NC_004296 AY628201 1 CGCACAGTGGATCCTAGGCTATTGGATTGCGCTTTGCTTTTGTCATTTTG 50 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||******|*|*|*** 1 CGCACAGTGGATCCTAGGCTATTGGATTGCGCTTTGTACCAATTACTACA 50 51 GCAGATAGTCTCAGTTCTTTGTTGCGTGCATACAACACAACAATCTGGCG 100 |||||||*|*||****||*||*||**|*|||||||||||*||||***||| 51 GCAGATAATTTCGACACTCTGCTGT-TACATACAACACACCAATTCAGCG 99 101 ATGAGTGCCTCAAAGGAAATAAAATCCTTTTTGTGGACACAATCTTTGAG 150 |||||||*|||||||||*||||||||||||*||||||||||*|||*|||| 100 ATGAGTGTCTCAAAGGAGATAAAATCCTTTCTGTGGACACAGTCTCTGAG 149 151 GAGGGAATTATCTGGTTACTGCTCCAACATCAAACTACAGGTGGTGAAAG 200 ||||||*||*||*|||||||||||*|||||*||**||||*|||||*|||| 150 GAGGGAGTTGTCGGGTTACTGCTCTAACATAAAGTTACAAGTGGTTAAAG 199 201 ATGCCCAGGCTCTTTTACATGGACTTGACTTCTCCGAAGTCAGTAATGTT 250 ||||*||*||||||*|*||||||||*||||||||*||*|||||*|||||* 200 ATGCTCAAGCTCTTCTGCATGGACTCGACTTCTCTGAGGTCAGCAATGTC 249 251 CAACGGTTGATGCGCAAGGAGAGAAGGGATGACAATGATTTGAAACGGTT 300 ||*|||||||||||||||*|*||||||||*|||||*||**|||||||**| 250 CAGCGGTTGATGCGCAAGCAAAGAAGGGACGACAACGACCTGAAACGACT 299 301 GAGGGACCTAAATCAAGCGGTCAACAATCTTGTTGAATTAAAATCAACTC 350 |||*||||||||*||*||*||*||||||||||||||**|*|||||||||| 300 GAGAGACCTAAACCAGGCAGTTAACAATCTTGTTGAGCTGAAATCAACTC 349 351 AACAAAAGAGTATACTGAGAGTTGGGACTCTAACCTCAGATGACTTATTA 400 |||||||||||*|*||||||||||||||**||||*|||||||||||*||| 350 AACAAAAGAGTGTGCTGAGAGTTGGGACATTAACTTCAGATGACTTGTTA 399 401 ATCTTAGCCGCTGATCTAGAGAAGTTAAAGTCAAAGGTGATCAGAACAGA 450 ||*|||||*|||||*||*||||||*|*|||||||||||||*|||*||||| 400 ATTTTAGCTGCTGACCTGGAGAAGCTGAAGTCAAAGGTGACCAGGACAGA 449 451 AAGGCCATTAAGTGCAGGTGTCTATATGGGCAACCTAAGCTCACAGCAAC 500 |||||||||*||*||*|||||*||*|||||*||*|||||||||||*|||| 450 AAGGCCATTGAGCGCTGGTGTTTACATGGGTAATCTAAGCTCACAACAAC 499 501 TTGACCAAAGAAGAGCTCTCCTGAATATGATAGGAATGAGTGGTGGTAAT 550 ||||*|||*||*|||||||**|||||||||||||*|||||||||||*||| 500 TTGATCAACGACGAGCTCTTTTGAATATGATAGGGATGAGTGGTGGGAAT 549 551 CAAGGGGCTCGGGCTGGGAGAGATGGAGTGGTGAGAGTTTGGGATGTGAA 600 ||||||||||*|*||||||||||*|||||||||||**||||||||||||| 550 CAAGGGGCTCAGACTGGGAGAGACGGAGTGGTGAGGATTTGGGATGTGAA 599 601 AAATGCAGAGTTGCTCAATAATCAGTTCGGGACCATGCCAAGTCTGACAC 650 ||||||||||*||||*||*||*|||||*|||||||||||*|||*|||||| 600 AAATGCAGAGCTGCTTAACAACCAGTTTGGGACCATGCCGAGTTTGACAC 649 651 TGGCATGTCTGACAAAACAGGGGCAGGTTGACTTGAATGATGCAGTACAA 700 |*||*|||*|*|||||||||||*||*|||||**||||*||||**||*||* 650 TAGCTTGTTTAACAAAACAGGGACAAGTTGATCTGAACGATGTTGTTCAG 699 701 GCATTGACAGATTTGGGTTTGATCTACACAGCAAAGTATCCCAACACTTC 750 |||||||||||**||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|| 700 GCATTGACAGACCTGGGCTTGATCTACACAGCAAAGTATCCCAACACCTC 749 751 AGACTTAGACAGGCTGACTCAAAGTCATCCCATCCTAAATATGATTGACA 800 ||||*|*||*||*||*||*||*||*||*||*||*|||||*|||||||||| 750 AGACCTGGATAGACTAACCCAGAGCCACCCTATTCTAAACATGATTGACA 799 801 CCAAGAAAAGCTCTTTGAATATCTCAGGTTATAATTTTAGCTTGGGTGCA 850 ||||||||||||||*|||||||||||||||||||*||*|||||*|||||| 800 CCAAGAAAAGCTCTCTGAATATCTCAGGTTATAACTTCAGCTTAGGTGCA 849 851 GCTGTGAAGGCAGGAGCTTGCATGCTGGATGGTGGCAATATGTTGGAGAC 900 ||||||||*|||||||||||*|||*|||||||||||||*|||||*||||| 850 GCTGTGAAAGCAGGAGCTTGTATGTTGGATGGTGGCAACATGTTAGAGAC 899 901 AATCAAGGTGTCACCTCAGACAATGGATGGTATCCTCAAATCCATTTTAA 950 ||||||*||||||||*||*||||||||||||||*|||||*|||||*|||| 900 AATCAAAGTGTCACCCCAAACAATGGATGGTATTCTCAAGTCCATCTTAA 949 951 AGGTCAAGAAGGCTCTTGGAATGTTCATTTCAGACACCCCTGGTGAAAGG 1000 ||||||||||*||||||||*|||||*||||||||*||*||*|||||*||* 950 AGGTCAAGAAAGCTCTTGGGATGTTTATTTCAGATACTCCCGGTGAGAGA 999 1001 AATCCTTATGAAAACATACTCTACAAGATTTGTTTGTCAGGAGATGGATG 1050 ||*||||||||*||||||||*||||||||*|||||||||||*|||||*|| 1000 AACCCTTATGAGAACATACTTTACAAGATCTGTTTGTCAGGGGATGGGTG 1049 1051 GCCATATATTGCATCAAGAACCTCAATAACAGGAAGGGCCTGGGAAAACA 1100 ||||||*||||||||*||*||*|||||||||||||||||*|||||||||| 1050 GCCATACATTGCATCTAGGACTTCAATAACAGGAAGGGCATGGGAAAACA 1099 1101 CTGTCGTTGATCTGGAATCAGATGGGAAGCCACAGAAAGCTGACAGCAAC 1150 ||||*||||||*|||||||||**|*|||||||||*|||**||**|||||| 1100 CTGTTGTTGATTTGGAATCAGGCGAGAAGCCACAAAAAATTGGGAGCAAC 1149 1151 AATTCCAGTAAATCCCTGCAGTCGGCAGGGTTTACCGCTGGGCTTACCTA 1200 ||*||||**||||*|*|*|||||*||||||||*||*|||||||||*|||| 1150 AACTCCAACAAATGCTTACAGTCTGCAGGGTTCACTGCTGGGCTTTCCTA 1199 1201 TTCTCAGCTGATGACCCTCAAGGATGCAATGCTGCAACTTGACCCAAATG 1250 |||||||||*|||||*|||||*|||||||||||*||*||||||||||||| 1200 TTCTCAGCTCATGACTCTCAAAGATGCAATGCTACAGCTTGACCCAAATG 1249 1251 CTAAGACCTGGATGGACATTGAAGGAAGACCTGAAGATCCAGTGGAAATT 1300 ||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||*|||||| 1250 CTAAGACCTGGATGGACATTGAGGGGAGACCTGAAGATCCAGTAGAAATT 1299 1301 GCCCTCTATCAACCAAGTTCAGGCTGCTACATACACTTCTTCCGTGAACC 1350 |||||*|||||*||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||| 1300 GCCCTATATCAGCCAAGTTCAGGCTGTTACATTCACTTCTTCCGTGAACC 1349 1351 TACTGATTTAAAGCAGTTCAAGCAGGATGCTAAGTACTCACATGGGATTG 1400 *|||||**||||*|||||||||||*|||||||||||*|||||*||*|||| 1350 CACTGACCTAAAACAGTTCAAGCAAGATGCTAAGTATTCACACGGAATTG 1399 1401 ATGTCACAGACCTCTTCGCTACACAACCGGGCTTGACCAGTGCTGTCATT 1450 ||||*||||||||*||*|||*||||*||*||*||||||||||||||*||* 1400 ATGTTACAGACCTTTTTGCTGCACAGCCAGGTTTGACCAGTGCTGTTATA 1449 1451 GATGCACTCCCCCGGAATATGGTCATTACCTGTCAGGGGTCCGATGACAT 1500 ||*|||||||||||*||*||||||||*||||||||||||||*|||||||| 1450 GAGGCACTCCCCCGAAACATGGTCATGACCTGTCAGGGGTCTGATGACAT 1499 1501 AAGGAAACTCCTTGAATCACAAGGAAGAAAAGACATTAAACTAATTGATA 1550 |||*||*||||||||*|||||||||||*||*||*||*||**|*||||||| 1500 AAGAAAGCTCCTTGAGTCACAAGGAAGGAAGGATATCAAGTTGATTGATA 1549 1551 TTGCCCTCAGCAAAACTGATTCCAGGAAGTATGAAAATGCAGTCTGGGAC 1600 ||||*||||||||*||*|||||*||*||*|||||*||||||||||||||* 1550 TTGCTCTCAGCAAGACAGATTCTAGAAAATATGAGAATGCAGTCTGGGAT 1599 1601 CAGTATAAAGACTTATGCCACATGCACACAGGTGTCGTTGTTGAAAAGAA 1650 ||*||*|||||*||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||| 1600 CAATACAAAGATTTATGCCACATGCATACAGGTGTTGTTGTTGAAAAGAA 1649 1651 GAAAAGAGGCGGTAAAGAGGAAATAACCCCTCACTGTGCACTAATGGACT 1700 |||*|**||*||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1650 GAAGAAGGGTGGCAAAGAGGAAATAACCCCTCACTGTGCCCTAATGGACT 1699 1701 GCATCATGTTTGATGCAGCAGTGTCAGGAGGACTGAACACATCGGTTTTG 1750 |*||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||*|||*|| 1700 GTATCATGTTTGATGCAGCAGTGTCAGGAGGATTGAACACATCAGTTCTG 1749 1751 AGAGCAGTGCTGCCCAGAGATATGGTGTTCAGAACATCGACACCTAGAGT 1800 |||||||||||*||||||||*||||||||*||||||||*||*||*|*||| 1750 AGAGCAGTGCTACCCAGAGACATGGTGTTTAGAACATCAACGCCCAAAGT 1799 1801 CGTTCTGTAAATGGACGCCCCCGTGACCCACCGCCAATAGGCGGTGGGTC 1850 |||*|||||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1800 CGTCCTGTAAACGGACGCCCCCGTGACCCACCGCCAACAGGCGGTGGGTC 1849 1851 ACGGGGGCCCTGACAAGGGTCTCATCTCTTCCATTTCACAGGCACACCAG 1900 ||||||||||||**|*||||||*|*||*||||||*|||||||*||||||| 1850 ACGGGGGCCCTGGTA-GGGTCTTACCTTTTCCATCTCACAGGTACACCAG 1898 1901 GCTGTTTGTAGAGTCCACAGGAACAAATGCCCATATGATTCAATCTGTGA 1950 |*||||||||*|**|||||||||||*||*||||||||*||||**||*||| 1899 GTTGTTTGTAAACACCACAGGAACATATACCCATATGGTTCAGCCTATGA 1948 1951 GGTTTGGGACACGACTTGCCTACAATATGCCTATGAGTTGGTATTTTGAC 2000 |||||*|||||*|**|||||||||||*||*|||||*|||||||||||||| 1949 GGTTTAGGACATGGTTTGCCTACAATGTGTCTATGTGTTGGTATTTTGAC 1998 2001 TAGGTGAAGGAAGATGCTAATAAGATAGAAACTTGTACTGAACACAAAGA 2050 ||||||*|||||||||||*|||||*||*||*||||||||||||||||||| 1999 TAGGTGGAGGAAGATGCTTATAAGGTAAAAGCTTGTACTGAACACAAAGA 2048 2051 GGTCAACTAGACCCAATGGTGTCTTCCCCTGCCTCTCCATATACTCCTTC 2100 |||||||*|*|||*||||||||*||*||*||*||*|||||*||*|||||* 2049 GGTCAACCAAACCTAATGGTGTTTTGCCTTGTCTTTCCATGTATTCCTTT 2098 2101 TGTAACATCTCAGTGATCATATTGTCAGCTTGTTGTTCAATATCATCAGA 2150 |||||||||||||||||*|*||||||||||||*|||||*||||||||||| 2099 TGTAACATCTCAGTGATTAAATTGTCAGCTTGCTGTTCGATATCATCAGA 2148 2151 AAAGTGGGTCTCGTTCAAGTATGAACCATTTGATACAAGCCAACATTTGG 2200 *|||||||||||*||*|*||||||*||||||||||||||||||||||||| 2149 GAAGTGGGTCTCATTTAGGTATGATCCATTTGATACAAGCCAACATTTGG 2198 2201 GCAGTGATGTTCTCCCAGTAGTTGTGTGGTTGAGGTACCAATACTTGCTG 2250 |||*||||||**|*|||||***||||||||||||*|||||*||*|||||| 2199 GCAATGATGTCTTTCCAGTGACTGTGTGGTTGAGATACCAGTATTTGCTG 2248 2251 TAATTACAGTATGGAATTCCCATGATGTCCCGTAGATGGTTCTTCATTAT 2300 |||||*||||||||*||*|||||*|||||*||*|*||||||||||||||| 2249 TAATTGCAGTATGGGATCCCCATAATGTCTCGCAAATGGTTCTTCATTAT 2298 2301 AAGTTGGTCATTTATCAAAGCATTTACTGCTTTGTTGATCAACTGAATGC 2350 *||*||*||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||*||*| 2299 TAGCTGATCATTTATCAGAGCATTTACTGCTTTGTTGATCAGCTGTATAC 2348 2351 TCATTTGTGCTTCAGCTTTCAACCTTTGAATGGCTTGTTTGTTGAAGTCA 2400 ||||*||*||*||*||||||||*|||||*||||||||||||||||||||| 2349 TCATCTGAGCCTCGGCTTTCAATCTTTGGATGGCTTGTTTGTTGAAGTCA 2398 2401 AACAGCCTCAGCATGTCACAAAATTCCTCATCATGCTTCTCATTACATTT 2450 ||*||||||||||||||||||||*||*||||||||*|||||||||||*|| 2399 AATAGCCTCAGCATGTCACAAAACTCTTCATCATGTTTCTCATTACACTT 2448 2451 TGCCACAGCTGTGTTCCCGAAGCATTTTAGTTCAGCCTCAATTAGCATCC 2500 ||||||*||||||||*||*|||||*||||**|||||*|||||*||||||| 2449 TGCCACGGCTGTGTTGCCAAAGCACTTTAACTCAGCTTCAATCAGCATCC 2498 2501 ACCTGGTCAGACAATATCCCCCTGGTGTGTCTTTACCTTCAGAATCTGAC 2550 |||||||||*|||*||*||||||||||||||*|||||||||||||||||* 2499 ACCTGGTCAAACAGTACCCCCCTGGTGTGTCCTTACCTTCAGAATCTGAT 2548 2551 AGTGTCCATGTGAATGTGCCTAGCAATCTTCTACTAATATAAATATCTCT 2600 |||||||||||||||||*||*||||||||*||*||*||*||||||||||| 2549 AGTGTCCATGTGAATGTTCCCAGCAATCTCCTGCTGATGTAAATATCTCT 2598 2601 AGTCCTTTGTGAGAGGAGCCCGAGATAACCGATGGGAGATGGTCTCGAGA 2650 *||*||*|||||*||||||||*|||||*|||||||||||||||||*|||| 2599 GGTTCTCTGTGAAAGGAGCCCAAGATAGCCGATGGGAGATGGTCTTGAGA 2648 2651 ATTGGCAGTGATCTTCCCAGGTTGTATTTTGGATTATCAGATATTGATAA 2700 |*||*||*||*||||||||||||||*||*||*||||**||||||||*||| 2649 ACTGACAATGGTCTTCCCAGGTTGTGTTCTGAATTACAAGATATTGGTAA 2698 2701 CTAGTCATAATACAGTCCCAGTTGCCACGGCCTGAGTCAAGAGCAATGTA 2750 ||||||||*||*|||||||||||||||||*|||||*|||||*|||||||| 2699 CTAGTCATGATGCAGTCCCAGTTGCCACGACCTGAATCAAGGGCAATGTA 2748 2751 GCTCCCACCCCAAGCCATCCTCATAAAAGTCTGTAACACACCATTTGCAA 2800 *||*||*|||||||||||||||||*||*|||||*||*|||||||||||*| 2749 ACTTCCGCCCCAAGCCATCCTCATGAAGGTCTGCAAAACACCATTTGCCA 2798 2801 CAGTACCACAATGGTTGGCTGCATCCCCAGCATAGCTGTGACTCAGGTTG 2850 |*|||||||||||*||*||||||||**|||||||*||||||||||||||| 2799 CTGTACCACAATGATTAGCTGCATCTACAGCATAACTGTGACTCAGGTTG 2848 2851 TACTGCACACTAATCTTTCCCCCATTAAAATCGCAGCTCATTGCCTCATA 2900 ||*||||||||*|||||*|||||||||||*||*||*||||||||*||||| 2849 TATTGCACACTGATCTTACCCCCATTAAAGTCACAACTCATTGCTTCATA 2898 2901 CTGATTGAAGTTGGGGATGGACAAGTGGAAAGTTGAGATTATGCTCATAA 2950 |||||||||*|||||*||*||||**||||||||||||||||||||||||| 2899 CTGATTGAAATTGGGTATAGACAGATGGAAAGTTGAGATTATGCTCATAA 2948 2951 GAGCGTGGTCATAGAGGTTCTTTTTGTGGGCATCAGACAGATTGCAAAAT 3000 |||*||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||*||* 2949 GAGTGTGGTCATAGAGATTCTTTTTGTGGGCATCAGATAGATTGCAGAAC 2998 3001 TTGTGATTAATAATGCTCGTGTTGGTCAAGGTCAGTTCTAGTCCTGTCTC 3050 ||||||||*|||||*||*|||||||||||*|||||||||||||||||||| 2999 TTGTGATTTATAATACTTGTGTTGGTCAAAGTCAGTTCTAGTCCTGTCTC 3048 3051 ATTGCCCACCATTATATAATGATGACTGTTGTTCTTTGTGCAGGAGAGAG 3100 |||*|||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||*|||||*| 3049 ATTACCCACCATTATGTAATGGTGACTGTTGTTCTTTGTGCAAGAGAGGG 3098 3101 GCATGGTCATATTGAGTGTCTCCATGTTTAGTTCCAGAGTCTGAAGCTCA 3150 ||||*||||||||*|||||*||||||||*|**||||**|||||||||||| 3099 GCATTGTCATATTCAGTGTTTCCATGTTCAACTCCAAGGTCTGAAGCTCA 3148 3151 TAAACCCCTTTATAAAGACTGGTTGTGCAAGACCTACCACACAACAGGAG 3200 |||||*||*||*||||||**|||||**||||||||||||||*|**|*||| 3149 TAAACTCCCTTGTAAAGAGAGGTTGAACAAGACCTACCACATAGGAAGAG 3198 3201 GAAAGTGACCAAACCAACAAGGCCACACGTTGCAAAATTGTACAGACCTT 3250 *||*||||||||*||||*|||||||||*|||||||*||||||||*||||| 3199 AAAGGTGACCAAGCCAATAAGGCCACATGTTGCAACATTGTACAAACCTT 3248 3251 TCAGCACTGCTAGTACAGACAGTGCAATGAGAACAATGTTCATCACCTCT 3300 |||||||*|||||||**|||||||||||*||*|||||||||||*|||||* 3249 TCAGCACAGCTAGTATGGACAGTGCAATAAGTACAATGTTCATGACCTCC 3298 3301 TCTATTACATGAGGCACTTCCTGGAAGAATGTCACTATTTGTCCCATTTT 3350 ||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||*|||||||| 3299 TCTATTACATGAGGGACTTCCTGGAAAAATGTGACTATTTGCCCCATTTT 3348 3351 AAATAGGACACTTGAATTGCGCAACCAAAAATGCCTAGGATCCCCGGTGC 3400 ||*****|*||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||| 3349 AAGGGAAATACTTGAATTGCGCAACCAAAAATGCCTAGGATCCACTGTGC 3398 3401 GC 3402 |* 3399 G- 3399