250 251 CGCAAGCATGAAGATGTACGGCGCAACATCTCCTCTGAGGAATTGCAGAT 300 ||||||||||**||||||||||||||||||||*|||||*||*|||||||| 251 CGCAAGCATGTTGATGTACGGCGCAACATCTCTTCTGAAGAGTTGCAGAT 300 301 GTTGATAAATGCATATCCTGAATATGCCGTTTCATCCTCAGCTTGTGAAT 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 301 GTTGATAAATGCATATCCTGAATATGCCGTTTCATCTTCAGCTTGTGAAT 350 351 CTGGTACTCATAGCATGGCGGCTTGTTTTCGATTTCTGGAGACAGAATAT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 351 CTGGTACTCATAGCATGGCGGCTTGTTTTCGATTTCTGGAGACAGAATAC 400 401 CTCTTAGATATGGTTCCAATGAAAGAGACTTTTGTTTATGACATTGGTGG 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||| 401 CTCTTAGATATGGTTCCAATGAAAGAGACTTTTGTCTACGACATTGGTGG 450 451 CAACTGGTTTTCTCATATGAAGTTTCGTGCTGATAGAGAAATTCATTGTT 500 *||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 451 TAACTGGTTTTCTCACATGAAGTTTCGTGCTGATAGAGAAATTCATTGTT 500 501 GCTGTCCGATCTTATCTATGAGAGATTCTGAAAGACTGGAAACACGCATG 550 |||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 GCTGTCCAATCTTATCAATGAGAGATTCTGAAAGACTGGAAACACGCATG 550 551 ATGGCAATGCAAAAATATATGCGTGGATCGAAAGACAAACCGTTACGCTT 600 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||| 551 ATGGCGATGCAAAAATATATGCGTGGATCGAAAGATAAACCGTTGCGCTT 600 601 GTTAAGCCGTTATCAAAATATCCTGCGTGAACAAGCGGCGAGAACAACTG 650 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 601 GTTAAGCCGTTATCAAAATATACTGCGTGAACAAGCGGCGAGAACAACTG 650 651 CCTTTATGGCAGGTGAGGTGAATGCGGGTGTTCTCGATGGAGATGTGTTT 700 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||*|||||| 651 CCTTTATGGCAGGTGAGGTGAATGCGGGTGATCTTGATGGAGAGGTGTTT 700 701 TGTGAGAACACTTTTCAAGACTGTGTGAGACGAGTGCCCGAAGGTTTTTT 750 |||||||||||*||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 701 TGTGAGAACACGTTTCAAGACTGTGTGAGAGGAGTGCCCGAAGGTTTTTT 750 751 GAAGACAGCTATAGCAGTTCATAGCATCTACGATATCAAAGTGGAGGAAT 800 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||| 751 GAAGACAGCTATAGCAGTTCATAGCATTTACGATATCAAAGTGGAAGAAT 800 801 TTGCGTCTGCATTGAAAAGAAAAGGTATAACACAGGCTTATGGGTGTTTC 850 ||||||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 801 TTGCGTCTGCGCTGAAAAGAAAAGGTATAACACAGGCTTATGGGTGCTTC 850 851 CTGTTTCCTCCTGCTGTATTGATAGGTCAGAAGGAAGGCATTTTACCTTC 900 |||||||||||*||*|||||||||||*|||||||||||*||||||||*|| 851 CTGTTTCCTCCCGCCGTATTGATAGGCCAGAAGGAAGGTATTTTACCCTC 900 901 CGTGGACGGTCATTACTTGGTGGAGAATGGCAGGATTAAGTTCTTCTTTG 950 |||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||| 901 CGTGGACGGTCATTACTTGGTTGAGAATGGTAGGATTAAGTTCTTCTTTG 950 951 CGAATGATCCGAATGCCGGTTACTCTCATGACCTTAAGGATTATCTGAAG 1000 |*|||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||| 951 CAAATGATCCGAATGCCGGTTACTCGCACGACCTTAAGGATTATCTGAAG 1000 1001 TATGTGGAAAAGACCTATGTGGATATAGAGGATGGAGTGTTTGCTATTGA 1050 ||||||||*|||*|||||||||||||||||||*|||||||*||||||||| 1001 TATGTGGAGAAGGCCTATGTGGATATAGAGGACGGAGTGTCTGCTATTGA 1050 1051 GCTGATGCAAATGCGAGGTGATACCATGTTCTTTAAGATCACGGATGTCA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1051 GCTGATGCAAATGCGAGGTGATACCATGTTCTTTAAGATCACGGATGTCA 1100 1101 CCGCAGCAATGTATCATATGAAATACAGAGGTATGAAACGCGATGAAACA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||| 1101 CCGCAGCAATGTATCATATGAAATACAGAGGAATGAAACGTGATGAAACA 1150 1151 TTCAAATGCATTCCGTTGCTAAAGAATTCATCTGTTGTCGTACCTCTATT 1200 ||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||| 1151 TTCAAATGTATTCCGTTGCTAAAGAATTCATCTGTTGTTGTGCCTCTATT 1200 1201 TTCGTGGGACAACCGTTCTTTAAAGATCACAAGTGGTTTACTACCACGAA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1201 TTCGTGGGACAACCGTTCTTTAAAGATCACAAGTGGTTTACTACCGCGAA 1250 1251 CTTTGGTCGAGCAGGGTGCGGCTTTTATTATGAAAAACAAGGAGAAGGAC 1300 |||||||*|||||*||||||||*||*||*|||||*||||||||*||*||| 1251 CTTTGGTTGAGCAAGGTGCGGCGTTCATCATGAAGAACAAGGAAAAAGAC 1300 1301 TTGAACGTTGCTGTGTTGAAGAACTATCTTTCCGCTGTGAACAACTCATA 1350 |||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||| 1301 TTGAACGTTGCCGTGTTGAAGAACTACCTTTCCGCTGTGAACAATTCATA 1350 1351 CATTTTCAACGGATCCCAGGTTAGAGATGGCGTGAAAATTGCCCCGGATT 1400 |||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||| 1351 CATTTTCAACGGATCTCAGGTTAGAGATGGTGTGAAAATTGCTCCGGATT 1400 1401 TAATCTCCAAGTTGGCAGTGACTCTGTACCTGAGAGAAAAAGTCTATCGA 1450 ||||*||*||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1401 TAATTTCTAAATTGGCAGTGACTCTGTATCTGAGAGAAAAAGTCTATCGA 1450 1451 CAAAGAGAAAATTCAATCATAAGTTATTTCGAGCAAGAAATGCTTCACGA 1500 |||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||| 1451 CAAAGAGAAAATTCAATCATAAGTTATTTTGAACAAGAAATGCTTCACGA 1500 1501 TCCCAACTTGAAAGCCATGTTTGGAGACTTTCTGTGGTTTGTTCCAAATA 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1501 TCCCAACTTGAAAGCCATGTTTGGAGACTTTCTGTGGTTTGTTCCGAATA 1550 1551 CTCTCTCGAGTGTCTGGAAGAACATGCGAAAATCACTGATGGAATGGTTT 1600 ||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1551 CTCTTTCGAGTGTTTGGAAGAACATGCGAAAATCACTGATGGAATGGTTT 1600 1601 GGCTACGCAGAATTTGACTTGACTACTTTTGATATTTGCGATCCCGTTCT 1650 ||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1601 GGTTACGCAGATTTTGACTTGACTACTTTTGATATTTGCGATCCCGTTCT 1650 1651 CTATGTAGAGATAGTGGATCGGTATAAGATCATTCAAAAAGGGCGAATTC 1700 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1651 CTATGTAGAGATAGTGGATCGGTACAAGATCATTCAAAAAGGGCGAATTC 1700 1701 CACTTGGTGAGTTCTTTGATTGTCATGAAGAATGCGAGAATTACGAACTG 1750 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1701 CACTTGGCGAGTTCTTTGATTGTCATGAAGAATGCGAGAATTACGAACTA 1750 1751 CGTGAGAAGGAGAAAAACGACCTAGCGGTGAAAATGGCCCAGAAGGTAAC 1800 |||||||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||| 1751 CGTGAGAAGGAGAAAAATGACCTAGCGTTGAAAATGGCCCAGAAGGTAAC 1800 1801 AGGGACGGTGACCGAATGCGAGAAGGACCTGGGACCTCTTGTTCAACCGA 1850 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||* 1801 AGGGACGGTGACTGAATGCGAGAAGGACCTGGGACATCTTGTTCAGCCGG 1850 1851 TAAAAGAGATATTGGTTCAACTTGTGATGCCCAATTTGGTCAGAGCGCTG 1900 |||||*|||||*|*|||||||||*|||||||||||*|*|||||||||||* 1851 TAAAACAGATACTAGTTCAACTTATGATGCCCAATGTTGTCAGAGCGCTA 1900 1901 TGTAGACCTCGTAGCCCAACGTCTCCTTTGGACTTAAAAAGTATCCCAGG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|***|||||||**| 1901 TGTAGACCTCGTAGCCCAACGTCTCCTTTGGACATTA---GTATCCCGAG 1947 1951 GTCAACTCCATCACACTCAAGTTCAGATTCTGAACACTCTATGACTGAAG 2000 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||| 1948 GTCAACTCCATCACACTCAAGTTCAGATTCTGAACAATCTGTGACTGAAG 1997 2001 AAGCGAGCTGCACCATTGCGGGTAGCGTACCAACATGGGAAATTGCGACT 2050 |||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1998 AAGCGAGCTCCTCCATTGCGGGTAGCGTACCAACATGGGAAATTGCGACT 2047 2051 AGGAAAGATCTAACCTTTCAGCGAATTGATGAAGATATGTCTCGACGAAC 2100 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2048 AAGAAAGATCTAACCTTTCAGCGAATTGATGAAGACATGTCTCGACGAAC 2097 2101 TGGTATGCCTCCAAGACCAAAAGTAACTTCTAGTTACAACATGAATGCCA 2150 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 2098 TGGTATGCCTCCAAGACCAAAAGTAACTTCCAGTTACAACATGAATGCCA 2147 2151 GAGCTGAGTTTCTCTACTATCAACTGTGTAGCGTGATTTGTGAAAGGGCT 2200 ||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2148 GAGCCGAGTTTCTCTACTATCAACTGTGTAGCGTGATTTGCGAAAGGGCT 2197 2201 CAGATTTTGAGTGTCATCGAAGACTTTCGTCAGAATTTGATATTCTCAGA 2250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2198 CAGATTTTGAGTGTCATCGAAGACTTTCGTCAGAATTTGATATTCTCAGA 2247 2251 TAAAGTGGCCGTTCCATTGAACGCTAGATTCTACAGTTTTCAGTCATTGA 2300 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||||*|||| 2248 TAAAGTGGCCGTTCCATTGAACGCTAGATTTTACAGTTTTAAGTCGTTGA 2297 2301 GACCCGGATGGGTGTTCAAAACTCCATCGCATAGTGAAGTAGGCCACAGT 2350 *|||*||||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||* 2298 AACCTGGATGGGTGTTCAAGACTCCATCGTATAGTGAAGTAGGCCACAGC 2347 2351 TATGCAGTACATTTTGACTTCAAGACAATTGGAACCGATTTGGAAGAGAG 2400 |||||||||||||||||||||||||||*|*|||||*|||||||||||*|| 2348 TATGCAGTACATTTTGACTTCAAGACAGTCGGAACTGATTTGGAAGAAAG 2397 2401 CCTAGCTTTTTGCCGAATGGTACCGATTTCATGGGATAAAAGCGGCAAAT 2450 |*|*||*|||||||||*|*||||||*|||||||||||||||||||||||| 2398 CTTGGCCTTTTGCCGATTAGTACCGGTTTCATGGGATAAAAGCGGCAAAT 2447 2451 ACATCGCGACAACTCCTCATTTTCCCGAGAGACATGGTTACTACGTGATT 2500 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2448 ACATCGCGACAATTCCTCATTTTCCCGAGAGACATGGTTACTACGTGATA 2497 2501 TGTGACAACACTAAATTGTGTAACAATTGGCTTATTTACAATAAGTTAGT 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2498 TGTGACAACACTAAATTGTGTAACAATTGGCTTATTTACAATAAGTTAGT 2547 2551 TGACGTCTACGCACTAGTGGCTGATAGACCTCTGAGATTCGAGTTGATTG 2600 |||||||||||||*|*|||*|||||||||||||||*|||*|||||||||| 2548 TGACGTCTACGCATTGGTGACTGATAGACCTCTGAAATTTGAGTTGATTG 2597 2601 ACGGAGTTCCTGGCTGCGGAAAGTCAACCATGATTTTAAACAGCTGTGAT 2650 ||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||* 2598 ACGGAGTTCCTGGCTGTGGAAAGTCTACCATGATTTTAAACAGCTGTGAC 2647 2651 ATTCGACGCGAAGTTGTTGTTGGTGAAGGACGGAATGCAACTGATGACTT 2700 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2648 ATTCGACGCGAAGTTGTTGTTGGTGAAGGACGGAATGCGACTGATGACTT 2697 2701 AAGGGAGAGGTTCAAGCGTAAGAAAAATTTGAATAGTAAGACTGCTAATC 2750 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 2698 AAGAGAGAGGTTCAAGCGTAAGAAAAATTTGAATAGTAAGATTGCTAATC 2747 2751 ACAGAGTTCGAACGCTTGACAGCTTATTACTTGCTGAAGGACCTTGTGTA 2800 |*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2748 ATAGAGTTCGGACGCTTGACAGCTTATTACTTGCTGAAGGACCTTGTGTA 2797 2801 CCGCAAGCTGATAGGTTTCATTTTGATGAAGCTCTAAAAGTTCATTACGG 2850 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2798 CCACAAGCTGATAGGTTTCATTTTGATGAAGCTCTAAAAGTTCATTACGG 2847 2851 CGCCATAATGTTCTGTGCTGATAAGCTTGGTGCCTCAGAAATTCTCGCTC 2900 *||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2848 TGCTATAATGTTCTGTGCTGATAAGCTTGGTGCCTCAGAAATTCTCGCTC 2897 2901 AGGGAGATAGGGCTCAATTGCCAATGATCTGTCGTGTAGAAGGTATTGAA 2950 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 2898 AGGGCGATAGGGCTCAATTGCCAATGATCTGTCGTGTAGAAGGAATTGAA 2947 2951 CTTCAATTTCAATCTCCTGATTACACGAAGACGATCATAAATCCTAAGCT 3000 |||||*|||||*||||||||||||*||||||||||||||||*|||||||| 2948 CTTCATTTTCAGTCTCCTGATTACGCGAAGACGATCATAAACCCTAAGCT 2997 3001 ACGGTCATACCGTATCCCTGGAGATGTTGCCTTCTATTTGAGTGCTAAGG 3050 *||*|||||||||||*||||||||||||||||||||**|||||||*|||| 2998 GCGATCATACCGTATTCCTGGAGATGTTGCCTTCTACCTGAGTGCCAAGG 3047 3051 AATTTTACAAAGTTAAAGGAATACCTCAAAAGGTTATAACTTCTAACAGT 3100 |*||||||||||||||||||*|||||||||||||||*||||*|||||||* 3048 AGTTTTACAAAGTTAAAGGAGTACCTCAAAAGGTTACAACTACTAACAGC 3097 3101 GTGAAACGTTCCTTGTACGCTAGAGGCGAAACGACTCCGGAAAGATTCGT 3150 ||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||| 3098 GTGAAACGCTCCTTGTACGCTAGAGGTGAAACGACTCCGGAGAGATTCGT 3147 3151 GAGTTTGCTTGATGTTCCGGTGAGAAAAGACACCCACTATCTAACCTTCT 3200 |*|*||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 3148 GGGCTTGCTTGATGTTCCAGTGAGAAAAGACACCCACTATCTAACCTTCT 3197 3201 TACAAGCTGAGAAGGAAAGTTTGATGAGTCATTTGATTCCAAAGGGTGTG 3250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3198 TACAAGCTGAGAAGGAAAGTTTGATGAGTCATTTGATTCCAAAGGGTGTG 3247 3251 AAGAAAGAGTCTATTTCAACGATTCATGAGGCGCAGGGTGGTACCTATGA 3300 |||||||||*|*||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||| 3248 AAGAAAGAGGCGATTTCAACGATTCATGAGGCACAAGGTGGTACCTATGA 3297 3301 AAATGTGATTCTGGTCCGTTTGCAACGGACGCCCAATGAAATTTATCCGG 3350 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*||||||| 3298 AAATGTGATTCTGGTCCGTTTGCAACGGACACCCAACGAAATATATCCGG 3347 3351 GTGGACCTAGGTCCGCCCCTTACATTGTGGTTGGGACTTCAAGGCATACA 3400 ||||||*|||||**|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3348 GTGGACTTAGGTTTGCCCCTTACATTGTGGTTGGGACTTCAAGGCATACA 3397 3401 AAAACTTTCACTTATTGTAGTGTTACGGACGATAAGTTGCTTTTAGATAT 3450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3398 AAAACTTTCACTTATTGTAGTGTTACGGACGATAAGTTGCTTTTAGATAT 3447 3451 CGCCGACGTCGGTGGTATTGCACATACACCTATTCGTACTTTTGAATCTC 3500 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3448 CGCCGATGTCGGTGGTATTGCACATACACCTATTCGTACTTTTGAATCTC 3497 3501 ATATAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-------------------- 3530 ||||||||||||||||||||||||||||||******************** 3498 ATATAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3547 3531 ---------TGTTTGATCAGATCATTCAAATCTGATGGTGCCCATCAACC 3571 *********||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 3548 AAAAAAAAATGTTTGATCAGATCATACAAATCTGATGGTGCCCATCAACC 3597 3572 ATATGATGGGAGTGTTTGCAAGTCCACTATAATCGAACTTGAAAA-CGAT 3620 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|**| 3598 ATATGATGGGAGTGTTTACAAGTCCACTATAATCGAACTTGAAAAACCCT 3647 3621 GCCTGAATTGGAAACCATGAATCTTAACGGATTCTGGAGAGAAAATTTAG 3670 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3648 GCCTGAATTGGAAACCATGAATCTTAACGGATTCTGGAGAGAAAATTTAG 3697 3671 GAATTGGTATGTAAGCTACAACTTCCGGTAGCTGCGTCACACTTTAAGAG 3720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3698 GAATTGGTATGTAAGCTACAACTTCCGGTAGCTGCGTCACACTTTAAGAG 3747 3721 TGTGCATACTGAGCCGAAGCTCAGCTTCGGTCCCCCAAGGGAAGACCA 3768 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3748 TGTGCATACTGAGCCGAAGCTCAGCTTCGGTCCCCCAAGGGAAGACCA 3795