NC_004178 AY099456 1 GATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAAG 50 *****************||||||||||||||||*|||||||||||*|||| 1 -----------------CCCGGGGGAGTCACCCGGGGACAGGCTGACAAG 33 51 GCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGGT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 34 GCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGGT 83 101 TAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCAA 150 |||||||||||||||*||||||||||||||||||*||||||||||||||| 84 TAGTAGAGATCAGACGAACGATCGCAGCGATGACGAACCTGCAAGATCAA 133 151 ACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCGG 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134 ACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCGG 183 201 ACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCAG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 184 ACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCAG 233 251 AGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAATT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 234 AGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAATT 283 301 GTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACACT 350 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 284 GTCTTTTTCCCTGGTTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACACT 333 351 GCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAGA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 334 GCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAGA 383 401 ACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCACA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 384 ACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCACA 433 451 GTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCAT 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 434 GTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCAT 483 501 AAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGCT 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 484 AAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAGCTGACAGATGTTAGCT 533 551 ACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 534 ACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAAC 583 601 GTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATGA 650 ||||||||||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||||| 584 GTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTTCTCAGCCTACCCACATCATATGA 633 651 TCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGACC 700 |||*||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 634 TCTGGGATATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCCATAGGGCTCGACC 683 701 CAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACACC 750 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 684 CGAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACACC 733 751 ATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTGG 800 ||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 734 ATAACTGCAGCCGATGATTACCAGTTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTGG 783 801 GGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTCA 850 ||||||*|||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||| 784 GGTAACGATCACACTGTTCTCAGCCAACATCGATGCCATCACAAGCCTCA 833 851 GCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACTG 900 ||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||| 834 GCATCGGGGGAGAACTTGTGTTCCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACTG 883 901 GGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 884 GGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACTAG 933 951 AGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATGC 1000 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 934 AGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTAACGGCCGGCACTGACAACCTTATGC 983 1001 CATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATCC 1050 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 984 CATTCAATATTGTGATTCCAACCAGTGAGATAACCCAGCCAATCACATCC 1033 1051 ATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATCA 1100 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1034 ATCAAACTGGAGATAGTGACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATCA 1083 1101 GATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGCA 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1084 GATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGCA 1133 1151 ACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGTG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1134 ACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGTG 1183 1201 GCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGAT 1250 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1184 GCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCTGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGAT 1233 1251 CCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTTG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1234 CCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATATGGCCGATTTG 1283 1301 ACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCGT 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1284 ACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCGT 1333 1351 CTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCGA 1400 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1334 CTTGGAATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCGA 1383 1401 GTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGAG 1450 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1384 GTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCACCCCTGAAGATTGCAGGAG 1433 1451 CATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCCG 1500 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1434 CATTTGGCTTCAAGGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCCG 1483 1501 GTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTGG 1550 ||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1484 GTGGTCTCTACATTGTTCCCACCCGCCGCTCCCTTAGCCCATGCAATTGG 1533 1551 GGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGAA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1534 GGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGAA 1583 1601 CTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAGG 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1584 CTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAGG 1633 1651 CAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGTT 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1634 CAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGTT 1683 1701 CCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGGA 1750 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1684 TCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCTGGGA 1733 1751 TACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCACG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1734 TACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCACG 1783 1801 CTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAGC 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1784 CTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAGC 1833 1851 ACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTCC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1834 ACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTCC 1883 1901 AACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAGA 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1884 AACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAGA 1933 1951 GTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAGT 2000 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||* 1934 GTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCTCTGGAGACTGGGAGAGA 1983 2001 TTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTGT 2050 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1984 TTACACCGTGGTCCCAATAGATGATGTCTGGGACGACAGCATTATGCTGT 2033 2051 CCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCATA 2100 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||||||||| 2034 CCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGTGGAAACCTAGCCATA 2083 2101 GCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGAC 2150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2084 GCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGAC 2133 2151 AGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGCA 2200 *|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 2134 GGGAGCCCTCAATGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTCAGAAGCA 2183 2201 CCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGGT 2250 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||* 2184 CCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGTCTCAAGTTGGCTGGTCCCGGA 2233 2251 GCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTTT 2300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2234 GCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTTT 2283 2301 TCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCAT 2350 *|||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 2284 CCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTATCTCAACCTTCCAT 2333 2351 ACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTCA 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2334 ACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTCA 2383 2401 GAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAGC 2450 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 2384 GAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGGGCGCCGTCAGAGCCATGGAAGC 2433 2451 AGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATGT 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2434 AGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATGT 2483 2501 GGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAGC 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2484 GGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAGC 2533 2551 GACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAGC 2600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2534 GACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAGC 2583 2601 AGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGG 2650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2584 AGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTGG 2633 2651 AGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGG 2700 ||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||||||||||||| 2634 AGGCCCGGGGCCCCACACCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACGG 2683 2701 ATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATG 2750 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 2684 ATCTCAAAGAAGATGGAGACCATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAATG 2733 2751 GGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTACT 2800 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||| 2734 GGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTAAAATACT 2783 2801 GGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTAC 2850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2784 GGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTAC 2833 2851 GTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGGC 2900 ||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||| 2834 GTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCTAAGGGC 2883 2901 AGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCCT 2950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2884 AGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCCT 2933 2951 TCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCCC 3000 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||*||| 2934 TCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGGCGTGGTCCC 2983 3001 AACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGCA 3050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2984 AACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGCA 3033 3051 TCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTTC 3100 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 3034 TCGCAATCCCAGGCGGGCTCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTTC 3083 3101 CAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTCT 3150 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 3084 CAACACAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTCT 3133 3151 GATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT----------------- 3183 |||||||||||||||||||||||||||||||||***************** 3134 GATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCCGACACCACCCGCGC 3183 -------------------------------- ******************************** 3184 AGGCGTGGACACCAATTCGGCCATACAACATC 3215