NC_003623 AY017338 1 ATGAAAAATGTTTACGTTTTCTTACGTTACCGTGATTTCACTTTTCTTTA 50 |||||||||*||******||||||||*|||||||||||||||||||||** 1 ATGAAAAATTTTGGTAGGTTCTTACGCTACCGTGATTTCACTTTTCTTCT 50 51 GCCAAGAGTTTAAGAAACTCAAAAGTGAAACTGCCAAGAGTTTAAGAAAC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 GCCAAGAGTTTAAGAAACTCAAAAGTGAAACTGCCAAGAGTTTAAGAAAC 100 101 TCACAAAGCGAAGAGTTTAAGAAACTCATCATTGCTTTTTTGTTCTTTTA 150 |||*||||||||||||||||||||||||*||||||||||***||||*||| 101 TCA-AAAGCGAAGAGTTTAAGAAACTCAACATTGCTTTTCCCTTCTCTTA 149 151 TTTTGCGCTTTATTTGTTTAGCATTTTATTTAGTTCTTTTAAAAAGCTTT 200 *|||||||||||||||*||||||||||||||||||**|||*||||||||| 150 CTTTGCGCTTTATTTGCTTAGCATTTTATTTAGTTTGTTTGAAAAGCTTT 199 201 TGTTTTGTTTTTCTTTTTCTTTACTTGCCCTTATGGGCAAATTTTATTAT 250 *||||||||||*|||*||*|**|*||||||*||||||||||||||||||| 200 CGTTTTGTTTTCCTTATTTTCCATTTGCCCGTATGGGCAAATTTTATTAT 249 251 TCCAACAGGCGGCTTGCCTGTTGGGCTGCTGGGAAGAACCCTCATCTTGG 300 |||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||*|||||*|| 250 TCCAACAGGCGTCTTGCCTGTTGGGCTGCTGGAAAGAACCCCCATCTAGG 299 301 GGGTTCTGTTGAACAATGGCTGGCGGCCATTAACACTGATCCCTCCTTCC 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||||||| 300 GGGTTCTGTTGAACAATGGCTGGCGGCCATTAATACTGATTCCTCCTTCC 349 351 GCCAAACTGTTAAGGAGGATGTCCAAGAAAACCGAGAACAGCCAACTGCT 400 |||||||||||||||||||||||||*||*|||||*||*|||||*|||||* 350 GCCAAACTGTTAAGGAGGATGTCCAGGACAACCGGGAGCAGCCTACTGCC 399 401 GTTCGAATGTTTTCTTGGAAAGTTGGGTCCGGGCCCATTGACAATCCCGA 450 *|*||*||||||||*||||||||*||*|*||||||||||||||||||||| 400 ATCCGGATGTTTTCCTGGAAAGTGGGATTCGGGCCCATTGACAATCCCGA 449 451 GAAATGCGACTGGCATTTTGTCCTTACGGGCGAGAGGCCAGC---GCCGT 497 *|||||*|||||||||||*||||||||||||||*||||||||***||||* 450 AAAATGTGACTGGCATTTCGTCCTTACGGGCGAAAGGCCAGCACAGCCGA 499 498 CCCGGCCGGTTAAAGCCGATGAGGTTGTGGTGGTGCCACAACCGAAGAAG 547 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 500 CCCGGCCGGTCAAAGCCGATGAGGTTGTGGTGGTGCCACAACTGAAGAAG 549 548 GTGGTGATTCCAACACCACCTCCTCCCCCAGCTCCCTACTTTAGGGCTGT 597 |||||||||||**|||||||||||||*|||||***|||*||||||||||| 550 GTGGTGATTCCGTCACCACCTCCTCCTCCAGCAGTCTATTTTAGGGCTGT 599 598 TGGGGCTTTTGCACCAACCCGGTCCGAGTTTGTTCGGGCCATTGTGGAAA 647 |||||||||*||||||||||||||||*||||*|||||||||*|||||||| 600 TGGGGCTTTCGCACCAACCCGGTCCGGGTTTATTCGGGCCACTGTGGAAA 649 648 GGCTCACCCGGCTACGGGAGGAGTCGAGAGCTGCGGCACTCTTTGCCGAA 697 |*|||*|||||**||||||*||||||||||||||||||||*||||||||| 650 GACTCTCCCGGGAACGGGAAGAGTCGAGAGCTGCGGCACTTTTTGCCGAA 699 698 TTGCCATTGGAGTACCCTCAGGGTGCTCCTCTGAAGTTGAGCCTGGCGGC 747 *|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||** 700 CTGCCATTGGAGTACCCTCAGGGTGCTCCTTTGAAGTTGAGCCTGGCGAT 749 748 GAAATTCGCCATGCTCAAACATACCACTTGGAGGAAGTGGTATGACACTA 797 |||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 750 GAAGTTCGCCATGCTCAAGCATACCACTTGGAGGAAGTGGTATGACACTA 799 798 GTGATGAGCGCCTTTTGGAGGCTCATCCTGGTGGTCCTTGTCTTCCTCCC 847 |||||||||||||*|**|||||*||||||||||||||||||||||||||| 800 GTGATGAGCGCCTCTCAGAGGCCCATCCTGGTGGTCCTTGTCTTCCTCCC 849 848 CCTCCCCCAATCCAAAATCCTCCCTCCTTCCAGGAGAGGGTGAGGGAGTT 897 |||||||||||||||||*|||||||**||*||*||||||||*|||||*|| 850 CCTCCCCCAATCCAAAACCCTCCCTTTTTTCAAGAGAGGGTAAGGGAATT 899 898 TTGCAGGATGAAGTCCTGCACCAAGGCTTTCGCCTTGGAAACCTCCCTAG 947 *||||||||||||||||||*|||*||||||*|||*|||||||*||||||| 900 CTGCAGGATGAAGTCCTGCGCCAGGGCTTTTGCCCTGGAAACTTCCCTAG 949 948 GTCTCAATAAGGCCTGGGTAGGTTTAGTGGACATCCCCAGTACTTCTGTG 997 |*||*||||*|||||||||||||||*||||||||||||||*||*|||||| 950 GCCTTAATAGGGCCTGGGTAGGTTTGGTGGACATCCCCAGCACCTCTGTG 999 998 TGCTGTGCGGATGGGAAGACTACCGGTGGGCAGACAATTGCCCAGGAAGC 1047 ||*||||||||||||***||||||||||||||*||||||||*||*||*|| 1000 TGTTGTGCGGATGGGCGCACTACCGGTGGGCAAACAATTGCTCAAGAGGC 1049 1048 TGATCCTTTGCAACATAGGATCAGTACGTCAGTAGCCCCCGGTAGGGCAC 1097 |||||||||||||||||||*|||||||*||*||*||||||||||||||*| 1050 TGATCCTTTGCAACATAGGGTCAGTACATCTGTGGCCCCCGGTAGGGCGC 1099 1098 AATGGATCTCCGAGCGCAGACAAGCTCTGCGGAGGAGAGAGCAAGCAAAT 1147 ||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1100 AATGGATCTCTGAACGCAGACAAGCTCTGCGGAGGAGAGAGCAGGCAAAT 1149 1148 AGCTTCGAAGGTCTTGCTGCTCAAACCGATATGACTTTTGAGCAGGCCAG 1197 |||*|**|*|||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||| 1150 AGCCTGCAGGGTCTTGCTGCTCAAACTGACATGACTTTTGAGCAGGCCAG 1199 1198 GAATGCTTATCTTGGTGCTGCCGACATGATTGAGCAAGGCCTACCGCTGC 1247 |||*||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1200 GAACGCCTATCTTGGTGCTGCCGACATGATCGAGCAAGGCCTACCGCTGC 1249 1248 TTCCCCCTCTGCGCAGCGCTTACGCCCCTAGGGGTTTGTGGAGGGGACCC 1297 ||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||* 1250 TTCCCCCTCTGCGCAGCGCTTATGCCCCTAGAGGTTTGTGGAGGGGACCT 1299 1298 TCAACCAGAGCCAATTACACGCTAGATTTTAGGCTCAATGGTATTCCGAC 1347 |||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||*||||| 1300 TCAACCAGAGCCAATTATACGCTAGATTTCAGGCTCAATGGTATACCGAC 1349 1348 CGGGACAAACACATTGGAAATATTGTATAATCCTGTGTCGGAGGAAGAGA 1397 *|||||*||||||||||||||*|||||*|||||*||||||||*||*|||| 1350 TGGGACGAACACATTGGAAATTTTGTACAATCCCGTGTCGGAAGAGGAGA 1399 1398 TGGAAGAGTACCGGGACAGGGGCATGTCAGCTGTGGTAATTGATGCGCTA 1447 |||||||||||||*||*|||||*|||||*||||||||*|||||||||||| 1400 TGGAAGAGTACCGTGATAGGGGTATGTCGGCTGTGGTGATTGATGCGCTA 1449 1448 GAAATAGCCATAAACCCATTTGGCATGCCTGGAAATCCTACGGACTTGAC 1497 ||||||||*||||||||*||*||||||||*||*|||||*||||||||*|| 1450 GAAATAGCTATAAACCCCTTCGGCATGCCCGGTAATCCAACGGACTTAAC 1499 1498 TGTCGTAGCGACATATGGGCATGAGCGCGACATGACGCGCGCCTTTATTG 1547 *|||||*||*|||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||| 1500 CGTCGTGGCAACATATGGGCATGAGCGTGATATGACGCGCGCCTTTATTG 1549 1548 GATCTGCTTCCACATTCTTAGGGAATGGGTTAGCTAGAGCCATTTTCTTT 1597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1550 GATCTGCTTCCACATTCTTAGGGAATGGGTTAGCTAGAGCCATTTTCTTC 1599 1598 CCTGGTTTGCAATATAGCCAGGAGGAACCAAGGCGCGAATCTATAATTCG 1647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|| 1600 CCTGGTTTGCAATATAGCCAGGAGGAACCAAGGCGTGAATCTATAATCCG 1649 1648 CCTATATGTTGCCTCTACCAATGCCACTGTGGATACTGATTCAGTCTTGG 1697 ||||||||||||||||||*|||||||||||*||*||*||*|||||**||| 1650 CCTATATGTTGCCTCTACTAATGCCACTGTAGACACCGACTCAGTTCTGG 1699 1698 CAGCCATTAGTGTTGGCACTTTGCGTCAACATGTTGGTTCCATGCACTAC 1747 |*||||||||||||||*||||||||*|||||*|||||*||||||||*||* 1700 CGGCCATTAGTGTTGGTACTTTGCGACAACACGTTGGCTCCATGCATTAT 1749 1748 CGGACAGTGGCTAGTACCGTGCACCAGGCTCAGGTGCAAGGAACGACGCT 1797 ||*|||||||||||*|||||*||||||||*||||||||*||||||||*|| 1750 CGAACAGTGGCTAGCACCGTACACCAGGCCCAGGTGCAGGGAACGACACT 1799 1798 CAGGGCTACTATGATGGGTAACACTGTCGTAGTATCACCTGAAGGAAGCC 1847 ||||||*||*|||||||||||||||||*||*|||||*|||||||||||*| 1800 CAGGGCAACCATGATGGGTAACACTGTTGTGGTATCCCCTGAAGGAAGTC 1849 1848 TGGTTACTGGAACCCCTGAAGCAAGAGTTGAAATAGGGGGCGGTTCTAGT 1897 ||||||||||*|||||*|||||||||||||||||*|||||||||||*||| 1850 TGGTTACTGGGACCCCAGAAGCAAGAGTTGAAATTGGGGGCGGTTCCAGT 1899 1898 ATTAGGATGGTGGGACCTCTACAGTGGGAAAGTGTGGAGGAACCAGGGCA 1947 ||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||*||*|| 1900 ATTAGGATGGTGGGACCTCTTCAATGGGAAAGTGTGGAGGAACCGGGCCA 1949 1948 AACCTTCTCTATCAGAAGCCGTTCACGGTCTGTGAGGATTGATAGAAACG 1997 ||||||||||||||||||*||*|||||*|||||||||||*||||||||*| 1950 AACCTTCTCTATCAGAAGTCGCTCACGATCTGTGAGGATAGATAGAAATG 1999 1998 TTGATCTTCCTCAACTTGAGGCTGAGCCCAGACTGAGCTCAACCGTGAGA 2047 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2000 TTGATCTTCCCCAACTTGAGGCTGAGCCCAGACTGAGCTCAACCGTGAGA 2049 2048 GGATTAGCTGGTAGAGGAGTAATCTACATTCCCAAGGATTGCCAGGCAAA 2097 ||||||||||||||||||||**|*||*||*||*||||||||||||||||| 2050 GGATTAGCTGGTAGAGGAGTTGTTTATATCCCTAAGGATTGCCAGGCAAA 2099 2098 TAGATACTTGGGCACCCTGAATATACGTGATATGATCTCAGACTTCAAGG 2147 |||*||*||||||||||||||*||||||||||||||*|||||*||*|||| 2100 TAGGTATTTGGGCACCCTGAACATACGTGATATGATTTCAGATTTTAAGG 2149 2148 GTGTCCAGTATGAAAAGTGGATAACTGCAGGATTAGTCATGCCTACTTTC 2197 ||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||| 2150 GTGTCCAGTACGAAAAGTGGATAACTGCAGGGTTAGTCATGCCAACTTTC 2199 2198 AAGATAGTTATTAGGCTACCTGCAAATGCCTTTACTGGATTGACATGGGT 2247 ||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||*||||| 2200 AAAATAGTTATTAGGCTGCCTGCAAATGCTTTTACTGGATTGACGTGGGT 2249 2248 GATGAGCTTTGATGCTTATAACCGGATAACTAGTAGAATTACTGCTAGTG 2297 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*| 2250 GATGAGCTTCGATGCTTATAACCGGATAACTAGTAGAATTACTACTAGCG 2299 2298 CGGATCCTGTATACACCTTGTCAGTCCCACATTGGCTTATCCACCATAAG 2347 |*|||||*||*||*|||*||||*|||||*||||||||||||||*|||||| 2300 CAGATCCGGTGTATACCCTGTCTGTCCCGCATTGGCTTATCCATCATAAG 2349 2348 TTGGGCACGTTTTCATGTGAGATAGACTATGGAGAATTGTGTGGTCATGC 2397 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||*|| 2350 TTGGGCACGTTTTCATGTGAGATAGATTATGGAGAATTGTGCGGTCACGC 2399 2398 TATGTGGTTTAAATCAACCACATTTGAATCTCCAAGGTTGCATTTCACGT 2447 *|||||||||||*||*||*||||||||*|||||||*|*|*|||||*||*| 2400 CATGTGGTTTAAGTCCACAACATTTGAGTCTCCAAAGCTACATTTTACAT 2449 2448 GTTTAACGGGCAACAACAAAGAGTTAGCGGCAGACTGGCAAGCTGTCGTA 2497 |*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||* 2450 GCTTAACGGGCAACAACAAAGAGTTGGCGGCAGACTGGCAAGCTGTCGTT 2499 2498 GAACTATATGCCGAATTGGAAGAGGCCACTTCTTTCCTTGGGAAACCAAC 2547 |||||*|||||*|||||||||||*|||*|*|||||*|||||||||||||| 2500 GAACTGTATGCTGAATTGGAAGAAGCCTCCTCTTTTCTTGGGAAACCAAC 2549 2548 TTTGGTTTTTGACCCAGGTGTTTTCAATGGCAAATTTCAATTTCTTACTT 2597 ||||||||||||||||||*|||||*|||||*|||||*||||||||||||| 2550 TTTGGTTTTTGACCCAGGAGTTTTTAATGGTAAATTCCAATTTCTTACTT 2599 2598 GCCCTCCCATATTCTTTGATTTAACGGCCGTCACGGCCCTTAGGAGTGCT 2647 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||*||||||| 2600 GCCCTCCCATATTCTTTGACTTAACGGCCGTCACGGCTCTTAAGAGTGCT 2649 2648 GGGCTGACATTGGGGCAAGTCCCAATGGTTGGCACCACTAAGGTTTATAA 2697 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||*|||||*||*|| 2650 GGGCTGACATTGGGACAAGTCCCAATGGTTGGCACTACAAAGGTATACAA 2699 2698 TCTAAACAGCACTCTTGTGAGTTGTGTTTTGGGTATGGGAGGTACTGTTA 2747 *|||||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2700 CCTAAATAGCGCTCTTGTGAGTTGTGTTTTGGGTATGGGAGGTACTATTA 2749 2748 GAGGGAGGGTGCACATTTGTGCGCCAATCTTCTACAGTATTGTTTTATGG 2797 ||||*||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||*|*||| 2750 GAGGAAGGGTGCACATTTGTGCGCCAATCTTTTATAGTATTGTTCTGTGG 2799 2798 GTCGTTAGTGAGTGGAACGGGACCACTATGGACTGGAATGAACTTTTTAA 2847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2800 GTCGTTAGTGAGTGGAACGGGACCACTATGGACTGGAATGAACTTTTTAA 2849 2848 GTATCCCGGGGTGTATGTGGAAGAGGACGGAAGTTTTGAAGTAAAGATTC 2897 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||*|||| 2850 GTATCCCGGGGTGTATGTGGAAGAGGATGGAAGTTTTGAAGTCAAAATTC 2899 2898 GCTCTCCATATCACCGAACTCCTGCCAGATTGCTTGCTGGTCAAAGTCAG 2947 |||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||| 2900 GCTCTCCATATCACCGAACACCTGCTAGATTGCTTGCTGGTCAAAGTCAG 2949 2948 AGAGACATGAGCTCTCTTAATTTTTATGCAATAGCAGGACCTATCGCTCC 2997 ||*||*|||||||||||*||*||*||||||||||||||||||||*||||| 2950 AGGGATATGAGCTCTCTAAACTTCTATGCAATAGCAGGACCTATTGCTCC 2999 2998 TTCGGGTGAGACTGCGCAACTTCCTATTGTTGTGCAGATAGATGAAATTG 3047 *||||||||||||||*|*|||||||||*|||||*||*||*||||||||*| 3000 ATCGGGTGAGACTGCACGACTTCCTATCGTTGTACAAATTGATGAAATCG 3049 3048 TGCGCCCAGATCTCTCTTTACCAAGTTTTGAAGATGACTATTTCGTATGG 3097 ||||||||||*||**||*|||||||||||||||||||||||||*|||||| 3050 TGCGCCCAGACCTTGCTCTACCAAGTTTTGAAGATGACTATTTTGTATGG 3099 3098 GTGGATTTTTCTGAATTCACTCTTGATAAAGAAGAAATTGAGATTGGTTC 3147 ||||||||||||||*|||||*|||||*|||||||||*||||||||||||| 3100 GTGGATTTTTCTGAGTTCACCCTTGACAAAGAAGAACTTGAGATTGGTTC 3149 3148 TCGTTTCTTCGATTTCACTTCGAATACTTGTAGGGTATCTATGGGTGAAA 3197 ||||||||||||*||*||*||*|*|||||||||*||***||||||*|||| 3150 TCGTTTCTTCGACTTTACCTCAAGTACTTGTAGAGTGATTATGGGGGAAA 3199 3198 ATCCGTTTGCTGCAATGATTGCCTGCCATGGATTGCATAGTGGTGTATTA 3247 |*||*||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||| 3200 ACCCATTCGCTGCAATGATTGCTTGCCATGGATTACATAGTGGTGTATTA 3249 3248 GACCTCAAACTCCAATGGAGTCTGAACACCGAATTCGGCAAGAGCAGCGG 3297 |||||||||||*||||||||||||||||||||*||*||||||||*||||| 3250 GACCTCAAACTTCAATGGAGTCTGAACACCGATTTTGGCAAGAGTAGCGG 3299 3298 GAGCGTTACCATCACGAAGCTGGTGGGTGATAAGGCCATGGGTCTGGACG 3347 |||||||||**|*||||||||||||||*||*||*||||*||||||||||| 3300 GAGCGTTACAGTTACGAAGCTGGTGGGCGACAAAGCCACGGGTCTGGACG 3349 3348 GACCTTCTCACGTTTTTGCCATACAAAAACTAGAGGGAACTACAGAGTTG 3397 |*||||||||*||||||||*||*|||||||||||||||**||||||*||| 3350 GGCCTTCTCAGGTTTTTGCTATTCAAAAACTAGAGGGAGTTACAGATTTG 3399 3398 TTGGTTGGGAATTTTGCAGGAGCAAACCCAAACACTCGTTTTTCCCTTTA 3447 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||*|| 3400 TTGATTGGGAATTTTGCAGGAGCAAACCCAAACACTCATTTCTCCCTATA 3449 3448 TAGTCGCTGGATGGCAATTAAATTGGATCAAGCAAAGAGTATTAAAGTAC 3497 ||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 3450 TAGTCGATGGATGGCAATTAAATTGGACCAAGCAAAGAGTATTAAAGTAC 3499 3498 TCCGCGTTTTGTGCAAGCCCCGTCCAGGCTTTAGCTTTTATGGTAGAACC 3547 ||||*||||||||*|||||*||||||||*||*||*||||||||*|||||| 3500 TCCGTGTTTTGTGTAAGCCTCGTCCAGGTTTCAGTTTTTATGGAAGAACC 3549 3548 AGTTTCCCAGTCTAGGGTATCTGACTTTAAAAGACCCAAGTGTATATATG 3597 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||*| 3550 AGCTTCCCAGTCTAGGGTATCTGACTTTAAAAGACCCAGGTGTACATACG 3599 3598 TGTTTTGTCAGTAGCATGTATTATTTTGTGTTATAATTTGTTTTAACTTG 3647 ||*|||||*||*****|||*||*|*||||*||*|||||||*||||||||| 3600 TGCTTTGTTAGCTATGTGTGTTTTCTTGTATTGTAATTTGCTTTAACTTG 3649 3648 TTTTCCGCTTTTGTGTGTTTAGTTTCATGCTTTTAGTGGCGACAGTGTGT 3697 |||*|*|||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 3650 TTTACTGCTTTAGTGTGTTTATTTTCATGCTTTTAGTGGCGACAGTGTGT 3699 3698 TGTTTGTCCTTTGGACACACTTGCCTAGTTGGACGCAAAAAGATTTTTCC 3747 ||||||||||||||||||||||||||*|||||||**|||||||*|||||* 3700 TGTTTGTCCTTTGGACACACTTGCCTTGTTGGACATAAAAAGAGTTTTC- 3748 3748 TTTCTTTTTACTGTTTTGCAAATTTAT 3774 ||||||||||||||||||||||||||| 3749 TTTCTTTTTACTGTTTTGCAAATTTAT 3775