NC_001939 AY965901 1 GTGGCATTTTTGTAATAAGAATGGGTACTCCAGATGAGTTACTCCAATTG 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 AGCCTTCTCAAACTTGCTCATTCAATTGGAGTATTAGAGTAACTTATATA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TAAGAACCCTCTATAGAACTATTAATCTGGTTCCTACACGTGGCGGCCAT 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 CCGATATAATATTACCGGATGGCCGCGCCCCCCCCCCTTTTATACGCGCG 200 *************|||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1 -------------ACCGGATGGCCGCGCCCCCCCCC-TTTTATACGCGCG 36 201 CCTCTTTTGTTGTATTTCCACGCTCCTTCCTGTTGGTGCGTGTCCAACAC 250 |||||||*||*|||||||||||||*||||||||||||||||*|||**||| 37 CCTCTTTAGTCGTATTTCCACGCTTCTTCCTGTTGGTGCGTATCCTTCAC 86 251 TTCCCATCTTTTTGAGTAGCCTTTAATTTGAATTAAAGGTTAAAACTTTA 300 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 87 TTCCCATCTTTTTGAGTATCCTTTAATTTGAATTAAAGGTTAAAACTTTA 136 301 TCGCGATGACTAATCATATCACATTGACCATGTGAAGGACGTGGCATTAT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 137 TCGCGATGACTAATCATATCACATTGACCATGTGAAGGACGTGGCATTAT 186 351 TTCGACCATGCTGCTGAGTTTATTTGCTATTATTGTTCTATCCATAATCT 400 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 187 TTTGACCATGCTGCTGAGTTTATTTGCTATTATTGTTCTATCCATAATCT 236 401 ATATATTGGATTGGTCAGGAATATTTTGTTTATCCAACTCAGCTGCATAC 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 237 ATATATTGGATTGGTCAGGAATATTTTGTTTATCCAACTCAGCTGCATAC 286 451 CACGTTTATATCGTTAGCTAAATTTTGATTAATCTTAGTTAAGTGTTTGA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 287 CACGTTTATATCGTTAGCTAAATTTTGATTAATCTTAGTTAAGTGTTTGA 336 501 CTATGTATCCTTTAAAGAGTAAACGTGGTTTCTCATATTCAAATCGAAGA 550 |||||||||*|||||||*|||||||||||||*||||||||*||||||||| 337 CTATGTATCATTTAAAGTGTAAACGTGGTTTATCATATTCTAATCGAAGA 386 551 TTTAACTCACGTAATATTGTGTTTAACCGTCCAGTTTCTGGTAAGAGACA 600 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 387 TTTAACTCACGTAATAATGTGTTTAACCGTCCAGTTTCTGGTAAGAGACA 436 601 TGATGGAAAGCGTCGGGGAGGTAATTTCGTGAAGCCCAATGATGAGCCCA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 437 TGATGGAAAGCGTCGGGGAGGTAATTTCGTGAAGCCCAATGATGAGCCCA 486 651 AGATGTTAGCCCAACGCATACATGAGAATCAGTATGGGCCTGAATTTGTA 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 487 AGATGTTAGCCCAACGCATACATGAGAATCAGTATGGGCCTGAATTTGTG 536 701 TTGGCCCATAACTCAGCTATCTCCACATTTATTCCAGTTATCC-ATCTTG 749 ||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||*|||||| 537 TTGGCCCATAACTCAGCTATCTCCACATTTAT--CAGTTATCCCATCTTG 584 750 GGCAAGTCCCGAAGCCCAGTCGAAGTAGGTCCTATATCAAGTTGAAACGT 799 |||||||||*|||||**||||||||||||||||||||||||||||||||| 585 GGCAAGTCC-GAAGCT-AGTCGAAGTAGGTCCTATATCAAGTTGAAACGT 632 800 CTCCGTTTCAAAGGGACTGTGAAGATTGAGCGTGTTCAATCTGATTTGAA 849 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 633 CTTCGTTTCAAAGGGACTGTGAAGATTGAGCGTGTTCAATCTGATTTGAA 682 850 CATGGATGGTTTTATGCCTAAAGTCGAAGGAGTATTCTCTATGGTTGTTG 899 |||||||||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 683 CATGGATGGCTTTGTGCCTAAAGTCGAAGGAGTATTCTCTATGGTTGTTG 732 900 TTGTGGATCGTAAACCACACCTTGGGCCTTCCGGGTGTTTGCATACATTC 949 ||||||||||||||||||||*|*||*||*||*|||||||||||||||||* 733 TTGTGGATCGTAAACCACACTTGGGTCCCTCTGGGTGTTTGCATACATTT 782 950 GACGAGCTATTTGGTGCAAGGATCAATAGTCATGGCAACCTCACTATTGT 999 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|| 783 GACGAGCTATTTGGTGCAAGGATCAATAGTCATGGCAATCTCACTATAGT 832 1000 ACCTTCTCTGAAAGATCGCTTCTACATTAGACATGTGTTCAAGCGAGTGC 1049 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 833 ACCTTCTCTGAAAGACCGCTTCTACATTAGACATGTGTTCAAGCGAGTGC 882 1050 TCTCAGTTGAGAAGGATACGTTGATGGTGGACGTTGAAGGATCCACAACA 1099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 883 TCTCAGTTGAGAAGGATACGTTGATGGTGGACGTTGAAGGATCCACAACA 932 1100 CTCTCTAACAGGCGTTACAACTGCTGGTCTACGTTTAAAGACCTTGATCG 1149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 933 CTCTCTAACAGGCGTTACAACTGCTGGTCTACGTTTAAAGACCTTGATCG 982 1150 TGAATCATGCAAGGGTGTTTATGATAACATTAGCAAGAACGCCTTGTTAG 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 983 TGAATCATGCAAGGGTGTTTATGATAACATTAGCAAGAACGCCCTGTTAG 1032 1200 TTTATTATTGCTGGATGTCTGACACGCCTGCGAATGCATCATCTTTTGTA 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1033 TTTATTATTGCTGGATGTCTGACACGCCTGCGAATGCATCATCTTTTGTA 1082 1250 TCTTTTGATCTTGATTATATTGGTTAAAT-AACGAAGTGTGTTTGACTAA 1298 |||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||*|||| 1083 TCTTTTGATCTTGATTATATTGGTTAACTTAACGAAGTGTGTTTGTCTAA 1132 1299 AGATGATTAACATAAATGAAAA-TGTAAAAATAAAATTTTATTTTAATGA 1347 ||||||||||||||||||||||*||||||||||*|||||||||||||||* 1133 AGATGATTAACATAAATGAAAAATGTAAAAATAGAATTTTATTTTAATGG 1182 1348 TTTCGTCTGAGACGCCTTACAATTACTATTAATACATTCATGGACCGTAG 1397 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 1183 TTTCGTCTGAGACGCTTTACAATTACTATTAATACATTCATGGACCGTAG 1232 1398 TCCGTATTAATTCGTTCAACTGACCCATAGACATTGTAATGTTGGACTCT 1447 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1233 TCCGTATTAATTCGTTCAACTGTCCCATAGACATTGTAATGTTGGACTCT 1282 1448 GCTTTCTGGGCCCCCACAATAGAAGCAGACTCTCCCGGGTCCAGTATGCC 1497 |*|*||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||| 1283 GTTCTCTGGGCCCCCACAATAGAAGCAGACTCTCCCGGATCCAGCATGCC 1332 1498 TGTTCCTAGCCTGTTTAGATGTCTGTACGGGTGGAGTTCGTTCTCCACTT 1547 ||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1333 TGTTGATAGCCTGTTTAGATGTCTGTACGGGTGGAGTTCGTTCTCCACAT 1382 1548 CTGAGTCTGCATCTGAATGCCCTATGCCTATTGTACTCCTTGAAGCCCAT 1597 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1383 CTGAGTCCGCATCTGAATGCCCTATGCCTATTGTACTCCTTGAAGCCCAT 1432 1598 GACTCACCAGGCCTGATCTCAATTGGGCCTCTAAGCCCAAGTCTGGACAT 1647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1433 GACTCACCAGGCCTGATCTCAATTGGGCCTCTAAGCCCAAGTCTGGACAT 1482 1648 AGACGCGCATCTAATGGGCTTCCTCTCCCATTTACCGTAATCCACATGGG 1697 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1483 GGACGCGCATCTAATGGGCTTCCTCTCCCATTTACCGTAATCCACATGGG 1532 1698 AAAAGTCCACATCTTTATCTGTGAACTGTTTGGACAGGATTTTTACTGTT 1747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1533 AAAAGTCCACATCTTTATCTGTGAACTGTTTGGACAGGATTTTTACTGTT 1582 1748 GGTGCCCGGAAGGGAATGTCTACTGAGTGTTTTGCTGTGGACAATTTCAG 1797 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1583 GGTGCCCGGAAGGGGATGTCTACTGAGTGTTTTGCTGTGGACAATTTCAG 1632 1798 CTTCCCCTTAAACTTGGCGAAGTGGGTCCGTTGATGAACATTCGTATCGC 1847 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1633 CTTCCCCTTAAACTTGGCGAAGTGGGTCCGTTGATGAACATTCGTATCAC 1682 1848 AAACCCTGTAATACAATTTCCATGGAATTGGGTCTTTCAAGGAGAAGAAG 1897 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1683 AAACCCTGTAATACAACTTCCATGGAATTGGGTCTTTCAAGGAGAAGAAG 1732 1898 GAAGCTGAGAAATAGTGGAGATCTATGTTGCACCTGATCGGAAATGTCCA 1947 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1733 GAAGCTGAGAAATAGTGGAGATCTATGTTGCACCTGATCGGAAATGTCCA 1782 1948 TGATGCCTGTAAAGACTCATTCTCCGTCATCCTTTTGTCGTGAATCTCCA 1997 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1783 TGATGCCTGTAAAGACTCATTCTCCGTCATTCTTTTGTCGTGAATCTCCA 1832 1998 CTATTACCGACCCAGTGGCGTTTATTGGTACTTGTTGTCTGTACTCTATG 2047 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1833 CTATTACCGACCCAGTGGCGTTTATTGGTACTTGTTGTCTGTACTCTATG 1882 2048 ACGCAGTGGTCGATTTTCATGCAGCTACGGCTGAGCCTAGCGGTTAACTG 2097 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1883 ACACAGTGGTCGATTTTCATGCAGCTACGGCTGAGCCTAGCGGTTAACTG 1932 2098 CGACGCCGTGGACGGAAACTGCAGTATTATCTCAGTTAGGTCATGAGAAA 2147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1933 CGACGCCGTGGACGGAAACTGCAGTATTATCTCAGTTAGGTCATGAGAAA 1982 2148 GCTGATATTCGTCACGGTGTGACTCTATGTAGTTGAATGCACTAGGAGGA 2197 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1983 GCTGATATTCGTCACGGTGTGACTCTATGTAGTTGAATGCCCTAGGAGGA 2032 2198 TTAACTAACTGAGAATCCATATAATGAAAATAAGGCCGCGCAGCGGCAGT 2247 ||||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||||||||||*| 2033 TTAACTAACTGAGAATCCATATGAAGAAAATAAGGCCGCGCAGCGGCACT 2082 2248 GATTGCTGAAGTTGAATCAGAAAGAAGTCGAACAAGCTATGAAACGGCAG 2297 |*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||*|||*||||||| 2083 GTTTGCTGAAGTTGAATCAGAA-GAAGTCGAACAAGCTTTGACACGGCAG 2131 2298 TTTCGAACTCGAAGAAGATATACAGCCAACTATATTTTCTTTTTTCCGA- 2346 |||||||||||||||*||*|*||||||||||||||||||||||||||*|* 2132 TTTCGAACTCGAAGACGAAAGACAGCCAACTATATTTTCTTTTTTCCAAT 2181 2347 -ATTCATGCTGTGCTGAATATAAAGTTTATGAAGAGCGGAAATGAAAAAA 2395 *|||||*|||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 2182 AATTCA-GCTGTGCTGAATATAAAGTTTATGAAGTGCGGAAATGAAAAAA 2230 2396 -GTAGATCAGGAGTCGAAGTGTTAGAGAAAGAAAAGAAATACGAAAAGAG 2444 *|||*|||||*|*||||||||||*||||*||||||||||||*||||*||| 2231 AGTATATCAGAATTCGAAGTGTTTGAGACAGAAAAGAAATATGAAA-GAG 2279 2445 AATTTTGGAGAAATTTGAGTAAGAAGGAATTTGTATATGAACTAAGAAAC 2494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2280 AATTTTGGAGAAATTTGAGTAAGAAGGAATTTGTATATGAACTAAGAAAC 2329 2495 CTAGGGTTGATGGGTATTTAAAT-GGTAAAGTGTTCATCCCATGAGATGG 2543 |||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||*| 2330 CTAGGGTTGATGGGTATTTAAATTGGTAAAGTGTTCATCCCATGAGATAG 2379 2544 A------------------------------------------------- 2544 |************************************************* 2380 AGTGGCATTTTTGTAATAAGAAGAGGTACTCCAGATGAGTTACTCCAATT 2429 -------------------------------------------------- ************************************************** 2430 GAGCCTTCTCAAACTTGCTCATTCAATTGGAGTATTAGAGTAACTTATAT 2479 -------------------------------------------------- ************************************************** 2480 ATAAGAACCCTCTATAGAACTATTAATCTGGTTCATACACGTGGCGGCCA 2529 -------------- ************** 2530 TCCGGTATAATATT 2543