NC_001938 AY965900 1 GGGGCATTTTTGTAATAAGAAGAGGTACTCCAGATGAGTTACTCCATTTG 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 AGCCTTCTCAAACTTGCTCATTCAATTGGAGTATTAGAGTAACTTATATA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TAAGAACCCTCTATAGAACTATTAATCTGGTTCATACACGTGGCGGCCAT 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 CCGATATAATATTACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTT-AATCCGTACAGT 199 *************||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1 -------------ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTTTAATCCGTACAGT 37 200 CCAACTCTCTCTCGTCCAATCATATTGCGTCGTACAAGCCTATATATTTC 249 ||||**|||||*|*||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 38 CCAATACTCTCACATCCAATCATAATGCGTCGTACAAGCCTATATATTTC 87 250 CAACAACTTGGGCCTTAAGTTGTTGGAGGCCCATTATAAATTAAAGTGAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 88 CAACAACTTGGGCCTTAAGTTGTTGGAGGCCCATTATAAATTAAAGTGAT 137 300 CTTGGCCCAATGTCTTTAACTCAAAATGCCTAAGCGTGATTTGCCATGGC 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138 CTTGGCCCAATGTCTTTAACTCAAAATGCCTAAGCGTGATTTGCCATGGC 187 350 GATCGATGGCGGGAACCTCAAAGGTTAGCCGCAATGCTAATTATTCTCCC 399 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 188 GATCGATCGCGGGAACCTCAAAGGTTAGCCGCAATGCTAATTATTCTCCT 237 400 CGTGCAGGTATTGGGCCAAGAATTAACAAGGCCGCTGAATGGGTGAACCG 449 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 238 CGTGCAGGTATTAGGCCAAGAATTAACAAGGCCGCTGAATGGGTGAACCG 287 450 GCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATGTATCGGACTCTTAGGACAACTGACG 499 |||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||| 288 GCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATCTATCGGACTCTTAGGACAACTGACG 337 500 TCGCCAGGGGCTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTTCGAACAGCGC 549 |**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 338 TGCCCAGGGGCTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCTTTCGAACAGCGC 387 550 CATGACATCTCACATATCGGTAAGGTCATGTGCATATCCGATGTGACTCG 599 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 388 CATGTCATCTCACATATCGGTAAGGTCATGTGCATATCCGATGTGACTCG 437 600 TGGTAATGGCATAACCCACCGTGTTGGTAAGCGTTTCTGTGTTAAGTCTG 649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 438 TGGTAATGGCATAACCCACCGTGTTGGTAAGCGTTTCTGTGTTAAGTCTG 487 650 TGTATATCCTTGGTAAGATTTGGATGGATGAGAACATCAAGCTGAAGAAC 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 488 TGTATATCCTTGGTAAGATTTGGATGGATGAGAACATCAAGCTGAAGAAC 537 700 CACACGAACAGTGTCATGTTCTGGTTGGTAAGAGATCGTAGACCCTATGG 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 538 CACACGAACAGTGTCATGTTCTGGTTGGTAAGAGATCGTAGACCCTATGG 587 750 TACTCCAATGGACATTTGGACAG-TGTTCAACATGTTCGACAACGAGCCT 798 ||||||||||||**|||||||||*|*|||||||||||||||||||||||| 588 TACTCCAATGGAT-TTTGGACAGGTATTCAACATGTTCGACAACGAGCCT 636 799 AGCACTGCTACTGTCAAAAACGATCTACGCGATCGTTACCAGGTCATGCA 848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 637 AGCACTGCTACTGTCAAAAACGATCTACGCGATCGTTACCAGGTCATGCA 686 849 TAAGTTCTATGGCAAGGTGACAGGTGGACAGTATGCCAGCAACGAGCAGG 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 687 TAAGTTCTATGGCAAGGTGACAGGTGGACAGTATGCCAGCAACGAGCAGG 736 899 CTATAGTTAAGAGGTTCTGGAAGGTCAACAATCATGTAGTCTATAATCAT 948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 737 CTATAGTTAAGAGGTTCTGGAAGGTCAACAATCATGTAGTCTATAATCAT 786 949 CAAGAGGCTGGCAAGTACGAGAATCACACAGAGAACGCCTTGTTATTGTA 998 |||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 787 CAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCACACGGAGAACGCCTTGTTATTGTA 836 999 TATGGCATGCACTCATGCGTCTAACCCTGTATATGCAACTTTGAAAATTC 1048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 837 TATGGCATGCACTCATGCGTCTAACCCTGTATATGCAACTTTGAAAATTC 886 1049 GAATCTATTTTTATGATTCGATCACGAATTAATAAAATTTGAATTTTATT 1098 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 887 GAATCTATTTTTATGATTCGATCATGAATTAATAAAATTTGAATTTTATT 936 1099 GAATGATTCTCCAATACATGATTTACATACACTCTGTTTGTTGCGAAACG 1148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 937 GAATGATTCTCCAATACATGATTTACATACACTCTGTTTGTTGCGAAACG 986 1149 TACAGCTCTAACTACATTGTTTATTGAAATAACACCTAATTGATCTAGAT 1198 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 987 TACAGCTCTAATTACATTGTTTATTGAAATAACACCTAATTGATCTAGAT 1036 1199 ACATGTTGACTAAATATCTAAATCTAGCTAAATAAATTGATCCAGAAGCT 1248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1037 ACATGTTGACTAAATATCTAAATCTAGCTAAATAAATTGATCCAGAAGCT 1086 1249 GTCATCGACGTCGTCCAAACTTGGAAGTTCAGGTAGGCTTTGTGGAGATG 1298 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1087 GTCATCCACGTCGTCCAAACTTGGAAGTTCAGGTAGGCTTTGTGGAGATG 1136 1299 CAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGTATCTGTACGTGGTATACCC 1348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1137 CAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGTATCTGTACGTGGTATACCC 1186 1349 TCGTTCTGGTATACAGTGGGTCCTCTACTCTGTGTATCTTGAAATAAAGG 1398 |||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||| 1187 TCGTTCTGGTATACAGTGGTTCCTCTACCCTGTGTATCTTGAAATAAAGG 1236 1399 GGATTTTCTAGCTCCCAGATATACACGCCATTCTCCGCCTGATGTGCAGT 1448 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1237 GGATTTTTTAGCTCCCAGATATACACGCCATTCTCCGCCTGATGTGCAGT 1286 1449 GATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCCGCACAGCCTAAGTGGAAG 1498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 1287 GATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCCGCACAGTCTAAGTGGAAG 1336 1499 TAGATGGAGCACCCGCACTGTAGATCAACCCTGCGCCTTCTGATTGCCCG 1548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1337 TAGATGGAGCACCCGCACTGTAGATCAACCCTGCGCCTTCTGATTGCCCG 1386 1549 TTTCTTGGCTTGCCTGTGTGCTCTCTTGATAGAGGGGGGCTGTGAGGGTG 1598 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1387 TTTCTTGGCTTGCCTGTGTGCTGTCTTGATAGAGGGGGGCTGTGAGGGTG 1436 1599 ATGAAGATCGCATTCTTGATAGTCCAGTTCTTGAGACCTGTATTTTCTGC 1648 |||||||||||||||||||*||||||||||||*||||||||||||||||| 1437 ATGAAGATCGCATTCTTGACAGTCCAGTTCTTTAGACCTGTATTTTCTGC 1486 1649 TTTGTCTAAGAACTCTTTATAGCTGGCACCCTCACCAGGATTGCAAAGCA 1698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1487 TTTGTCTAAGAACTCTTTATAGCTGGCACCCTCACCAGGATTGCAAAGCA 1536 1699 CGATTGCTGGGATTCCGCCTTTAATTTGAACTGGCTTACCGTACTTGCAA 1748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1537 CGATTGCTGGGATTCCGCCTTTAATTTGAACTGGCTTACCGTACTTGCAA 1586 1749 TTTGATTGCCAATCTTTCTGGGCCCCCAGCAATTCTTTCCAGTGCTTTAG 1798 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1587 TTTGATTGCCAATCTTTCTGGGCCCCTAGCAATTCTTTCCAGTGCTTTAG 1636 1799 CTTTAGATAATGCGGTGCGATGTCATCAATGACGTTATACTGCACATCAT 1848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1637 CTTTAGATAATGCGGTGCGATGTCATCAATGACGTTATACTGCACATCAT 1686 1849 TCGAGAAGACTCGACCATTGAAGTCTAGGTGTCCACTGAGATAGTTATGT 1898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1687 TCGAGAAGACTCGACCATTGAAGTCTAGGTGTCCACTGAGATAGTTATGT 1736 1899 GGGCCTAACGCACGCGCCCACATCGTCTTCCCTGTTCTTGAATCACCCTC 1948 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1737 GGGCCTAACGCACGTGCCCACATCGTCTTCCCTGTTCTTGAATCACCCTC 1786 1949 GACGATGATACTTACAGGTCTATCCGGCGGCGCAGCGTCACCCGTCCCGA 1998 |||||||||||||||||||||*||*|||*||||||||*|||||||||||| 1787 GACGATGATACTTACAGGTCTCTCTGGCCGCGCAGCGGCACCCGTCCCGA 1836 1999 AATAATTATCCGCCCATTCCTGCATCTCGTCAGGAACGTTAGTGAAAGAA 2048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1837 AATAATTATCCGCCCATTCCTGCATCTCGTCAGGAACGTTAGTGAAAGAA 1886 2049 GAGACTTGAAATGGAGGAACCCACGGTTCCGGAGCCTTTGCGAATATTCG 2098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1887 GAGACTTGAAATGGAGGAACCCACGGTTCCGGAGCCTTTGCGAATATTCG 1936 2099 TTCTAGGTTAGAGCGGATGTTATGATTTTGTAATACAAAATCTTTTGGTT 2148 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1937 CTCTAGGTTAGAGCGGATGTTATGATTTTGTAATACAAAATCTTTTGGTT 1986 2149 GTTCTTCCCTTAGAACCGCTAAGGCAGATTGAACCGAACCTGCATTTAAT 2198 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||* 1987 GTTCTTCCCTTAGAACTGCTAAGGCAGATTGAACCGAACTTGCATTTAAC 2036 2199 GCTTTCGCATATGAATCATTAGCAGACTGCTGGCCTCCTCTGGCAGATCT 2248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2037 GCTTTCGCATATGAATCATTAGCAGACTGCTGGCCTCCTCTGGCAGATCT 2086 2249 GCCGTCGATTTGGAAATCTCCCCATTCGATTGTATCTCCGTCCTTGTCGA 2298 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2087 GCCGTCGATCTGGAAATCTCCCCATTCGATTGTATCTCCGTCCTTGTCGA 2136 2299 TGTATGATTTGACGTCGGAGCTCGATTTAGCTCCCTGAATATTCGGATGG 2348 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2137 TGTACGATTTGACGTCGGAGCTCGATTTAGCTCCCTGAATATTCGGATGG 2186 2349 AAATGTGCTGACCGGGTTGGGGAGACCAGGTCGAAGAATCTGTTATTCGT 2398 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2187 AAATGTGATGACCGGGTTGGGGAGACCAGGTCGAAGAATCTGTTATTCGT 2236 2399 GCATTGGTACTTACCTTCGAACTGAACAAGCACATGGAGATGAGGTTCCC 2448 |||*||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 2237 GCACTGGTACTTGCCTTCGAACTGAACAAGCACGTGGAGATGAGGTTCCC 2286 2449 CATTTTCATGAAGCTCTCTGCAAATTTTGATGAATTTCTTGTTGACTGGG 2498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2287 CATTTTCATGAAGCTCTCTGCAAATTTTGATGAATTTCTTATTGACTGGG 2336 2499 GTATTTAGGTTTTGTAATTGGGAAAGTGCTTCTTCTTTAGATAGAGAGCA 2548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 2337 GTATTTAGGTTTTGTAATTGGGAAAGTGCTTCTTCTTTAGACAGAGAGCA 2386 2549 CTGGGGATAAGTTAGGAAATAGTTCTTTGACTGAACTCTAAATTTCTTTG 2598 |||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2387 CTGTGGATAAGTGAGGAAATAGTTCTTTGACTGAACTCTAAATTTCTTTG 2436 2599 GTG----------------------------------------------- 2601 |||*********************************************** 2437 GTGGGGGCATTTTTGTAATAAGAAGGGGTACTCCAGATGAGTTACTCCAA 2486 -------------------------------------------------- ************************************************** 2487 TTGAGCCTTCTCAAACTTGCTCATTCAATTGGAGTATTAGAGTAACTTAT 2536 -------------------------------------------------- ************************************************** 2537 ATATAAGAACCCTCTATAGAACTATTAATCTGGTTCATACACGTGGCGGC 2586 ---------------- **************** 2587 CATCCGATATAATATT 2602