NC_004178 AY462026 1 G-ATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAA 49 |*|||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||*|*||| 1 GGATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCTGGGGACAGGCCGTCAA 50 50 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGG 99 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 51 GGCTTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAACGCTATCATTGATGG 100 100 TTAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||| 101 TTAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGACAGATCA 150 150 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 200 200 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 249 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 201 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTGGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 250 250 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 300 300 TGTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 349 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 TGTCTTTTTCCCTGGATTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 350 350 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 400 400 AACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 449 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 AACCTACCGGCCAGTTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 450 450 AGTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCA 499 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 451 AGTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAACGGCACCA 500 500 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 550 550 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAA 599 |||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||| 551 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACGGCCAACATCAACGACAAAATTGGGAA 600 600 CGTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 649 *|||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 601 TGTCCTGGTAGGGGAAGGGGTCACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 650 650 ATCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGAC 699 ||||||||||||||||*||*||||||||||||||*|||||||||||*||| 651 ATCTTGGGTATGTGAGGCTTGGTGACCCCATTCCTGCTATAGGGCTTGAC 700 700 CCAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 749 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 701 CCAAAAATGGTAGCCACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 750 750 CATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTG 799 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||| 751 CATAACTGCAGCCGATGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAATCAGGTG 800 800 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTC 849 |||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||*|||||||||||| 801 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCCAACATTGATGCTATCACAAGCCTC 850 850 AGCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACT 899 |||||*||||||||*||||||||*||*|||||||||||*||||||**||| 851 AGCATTGGGGGAGAGCTCGTGTTCCATACAAGCGTCCACGGCCTTGCACT 900 900 GGGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCA 949 ||**||*||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||| 901 GGACGCCACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTACAGTAATCACCA 950 950 GAGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATG 999 |||||||||||*||||||||||||||||**||||||**|||||*|||||| 951 GAGCTGTGGCCTCAGACAATGGGCTGACTACCGGCATCGACAATCTTATG 1000 1000 CCATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1049 |||||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1001 CCATTCAATCTTGTGATTCCAACCAACGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1050 1050 CATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATC 1099 ||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||||*|||||*| 1051 CATCAAACTGGAGATAGTGACCTCCAAAAGTGGCGGTCAGGCAGGGGACC 1100 1100 AGATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGC 1149 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||*|||||| 1101 AGATGTCATGGTCGGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACAATCCATGGTGGC 1150 1150 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1151 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1200 1200 GGCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1249 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1201 GGCAACAGGATCCGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1250 1250 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTT 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1251 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTTACAGAATACGGCCGATTT 1300 1300 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1301 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1350 1350 TCTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCG 1399 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*| 1351 TCTTGGCATCAAGACCGTCTGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGTG 1400 1400 AGTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1449 |||||||||||||||||**||**|*|||||||||*|||*|*|*||**||* 1401 AGTACTTCATGGAGGTGAACGGGCGCAACTCTCCACTGCACACTGGCGGC 1450 1450 GCATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCC 1499 ||*||*|||||*|*||||**|***|||**||||||***|||||||*|||* 1451 GCGTTAGGCTTGAGAGACCGAGCTCGGTACCTAAGCTTGATAGCTTTGCT 1500 1500 GGTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTG 1549 *|||||*|***||*||||||||||*||*|**|*||||||||||||||||| 1501 TGTGGTATTCTCATTGTTCCCACCTGCAGAGCTCCTAGCCCATGCAATTG 1550 1550 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1551 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1600 1600 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1649 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1601 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCCGCCTCAGGCCGTATAAG 1650 1650 GCAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGT 1699 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||||*| 1651 GCAGCTAACTCTCGCCGCTGACAAGGGGTACGAGGTTGTCGCGAATCTAT 1700 1700 TCCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGG 1749 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*||| 1701 TCCAGGTGCCCCAGAATCCCGTAGTCGACGGGATTCTTGCTTCACCTGGG 1750 1750 ATACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCAC 1799 *||||||||||*|||||*|||||||||||||||*|*|||||||||||||| 1751 GTACTCCGCGGCGCACATAACCTCGACTGCGTGCTAAGAGAGGGTGCCAC 1800 1800 GCTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAG 1849 ||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||| 1801 GCTATTCCCTGTGGTCATTACGACAGTGGAAGACGCCATGACACCCAAAG 1850 1850 CACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTC 1899 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||| 1851 CACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGTGTGCGAGAAGACCTC 1900 1900 CAACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAG 1949 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||*|||||||||||*|| 1901 CAACCTCCATCTCAACGAGGATCCTTCATACGAACCCTCTCCGGACACAG 1950 1950 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1951 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 2000 2000 TTTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTG 2049 **||||||||*|||||||||||||*|||*||||||||||||||||||||| 2001 ACTACACCGTTGTCCCAATAGATGATGTATGGGACGACAGCATTATGCTG 2050 2050 TCCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCAT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||*||||||||||| 2051 TCCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGTGGCAACCTAGCCAT 2100 2100 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2101 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2150 2150 CAGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGC 2199 |||||||||||||*||*|*|||||||||||||||**|*|||||||||||| 2151 CAGGAGCCCTCAATGCTTGTGGCGAGATTGAGAAAATAAGCTTTAGAAGC 2200 2200 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGG 2249 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2201 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTTAAGTTGGCTGGTCCCGG 2250 2250 TGCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTT 2299 *|||||*||*||*|||||||||*||||*|||||*|||||*|||||||||| 2251 AGCATTCGATGTAAACACCGGGCCCAATTGGGCAACGTTCATCAAACGTT 2300 2300 TTCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2349 |*||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2301 TCCCTCACAATCCACGTGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2350 2350 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTC 2399 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||||||||*||*|| 2351 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACCACCTTGCCATGGCTGCATC 2400 2400 AGAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAG 2449 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2401 AGAGTTCAAAGAGACCCCTGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAG 2450 2450 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATG 2499 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||**||||*||||||||| 2451 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTATTCCAATCTGCAATCAGTGTGTTCATG 2500 2500 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAG 2549 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2501 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGACATGGCCAACTTCGCACTCAG 2550 2550 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAG 2599 *|||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||| 2551 TGACCCGAACGCCCATCGGATGCGAAATTTTCTTGCAAACGCACCACAAG 2600 2600 CAGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2649 |||||||*|||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||| 2601 CAGGCAGTAAGTCGCAACGGGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2650 2650 GAGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2699 |||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||| 2651 GAGGCCCGGGGCCCCACACCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2700 2700 GATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAAT 2749 |*|*|||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||| 2701 GTTTTCAAAGAAGATGGAGACCATGGGCATTTACTTTGCAACACCAGAAT 2750 2750 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTAC 2799 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||*|||||| 2751 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGAGGGCCAAGCCCTGGCCAGCTAAAGTAC 2800 2800 TGGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTA 2849 |||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||*|||||||| 2801 TGGCAGAACACACGAGAAATACCGGACCCAAACGAGGACTATCTAGACTA 2850 2850 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGG 2899 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||||||*||||| 2851 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCAAAGGG 2900 2900 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCC 2949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2901 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCT 2950 2950 TTCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCC 2999 ||||||||||||||*|||||||*|||||||*||||||||||*|||||||| 2951 TTCATAGACGAAGTTGCCAAAGCCTATGAAATCAACCATGGACGTGGCCC 3000 3000 CAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3049 *||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3001 AAACCAAGAGCAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3050 3050 ATCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTT 3099 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||*| 3051 ATCGCAATCCCAGGCGGGCTCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGCT 3100 3100 CCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTC 3149 |||||||*||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||| 3101 CCAACACCGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGACTGTCTC 3150 3150 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT---------------- 3183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||**************** 3151 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCCGACACCACCCGCG 3200 -------------------------------------------------- ************************************************** 3201 CAGGTGTGGACACCAATTCGGCCTTACAACATCCCAAATTGGATCCGTTC 3250 ---------- ********** 3251 GCGGGTCCCC 3260