NC_005236 AY766368 1 TAGTAGTAGACTCCCTAAAGAGCTACTCCACTAACAAGAGAAATGGCAAC 50 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||*| 1 TAGTAGTAGACTCCCTAAAGAGCTACTACACTAACAAGAAAAATGGCA-C 49 51 TATG-GAGGAAATCCAGAGAGAAATCAGTGCTCACGAGGGGCAGCTTGTG 99 ||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 50 TATGTGAAGAAATCCAGAGAGAAATCAGTGCTCACGAGGGGCAGCTTGTG 99 100 ATAGCACGCCAGAAGGTCAAGGATGCAGAAAAGCAGTATGAGAAGGATCC 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100 ATAGCACGCCAGAAGGTCAAGGATGCAGAAAAGCAGTATGAGAAGGATCC 149 150 TGATGACTTAAACAAGAGGGCACTGCATGATCGGGAGAGTGTCGCAGCTT 199 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150 TGATGACTTTAACAAGAGGGCACTGCATGATCGGGAGAGTGTCGCAGCTT 199 200 CAATACAATCAAAAATTGATGAACTGAAGCGCCAACTTGCCGACAGGATT 249 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 200 CAATACAATCAAAAATTGATGAATTGAAGCGCCAACTTGCCGACAGGATT 249 250 GCAGCAGGGAAGAACATCGGGCAAGACCGGGATCCTACAGGGGTAGAGCC 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 250 GCAGCAGGGAAGAACATCGGGCAAGACCGGGATCCTACAGGGGTAGAGCC 299 300 GGGTGATCATCTCAAGGAAAGATCAGCACTAAGCTACGGGAATACACTGG 349 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 300 GGGTGATCATCTCAAGGAAAGATCAGCACTAAGCTATGGGAATACACTGG 349 350 ACCTGAATAGTCTTGACATTGATGAACCTACAGGACAAACAGCTGATTGG 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 350 ACCTGAATAGTCTTGACATTGATGAACCTACAGGACAGACAGCTGATTGG 399 400 CTGACTATAATTGTCTATCTAACATCATTCGTGGTCCCGATCATCTTGAA 449 *||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 400 TTGACCATAATTGTCTATCTAACATCATTTGTGGTCCCGATCATCTTGAA 449 450 GGCACTGTACATGTTAACAACAAGAGGTAGGCAGACTTCAAAGGACAACA 499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 450 GGCACTGTACATGTTAACAACAAGAGGTAGGCAGACTTCAAAGGACAACA 499 500 AGGGGATGAGGATCAGATTCAAGGATGACAGCTCATATGAGGATGTCAAT 549 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 500 AGGGGATGAGGATTAGATTCAAGGATGACAGCTCATATGAGGATGTCAAT 549 550 GGGATCAGAAAGCCTAAACATCTGTATGTGTCAATGCCAAACGCCCAATC 599 ||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 550 GGAATCAGAAAGCCCAAACATCTGTATGTGTCAATGCCAAATGCCCAATC 599 600 CAGTATGAAGGCTGAAGAGATAACACCAGGAAGATTCCGCACTGCAGTAT 649 |||*|||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||| 600 CAGCATGAAAGCTGAAGAGATAACACCTGGAAGATTCCGCACAGCAGTAT 649 650 GTGGGCTATATCCTGCACAGATAAAGGCAAGGAATATGGTAAGCCCTGTC 699 |*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 650 GCGGGCTATATCCTGCACAGATAAAGGCAAGGAACATGGTAAGCCCTGTC 699 700 ATGAGTGTAGTTGGGTTTTTGGCACTAGCAAAAGACTGGACATCTAGAAT 749 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 700 ATGAGTGTAGTTGGGTTTTTGGCACTGGCAAAAGACTGGACATCTAGAAT 749 750 TGAAGAATGGCTTGGCGCACCCTGCAAGTTCATGGCAGAGTCTCCTATTG 799 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||*|||||*|||| 750 TGAAGAATGGCTTGGCGCACCTTGCAAGTTCATGGCGGAATCTCCCATTG 799 800 CTGGGAGTTTATCTGGGAATCCTGTGAATCGTGACTATATCAGACAAAGA 849 |*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 800 CCGGGAGTTTATCTGGGAATCCTGTGAATCGTGACTATATCAGACAGAGA 849 850 CAAGGTGCACTTGCAGGGATGGAGCCAAAGGAATTTCAAGCCCTCAGGCA 899 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 850 CAAGGTGCACTTGCAGGAATGGAGCCAAAGGAATTTCAAGCCCTCAGGCA 899 900 ACATTCAAAGGATGCTGGATGTACACTAGTTGAACATATTGAGTCACCAT 949 ||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 900 ACATGCAAAGGATGCTGGATGTACACTGGTTGAACATATTGAGTCACCAT 949 950 CGTCAATATGGGTGTTTGCTGGGGCCCCTGATAGGTGTCCACCAACATGC 999 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 950 CGTCAATATGGGTGTTTGCTGGGGCCCCTGACAGGTGTCCACCAACATGC 999 1000 TTGTTTGTTGGAGGGATGGCTGAGTTAGGTGCCTTCTTTTCTATACTTCA 1049 ||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||***|||** 1000 TTGTTTGTCGGAGGGATGGCTGAGTTAGGTGCCTTCTTTTCTGGCCTTGC 1049 1050 GGATATGAGGAACACAATCATGGCTTCAAAAACTGTGGGCACAGCTGATG 1099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1050 GGATATGAGGAACACAATCATGGCTTCAAAAACTGAGGGCACAGCTGATG 1099 1100 AAAAGCTTCGAAAGAAATCATCATTCTATCAATCATACCTCAGACGCACA 1149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**| 1100 AAAAGCTTCGAAAGAAATCATCATTCTATCAATCATACCTCAGACGCCAA 1149 1150 CAATCAATGGGAATACAACTGGACCAGAGGATAATTGTTATGTTTATGGT 1199 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1150 CAATCAATGGGGATACAACTGGACCAGAGGATAATTGTTATGTTTATGGT 1199 1200 TGCCTGGGGAAAGGAGGCAGTGGACAACTTCCATCTCGGTGATGACATGG 1249 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||| 1200 TGCCTGGGGAAAGGAGGCAGTGGACAACTTTCATCTTGGTGATGACATGG 1249 1250 ATCCAGAGCTTCGTAGCCTGGCTCAGATCTTGATTGACCAGAAAGTGAAG 1299 |*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1250 ACCCAGAGCTTCGTAGCCTGGCTCAGATCCTGATTGACCAGAAAGTGAAG 1299 1300 GAAATCTCGAACCAGGAGCCTATGAAATTATAAGCACATAAATATGTAAT 1349 ||||||||*||||||||*||||||||||||||||*||||||*|||||||| 1300 GAAATCTCAAACCAGGAACCTATGAAATTATAAGTACATAATTATGTAAT 1349 1350 CAATACTAACTATAGGTTAAGAAATACTAATCATTAGTTAATAAGAATAC 1399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1350 CAATACTAACTATAGGTTAAGAAATACTAATCATTAGTTAATAAGAATAC 1399 1400 AGATTTATTGAATAATCATATTAAATAATTAGGTAAGTTAAATATTATTT 1449 |||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||**|||||||| 1400 AGATTTATTGAATAATCATATTAAATAATTATATAAGTTACCTATTATTT 1449 1450 AGTTAAGTTAGCTAATTGATTTATATGATTATCACAATTGAATGTAATCA 1499 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1450 AGTTAAGTTAGCTAATTCATTTATATGATTATCACAATTGAATGTAATCA 1499 1500 TAAGCACAATCACTGCCATGTATAATCACGGGTATACGGGTGGTTTTCAT 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1500 TAAGCACAATCACTGCCATGTATAATCACGGGTATACGGGTGGTTTTCAT 1549 1550 ATGGGGAACAGGGTGGGCTTAGGGCCAGGTCACCTTAAGTGACCTTTTTT 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1550 ATGGGGAACAGGGTGGGCTTAGGGCCAGGTCACCTTAAGTGACCTTTTTT 1599 1600 TGTATATATGGATGTAGATTTCAATTGATCGAATACTAATCCTACTGTCC 1649 ||||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||*||||||||| 1600 TGTATATATGGATGTAAATTTCAATTGATCAAATACTAATTCTACTGTCC 1649 1650 TCTTTTCTTTTCCTTTCTCCTTCTTTACTAACAACAACAAACTACCTCAC 1699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*************** 1650 TCTTTTCTTTTCCTTTCTCCTTCTTTACTAACAAC--------------- 1684 1700 AACCTTCTACCTCAATATATACTACCTCATTAAGTTGTTTCCTTTTGTCT 1749 ***|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||| 1685 ---CTTCTACCTCAATATATACTACCTCATTAAGTTGTTTCCGATTGTCT 1731 1750 TTTTAGGGAGTCTACTACTA-- 1769 ||||||||||**||||||||** 1732 TTTTAGGGAGCATACTACTACT 1753