NC_004178 AY665672 1 GATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAAG 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 GCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGGT 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCAA 150 *****************************||||||||||||||||||||| 1 -----------------------------ATGACAAACCTGCAAGATCAA 21 151 ACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCGG 200 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 22 ACCCAACAGATTGTTCCGTTTATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCGG 71 201 ACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCAG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 72 ACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCAG 121 251 AGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAATT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122 AGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAATT 171 301 GTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACACT 350 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 172 GTCTTTTTCCCTGGTTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACACT 221 351 GCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAGA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222 GCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAGA 271 401 ACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCACA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 272 ACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCACA 321 451 GTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCAT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 322 GTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCAT 371 501 AAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 372 AAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGCT 421 551 ACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAAC 600 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 422 ACAATGGGTTGATGTCCGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAAC 471 601 GTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATGA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 472 GTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATGA 521 651 TCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGACC 700 |||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||||||| 522 TCTTGGGTATGTGAGGCTTGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGACC 571 701 CAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACACC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 572 CAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGATAGGCCCAGAGTCTACACC 621 751 ATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTGG 800 |||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 622 ATAACGGCAGCCGATGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTGG 671 801 GGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTCA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 672 GGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTCA 721 851 GCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 722 GCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACTG 771 901 GGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 772 GGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCAG 821 951 AGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATGC 1000 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 822 AGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTAACGGCCGGCACTGACAACCTTATGC 871 1001 CATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATCC 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 872 CATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATCC 921 1051 ATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATCA 1100 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 922 ATCAAACTGGAGATAGTGACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATCA 971 1101 GATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGCA 1150 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 972 AATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGCA 1021 1151 ACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGTG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1022 ACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGTG 1071 1201 GCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGAT 1250 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1072 GCAACAGGATCAGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGAT 1121 1251 CCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTTG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1122 CCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTTG 1171 1301 ACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1172 ACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCGT 1221 1351 CTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCGA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1222 CTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGTGA 1271 1401 GTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1272 GTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGAG 1321 1451 CATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCCG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1322 CATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCCG 1371 1501 GTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTGG 1550 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1372 GTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCAGCTCCCCTAGCCCATGCAATTGG 1421 1551 GGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGAA 1600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1422 GGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAAGCTGCTTCAGGAA 1471 1601 CTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAGG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1472 CTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAGG 1521 1651 CAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGTT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1522 CAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGTT 1571 1701 CCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGGA 1750 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1572 TCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCTGGGA 1621 1751 TACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCACG 1800 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1622 TACTCCGCGGTGCACATAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCACG 1671 1801 CTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAGC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1672 CTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAGC 1721 1851 ACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTCC 1900 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1722 ACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAGGATCTCC 1771 1901 AACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAGA 1950 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1772 AACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATTCGAACTCTCTCCGGACATAGA 1821 1951 GTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAGT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1822 GTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAGA 1871 2001 TTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTGT 2050 ||||||*||||||||||||||||**||||||||*|||||||||||||||| 1872 TTACACTGTGGTCCCAATAGATGACGTCTGGGATGACAGCATTATGCTGT 1921 2051 CCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCATA 2100 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1922 CCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGCGGAAACCTAGCCATA 1971 2101 GCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGAC 2150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1972 GCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGAC 2021 2151 AGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGCA 2200 *||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 2022 GGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAACGTGAGCTTTAGAAGCA 2071 2201 CCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGGT 2250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2072 CCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGGT 2121 2251 GCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTTT 2300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2122 GCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTTT 2171 2301 TCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCAT 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 2172 TCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCTTACCTCAACCTTCCAT 2221 2351 ACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTCA 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||| 2222 ACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCAATGGCCGCCTCA 2271 2401 GAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAGC 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2272 GAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAGC 2321 2451 AGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATGT 2500 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2322 GGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATGT 2371 2501 GGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAGC 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2372 GGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAGC 2421 2551 GACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAGC 2600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2422 GACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAGC 2471 2601 AGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGG 2650 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2472 AGGTAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGG 2521 2651 AGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGG 2700 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2522 AGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGG 2571 2701 ATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATG 2750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2572 ATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATG 2621 2751 GGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTACT 2800 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2622 GGTAGCTCTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTACT 2671 2801 GGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTAC 2850 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2672 GGCAGAACACACGAGAAATACCTGACCCAAACGAGGACTACCTAGACTAC 2721 2851 GTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGGC 2900 ||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||| 2722 GTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCTAAGGGC 2771 2901 AGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCCT 2950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2772 AGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCCT 2821 2951 TCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCCC 3000 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2822 TCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGGCGTGGCCCC 2871 3001 AACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGCA 3050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2872 AACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGCA 2921 3051 TCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTTC 3100 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2922 TCGCAATCCCAGGCGGGCTCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTTC 2971 3101 CAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTCT 3150 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2972 CAACACAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTCT 3021 3151 GATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT----------------- 3183 |||||||||||||||||||||||||||||||||***************** 3022 GATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCCGACACCACCCGCGC 3071 -------------------------------------------------- ************************************************** 3072 AGGCGTGGACACCAATTCGGCCATACAACATCCCAAATTGGATCCGTTCG 3121 ---------- ********** 3122 CGGGTCCCCT 3131