NC_004178 AY323952 1 GATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAAG 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 GCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGGT 100 ******************|||||||||||||||||||||||||||||||| 1 ------------------ACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGGT 32 101 TAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCAA 150 |||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||| 33 TAGTAGAGATCAGACAAACAATCGCAGCGATGACGAACCTGCAAGATCAA 82 151 ACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCGG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 83 ACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCGG 132 201 ACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCAG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133 ACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCAG 182 251 AGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAATT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183 AGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAATT 232 301 GTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACACT 350 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 233 GTCTTTTTCCCTGGTTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACACT 282 351 GCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAGA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 283 GCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAGA 332 401 ACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCACA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 333 ACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCACA 382 451 GTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCAT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 383 GTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCAT 432 501 AAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 433 AAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGCT 482 551 ACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 483 ACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAAC 532 601 GTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATGA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 533 GTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATGA 582 651 TCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGACC 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 583 TCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGACC 632 701 CAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACACC 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 633 CAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACACC 682 751 ATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTGG 800 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 683 ATAACTGCAGCCGATGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTGG 732 801 GGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTCA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 733 GGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTCA 782 851 GCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 783 GCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACTG 832 901 GGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 833 GGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCAG 882 951 AGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATGC 1000 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 883 AGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTAACGGCCGGCACTGACAACCTTATGC 932 1001 CATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATCC 1050 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 933 CATTCAATATTGTGATTCCAACCAGTGAGATAACCCAGCCAATCACATCC 982 1051 ATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATCA 1100 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 983 ATCAAACTGGAGATAGTGACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATCA 1032 1101 GATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGCA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1033 GATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGCA 1082 1151 ACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGTG 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1083 ACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTATGAAAGAGTG 1132 1201 GCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGAT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1133 GCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGGGCTGAT 1182 1251 CCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTTG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1183 CCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTTG 1232 1301 ACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1233 ACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGGGTGAGAGGGACCGT 1282 1351 CTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCGA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1283 CTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCGA 1332 1401 GTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGAG 1450 |||||||||||||||||*||||||||||||||||||*||||||||||||| 1333 GTACTTCATGGAGGTGGTCGACCTCAACTCTCCCCTAAAGATTGCAGGAG 1382 1451 CATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCCG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1383 CATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCCG 1432 1501 GTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTGG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1433 GTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTGG 1482 1551 GGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGAA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1483 GGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGAA 1532 1601 CTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAGG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1533 CTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAGG 1582 1651 CAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGTT 1700 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 1583 CAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGATGTAGTCGCGAATCTGTT 1632 1701 CCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGGA 1750 *||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||| 1633 TCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGATGGGATTCTCGCTTCACCTGGGA 1682 1751 TACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCACG 1800 ||||*|||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 1683 TACTTCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGCTGAGAGAGGGTGCCACG 1732 1801 CTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAGC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1733 CTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAGGC 1782 1851 ACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTCC 1900 |||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*|||| 1783 ACTTAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAAGCGTGCGAGAAGACCTCC 1832 1901 AACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAGA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1833 AACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAGA 1882 1951 GTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAGT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||* 1883 GTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTCCCACTGGAGACTGGGAGAGA 1932 2001 TTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTGT 2050 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1933 TTACACCGTGGTCCCAATAGATGATGTCTGGGACGACAGCATTATGCTGT 1982 2051 CCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCATA 2100 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1983 CCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGCGGAAACCTAGCCATA 2032 2101 GCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGAC 2150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2033 GCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGAC 2082 2151 AGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGCA 2200 *|||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||| 2083 GGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAGCGTGAGCTTTAGAAGCA 2132 2201 CCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGGT 2250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2133 CCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGGT 2182 2251 GCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTTT 2300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2183 GCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTTT 2232 2301 TCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCAT 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 2233 TCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCTTACCTCAACCTTCCAT 2282 2351 ACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTCA 2400 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2283 ACCTTCCACCTAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTCA 2332 2401 GAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAGC 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 2333 GAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCTATGGAAGC 2382 2451 AGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATGT 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2383 AGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATGT 2432 2501 GGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAGC 2550 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2433 GGCTGGAAAAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAGC 2482 2551 GACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAGC 2600 ||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2483 GAACCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTTGCAAACGCACCACAAGC 2532 2601 AGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGG 2650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2533 AGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGG 2582 2651 AGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGG 2700 |||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2583 AGGCCCGGGGCCCCATTCCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGG 2632 2701 ATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATG 2750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2633 ATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATG 2682 2751 GGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTACT 2800 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2683 GGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAATCCCCGGCCAGCTGAAGTACT 2732 2801 GGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTAC 2850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||| 2733 GGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGAGTACTTAGACTAC 2782 2851 GTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGGC 2900 ||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||| 2783 GTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCTAAGGGC 2832 2901 AGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCCT 2950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2833 AGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCCT 2882 2951 TCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCCC 3000 |||||||||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||* 2883 TCATAGACGAAGTAGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGGCGTGGCCCT 2932 3001 AACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGCA 3050 |||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||||||||||||| 2933 AACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCCTGACTGTGATGGAGATGAAGCA 2982 3051 TCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTTC 3100 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2983 TCGCAATCCCAGGCGGGCTCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTTC 3032 3101 CAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTCT 3150 ||||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 3033 CAACCCAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTCT 3082 3151 GATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT----------------- 3183 |||||||||||||||||||||||||||||||||***************** 3083 GATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCTGACAACACCCGCGC 3132 ----------------------------------------------- *********************************************** 3133 AGGCGTGGACACCAATTCGGCCATACAACATCCCAAATTGGATCCGT 3179