NC_004178 EF646853 1 G-ATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGTCACCCTGGGACAGGCTGGCAA 49 |*||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||*|*||| 1 GGATACGATCGGTCTGACCCCGGGGGAGGCACCCGGGGACAGGCCGCCAA 50 50 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAATGCTATCATTGATGG 99 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 51 GGCCTTGTTCCAGGATGGAACTCCTCCTTCTACAACGCTATCATTGATGG 100 100 TTAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 149 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 TCAGTAGAGATCAGACAAACGATCGCAGCGATGACAAACCTGCAAGATCA 150 150 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 AACCCAACAGATTGTTCCGTTCATACGGAGCCTTCTGATGCCAACAACCG 200 200 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTAGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 249 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 201 GACCGGCGTCCATTCCGGACGACACCCTGGAGAAGCACACTCTCAGGTCA 250 250 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 GAGACCTCGACCTACAATTTGACTGTGGGGGACACAGGGTCAGGGCTAAT 300 300 TGTCTTTTTCCCTGGCTTCCCTGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 349 |||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||| 301 TGTCTTTTTCCCTGGATTCCCAGGCTCAATTGTGGGTGCTCACTACACAC 350 350 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGCAGAGCAATGGGAACTACAAGTTCGATCAGATGCTCCTGACTGCCCAG 400 400 AACCTACCGGCCAGCTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 449 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 AACCTACCGGCCAGTTACAACTACTGCAGGCTAGTGAGTCGGAGTCTCAC 450 450 AGTGAGGTCAAGCACACTCCCTGGTGGCGTTTATGCACTAAATGGCACCA 499 ||||||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||*||||||| 451 AGTGAGGTCAAGCACACTTCCTGGTGGCGTTTGTGCACTAAACGGCACCA 500 500 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 TAAACGCCGTGACCTTCCAAGGAAGCCTGAGTGAACTGACAGATGTTAGC 550 550 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATCGGGAA 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 551 TACAATGGGTTGATGTCTGCAACAGCCAACATCAACGACAAAATTGGGAA 600 600 CGTCCTAGTAGGGGAAGGGGTAACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 649 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 601 CGTCCTAGTAGGGGAAGGGGTCACCGTCCTCAGCTTACCCACATCATATG 650 650 ATCTTGGGTATGTGAGACTCGGTGACCCCATTCCCGCTATAGGGCTCGAC 699 ||||||||||||||||*||*||||*||||||||||||*||||||||*||| 651 ATCTTGGGTATGTGAGGCTTGGTGGCCCCATTCCCGCAATAGGGCTTGAC 700 700 CCAAAAATGGTAGCAACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 749 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 701 CCAAAAATGGTAGCCACATGTGACAGCAGTGACAGGCCCAGAGTCTACAC 750 750 CATAACTGCAGCCGACGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAAGCAGGTG 799 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||| 751 CATAACTGCAGCCGATGATTACCAATTCTCATCACAGTACCAACCAGGTG 800 800 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCTAATATCGATGCCATCACAAGCCTC 849 |||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||||||||||||||| 801 GGGTAACAATCACACTGTTCTCAGCCAACATTGATGCCATCACAAGCCTC 850 850 AGCATCGGGGGAGAACTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCAAGGCCTTATACT 899 |||*|*||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||*|||| 851 AGCGTTGGGGGAGAGCTCGTGTTTCAAACAAGCGTCCACGGCCTTGTACT 900 900 GGGTGCTACCATCTACCTTATAGGCTTTGATGGGACTGCGGTAATCACCA 949 |||*||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||| 901 GGGCGCCACCATCTACCTCATAGGCTTTGATGGGACAGCGGTAATCACCA 950 950 GAGCTGTGGCCGCAGACAATGGGCTGACGGCCGGCACTGACAACCTTATG 999 |*||||||||||||*||||||||||||||*|||||||*|||||||||*|| 951 GGGCTGTGGCCGCAAACAATGGGCTGACGACCGGCACCGACAACCTTTTG 1000 1000 CCATTCAATATTGTGATTCCAACCAGCGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1049 |||||||||*|||||||||||||*|*|||||||||||||||||||||||| 1001 CCATTCAATCTTGTGATTCCAACAAACGAGATAACCCAGCCAATCACATC 1050 1050 CATCAAACTGGAGATAGTAACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCGGGGGATC 1099 |||||||||||*||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||| 1051 CATCAAACTGGGGATAGTGACCTCCAAAAGTGGTGGTCAGGCAGGGGATC 1100 1100 AGATGTCATGGTCAGCAAGTGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCACGGTGGC 1149 |||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||*|||||| 1101 AGATGTCATGGTCCGCAAGAGGGAGCCTAGCAGTGACGATCCATGGTGGC 1150 1150 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACACTAGTAGCCTACGAAAGAGT 1199 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 1151 AACTATCCAGGGGCCCTCCGTCCCGTCACGCTAGTGGCCTACGAAAGAGT 1200 1200 GGCAACAGGATCTGTCGTTACGGTCGCCGGGGTGAGCAACTTCGAGCTGA 1249 ||||||||||||*||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||| 1201 GGCAACAGGATCCGTCGTTACGGTCGCTGGGGTAAGCAACTTCGAGCTGA 1250 1250 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTCACAGAATACGGCCGATTT 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1251 TCCCAAATCCTGAACTAGCAAAGAACCTGGTTACAGAATACGGCCGATTT 1300 1300 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1301 GACCCAGGAGCCATGAACTACACAAAATTGATACTGAGTGAGAGGGACCG 1350 1350 TCTTGGCATCAAGACCGTATGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGCG 1399 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*| 1351 TCTTGGCATCAAGACCGTCTGGCCAACAAGGGAGTACACTGACTTTCGTG 1400 1400 AGTACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1449 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1401 AATACTTCATGGAGGTGGCCGACCTCAACTCTCCCCTGAAGATTGCAGGA 1450 1450 GCATTTGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCCTAAGGAGGATAGCTGTGCC 1499 |||||*||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1451 GCATTCGGCTTCAAAGACATAATCCGGGCCATAAGGAGGATAGCTGTGCC 1500 1500 GGTGGTCTCTACACTGTTCCCACCCGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTG 1549 |||||||||*|||*||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1501 GGTGGTCTCCACATTGTTCCCACCTGCCGCTCCCCTAGCCCATGCAATTG 1550 1550 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1551 GGGAAGGTGTAGACTACCTGCTGGGCGATGAGGCACAGGCTGCTTCAGGA 1600 1600 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1601 ACTGCTCGAGCCGCGTCAGGAAAAGCAAGAGCTGCCTCAGGCCGCATAAG 1650 1650 GCAGCTAACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTGT 1699 ||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1651 GCAGCTGACTCTCGCCGCCGACAAGGGGTACGAGGTAGTCGCGAATCTAT 1700 1700 TCCAGGTGCCCCAGAATCCTGTAGTCGACGGGATTCTCGCTTCACCCGGG 1749 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*||| 1701 TCCAGGTGCCCCAGAATCCCGTAGTCGACGGGATTCTTGCTTCACCTGGG 1750 1750 ATACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTGAGAGAGGGTGCCAC 1799 *||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1751 GTACTCCGCGGTGCACACAACCTCGACTGCGTGTTAAGAGAGGGTGCCAC 1800 1800 GCTATTCCCTGTGGTCATCACGACAGTGGAAGATGCCATGACACCCAAAG 1849 |||||||||*|||||*||*||||||||||||||*|||||||||||||||| 1801 GCTATTCCCCGTGGTTATTACGACAGTGGAAGACGCCATGACACCCAAAG 1850 1850 CACTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGATCTC 1899 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 1851 CATTGAACAGCAAAATGTTTGCTGTCATTGAAGGCGTGCGAGAAGACCTC 1900 1900 CAACCTCCATCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCCGGACATAG 1949 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|| 1901 CAACCTCCTTCTCAAAGAGGATCCTTCATACGAACTCTCTCTGGACACAG 1950 1950 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1951 AGTCTATGGATATGCTCCAGATGGGGTACTTCCACTGGAGACTGGGAGAG 2000 2000 TTTACACCGTGGTCCCAATAGATGGTGTCTGGGACGACAGCATTATGCTG 2049 **||||||||*|||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2001 ACTACACCGTTGTCCCAATAGATGATGTCTGGGACGACAGCATTATGCTG 2050 2050 TCCAAAGACCCCATACCTCCTATTGTGGGAAGCAGCGGAAACCTAGCCAT 2099 ||||||||*||||||||||||||||||||||*|||*|||||*|||||||| 2051 TCCAAAGATCCCATACCTCCTATTGTGGGAAACAGTGGAAATCTAGCCAT 2100 2100 AGCTTACATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCCATCCATGTGGCCATGA 2149 |||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||| 2101 AGCTTGCATGGATGTGTTTCGACCCAAAGTCCCAATCCATGTGGCTATGA 2150 2150 CAGGAGCCCTCAACGCCTATGGCGAGATTGAGAATGTGAGCTTTAGAAGC 2199 |*|||||||||||*||*|*|||||||||||||||*||*|||||||||||| 2151 CGGGAGCCCTCAATGCTTGTGGCGAGATTGAGAAAGTAAGCTTTAGAAGC 2200 2200 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTCAAGTTGGCTGGTCCCGG 2249 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2201 ACCAAGCTCGCCACTGCACACCGACTTGGCCTTAAGTTGGCTGGTCCCGG 2250 2250 TGCATTTGACGTGAACACCGGGTCCAACTGGGCGACGTTTATCAAACGTT 2299 *|||||*||*||*|||||||||*||||||||||*|||||*|||||||||| 2251 AGCATTCGATGTAAACACCGGGCCCAACTGGGCAACGTTCATCAAACGTT 2300 2300 TTCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTTCCA 2349 |*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2301 TCCCTCACAATCCACGCGACTGGGACAGGCTCCCCTACCTCAACCTACCA 2350 2350 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTACGACCTGGCCATGGCCGCTTC 2399 ||||||||||||||||||||||||||||*|*||||*||||||||*||*|| 2351 TACCTTCCACCCAATGCAGGACGCCAGTGCCACCTTGCCATGGCTGCATC 2400 2400 AGAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGCGCCGTCAGAGCCATGGAAG 2449 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||| 2401 AGAGTTCAAAGAGACCCCCGAACTCGAGAGTGCCGTCAGAGCAATGGAAG 2450 2450 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTGTTCCAATCTGCGCTCAGCGTGTTCATG 2499 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||| 2451 CAGCAGCCAACGTGGACCCACTATTCCAATCTGCACTCAGTGTGTTCATG 2500 2500 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGATATGGCCAACTTCGCACTCAG 2549 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2501 TGGCTGGAAGAGAATGGGATTGTGACTGACATGGCCAACTTCGCACTCAG 2550 2550 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGCAATTTTCTCGCAAACGCACCACAAG 2599 ||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||* 2551 CGACCCGAACGCCCATCGGATGCGAAATTTTCTTGCAAACGCACCACAAA 2600 2600 CAGGCAGCAAGTCGCAAAGAGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2649 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2601 CAGGCAGCAAGTCGCAAAGGGCCAAGTACGGGACAGCAGGCTACGGAGTG 2650 2650 GAGGCCCGGGGCCCCACTCCAGAGGGAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2699 |||||*|||||||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||| 2651 GAGGCTCGGGGCCCCACACCAGAGGAAGCACAGAGGGAAAAAGACACACG 2700 2700 GATCTCAAAGAAGATGGAGACTATGGGCATCTACTTTGCAACACCAGAAT 2749 |||||||||||*|||||||||*||||||||||||*||||||||||||||| 2701 GATCTCAAAGAGGATGGAGACCATGGGCATCTACCTTGCAACACCAGAAT 2750 2750 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGGGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTGAAGTAC 2799 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||| 2751 GGGTAGCACTCAATGGGCACCGAGGGCCAAGCCCCGGCCAGCTAAAGTAC 2800 2800 TGGCAGAACACACGAGAAATACCTGATCCAAACGAGGACTACCTAGACTA 2849 |||||||||||*|||||||||||*||*||||||||||||||*|||||||| 2801 TGGCAGAACACGCGAGAAATACCGGACCCAAACGAGGACTATCTAGACTA 2850 2850 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCGTCAGAAGGACAAATCCTAAGGG 2899 |||||||||||||||||||||||||||*|||||*|*|||*|||||||||| 2851 CGTGCATGCAGAGAAGAGCCGGTTGGCATCAGATGAACAGATCCTAAGGG 2900 2900 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCC 2949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2901 CAGCTACGTCGATCTACGGGGCTCCAGGACAGGCAGAGCCACCCCAAGCT 2950 2950 TTCATAGACGAAGTCGCCAAAGTCTATGAAGTCAACCATGGGCGTGGCCC 2999 ||||||||||||||*|||||||||||||||*||||||||||*|||||||| 2951 TTCATAGACGAAGTTGCCAAAGTCTATGAAATCAACCATGGACGTGGCCC 3000 3000 CAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3049 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 3001 AAACCAAGAACAGATGAAAGATCTGCTCTTGACTGCGATGGAGATGAAGC 3050 3050 ATCGCAATCCCAGGCGGGCCCCACCAAAGCCCAAGCCAAAACCCAATGTT 3099 |||||||||||||||||||***|||||||||||||||||||*||||||*| 3051 ATCGCAATCCCAGGCGGGCTTTACCAAAGCCCAAGCCAAAATCCAATGCT 3100 3100 CCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGTTGGGCCGCTGGATCAGGGCTGTCTC 3149 ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|*||||| 3101 CCAACACAGAGACCCCCTGGTCGGCTGGGCCGCTGGATCAGGACCGTCTC 3150 3150 TGATGAGGACCTTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCT---------------- 3183 |||||||||||*||||||||||||||||||||||**************** 3151 TGATGAGGACCCTGAGTGAGGCTCCTGGGAGTCTCCCGACACCACCCGCG 3200 -------------------------------------------------- ************************************************** 3201 CAGGTGTGGACACCAATTCGGCCTTACAACATCCCAAATTGGATCCGTTC 3250 ---------- ********** 3251 GCGGGTCCCC 3260