NC_001935 AY965898 1 TTTCGGGGCATTTTGATAAATATTAGTGTTCCCCCGATATGTTCCCCCAA 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 TTGCTCTGGCCCTCAAAACTCTTATGAATTGGGGGAACTGGGGGAACTTA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TATAGTAGAAGTTCCTAAAGGCAGATCAACACGTGCGGCCATCCGTTATA 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 ATATTACCGGATGGCCGCGAGATTTTTTATACTGGGCTTTCTACTAAGGC 200 *****||||||||||||||*||||||||*||*||||||||*||||||||| 1 -----ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTGTATTGGGCTTTTTACTAAGGC 45 201 CCAAGTATGATTGGACTCTAGGCCCATTTTTTAGCGGTCCCTCTTTTTCC 250 ||||*||*|***||||||*||||||||*||**|**|*|||||||*||||| 46 CCAACTAGGTCCGGACTCAAGGCCCATGTTGGACTGATCCCTCTCTTTCC 95 251 TCGTCCTTTCTCTGCTGTTTCCTTTTACTTTAATTTAAA-TCACTCTTAA 299 ||||||||||||*|****|||||||*|||||||||||||*|*|||*|||| 96 TCGTCCTTTCTCCGTGTGTTCCTTTAACTTTAATTTAAAATAACTTTTAA 145 300 ATTAAATATGT--------TGTGATCAATTTCAACAGCTGTCCCGCATAA 341 |||||||||*|********|*||**||||||**||||||||*|||||*|* 146 ATTAAATATTTCTCTCTTTTATGGGCAATTTTGACAGCTGTTCCGCACAT 195 342 TATATGTACTGACGACGTGGGTAATTCTCGACCAAGTTACAGTGTTAAGT 391 |||||*|||||||*||||||||||||||||||||||||*||*|**||||| 196 TATATATACTGACTACGTGGGTAATTCTCGACCAAGTTTCATTAATAAGT 245 392 CGAAATTGATTTTAACGTCTCTCCATTTATGAGCTCATGGTCCTATTAAG 441 ||||||||||||||||*|*|*|||||||||||||||||***|*||*|*|| 246 CGAAATTGATTTTAACTTTT-TCCATTTATGAGCTCATTTACTTACTGAG 294 442 CATTACATTACACGTGTACCATTTAAATTGATCGTGTGGAGTCAATTTAA 491 |**|*||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||| 295 CTGTGCATTACACGTGTACCATTTAAATTGATCGTGTAGATTCAATTTAA 344 492 TTAATTGTATAACCTGATATGTCTATATATTCGCTGACTAGGAATGAGCT 541 *||||||*||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 345 ATAATTGCATAAACTGATATGTCTATATATTCGCTGACTAGGAATGAGCT 394 542 CATTATTACGTGGTACAAAGACATTACATGATAATGTATCCTAATAGGCA 591 |||||||||||||||*||||||||*||*||||||||||||||||||*||| 395 CATTATTACGTGGTATAAAGACATAACTTGATAATGTATCCTAATAAGCA 444 592 CAGGCGTGCTTCTTTTTGTAGCCAGCCACGTACTTACCCACGTAATAGTT 641 |||||||||||||||||*||||||*||||||||||||||||||||||||| 445 CAGGCGTGCTTCTTTTTCTAGCCAACCACGTACTTACCCACGTAATAGTT 494 642 TGATTAGACAGCAGTCATTATTCAAGCGTAATGTTAGCAAACGACGACCA 691 ||||*||||*|||*|||*|*|||||||||||||*||**|||||||||||| 495 TGATAAGACGGCAATCACTTTTCAAGCGTAATGATAATAAACGACGACCA 544 692 TTTCAAACCGTGAAGATGGTTGATGACTCCATGATGAAGGCACAACGTAT 741 ||||||||*|*|||*|**||||||||*||*|||*|*|||||*|||||||| 545 TTTCAAACTGCGAAAACAGTTGATGAGTCTATGGTCAAGGCCCAACGTAT 594 742 TCATGAGAATCAATACGGTCCAGATTTTTCACTGGCCCATAATACAGCCG 791 |||||||||||||||||||||||||||*|||*|*||||||||*|||||*| 595 TCATGAGAATCAATACGGTCCAGATTTCTCAATAGCCCATAACACAGCTG 644 792 TCTCTACATTTATAAGTTACCCTGATATTGCTAAGTCTCTGCCCAATAGA 841 |||||||||||||*||||||||||||||**||||||||||||||||*||| 645 TCTCTACATTTATTAGTTACCCTGATATCTCTAAGTCTCTGCCCAACAGA 694 842 ACCAGGTCATATATTAAGCTAAAACGACTTCGGTTCAAGGGTATTGTGAA 891 ||*|*|||||||||||||*|||||||||||||*||||||||||||||||| 695 ACTAAGTCATATATTAAGTTAAAACGACTTCGTTTCAAGGGTATTGTGAA 744 892 GGTGGAACGTGTACATGTAGAGGTTAACATGGACTGTTCTGTGCCTAAGA 941 *||||||||*||*||||*||*|*|*|||||*||||||||*|||||*|||| 745 AGTGGAACGGGTTCATGCAGGGATGAACATTGACTGTTCAGTGCCGAAGA 794 942 CCGAAGGAGTTTTCTCTTTGGTTATTGTAGTGGATCGTAAACCTCACCTT 991 ||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||| 795 CCGAAGGAGTTTTCTCCTTGGTTATTGTTGTGGATCGTAAACCTCACCTT 844 992 GGACCCTCTGGGGGACTGCCTACATTTGACGAGCTATTTGGCGCTAGGAT 1041 |||||||||||||||*|||||||*||*||*|||||||||||||||||||| 845 GGACCCTCTGGGGGATTGCCTACTTTCGATGAGCTATTTGGCGCTAGGAT 894 1042 CCACAGTCATGGTAACTTGGCAATAGTTCCATCTCTGAAGGATCGGTTCT 1091 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||*||||||| 895 CCACAGTCATGGTAATTTGGCAATAGTTCCATCTCTGGAGGAACGGTTCT 944 1092 ACATACGCCATGTACTGAAGCGTGTGATATCAGTCGAGAAGGACACCATG 1141 |||||||*|||||*||||||||||||*|||||||*||||||||||||||| 945 ACATACGTCATGTGCTGAAGCGTGTGGTATCAGTTGAGAAGGACACCATG 994 1142 ATGGTGGACATAGAAGGTGTTGTAGCCCTTTCTAGCAGACGTTTTAATTG 1191 *|||||||||||||||||||||*|*|||||||||*||**||||||||||| 995 TTGGTGGACATAGAAGGTGTTGCAACCCTTTCTAACAAGCGTTTTAATTG 1044 1192 TTGGGCTGGTTTTAAGGACCTTGACATAGAGTCCCGAAAGGGTGTTTATG 1241 |||||||*||||||||||||*||||||||||*|*|||||||||||||||| 1045 TTGGGCTAGTTTTAAGGACCCTGACATAGAGACTCGAAAGGGTGTTTATG 1094 1242 ATAACATTAATAAGAACGCCCTGTTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGAT 1291 |||||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1095 ATAACATTAGCAAGAACGCCCTGTTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGAT 1144 1292 ACAGTATCCAAAGCATCCACATTTGTATCGTTTGATCTTGATTATATTGG 1341 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1145 ACTGTATCCAAAGCATCCACATTTGTATCGTTTGACCTTGATTATATTGG 1194 1342 ATGATTGTATTCACTAATACAAATTTTATTTAAAATTTTTTGGCTGAGAA 1391 *|||*|||||**|*|||||*||||||||||||||||||||*||||||||| 1195 TTGAGTGTATATAATAATAAAAATTTTATTTAAAATTTTTGGGCTGAGAA 1244 1392 CTATTACAATTACTCTTTATACATTCTTGGACAGTTGTCCTTACAAGTTC 1441 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1245 CTATTACAATTACTCTTTATACATTCTTGGACAGTTGTCCTTACAAGTTC 1294 1442 ATTTAACTGGGCTACGGACATGGTTATGTTCGATTGGGCCATGTTAGCAC 1491 *||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||*|**| 1295 GTTTAACTGGGCTACGGACATGGTTATGTTCGACTGGGCCCTGTTTGTTC 1344 1492 CAACTATAGATGCTGACTCTCCTGGATCTAGGACGCTGGCTCCTAGTCTT 1541 |||||||||||||*||||||||*||||||||||||||*|||||*||*||| 1345 CAACTATAGATGCAGACTCTCCCGGATCTAGGACGCTTGCTCCCAGCCTT 1394 1542 TGCAAATCTCGATACGTATGTAGCTCGTTCTCTATCTCTGACTCGCCCTC 1591 ||||*|||||||||||*|||||*||||||||*|||||||||||||*|||| 1395 TGCAGATCTCGATACGGATGTAACTCGTTCTGTATCTCTGACTCGTCCTC 1444 1592 TGATTGACCCACTCCTATTGTACTCCTGGAAGCCCATGATTCACCAGGCC 1641 |||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1445 TGATTGACCCATTCCTATTGTGCTCCTGGAAGCCCATGATTCACCAGGCC 1494 1642 TTATTTCAATTGGGCCTCTGAGCCCAACTCTGGACATTGATGCGCATCTA 1691 |||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||||** 1495 TTATTTCAATTGGGCCTCTTAGCCCAACTCTAGACATGGATGCGCATCGT 1544 1692 ATGGGCTTCCTCTCCCATCTCCCGTAGTCGACGTGCGAGAAATCCACGTC 1741 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||*|| 1545 ATGGGCTTCCTCTCCCATTTCCCGTAGTCGACGTGCGAGAAGTCCACATC 1594 1742 CTTATCTGTGAACTGTTTGGACAGGATCTTGACCGTTGGTGCTCTGAACG 1791 *||*||*|||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||| 1595 ATTTTCCGTGAACTGTTTGGACAGAATCTTCACCGTTGGTGCTCTGAACG 1644 1792 GAATGTCTACGGAATGTTTCGCCGTCGACAGTTTCAGCTTCCCTTTGAAC 1841 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1645 GAATGTCAACGGAATGTTTCGCCGTCGACAGTTTCAGCTTCCCTTTGAAC 1694 1842 TTGGCAAAGTGTGTCCGTTGATGAACGTTCGTGTCGGAAACTCTGTAATA 1891 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1695 TTGGCAAAGTGTGTCCGCTGATGAACGTTCGTGTCGGAAACTCTGTAATA 1744 1892 GAGTTTCCATGGGATAGGATCTTTTAGGGAGAAAAAGGAAGCTGAGAAAT 1941 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1745 TAGTTTCCATGGGATAGGATCTTTTAGGGAGAAAAAGGAAGCTGAAAAAT 1794 1942 AGTGGAGATCTATGTTGCATCTTAACGGGAACGTCCATGACGCCTGCAGA 1991 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||*|||||*||*||* 1795 AGTGGAGATCTATGTTGCATCTTATCGGGAACGTCCAAGACGCTTGAAGT 1844 1992 GATTCGTTGTCTGTCATCCTCTTATCATGAATCTCCACTATTACAGACCC 2041 |||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|| 1845 GATTCGTTGTCAGTCATCCTCTTGTCATGAATCTCCACTATTACAGAACC 1894 2042 GGTGGCGTTGATGGGTACCTGTTGCCTGTACTCAATTACGCAGTGGTCTA 2091 ||||||||||||*||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||| 1895 GGTGGCGTTGATCGGTACCTGCTGCCTGTACTCTATTACGCAGTGGTCTA 1944 2092 TCTTCATACAGCTGCGACTGAGCCTCGCCGTTAACTGCGCCGCCGTCGAC 2141 |||||||||||||||||||||**||||||||*||*||||||||||||||* 1945 TCTTCATACAGCTGCGACTGATTCTCGCCGTCAATTGCGCCGCCGTCGAA 1994 2142 GGAAATTGCAGTATTATCTCAGTTAGGTCATGCGAAAGCTGATATTCATC 2191 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1995 GGAAATTGCAGTATTATCTCAGTTAGGTCATGGGAAAGCTGATACTCATC 2044 2192 CCGTTGAGACTCTATGTAATTGAAAGCATGAGGAGGATTAACTAACTGAG 2241 |||*|||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||||||| 2045 CCGCTGAGACTCTATATAATTGAAAGCATGCGGAGGATTAACTAACTGAG 2094 2242 AATTCATTTATTGAAAATTAGGCCGCGCAGCGGCACCGCTTCCAGAATAT 2291 |||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||*||||*|| 2095 AATTCATTTATAGAAA-TTAGGCCGCGCAGCGGCACCGCTTCGAGAAAAT 2143 2292 GAACAGGA-AAAGAGGATGATAGGGTTTC--------------------- 2319 ||||||||*|||||||||**|||||||||********************* 2144 GAACAGGATAAAGAGGATATTAGGGTTTCGTCAGAAAGTTAAAGAATTAG 2193 2320 ---------------------TCGAACAGGCAAGACGATGATCTTGAAGA 2348 *********************||||||*||||||||||||*|||*|*||| 2194 TATCATAATTGAGGGTGACTCTCGAACGGGCAAGACGATGTTCTCGGAGA 2243 2349 GAAGACAGAGAAATATAATAGTGCTATGGAAGACTCTGAATATGTTAATG 2398 |||*|*|||||*|*|*|**||||*|||**||||*|*||||||||*|||** 2244 GAATATAGAGAGAGAGAGGAGTGATATATAAGAGTTTGAATATGATAAGT 2293 2399 TTCAAGGATTAGGTAGTTTATATAAAGAAGTTGTTACTGCTGAGGTACCA 2448 ||*||*||||||||*|||||||||*|*|||*||*||*|**|*|||||**| 2294 TTGAATGATTAGGTTGTTTATATAGACAAGATGATAATAATCAGGTAGTA 2343 2449 ATTAAGAAATTTGAAGTTGGGAAAGTGCATCTTCTTTGCT-AAGATAGTA 2497 |||||||*||*|*|*|*|***|||**|*|**||**||*|**||||*|*** 2344 ATTAAGATATGTCA-GATAATAAATGGAAGATTAATTACAGAAGAAACCC 2392 2498 TTGAGGA---TTCGTAA---GGA---------AATAATTT---------- 2522 |*|*||****||*||||***|||*********||||**||********** 2393 TAGTGGCATTTTTGTAATAAGGATGTTCCCCCAATATGTTCCCCCAATAG 2442 2523 -------------------------TTGG--------------CTTAAAT 2533 *************************||||**************||||*|| 2443 CTCTGGCTCTCAAAACTCCTATGAATTGGGGGAACTGGGGGAACTTATAT 2492 2534 AG-AGAA---------------------CGAGCC---------------- 2545 ||*||||*********************||*|*|**************** 2493 AGTAGAAGTTCCTAAAGGCAGATCAACACGTGGCGGCCATCCGTTATAAT 2542 2546 -TT 2547 *|| 2543 ATT 2545