NC_001936 AF256203 1 AACGAAAGGAATTAGGGTTTCGTGGCATATTTCGTAAATATGCATCGGGA 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 CACCAGGAGGTGTCCTCTCAACTTTCTCATATTGCTGGTGTCCTGGTGTC 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 CTATATATACCTCAAGACACATAAAGCCTCTAGGGGACACCAAGGGGCAA 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 AATCGGCCATCCGCAATAATATTACCGGATGGCCGCCCGTTTTTGGTGTC 200 ************************|||||||||||||||||||||||||| 2 ------------------------CCGGATGGCCGCCCGTTTTTGGTGTC 27 201 CTCTACTTTAGCCCACGGGGCAGGCCCAGGCCCAAATCAACCACAACCTT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 28 CTCTACTTTAGCCCACGGGGCAGGCCCAGGCCCAAATCAACCACACCCTT 77 251 TTTTTA-TTTTATGGGACCACTTTAATTATTCCAACCAACCACGTTCCGC 299 ||||||*||||**|||||||||*|||||||||||||||||||||||*||| 78 TTTTTAATTTTGGGGGACCACTGTAATTATTCCAACCAACCACGTTGCGC 127 300 CTGACGAGTCTA-ATAATAATGCCTTGGTGACTAAGTGTGGTCCCTATAA 348 ||||||||||||*|||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 128 CTGACGAGTCTATATAATAATGACTTGGTGACTAAGTGTGGTCCCTATAA 177 349 ATAAAGCTGACATATCCCATACCTCTTTAATTCAAAATGGTTAAGAGAGA 398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178 ATAAAGCTGACATATCCCATACCTCTTTAATTCAAAATGGTTAAGAGAGA 227 399 TGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCTCAAAGGTCTCACGCTCTGCTA 448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 228 TGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCTCAAAGGTCTCACGCTCTGCTA 277 449 ACTTTTCGCCTCGTGAAGGTATGGGCCCAAAATTCAACAAGGCCGCTGCA 498 |||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 278 ACTTTTCCCCTCGTGGAGGTATGGGCCCAAAATTCAACAAGGCCGCTGCA 327 499 TGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATCTATCGCACAATGAG 548 |||||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 328 TGGGTGAACAGGCCCATGTATAGGAAGCCCAGGATCTATCGCACAATGAG 377 549 AGGCCCAGACATCCCCAAGGGATGTGAGGGGCCATGCAAGGTTCAGTCTT 598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 378 AGGCCCAGACATCCCCAAGGGATGTGAGGGGCCATGCAAGGTTCAGTCTT 427 599 ACGAGCAGCGGCATGATATCTCTCATCTTGGCAAGGTAATGTGTATTTCT 648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 428 ACGAGCAGCGGCATGATATCTCTCATCTTGGCAAGGTAATGTGTATTTCT 477 649 GACGTGACGCGTGGTAATGGCATTACTCACCGCGTCGGCAAGCGCTTTTG 698 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 478 GACGTGACGCGTGGTAATGCCATTACTCACCGCGTCGGCAAGCGCTTTTG 527 699 TGTTAAGTCTGTATATATTTTAGGCAAGATATGGATGGACGAAAATATCA 748 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 528 TGTTAAGTCTATATATATTTTAGGCAAGATATGGATGGACGATAATATCA 577 749 AGTTGAAGAATCACACGAACAGTGTGATGTTTTGGTTAGTTCGAGACCGT 798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 578 AGTTGAAGAATCACACGAACAGTGTGATGTTTTGGTTAGTTCGAGACCGT 627 799 AGACCATATGGCACTCCTATGGATTTCGGCCAGGTGTTCAATATGTTCGA 848 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 628 AGACCATATGGTACTCCTATGGATTTCGGCCAGGTGTTCAATATGTTCGA 677 849 CAACGAGCCCAGTACGGCAACTATCAAGAACGATCTACGTGATCGTTATC 898 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 678 CAACGAGCCCAGTACGGCAACAATCAAGAACGATCTACGTGATCGTTATC 727 899 AAGTCATGCACAGGTTCTACGCGAAGGTCACTGGTGGTCAGTATGCGAGC 948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 728 AAGTCATGCACAGGTTCTACGCGAAGGTCACTGGTGGTCAGTATGCGAGC 777 949 AACGAACAAGCCTTGGTTAGGCGTTTCTGGAAGGTCAACAACCATGTTGT 998 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 778 AACGAGCAAGCCTTGGTTAGGCGTTTCTGGAAGGTCAACAACCATGTTGT 827 999 GTATAACCACCAGGAAGCCGGGAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCTC 1048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 828 GTATAACCACCAGGAAGCCGGGAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCTC 877 1049 TGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTATATGCGACA 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 878 TGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTATATGCGACA 927 1099 TTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAATTTT 1148 ||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||*||| 928 TTGAAAATTCGGATTTATTTCTATGATTCGATAACAAATTAATAAAGTTT 977 1149 GAATTTTATTTCATGATTCTCGAGTACATAATTTACATATGAACGGTCTG 1198 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 978 GAATTTTATTTCATGATTCTCGATTACATAATTTACATATGAACGGTCTG 1027 1199 TTGCCCAAGATACAGCTCGTATAACGTTATTGAGACCAATAACTCCTAAC 1248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1028 TTGCCCAAGATACAGCTCGTATAACGTTATTGAGACCAATAACTCCTAAC 1077 1249 CTATCTAAGTACAACATAACTAAATGCCTAAATCTATTCAAATATGTCGT 1298 ||||||||||||||||**|||||||||||||||||||||||||||||*|| 1078 CTATCTAAGTACAACAATACTAAATGCCTAAATCTATTCAAATATGTTGT 1127 1299 CCCAGAAGCTCGAATCGATTCCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGAACGCTT 1348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1128 CCCAGAAGCTCGAATCGATTCCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGAACGCTT 1177 1349 TGTGAAGATTTAGTGCTCTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGGATTTGTATG 1398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1178 TGTGAAGATTTAGTGCTCTCCTCAGGTTGTGGTTGAAGCGGATTTGTATG 1227 1399 TGGTATATCCTTGTGTGCGTGTAGAGTGGATCCTCCACNTTGTACATCTT 1448 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 1228 TGGTATATCCTTGTGTGCGTGTAGAGTGGATCCTCCACGTTGTACATCTT 1277 1449 GAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAAATAAAAACGGAATTCTCTGCCT 1498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1278 GAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAAATAAAAACGGAATTCTCTGCCT 1327 1499 GATGCACAGTGATGTCGTCCCATGTGCGTAAATCCATTACCATCTTTGGC 1548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1328 GATGCACAGTGATGTCGTCCCATGTGCGTAAATCCATTACCATCTTTAGC 1377 1549 GCAGTTGATATGAATGTATATGGAACAGCCACAGTCTAAGTCGATTCTTC 1598 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1378 GCAATTGATATGAATGTATATGGAACAGCCACAGTCTAAGTCGATTCTTC 1427 1599 GACGACGAACAGCTCTCTTTTTAGCAATCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAG 1648 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1428 GACGACGAACAGCTCTCTTTTTAGCAATCCTGTGCTGTGCTTCGATAGAG 1477 1649 GGGACCTTCGAGGAAGATGAATTTGGCATTTTTTTCAGTCCACTCTCTTA 1698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1478 GGGACCTTCGAGGAAGATGAATTTGGCATTTTTTTCAGTCCACTCTCTTA 1527 1699 GAGCCGAGTTCTCGGCTTTGTCGAGGAAATCTTTATAACTGGACCCCTCT 1748 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1528 GTGCCGAGTTCTCGGCTTTGTCGAGGAAATCTTTATAACTGGACCCCTCT 1577 1749 CCAGGATTGCACAGCACGATTGATGGGATTCCACCTTTAATTTGAACCGG 1798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1578 CCAGGATTGCACAGCACGATTGATGGGATTCCACCTTTAATTTGAACCGG 1627 1799 CTTTCCATATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCAATCAATT 1848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1628 CTTTCCATATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCAATCAATT 1677 1849 CCTTCCAGTGCTTTAGCTTTAGGTAATGCGGAGCGACGTCATCAATGACG 1898 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1678 CTTTCCAGTGCTTTAGCTTTAGGTAATGCGGAGCGACGTCATCAATGACG 1727 1899 TTATACTTGACGTCATTTGAGAAAACCCTAGAATTGAAATCAAGATGGCC 1948 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1728 TTATACTTGACGTCATTCGAGAAAACCCTAGAATTGAAATCAAGATGGCC 1777 1949 GCTCAAGTAATTATGTGGGCCTAACGACCTAGCCCACATTGTCTTGCCCG 1998 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1778 ACTCAAGTAATTATGTGGGCCTAACGACCTAGCCCACATTGTCTTGCCCG 1827 1999 TTCTTGAACCACCTTCTATGATTATACTAGTTGGCCTTGCC---GCAGCG 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|***|||||| 1828 TTCTTGAACCACCTTCTATGATTATACTAGTTGGCCTTGGCCGCGCAGCG 1877 2046 GAACACTCATTAAAATAATCATCAGCCCAATCTTGTAACTCTTCTGGAAC 2095 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1878 GAACACTCATTAAAATAATCATCAGCCCATTCTTGTAACTCTTCTGGAAC 1927 2096 TGACGTGAACGAAGAGAGCTCAAACGGAGGAACCCACGGTTCCGGAGGTT 2145 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1928 TGACGTGAACGAAGAGAGCTCAAACGGAGGAACCCATGGTTCCGGAGGTT 1977 2146 TCTGAAATAATCTCTCGACGTTAGCTAATAAATTGTGATAATTAACGATA 2195 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 1978 TCTGAAATAATCTCTCGACGTTAGCTAATAAATTGTGATAATTAACAATA 2027 2196 AACGTCTTTGGATCACCAGCTTTTATAATGTCGAGAGCTTCTCCCGCACT 2245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2028 AACGTCTTTGGATCACCAGCTTTTATAATGTCGAGAGCTTCTCCCGCACT 2077 2246 ACCTGCATTAACGGCATTGTGATATACGTCGTCTTTGTTTGACTTTGAAC 2295 ||||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||||||||||| 2078 ACCTGCATTAACGGCATTATGATATATGTCGTCTTTGTTTGACTTTGAAC 2127 2296 CCCCAGACACTTTATATTGCCCGGATTCACAATAATCACCTTCTTTGGTG 2345 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2128 CCCCAGACACTTTATACTGCCCGGATTCACAATAATCACCTTCTTTGGTG 2177 2346 ATGTAGTTCTTGACGGCGTTGGTGTCTTTGGCAGCCTGAATGTTTGGGTG 2395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2178 ATGTAGTTCTTGACGGCGTTGGTGTCTTTGGCAGCCTGAATGTTTGGGTG 2227 2396 AAATCGGGCAGACCGTCTGGGGTGAGTGAGGTCGAAAAATCCAGCATCCT 2445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2228 AAATCGGGCAGACCGTCTGGGGTGAGTGAGGTCGAAAAATCCAGCATCCT 2277 2446 TGATGTTGGATTTTCCAGATAATTGAATGAGGCAGTGTAAGTGCGGAGAC 2495 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2278 TGATGTTCGATTTTCCAGATAATTGAATGAGGCAGTGTAAGTGCGGAGAC 2327 2496 CCGTCGGAATGTTCCTCTCTGGCGACTCTAACGTAATTCGGTTTGACGAC 2545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2328 CCGTCGGAATGTTCCTCTCTGGCGACTCTAACGTAATTCGGTTTGACGAC 2377 2546 CGACCACGAGAGATGCAGAAGCATCTCAAGAACTTCTTCTTTGGGAACAT 2595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2378 CGACCACGAGAGATGCAGAAGCATCTCAAGAACTTCTTCTTTGGGAACAT 2427 2596 CGCACCTTGGATAAGTTAAGAATATGTTTCTGGCAGTTA----------- 2634 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*********** 2428 CGCACCTTGGATAAGTTAAGAATATGTTTCTGGCAGTTAAACGAAAGGAA 2477 -------------------------------------------------- ************************************************** 2478 TTAGGGTTTCGTGGCATATTTCGTAAATATGCGTTGGGACACCAGGAGGT 2527 -------------------------------------------------- ************************************************** 2528 GTCCTCTCAACTTTCTCATATTGCTGGTGTTCTGGTGTCCTATATATACC 2577 -------------------------------------------------- ************************************************** 2578 TCAAGACTCATAAAGCCTCTAGGGGACACCAAGGGGCAAAATCGGCCATC 2627 ------------ ************ 2628 CGCAATAATATT 2639