NC_001916 AY129664 1 GGAAACAGTGGGTCAACGTTGGTGGCACCCGACATACCACGACTGTTTAC 50 **********************|||||||||||||||||||||||||||* 1 ----------------------TGGCACCCGACATACCACGACTGTTTAT 28 51 GTATGCACGCAAGTGCCCTTTAACAAAACCCTATACACACAACTCATGAT 100 ||||||||||||||||||**|||||||*|*|||||||||||||||||||| 29 GTATGCACGCAAGTGCCCCCTAACAAATCTCTATACACACAACTCATGAT 78 101 ATGTCGGACATCTTCAACTCACCACAAAACAAGGCATCCATCTTGACTGC 150 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||*|||||||*||| 79 ATGTCGGACATCTTCAACTCACCACAGAACAAGGCTTCTATCTTGAATGC 128 151 TCTGATGAAGAGCACAACAGGAGACGTAGAGGACGTGCTGATACCAAAAC 200 |||*||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||*||*| 129 TCTCATGAAGAGCACAACAGGAGATGTAGAAGACGTGCTGATACCCAAGC 178 201 GCTTCAGGCCAGCCAAGGACCCCCTCGACAGCCCGCAAGCAGCAGCACAG 250 ||||||||||*||||||||*|||||*||||||||||||||*||||||||| 179 GCTTCAGGCCCGCCAAGGATCCCCTTGACAGCCCGCAAGCCGCAGCACAG 228 251 TTCCTGAAGGACAACAAGTACCGGATACTTAGGCCGCGAGCCATCCCGAC 300 |||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||| 229 TTCCTAAAGGACAACAAGTATCGGATACTTAGGCCGCGAGCCATTCCGAC 278 301 CATGGTCGAACTAGAGACAGATGCCGCTCTGCCTCGACTGCGACAAATGG 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 279 CATGGTCGAACTAGAGACAGATGCCGCTCTGCCTCGACTGCGACAAATGG 328 351 TGGAAGACGGCAAGCTTAAGGACACGGTAAGCGTCCCAGAAGGAACCACT 400 |*||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 329 TTGACGATGGCAAGCTTAAGGACACGGTAAGCGTCCCAGAGGGAACCACT 378 401 GCGTTCTACCCAAAGTACTACCCATTCCACAAGCCAGACCATGACGAAGT 450 ||*||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||*||*|| 379 GCATTTTACCCAAAATACTACCCATTCCACAAGCCAGACCACGATGAGGT 428 451 GGGGACGTTCGGGGCTCCGGACATCACACTTCTGAAGCAACTCACCTTCT 500 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 429 TGGGACGTTCGGGGCTCCGGACATCACACTTCTGAAGCAACTCACCTTCT 478 501 TCCTGTTGGAGAATGACTTCCCAACAGGACCGGAGACGCTCAGACAAGTC 550 |||||*||||*|||||||||||*||||||||||||||*|||||*|||||| 479 TCCTGCTGGAAAATGACTTCCCCACAGGACCGGAGACACTCAGGCAAGTC 528 551 CGAGAAGCCATAGCCACACTTCAGTACGGCTCAGGCAGCTACTCAGGACA 600 ||*||*||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||*||||| 529 CGCGAGGCCATAGCCACACTCCAGTATGGCTCAGGCAGCTACTCCGGACA 578 601 GCTGAACAGGCTCCTAGCAATGAAGGGCGTCGCCACTGGCAGGAATCCAA 650 *|||||||||||||||||*|||||*||*||*||||||||||||||||||| 579 ACTGAACAGGCTCCTAGCCATGAAAGGAGTTGCCACTGGCAGGAATCCAA 628 651 ACAAGACTCCAAAAACAGTGGGCTACACGAACGAACAGCTAGCAAAACTG 700 |||||||||||||||||||*||||||||*|||||*|||||*||*|||||| 629 ACAAGACTCCAAAAACAGTAGGCTACACCAACGAGCAGCTGGCCAAACTG 678 701 CTGGAGCAAACACTACCGATCAACACACCAAAGCATGAGGACCCCGACCT 750 |||||||||||*||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||| 679 CTGGAGCAAACCCTACCGATCAACACTCCAAAACATGAGGACCCCGACCT 728 751 CCGGTGGGCCCCAAGCTGGCTGATCAACTACACCGGAGACCTGAGCACAG 800 ||||||||||||*||||||*|||||||||||||||||||*|||||||||| 729 CCGGTGGGCCCCCAGCTGGTTGATCAACTACACCGGAGATCTGAGCACAG 778 801 ACAAGTCATATCTGCCACATGTGACCATAAAGTCCTCAGCCGGCCTACCA 850 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 779 ACAAGTCATACCTGCCACATGTGACCATAAAGTCCTCAGCCGGCCTACCG 828 851 TACATAGGCAAAACCAAAGGAGACACGACGGCAGAAGCGCTCGTACTGGC 900 |||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||| 829 TACATAGGCAAAACCAAAGGAGACACGACTGCCGAAGCGCTCGTACTGGC 878 901 TGACTCCTTCATACGTGACCTCGGAAGAGCCGCCACATCAGCAGACCCAG 950 |||||||||||||||||||||*||||**||*||*|||||||||||||||| 879 TGACTCCTTCATACGTGACCTTGGAAAGGCAGCAACATCAGCAGACCCAG 928 951 AAGCAGGTGTGAAGAAAACCATCACCGACTTCTGGTACCTGAGCTGTGGG 1000 ||||*||*||||||||*||*|||||||||||||||||*||*||||||||| 929 AAGCTGGGGTGAAGAAGACAATCACCGACTTCTGGTATCTAAGCTGTGGG 978 1001 CTGCTCTTCCCAAAGGGCGAAAGATACACACAAGTGGACTGGGACAAGAA 1050 |||||*||||||||||||||*|||||||||||**|*|||||||||||||| 979 CTGCTATTCCCAAAGGGCGAGAGATACACACAGATCGACTGGGACAAGAA 1028 1051 GACCAGAAACATTTGGAGCGCGCCCTACCCAACACACCTACTACTATCAA 1100 ||||||||||||*|||||*||||||||*|||||||||||||||||||||| 1029 GACCAGAAACATCTGGAGTGCGCCCTATCCAACACACCTACTACTATCAA 1078 1101 TGGTGTCAACCCCGGTGATGAACGAGTCCAAACTCAACATCACCAACACC 1150 |||||||**||||*||||||*|||||||*||||||||||||||||||||| 1079 TGGTGTCGTCCCCCGTGATGGACGAGTCAAAACTCAACATCACCAACACC 1128 1151 CAGACCCCGTCTCTGTACGGGTTCTCACCATTCCACGGAGGAATGGACAG 1200 ||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||| 1129 CAGACCCCATCTCTGTACGGCTTCTCACCATTCCACGGAGGGATGGACAG 1178 1201 AATCATGACAATCATAAGAGACAGCCTGGACAATGACGAGGACCTAGTCA 1250 *||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||*| 1179 GATCATGACAATCATCAGAGACAGCCTGGACAACGACGAGGACCTAGTGA 1228 1251 TGATCTATGCGGACAACATCTACATACTGCAGGACAACACATGGTACTCA 1300 ||||*|||||*||||||||||||||*|||||*||||||||*||||||||* 1229 TGATATATGCAGACAACATCTACATCCTGCAAGACAACACGTGGTACTCG 1278 1301 ATTGACCTGGAGAAAGGCGAGGCCAACTGCACTCCACAGCACATGCAGGC 1350 ||*|||||||||||*|||||||||||||||||*|||||*||||||||||| 1279 ATAGACCTGGAGAAGGGCGAGGCCAACTGCACCCCACAACACATGCAGGC 1328 1351 CATGATGTACTACCTCCTGACGAGGGGATGGACGAACGAGGACGGCTCAC 1400 ||||||||||||||||||*||*||*||*||||||||||||||*|||||*| 1329 CATGATGTACTACCTCCTAACAAGAGGGTGGACGAACGAGGATGGCTCTC 1378 1401 CGCGATACAACCCGACATGGGCCACATTCGCAATGAACGTCGCTCCATCC 1450 |*||*|||||||||||*|||||*||*|||||*||||||||*||*||*||* 1379 CACGGTACAACCCGACGTGGGCAACCTTCGCCATGAACGTTGCACCGTCT 1428 1451 ATGGTGGTGGACTCATCGTGTCTTTTGATGAACCTTCAACTGAAGACCTA 1500 |||||*|||||||||||*||*||**|*|||||*|||||*||||||||||| 1429 ATGGTCGTGGACTCATCCTGCCTGCTAATGAATCTTCAGCTGAAGACCTA 1478 1501 CGGCCAGGGCAGTGGGAATGCCTTTACATTCCTGAACAACCACCTCATGT 1550 ||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||*|||||||||| 1479 CGGCCAGGGCAGTGGGAACGCCTTTACCTTCCTGAACAATCACCTCATGT 1528 1551 CCACAATAGTCGTGGCCGAGTGGGTAAAAGCAGGGAAACCAAACCCCATG 1600 ||||*||*||*|||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||| 1529 CCACGATTGTAGTGGCTGAGTGGGTAAAAGCAGGAAAACCAAACCCCATG 1578 1601 ACCAAAGAGTTCATGGACCTCGAGGAGAAAACGGGCATCAACTTCAAGAT 1650 ||*||||*||||||||||||||||||*||*|||||*||||||||*||||| 1579 ACAAAAGGGTTCATGGACCTCGAGGAAAAGACGGGGATCAACTTTAAGAT 1628 1651 AGAGCGCGAGCTGAAAAACCTTAGAGAGACCATCGTTGAGGCCGTCGAGA 1700 *|||||*|||||*||*|||||*|**|||||||||*|*||||||||*||*| 1629 TGAGCGAGAGCTAAAGAACCTCAAGGAGACCATCATCGAGGCCGTGGAAA 1678 1701 CGGCACCCCAGGATGGATACCTCGCCGATGGGTCCGACCTACCCCCCATC 1750 ||||*|||||||||||*|||||*||||||||*|||||*|||||*||***| 1679 CGGCTCCCCAGGATGGCTACCTAGCCGATGGCTCCGATCTACCACCGCAC 1728 1751 AGACCAGGAAAAGCAGTAGAGCTTGACCTGCTCGGGTGGTCGGCCATCTA 1800 ||*|||||||*|||*|||||||||||||||*|*||*|||||||||||||| 1729 AGGCCAGGAAGAGCCGTAGAGCTTGACCTGTTAGGCTGGTCGGCCATCTA 1778 1801 CAGCCGCCAAATGGAGATGTTCGTTCCAGTCCTCGAGAACGAGAGACTAA 1850 |||||||||*||||||||||||||*||*||||||||||||||**|||||| 1779 CAGCCGCCAGATGGAGATGTTCGTCCCGGTCCTCGAGAACGAACGACTAA 1828 1851 TTGCCTCAGCAGCCTACCCAAAGGGGCTCGAGAACAAAGCCCTGGCCAGA 1900 ||||*|||||*|||||*|||||*|||||*||||||||**||||*|||*|* 1829 TTGCATCAGCCGCCTATCCAAAAGGGCTTGAGAACAAGACCCTTGCCCGG 1878 1901 AAACCCGGAGCCGAGATTGCGTACCAGATAGTGCGGTACGAGGCAATCAG 1950 ||||||||*|||||||||||*||*||*|||||**|||||||*|||||||| 1879 AAACCCGGGGCCGAGATTGCATATCAAATAGTAAGGTACGAAGCAATCAG 1928 1951 GCTGGTAGGCGGCTGGAACAATCCGCTACTAGAGACCGCGGCCAAACACA 2000 |*||||*|||||||||||||||||*||*||*||*|||||*||*||||||| 1929 GATGGTGGGCGGCTGGAACAATCCACTGCTGGAAACCGCAGCAAAACACA 1978 2001 TGTCCCTCGACAAGAGGAAGAGACTGGAAGTGAAGGGGATAGACGTCACC 2050 ||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||* 1979 TGTCCCTCGACAAGAGGAAGAGACTGGAGGTGAAGGGGATCGACGTGACA 2028 2051 GGATTCCTCGATGACTGGAACAACATGTCCGAATTCGGAGGAGACCTAGA 2100 ||*||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2029 GGGTTCCTCGACGACTGGAACAACATGTCCGAGTTCGGAGGAGACCTAGA 2078 2101 AGGAATAACGCTATCAGAACCCCTAACAAACCAAACACTTGTTGACATCA 2150 ||||||*||*|||||**|||||||*||||||||*||*||**|*||||||| 2079 AGGAATCACACTATCCAAACCCCTCACAAACCAGACCCTGATAGACATCA 2128 2151 ACACGCCGCTGGACAGCTTTGACCCCAAGGCAAGACCCCAAACACCCAGG 2200 ||||*||*|||||*|*|||*|||||*|||||*|||||*|||||||||||| 2129 ACACACCACTGGAGAACTTCGACCCAAAGGCGAGACCACAAACACCCAGG 2178 2201 TCTCCAAAGAAGACTCTAGACGAGGTGACTACGGCCATCACCTCGGGCAC 2250 |||||||||||*||*|||||||||||*||**|*|||||*||*|||||*|| 2179 TCTCCAAAGAAAACCCTAGACGAGGTAACAGCCGCCATAACATCGGGGAC 2228 2251 ATACAAGGACCCCAAAAGCGCTGTGTGGCGACTGCTAGACCAGAGGACCA 2300 *||||||||||||||*|||||*||||||||||||||*|||||*||*|||| 2229 CTACAAGGACCCCAAGAGCGCAGTGTGGCGACTGCTTGACCAAAGAACCA 2278 2301 AACTCCGAGTCAGCACACTACGAGATCAAGCACTAGCGCTAAAACCCGCG 2350 |||||*|*|||||||||||*||||||||*||****|||||*|||||*||* 2279 AACTCAGGGTCAGCACACTGCGAGATCAGGCCTCGGCGCTGAAACCGGCA 2328 2351 TCGTCCTCGGTGGACAACTGGGCCGAAGCCACTGAGGAACTGGCACAACA 2400 ||*|||||*||*||||||||||||||||||||*||||||||*||**|*|| 2329 TCATCCTCAGTAGACAACTGGGCCGAAGCCACAGAGGAACTAGCGGAGCA 2378 2401 GCAACAGCTACTCATGAAGGCCAACAATCTGCTGAAGAGCAGCCTGACGG 2450 ||||||*||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 2379 GCAACAACTTCTCATGAAGGCCAACAACCTGCTGAAGAGCAGCCTGACGG 2428 2451 AGACAAGAGAAGCACTGGAGACCATCCAGTCAGACAAAATCATCGCAGGG 2500 ||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||*||* 2429 AGACCAGAGAAGCACTGGAAACCATCCAGTCCGACAAAATCATCGCTGGA 2478 2501 AAATCCAACCCCGAGAAGAACCCGGGGACCGCAGCCAACCCAGTCGTTGG 2550 ||||||||*|||||*|||||||||||*||*||||||||||||||*||||| 2479 AAATCCAATCCCGAAAAGAACCCGGGAACAGCAGCCAACCCAGTGGTTGG 2528 2551 CTACGGGGAATTCAGTGAGAAGATTCCTCTGACCCCCACGCAGAAAAAGA 2600 |||*|||||||||||*||*|||||*||||||||*||||||||*||*|||| 2529 CTATGGGGAATTCAGCGAAAAGATCCCTCTGACTCCCACGCAAAAGAAGA 2578 2601 ATGCCAAGCGGAGGGAAAAGCAGAGAAGAAACCAGTAAGAAGACCCAAAC 2650 ||||||||||||||||*|||||||||*||||*||||*||||||||*|||| 2579 ATGCCAAGCGGAGGGAGAAGCAGAGACGAAAACAGTGAGAAGACC-AAAC 2627 2651 CGGGAAGAATCCGAAATGAATCAGCTGGACTCATATGAAAGCTCCGCGCC 2700 ||||*||||||||||||||**||||||||||||||||*|||||||*|||| 2628 CGGGGAGAATCCGAAATGACCCAGCTGGACTCATATGCAAGCTCCACGCC 2677 2701 GCACGGCAAGCTGGACAAAAGTAGTGACCCGACAACGTGCCACCAACATG 2750 |*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2678 GTACGGCAAGCTGAACAAAAGTAGTGACCCGACAACGTGCCACCAACATG 2727 2751 ACCCCTGAAAACATCCGGTTCCGCCAGGGACCCC 2784 |||||*||*||*********************** 2728 ACCCCAGATAA----------------------- 2738