NC_004178 AY368653 1 G-ATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAA 49 |*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|*||| 1 GGATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCGGGGACAGGCCGTCAA 50 50 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGG 99 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 51 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCCCCTTCTACAATGCTATCATTGATGG 100 100 TTAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 149 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 TTAGTAGAGATCGGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 150 150 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 200 200 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 249 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 201 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTGGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 250 250 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 300 300 TGTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 349 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 TGTCTTTTTCCCTGGATTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 350 350 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 400 400 AACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 AACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 450 450 AGTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCA 499 |||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 451 AGTAAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAACGGCACCA 500 500 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 550 550 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAA 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 551 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATTGGGAA 600 600 CGTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 649 |||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||| 601 CGTCCTAGTAGGGGAAGGGGTTACTGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 650 650 ATCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGAC 699 ||||||||||||||||*||*|||||||||||*||||||||||||||*||| 651 ATCTTGGGTATGTGAGGCTTGGTGACCCCATACCCGCTATAGGGCTTGAC 700 700 CCAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 701 CCAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 750 750 CATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTG 799 ||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||| 751 CATAACTGCAGCTGATGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAACAGGTG 800 800 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTC 849 |||||||||||||*|||||||||||*||*||*|||||||||||||||||| 801 GGGTAACAATCACCCTGTTCTCAGCCAACATTGATGCCATCACAAGCCTC 850 850 AGCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACT 899 |||*|*||||||||*|||||||||*||||||||||||||*|||||*|||| 851 AGCGTTGGGGGAGAGCTCGTGTTTAAAACAAGCGTCCAAAGCCTTGTACT 900 900 GGGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCA 949 |||*||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*| 901 GGGCGCCACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGTCTGCGGTAATCACTA 950 950 GAGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATG 999 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||*|||||| 951 GAGCTGTGGCCGCAAACAATGGGCTGACGGCCGGCACCGACAATCTTATG 1000 1000 CCATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1049 |||||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1001 CCATTCAATCTTGTGATTCCAACCAACGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1050 1050 CATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATC 1099 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||**|||||*| 1051 CATCAAACTGGAGATAGTGACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGAAGGGGACC 1100 1100 AGATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGC 1149 |||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||*|||||| 1101 AGATGTCATGGTCCGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATTCATGGTGGC 1150 1150 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1151 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1200 1200 GGCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1249 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1201 GGCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCTGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1250 1250 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTT 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1251 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTTACAGAATACGGCCGATTT 1300 1300 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1301 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1350 1350 TCTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCG 1399 *||||||||||||||*||*|||||*||||||||||||||*||||||||*| 1351 CCTTGGCATCAAGACAGTCTGGCCGACAAGGGAGTACACCGACTTTCGTG 1400 1400 AGTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1449 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1401 AGTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAGCTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1450 1450 GCATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCC 1499 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1451 GCATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCATAAGGAGGATAGCTGTGCC 1500 1500 GGTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTG 1549 |||||||||*|||*||||||||||*|||||||||||*||||||||||||| 1501 GGTGGTCTCCACATTGTTCCCACCTGCCGCTCCCCTGGCCCATGCAATTG 1550 1550 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1599 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1551 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGTGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1600 1600 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1649 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1601 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGGGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1650 1650 GCAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGT 1699 ||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1651 GCAGCTGACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTAT 1700 1700 TCCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGG 1749 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||||| 1701 TCCAGGTGCCCCAGAATCCCGTAGTCGACGGGATTCTTGCTTCACCCGGG 1750 1750 ATACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCAC 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||| 1751 ATACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTAAGAGAGGGCGCCAC 1800 1800 GCTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAG 1849 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1801 GCTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGACGCCATGACACCCAAAG 1850 1850 CACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTC 1899 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||| 1851 CACTAAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAGGACCTC 1900 1900 CAACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAG 1949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1901 CAACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACACAG 1950 1950 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1951 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 2000 2000 TTTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTG 2049 **||||||||*|||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2001 ACTACACCGTTGTCCCAATAGATGATGTCTGGGACGACAGCATTATGCTG 2050 2050 TCCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCAT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||| 2051 TCCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGTGGAAACCTAGCCAT 2100 2100 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2101 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2150 2150 CAGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGC 2199 |*||||||||||||||*|*|||||||||||||||**|*|||||||||||| 2151 CGGGAGCCCTCAACGCTTGTGGCGAGATTGAGAAAATAAGCTTTAGAAGC 2200 2200 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGG 2249 ||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2201 ACCAAGCTCGCCACCGCACACCGGCTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGG 2250 2250 TGCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTT 2299 *|||||||||||*|||||||||*||||||||||*|||||*|||||||||| 2251 AGCATTTGACGTAAACACCGGGCCCAACTGGGCAACGTTCATCAAACGTT 2300 2300 TTCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2349 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2301 TCCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2350 2350 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTC 2399 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||||||*|| 2351 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACCACCTCGCCATGGCCGCATC 2400 2400 AGAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAG 2449 |||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||| 2401 AGAGTTCAAGGAGACCCCTGAACTCGAGAGCGCCGTCAGGGCCATGGAAG 2450 2450 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATG 2499 |||||||||**||*||||||||||||||||||||*|||||*||||||||| 2451 CAGCAGCCAGTGTAGACCCACTGTTCCAATCTGCACTCAGTGTGTTCATG 2500 2500 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAG 2549 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2501 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGACATGGCCAACTTCGCACTCAG 2550 2550 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAG 2599 ||||||||||||||||||||||||*||*|||||*|||||||||||||||| 2551 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGAAACTTTCTTGCAAACGCACCACAAG 2600 2600 CAGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2649 ||||*||||||||*|||||*|||||*|||||||||||||||||||||||| 2601 CAGGTAGCAAGTCTCAAAGGGCCAAATACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2650 2650 GAGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2699 |||||||||||||||||*|||||*|*|||||||||||||||||||||||| 2651 GAGGCCCGGGGCCCCACACCAGAAGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2700 2700 GATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAAT 2749 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2701 GATCTCAAAGAAGATGGAGACCATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAAT 2750 2750 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTAC 2799 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||| 2751 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGAGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTAAAGTAC 2800 2800 TGGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTA 2849 |||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||*|||||||| 2801 TGGCAGAACACACGAGAAATACCGGACCCAAACGAGGACTATCTAGACTA 2850 2850 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGG 2899 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||| 2851 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCTAAGGG 2900 2900 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCC 2949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2901 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCT 2950 2950 TTCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCC 2999 ||||||||||||||*|||||||||||||||*||||||||||*|||||||| 2951 TTCATAGACGAAGTTGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGACGTGGCCC 3000 3000 CAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3049 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3001 AAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3050 3050 ATCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTT 3099 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||*||||||*|*| 3051 ATCGCAATCCCAGGCGGGCTCCACCAAAGCCCAAGCCAAGACCCAACGCT 3100 3100 CCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTC 3149 |||||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||| 3101 CCAACGCAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGACTGTCTC 3150 3150 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT---------------- 3183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||**************** 3151 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCCGACACCACCCGCG 3200 -------------------------------------------------- ************************************************** 3201 CAGGCGTGGACACCAATTCGGCCTTACAACATCCCAAATTGGATCCGTTC 3250 ----------- *********** 3251 GCGGGTCCCCT 3261