NC_004296 AY628208 1 CGCACAGTGGATCCTAGGCTATTGGATTGCGCTTTGC-----TTTTG--- 42 |||||||||||||||||||*||*|||||||||||||******||*||*** 1 CGCACAGTGGATCCTAGGCGAT-GGATTGCGCTTTGTGATAATTGTGCAG 49 43 -------TCATTTTGGCAGATAGTCT---CAGTTCTTTGTTGCGTGCATA 82 *******|*|*|*|**||||****||***||*|*|****||**||***|* 50 AGTAAAGTGACTCTTACAGAACCACTTGTCACTCCACCTTTAGGTTGCTC 99 83 CAA-CACAACAATCTGGCGATGAGTGCCTCAAAGGAAATAAAATCCTTTT 131 |||*||||*||*****||*|||||***|||*||||||||*|||||*||** 100 CAAGCACATCA-----GCAATGAGCAACTCCAAGGAAATCAAATCATTCC 144 132 TGTGGACACAATCTTTGAGGAGGGAATTATCTGGTTACTGCTCCAACATC 181 |*|||||*||*||*||**|*||||||*|||||||||||||*||*|||||* 145 TTTGGACTCAGTCCTTACGAAGGGAACTATCTGGTTACTGTTCTAACATA 194 182 AAACTACAGGTGGTGAAAGATGCCCAGGCTCTTTTACATGGACTTGACTT 231 ||**|*||*||*||*||||||||*||||||||**|*|||||*|||||||| 195 AAGTTGCAAGTTGTCAAAGATGCTCAGGCTCTCCTGCATGGCCTTGACTT 244 232 CTCCGAAGTCAGTAATGTTCAACGGTTGATGCGCAAGGAGAGAAGGGATG 281 *||*||*|||||*|||||*||**||*|||||||||||*|||**||*|||| 245 TTCTGAGGTCAGCAATGTGCAGAGGCTGATGCGCAAGCAGAAGAGAGATG 294 282 ACAATGATTTGAAACGGTTGAGGGACCTAAATCAAGCGGTCAACAATCTT 331 |****||**|*||*||**|||||||*||*||||||||*|||||||||||| 295 ATGCAGACCTAAAGCGACTGAGGGATCTGAATCAAGCTGTCAACAATCTT 344 332 GTTGAATTAAAATCAACTCAACAAAAGAGTATACTGAGAGTTGGGACTCT 381 ||||||*|*||*|||||||||||*||||*|*|**|*||*||*||*||**| 345 GTTGAACTGAAGTCAACTCAACAGAAGAATGTCTTAAGGGTCGGCACCTT 394 382 AACCTCAGATGACTTATTAATCTTAGCCGCTGATCTAGAGAAGTTAAAGT 431 *|**||||||||**||*|||**||*||*||*||*||*||*||**|*|||| 395 GAGTTCAGATGATCTAATAACTTTGGCAGCGGACCTGGAAAAACTCAAGT 444 432 CAAAGGTGATCAGAACAGAAAGGCCATTAAGTGCAGGTGTCTATATGGGC 481 |*||*||*||*||*|||||||||||*||*||**|||||||*||*|||||* 445 CCAAAGTCATAAGGACAGAAAGGCCTTTGAGCTCAGGTGTTTACATGGGG 494 482 AACCTAAGCTCACAGCAACTTGACCAAAGAAGAGCTCTCCTGAATATGAT 531 ||**||||||||||*||*|||||*|||||*||*||||||*|||**||||| 495 AATTTAAGCTCACAACAGCTTGATCAAAGGAGGGCTCTCTTGAGCATGAT 544 532 AGGAATGAGTGGTGGTAATCAAGGGGCTCGGGCTGGGAGAGATGGAGTGG 581 *||*|||***|||||***||||||***|*||*|*||**|*|||||*||*| 545 TGGGATGTCAGGTGGACCTCAAGGAAATAGGACAGGTGGGGATGGTGTCG 594 582 TGAGAGTTTGGGATGTGAAAAATGCAGAGTTGCTCAATAATCAGTTCGGG 631 |*||*||||||||*||*|||||||||||*||*||||||||*||*||*||* 595 TCAGGGTTTGGGACGTAAAAAATGCAGAATTACTCAATAACCAATTTGGA 644 632 ACCATGCCAAGTCTGACACTGGCATGTCTGACAAAACAGGGGCAGGTTGA 681 |||||||||||*||*||**||||*||*||*||*|||||*|||||*||*|| 645 ACCATGCCAAGCCTCACCTTGGCGTGCCTCACCAAACAAGGGCAAGTGGA 694 682 CTTGAATGATGCAGTACAAGCATTGACAGATTTGGGTTTGATCTACACAG 731 |*|*||||||||*||*|||||*||*||||||||*||||||||*||||||| 695 CCTCAATGATGCTGTGCAAGCTTTAACAGATTTAGGTTTGATTTACACAG 744 732 CAAAGTATCCCAACACTTCAGACTTAGACAGGCTGACTCAAAGTCATCCC 781 |||||||*||*|||*|||||||**||||||*|||*|||||*|||||*||* 745 CAAAGTACCCGAACTCTTCAGATCTAGACATGCTCACTCAGAGTCACCCT 794 782 ATCCTAAATATGATTGACACCAAGAAAAGCTCTTTGAATATCTCAGGTTA 831 ||*|||***|||*|||||||*||*||*||*||**||||*||||||||||| 795 ATACTAGGAATGGTTGACACAAAAAAGAGTTCCCTGAACATCTCAGGTTA 844 832 TAATTTTAGCTTGGGTGCAGCTGTGAAGGCAGGAGCTTGCATGCTGGATG 881 *||*||*||**||||*||*||*||*||*||*||*|||||||||||*|||| 845 CAACTTCAGTCTGGGGGCTGCAGTTAAAGCTGGTGCTTGCATGCTTGATG 894 882 GTGGCAATATGTTGGAGACAATCAAGGTGTCACCTCAGACAATGGATGGT 931 |*|||||*||||||||*|||||*||*||||||||*||*||||||||*||| 895 GGGGCAACATGTTGGAAACAATAAAAGTGTCACCACAAACAATGGACGGT 944 932 ATCCTCAAATCCATTTTAAAGGTCAAGAAGGCTCTTGGAATGTTCATTTC 981 ||**|*|||||*|||*|*||||||||*|***|*||*|||||||||||||| 945 ATTTTGAAATCTATTCTGAAGGTCAAAAGATCACTGGGAATGTTCATTTC 994 982 AGACACCCCTGGTGAAAGGAATCCTTATGAAAACATACTCTACAAGATTT 1031 *|||||*|||||||||||*||*||*|||||*|||||*|||||*|||||*| 995 TGACACTCCTGGTGAAAGAAACCCATATGAGAACATCCTCTATAAGATCT 1044 1032 GTTTGTCAGGAGATGGATGGCCATATATTGCATCAAGAACCTCAATAACA 1081 |**|*|||||*||*||*|||||*|||||||||||||||||*|||||*||* 1045 GCCTTTCAGGTGAAGGTTGGCCGTATATTGCATCAAGAACATCAATTACT 1094 1082 GGAAGGGCCTGGGAAAACACTGTCGTTGATCTGGAATCAGATGGGAAGCC 1131 ||*||*||*||||||||||||*|*||||||*|||||||*||****||*|| 1095 GGGAGAGCTTGGGAAAACACTCTTGTTGATTTGGAATCTGACAACAAACC 1144 1132 ACAGAAAGCTGACAGCAACAATTCCAGTAAATCCCTGCAGTCGGCAGGGT 1181 ||*||||****|*|||*****|||||*||||**|*|||||*|*|||||** 1145 ACCGAAACTAAATAGCGCTGGTTCCAATAAAAGCTTGCAGGCTGCAGGTC 1194 1182 TTACCGCTGGGCTTACCTATTCTCAGCTGATGACCCTCAAGGATGCAATG 1231 |*|**||||||*|*|||||||||||*||||||||*||*||*|||***||| 1195 TAAATGCTGGGTTGACCTATTCTCAACTGATGACACTAAAAGATTGTATG 1244 1232 CTGCAACTTGACCCAAATGCTAAGACCTGGATGGACATTGAAGGAAGACC 1281 *|*||**|*|||||||*|***||*||*|||||*||*|||||*||*||*|| 1245 TTACAGTTGGACCCAAGTAGCAAAACATGGATAGATATTGAGGGCAGGCC 1294 1282 TGAAGATCCAGTGGAAATTGCCCTCTATCAACCAAGTTCAGGCTGCTACA 1331 ||||||*||||||||*|||||**|*|*|||||||||*||*||*||*|||| 1295 TGAAGACCCAGTGGAGATTGCTTTGTTTCAACCAAGCTCTGGTTGTTACA 1344 1332 TACACTTCTTCCGTGAACCTACTGATTTAAAGCAGTTCAAGCAGGATGCT 1381 |||||||*||**|*|||||||||||**|*|||||*|||||*||||||||| 1345 TACACTTTTTTAGAGAACCTACTGACCTTAAGCAATTCAAACAGGATGCT 1394 1382 AAGTACTCACATGGGATTGATGTCACAGACCTCTTCGCTACACAACCGGG 1431 |||||||||||||||||*|||||*|||||*||*||**|*||||||||*|| 1395 AAGTACTCACATGGGATAGATGTTACAGATCTTTTTTCCACACAACCCGG 1444 1432 CTTGACCAGTGCTGTCATTGATGCACTCCCCCGGAATATGGTCATTACCT 1481 **||||*|||||||||||*||*|||||*|||||*||||||||**|*|||| 1445 GCTGACAAGTGCTGTCATAGAGGCACTTCCCCGCAATATGGTGTTGACCT 1494 1482 GTCAGGGGTCCGATGACATAAGGAAACTCCTTGAATCACAAGGAAGAAAA 1531 |*||||||||*||||||||*|**||*||**|*||*||*|||||*||||*| 1495 GCCAGGGGTCAGATGACATCAAAAAGCTGTTGGAGTCTCAAGGGAGAAGA 1544 1532 GACATTAAACTAATTGATATTGCCCTCAGCAAAACTGATTCCAGGAAGTA 1581 |||||*|||*|*|||||||||*|**|*||||||*|*|||||*|||||||* 1545 GACATCAAATTGATTGATATTTCTTTGAGCAAAGCAGATTCAAGGAAGTT 1594 1582 TGAAAATGCAGTCTGGGACCAGTATAAAGACTTATGCCACATGCACACAG 1631 |||||||||*||*||||||||*||*||||||||*||*|||||||||||*| 1595 TGAAAATGCTGTGTGGGACCAATACAAAGACTTGTGTCACATGCACACGG 1644 1632 GTGTCGTTGTTGAAAAGAAGAAAAGAGGCGGTAAAGAGGAAATAACCCCT 1681 |*||*||*|||||*|||||*||*||*||*||*|||||||||||*|||||* 1645 GAGTAGTCGTTGAGAAGAAAAAGAGGGGTGGAAAAGAGGAAATCACCCCA 1694 1682 CACTGTGCACTAATGGACTGCATCATGTTTGATGCAGCAGTGTCAGGAGG 1731 ||*||*||**||*|||||||||||||||||||||||||*****|*||**| 1695 CATTGCGCTTTACTGGACTGCATCATGTTTGATGCAGCTACTACTGGTAG 1744 1732 ACTGAACACATCGGTTTTGAGAGCAGTGCTGCCCAGAGATATGGTGTTCA 1781 **||||||***|*****||||*|||||*||*||||||||*|||||*|||| 1745 TTTGAACATCACAACACTGAGGGCAGTACTTCCCAGAGACATGGTCTTCA 1794 1782 GAACATCGACACCTAGAGTCGTTCTGTAAATGGACGCCCCCGTGACCCAC 1831 |*||****||*||||*||||||||||||||||*||||||||||||||||| 1795 GGACCAGCACCCCTAAAGTCGTTCTGTAAATGAACGCCCCCGTGACCCAC 1844 1832 CGCCAATAGGCGGTGGGTCACGGGGGC--CCTGACAAGGGTCTCATCTCT 1879 |||||*|*|||||||||||||||||||**||||****|*||||*|||||| 1845 CGCCATT-GGCGGTGGGTCACGGGGGCTCCCTGTTTGGAGTCT-ATCTCT 1892 1880 TCCATTTCACAGGCACACCAGGCTGTTTGTAGAGTCCACAGGAACAAATG 1929 ||||*||****||*||||||||*||||||||*||||||||||||||*|** 1893 TCCACTTTGTTGGAACACCAGGGTGTTTGTACAGTCCACAGGAACATACT 1942 1930 CCCATATGATTCAATCTGTGAGGTTTGGGACACGACTTGCCTACAATATG 1979 |||||*|||||*|*|||*||*|||||||||||*|**||*||*||*||*|| 1943 CCCATGTGATTTAGTCTATGGGGTTTGGGACAGGGTTTCCCAACGATGTG 1992 1980 CCTATGAGTTGGTATTTTGACTAGGTGAAGGAAGATGCTAATAAGATAGA 2029 *|*|||*||*||*|||||*|*||**||*|*|||*|||||*||*|||||*| 1993 TCGATGTGTAGGGATTTTAATTAAATGCAAGAAAATGCTGATCAGATAAA 2042 2030 AACTTGTACTGAACACAAAGAGGTCAACTAGACCCAATGGTGTCTTCCCC 2079 |*|||||*||*||*|**||*|*|||*|||||*|||||*||*||*|||||* 2043 AGCTTGTGCTAAAGATGAAAATGTCCACTAGTCCCAAGGGCGTTTTCCCT 2092 2080 TGCCTCTCCATATACTCCTTCTGTAACATCTCAGTGATCATATTGTCAGC 2129 ||*||*||*||*||*||*|||||*|*||||||*||||||||||*|||*|| 2093 TGTCTTTCAATGTATTCTTTCTGAAGCATCTCTGTGATCATATGGTCGGC 2142 2130 TTGTTGTTCAATATCATCAGAAAAGTGGGTCTCGTTCAAGTATGAACCAT 2179 |||*|||||*||*||||||||*||*|||||*||*||*|**|||||*|||| 2143 TTGCTGTTCTATGTCATCAGAGAACTGGGTTTCATTTAGATATGACCCAT 2192 2180 TTGATACAAGCCAACATTTGGGCAGTGATGTTCTCCCAGTAGTTGTGTGG 2229 |*||||*|||||||||*||*||*||||||||||||||**||*|*||*||* 2193 TGGATATAAGCCAACACTTTGGTAGTGATGTTCTCCCGCTACTAGTATGA 2242 2230 TTGAGGTACCAATACTTGCTGTAATTACAGTATGGAATTCCCATGATGTC 2279 ||*|||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*||||||||||| 2243 TTAAGGTACCAATACTTGCTGTAATTGCAGTAGGGAATGCCCATGATGTC 2292 2280 CCGTAGATGGTTCTTCATTATAAGTTGGTCATTTATCAAAGCATTTACTG 2329 *|*||*||||||||||||*||*|*|||*|||||*||*||*|||||*||*| 2293 TCTTAAATGGTTCTTCATGATTAATTGATCATTGATTAAGGCATTCACGG 2342 2330 CTTTGTTGATCAACTGAATGCTCATTTGTGCTTCAGCTTTCAACCTTTGA 2379 ||||*||*||*||*|||||*|||||*||*||*|||||*||||||||**|* 2343 CTTTATTTATTAATTGAATACTCATCTGGGCCTCAGCCTTCAACCTACGG 2392 2380 ATGGCTTGTTTGTTGAAGTCAAACAGCCTCAGCATGTCACAAAATTCCTC 2429 ||*|||||*||||||||*|||||||**|||||||||||||||||*||||| 2393 ATTGCTTGCTTGTTGAAATCAAACAATCTCAGCATGTCACAAAACTCCTC 2442 2430 ATCATGCTTCTCATTACATTTTGCCACAGCTGTGTTCCCGAAGCATTTTA 2479 |||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||*||*||*||*| 2443 ATCATGCTTCTCATTGCATTTTGCCACAGCTGTATTCCCAAAACACTTGA 2492 2480 GTTCAGCCTCAATTAGCATCCACCTGGTCAGACAATATCCCCCTGGTGTG 2529 ||||*||*||||||||||||||||||||*|*||||||*||*||||||||* 2493 GTTCTGCTTCAATTAGCATCCACCTGGTTAAACAATAACCACCTGGTGTT 2542 2530 TCTTTACCTTCAGAATCTGACAGTGTCCATGTGAATGTGCCTAGCAATCT 2579 ||*||*||*|||||||||||||*||||||*|||||*||*||*|**|**|| 2543 TCATTGCCCTCAGAATCTGACAATGTCCAGGTGAAGGTCCCCAAGAGCCT 2592 2580 TCTACTAATATAAATATCTCTAGTCCTTTGTGAGAGGAGCCCGAGATAAC 2629 *|||||*|||||*||||||||*|||||||||||*|**||*||*||*||*| 2593 CCTACTTATATATATATCTCTTGTCCTTTGTGACAAAAGGCCAAGGTACC 2642 2630 CGATGGGAGATGGTCTCGAGAATTGGCAGTGATCTTCCCAGGTTGTATTT 2679 ||||*|||||*|||||*||||||||||||||*||*|||||*||||||||| 2643 CGATAGGAGACGGTCTTGAGAATTGGCAGTGGTCCTCCCATGTTGTATTT 2692 2680 TGGATTATCAGATATTGATAACTAGTCATAATACAGTCCCAGTTGCCACG 2729 ||*||||||||*||*||*||*||*|||||*||||||||||||||*||*** 2693 TGAATTATCAGGTACTGGTAGCTGGTCATTATACAGTCCCAGTTTCCCTT 2742 2730 GCCTGAGTCAAGAGCAATGTAGCTCCCACCCCAAGCCATCCTCATAAAAG 2779 *||||||||*|**||||||||*||*||||||||*|||||*||||||||*| 2743 TCCTGAGTCTAATGCAATGTATCTTCCACCCCAGGCCATTCTCATAAATG 2792 2780 TCTGTAACACACCATTTGCAACAGTACCACAATGGTTGGCTGCATCCCCA 2829 |*||*|||||*||*||*|||||*||*|||||*||*|*|||*||||||||| 2793 TTTGCAACACTCCGTTGGCAACTGTCCCACAGTGTTCGGCCGCATCCCCA 2842 2830 GCATAGCTGTGACTCAGGTTGTACTGCACACTAATCTTTCCCCCATTAAA 2879 ||||||***|||***||||||||*||||||||*||*||*||*|||||*|| 2843 GCATAGGAATGAGAGAGGTTGTATTGCACACTGATTTTCCCTCCATTGAA 2892 2880 ATCGCAGCTCATTGCCTCATACTGATTGAAGTTGGGGATGGACAAGTGGA 2929 |||*||*|||||*||*|||||||||||||||||*||*|||||*|**|||| 2893 ATCACAACTCATGGCTTCATACTGATTGAAGTTTGGAATGGATAGATGGA 2942 2930 AAGTTGAGATTATGCTCATAAGAGCGTGGTCATAGAGGTTCTTTTTGTGG 2979 |*||||||||*||||||||*|||||*||*|||||*||*|||||||||||* 2943 ATGTTGAGATGATGCTCATGAGAGCATGATCATAAAGATTCTTTTTGTGA 2992 2980 GCATCAGACAGATTGCAAAATTTGTGATTAATAATGCTCGTGTTGGTCAA 3029 |||||*||*|**|||||||||||||||||*||||||||*|||||*||*|| 2993 GCATCGGATAAGTTGCAAAATTTGTGATTTATAATGCTGGTGTTAGTTAA 3042 3030 GGTCAGTTCTAGTCCTGTCTCATTGCCCACCATTATATAATGATGACTGT 3079 *||||*|||||*|||*||||||||||||||**||||*||||||||||||* 3043 AGTCAATTCTAATCCAGTCTCATTGCCCACTCTTATGTAATGATGACTGC 3092 3080 TGTTCTTTGTGCAGGAGAGAGGCATGGTCATATTGAGTGTCTCCATGTTT 3129 |||||||*|||||*||*|**|||||||||||*||*||*||||||||*||| 3093 TGTTCTTGGTGCATGATAAGGGCATGGTCATGTTTAGGGTCTCCATATTT 3142 3130 AGTTCCAGAGTCTGAAGCTCATAAACCCCTTTATAAAGACTGGTTGTGCA 3179 |*|||*|**||*||*||||||||**||||||||***||**|****|**|| 3143 AATTCTAAGGTTTGCAGCTCATATCCCCCTTTA---AGGGTTAGGGAACA 3189 3180 AGACCTACCACACAACAGGAGGAAAGTGACCAAACCAACAAGGCCACACG 3229 ||||*|*||||||||*|**|**||*|**|||||*||||*||**|||||*| 3190 AGACTTGCCACACAAGAATAAAAAGGCAACCAATCCAATAATCCCACATG 3239 3230 TTGCAAAATTGTACAGACCTTTCAGCACTGCTAGTACAGACAGTGCAATG 3279 |*||*|**||*||||**||*||||**|*|||*|*||*|||*||*|||||* 3240 TAGCGATGTTATACAAGCCCTTCAAGATTGCCAATAGAGAAAGCGCAATT 3289 3280 AGAACAATGTTCATCACCTCTTCTATTACATGAGGCACTTCCTGGAAGAA 3329 ||*|||||||||||*||*||*|||||||||||*||||||||*||*||||| 3290 AGCACAATGTTCATGACTTCCTCTATTACATGTGGCACTTCTTGAAAGAA 3339 3330 TGTCACTATTTGTCCCAT--TTTA----------AATAG----GACACTT 3363 |||*|**||*||*|||||**||||**********|*|||****||**||* 3340 TGTAATAATCTGCCCCATGATTTAGGAATTCCTAACTAGTAGTGAATCTC 3389 3364 GAATTGCGCAACCAAAAATGCCTAGGATCCCCGGTGCGC 3402 *||**||||||*|**|||||||||||||||*|*|||||* 3390 TAAAAGCGCAATCCTAAATGCCTAGGATCCACTGTGCG- 3427