NC_004178 AY029166 1 G-ATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAA 49 |*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|*||| 1 GGATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCGGGGACAGGCCGTCAA 50 50 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGG 99 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 51 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTTTACAACGCTATCATTGATGG 100 100 TTAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 TTAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 150 150 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 200 200 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 249 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 201 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTGGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 250 250 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 300 300 TGTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 349 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 TGTCTTTTTCCCTGGATTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 350 350 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 400 400 AACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 449 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 AACCTACCGGCCAGTTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 450 450 AGTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCA 499 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 451 AGTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAACGGCACCA 500 500 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 550 550 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAA 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 551 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATTGGGAA 600 600 CGTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 649 *|||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 601 TGTCCTGGTAGGGGAAGGGGTCACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 650 650 ATCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGAC 699 ||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||*||||||||*||| 651 ATCTTGGGTATGTGAGGCTTGGTGACCCCATTCCCGCCATAGGGCTTGAC 700 700 CCAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 749 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 701 CCAAAAATGGTAGCCACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 750 750 CATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTG 799 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||| 751 CATAACTGCAGCCGATGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAACCAGGTG 800 800 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTC 849 |||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||*||*||||||||| 801 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCCAACATTGATGCTATTACAAGCCTC 850 850 AGCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACT 899 |||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 851 AGCATTGGGGGAGAGCTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTGTACT 900 900 GGGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCA 949 |||*||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 901 GGGCGCCACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACCGCGGTAATCACCA 950 950 GAGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATG 999 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||| 951 GGGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACCGACAATCTTATG 1000 1000 CCATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1049 |||||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1001 CCATTCAATCTTGTGATTCCAACCAACGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1050 1050 CATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATC 1099 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||*||||||| 1051 CATCAAACTGGAGATAGTGACCTCCAAAAGTGGTGGCCAGGCAGGGGATC 1100 1100 AGATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGC 1149 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1101 AGATGTCATGGTCGGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCATGGTGGC 1150 1150 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1151 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1200 1200 GGCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1249 ||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1201 GGCAACAGGATCCGTCGTTACGGTCGCTGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1250 1250 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTT 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1251 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTTACAGAATACGGCCGATTT 1300 1300 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1301 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1350 1350 TCTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCG 1399 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||*| 1351 TCTTGGCATCAAGACCGTCTGGCCAACAAGGGAGTACACCGACTTTCGTG 1400 1400 AGTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1449 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1401 AGTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAATTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1450 1450 GCATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCC 1499 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1451 GCATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCATAAGGAGGATAGCTGTGCC 1500 1500 GGTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTG 1549 |||||||||||||*||||||||||*|||||||||||*||||||||||||| 1501 GGTGGTCTCTACATTGTTCCCACCTGCCGCTCCCCTGGCCCATGCAATTG 1550 1550 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1551 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1600 1600 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1601 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1650 1650 GCAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGT 1699 ||||||*|||||||||||||||||||||*||||*||||||||||||||*| 1651 GCAGCTGACTCTCGCCGCCGACAAGGGGCACGAAGTAGTCGCGAATCTAT 1700 1700 TCCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGG 1749 |||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||*||| 1701 TCCAGGTGCCCCAGAATCCCGTAGTCGACGGAATTCTTGCTTCACCTGGG 1750 1750 ATACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCAC 1799 *|*||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 1751 GTGCTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGTGTGTTAAGAGAGGGTGCCAC 1800 1800 GCTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAG 1849 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1801 GCTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGACGCCATGACACCCAAAG 1850 1850 CACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTC 1899 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||| 1851 CATTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAAAAGACCTC 1900 1900 CAACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAG 1949 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|| 1901 CAACCTCCATCTCAAAGAGGGTCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACACAG 1950 1950 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1951 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 2000 2000 TTTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTG 2049 **||||||||*|||||||||||||*|||*||||||||||||||||||||| 2001 ACTACACCGTTGTCCCAATAGATGATGTTTGGGACGACAGCATTATGCTG 2050 2050 TCCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCAT 2099 ||||||||*||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||| 2051 TCCAAAGATCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGTGGAAACCTAGCCAT 2100 2100 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2101 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2150 2150 CAGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGC 2199 |||||||||||||*||*|*|||||||||||||||*||*|||||||||||| 2151 CAGGAGCCCTCAATGCTTGTGGCGAGATTGAGAAAGTAAGCTTTAGAAGC 2200 2200 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGG 2249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2201 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGG 2250 2250 TGCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTT 2299 *|||||*|||||*|||||||||*||||||||||*|||||*|||||||||| 2251 AGCATTCGACGTAAACACCGGGCCCAACTGGGCAACGTTCATCAAACGTT 2300 2300 TTCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2349 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2301 TCCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2350 2350 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTC 2399 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||||||||*||*|| 2351 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACCACCTTGCCATGGCTGCATC 2400 2400 AGAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAG 2449 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 2401 AGAGTTCAAAGAGACCCCTGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAG 2450 2450 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATG 2499 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||| 2451 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTATTCCAATCTGCACTCAGTGTGTTCATG 2500 2500 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAG 2549 ||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||| 2501 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACCGACATGGCCAACTTCGCACTCAG 2550 2550 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAG 2599 ||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||*||||||| 2551 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGAAATTTTCTTGCAAACGCGCCACAAG 2600 2600 CAGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2649 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2601 CAGGCAGCAAGTCGCAAAGGGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2650 2650 GAGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2699 |||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||| 2651 GAGGCCCGGGGCCCCACACCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2700 2700 GATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAAT 2749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2701 GATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAAT 2750 2750 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTAC 2799 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||| 2751 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGAGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTAAAGTAC 2800 2800 TGGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTA 2849 |||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||*|||||||| 2801 TGGCAGAACACACGAGAAATACCGGACCCAAACGAGGACTATCTAGACTA 2850 2850 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGG 2899 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||*|| 2851 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGAAGAACAAATCCTAAAGG 2900 2900 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCC 2949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2901 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCT 2950 2950 TTCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCC 2999 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||*|||||||| 2951 TTCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGACGTGGCCC 3000 3000 CAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3049 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3001 AAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3050 3050 ATCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTT 3099 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||*| 3051 ATCGCAATCCCAGGCGGGCTCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGCT 3100 3100 CCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTC 3149 ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||| 3101 CCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGACTGTCTC 3150 3150 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT---------------- 3183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||**************** 3151 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCCGACACCACCCGCG 3200 -------------------------------------------------- ************************************************** 3201 CAGGTGTGGACACCAATTCGGCCTTACAACATCCCAAATTGGATCCGTTC 3250 ----------- *********** 3251 GCGGGTCCCCT 3261