NC_001934 AY965897 1 TTTCGTGGCATTTTTGTAAATATGAATGTTCTCCCAATATGTTCCCCCTA 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 TTGCTCTGGCTCTCAAAACTCTTATGAATTGGGGGAACTGGGGGAACTTA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 TATAGTAGAAGTTCCTAAAGGCAGATCAACACGTGCGGCCATCCGTTATA 150 ************************************************** -------------------------------------------------- 151 ATATTACCGGATGGCCGCGTTTTTTTTTTA--ATGGGCCTTATTTGTAAT 198 *****||||||||||||||***||||||****|||||||||**||*|||| 1 -----ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCCTATGGGCCTTTCTT-TAAT 44 199 GGGCTTTAATTTGGCCCAATCAACGTTAGTCTGACACACCTAGATAAGTG 248 ||||||||||||||||||||||**||**|||||*||*|||||*||||*|| 45 GGGCTTTAATTTGGCCCAATCATAGTCTGTCTGCCAAACCTAAATAAATG 94 249 GAATTACTTTGTCGCTAAGTTGTGATTTTGTCTATAAATTAAAGCCTCTT 298 *||*|||||||*|||||||||****||||||||||||||||||||||||| 95 AAAATACTTTGGCGCTAAGTTAGTCTTTTGTCTATAAATTAAAGCCTCTT 144 299 GGCCCACTATCTTTAACTCAAAATGCCTAAGCGCGATGCCCCATGGCGTT 348 ||||||||*||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||||||| 145 GGCCCACTCTCTTTAACTCAAAATGCCTAAGCGTGACGCTCCATGGCGTT 194 349 CAATGGCGGGAACCTCAAAGGTTAGCCGCAACGCTAATTACTCTCCTCGT 398 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 195 CAATGGCGGGAACCTCAAAGGTTAGCCGCAACGCTAATTACTCTCCCCGT 244 399 TCAGGAATTGGGCCAAGAATAAACAAGGCCGCTGAATGGGTTAATAGGCC 448 ||||||||||||||||||||*||||||*||||||||||||||||*||||| 245 TCAGGAATTGGGCCAAGAATTAACAAGACCGCTGAATGGGTTAACAGGCC 294 449 CATGTACCGGAAGCCCAGGATCTATCGGACGCTGAGGACGCCTGATGTTC 498 |||||||*||||||||||*||*||*||||||||*|*||||||*|||||*| 295 CATGTACAGGAAGCCCAGCATATACCGGACGCTCACGACGCCCGATGTAC 344 499 CTAGAGGCTGTGAAGGGCCTTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAGCAGCGACAC 548 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 345 CAAGAGGCTGTGAAGGGCCTTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAGCAGCGACAT 394 549 GATATCTTACACACTGGCAAGGTAATGTGCATATCTGACGTTACTCGCGG 598 ||*||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||| 395 GACATCTTACACACTGGTAAGGTTATGTGCATATCTGACGTTACTCGCGG 444 599 TAACGGTATTACTCACCGTGTCGGGAAGCGGTTCTGTGTTAAGTCCGTTT 648 ||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*| 445 TAACGGTATTACCCACCGTGTCGGGAAGCGGTTTTGTGTTAAGTCCGTCT 494 649 ACATATTAGGTAAGATATGGATGGACGAGAATATCAAGCTGAAGAACCAC 698 ||||||||||*||*||||||||||||||*||||||*|*|||||||||||| 495 ACATATTAGGCAAAATATGGATGGACGACAATATCCATCTGAAGAACCAC 544 699 ACCAACAGCGTCATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGAAGACCGTATGGAAC 748 |||||||||||*|||||||||||*||||||||*||*|||||||||||||| 545 ACCAACAGCGTTATGTTCTGGCTAGTCAGAGATCGTAGACCGTATGGAAC 594 749 GCCTATGGATTTCGGACAAGTGTTCAACATGTTCGACAATGAGCCTAGCA 798 ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*| 595 GCCTATGGATTTCGGACAAGTGTTTAACATGTTCGACAATGAGCCTAGTA 644 799 CCGCCACTGTTAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCATGCATAGG 848 |||||||*|||||||||||||||*||||||||||*||*|||||||||||| 645 CCGCCACAGTTAAGAACGATCTTGGTGATCGTTACCAAGTCATGCATAGG 694 849 TTCTATGGCAAGGTGACAGGTGGACAGTATGCCAGCAACGAGCATGCTAT 898 |||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||| 695 TTCTATGGCAAAGTGACAGGCGGACAGTATGCCAGCAACGAGCAGGCTAT 744 899 TGTGAGGCGTTTCTGGAAGGTCAACAACCACGTTGTTTACAACCACCAGG 948 |||*|||||*|||||||||||||||||||||||*||*|||||*||*|||| 745 TGTCAGGCGGTTCTGGAAGGTCAACAACCACGTGGTCTACAATCATCAGG 794 949 AAGCTGGCAAATACGAGAATCATACTGAGAACGCCCTATTATTGTACATG 998 ||||||||||*||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||| 795 AAGCTGGCAAGTACGAGAACCATACCGAGAACGCCCTATTATTGTACATG 844 999 GCATGTACTCATGCCTCAAATCCTGTATATGCAACACTTAAGATTCGGAT 1048 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||| 845 GCATGTACTCATGCCTCAAACCCTGTATATGCAACGCTTAAGATTCGGAT 894 1049 CTATTTTTATGATTCGATCTTAAATTAATAAAATTTATATTTTATTGAAT 1098 *|||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||| 895 ATATTTTTATGATTCGATCTTAAATTAATAAAATTTTAATTTTATTGAAT 944 1099 GATTTTCCAGTACATAATTTACATATGATCTATCTGTTGCAAAACGAACA 1148 |||||||*||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 945 GATTTTCAAGTACATAATTTACATATGATCGATCTGTTGCAAAACGAACA 994 1149 GATCTAATTACATTGTTAATTGAAATGACACCTAACCGGTCTAAGTACAG 1198 |*|*||||*|||||||||||||||||*||*||||||*|*|*||||||||| 995 GCTTTAATGACATTGTTAATTGAAATAACCCCTAACTGATTTAAGTACAG 1044 1199 AAGAACTAATTGTCTAAATCTAGCTAAATAATTCGACCCAGAAGCTGTCA 1248 *||*||||||||||||||*||||||||||||*|||||||||||||||||| 1045 CAGTACTAATTGTCTAAACCTAGCTAAATAAGTCGACCCAGAAGCTGTCA 1094 1249 TCGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGTATGCTTTGTGGAGATCCAAT 1298 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||* 1095 TCGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGTAGGCTTTGTGGAGATCCAAC 1144 1299 GCTCTCCTGAGGTTGTGGTTGAACCGGATTTGGACGCTGTATATCCTGGT 1348 |||*|||||||||||||*||||||||||*||||||||||||||||||||| 1145 GCTTTCCTGAGGTTGTGATTGAACCGGACTTGGACGCTGTATATCCTGGT 1194 1349 CCTGGTGTATTGCATGTCCTCTACTTGGTTTATCTTGAAATAGAGGGGAT 1398 ||||||||||*|*|*||||||||||*||||||||||||||||*||||||| 1195 CCTGGTGTATAGTACGTCCTCTACTCGGTTTATCTTGAAATACAGGGGAT 1244 1399 TTTCTATCTCCCAGATAAACACGCCATTCTCTGCCTGACGTGCAGTGATG 1448 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1245 TTTCTATCTCCCAGGTAAACACGCCATTCTCTGCCTGACGTGCAGTGATG 1294 1449 AGCTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCTGCGCAGTCTATGTGGAAGTATA 1498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1295 AGCTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCTGCGCAGTCTATGTGGAAGTATA 1344 1499 TGGAGCAACCGCAGTCTAAGTCAATGCGTCTCCTCCTGATTGCCCTCTTC 1548 |||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||||||*|* 1345 TGGAGCAACCGCAATCTAAGTCAATGCGTCTCCTCCTGATGGCCCTCCTT 1394 1549 TTTGCTTGCCTGTGTGCCTTCTTGATAGAGGGGGGCTGTGATGGTGATGA 1598 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1395 TTTGCTTGCCTGTGCGCCTTCTTGATAGAGGGGGGCTGTGAGGGTGATGA 1444 1599 AGACCGCATTCTTTAGAGTCCAGTTTTTGAGAGACGCATTTTCGTCTTTG 1648 |||*|||||||||*||||||||**|||||||||||||||||||****||* 1445 AGAGCGCATTCTTCAGAGTCCAAGTTTTGAGAGACGCATTTTCTATCTTA 1494 1649 TCGAGGAAAGCTTTATAGCTGGAACCCTCACCAGGATTGCAGAGCACGAT 1698 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||* 1495 TCGAGGAAAGCTTTATAGCTGGAACCCTCTCCAGGATTGCAGAGCACGAC 1544 1699 TGATGGGATACCGCCTTTAATTTGAACAGGCTTTCCGTACTTACAATTTG 1748 ||||||*||*||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1545 TGATGGAATCCCTCCTTTAATTTGAACAGGCTTTCCGTACTTGCAATTTG 1594 1749 ATTGCCAATCCCTTTGGGCCCCAAGCAGTTCTTTCCAGTGCTTTAGCTTT 1798 |||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1595 ATTGCCAATCCTTTTGGGCCCCAAGGAGTTCTTTCCAGTGCTTTAGCTTT 1644 1799 AGATATTGCGGTGCGACGTCATCAATGACGTTATACTCCACTTCATTCGA 1848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1645 AGATATTGCGGTGCGACGTCATCAATGACGTTATATTCCACTTCATTCGA 1694 1849 ATAGACCCTGGGATTGAAATCAAGATGACCGCTCAAGTAATTATGTGGGC 1898 |||||||||*|*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1695 ATAGACCCTAGAATTGAAATCCAGATGACCGCTCAAGTAATTATGTGGGC 1744 1899 CTAAGACTCGCGCCCACATCGTCTTGCCTCTTCGAGAATCACCTTCAATT 1948 |||||||*|**|||||||||||||||||**|||||||*|||||*|||||| 1745 CTAAGACCCTTGCCCACATCGTCTTGCCCGTTCGAGAGTCACCCTCAATT 1794 1949 ATAATACTAATAGGTCTTTCTGGGCGCGCCGCACTACTCTTTCCGAAATA 1998 ||*||||||||||||||*|||||*|||||**|***||*|*||||*||||| 1795 ATGATACTAATAGGTCTATCTGGCCGCGCAACGGCACCCCTTCCAAAATA 1844 1999 ACCATCTGCCCACTCTTGCATCTCGTCGGGAACGTTAGTGAAAGAGGAGA 2048 **|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1845 TTCATCTGCCCACTCTTGCATCTCGTCGGGAACGTTAGTGAAAGATGAGA 1894 2049 GTGGAAACGGAGGAGCCCATGTCTCTGGAGCCTTCATGAAAATCCTATCG 2098 |||||||||||||||||||*|*||*|||||||||||||||||||||*||| 1895 GTGGAAACGGAGGAGCCCACGGCTTTGGAGCCTTCATGAAAATCCTGTCG 1944 2099 AGGTTACAGGATAGGTTATGATACTGAAAAAGAAACTTTTCCGGCAACTT 2148 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1945 AGGTTACTGGATAGGTTATGATACTGAAAAAGAAACTTTTCCGGCAACTT 1994 2149 CTCTTTAATGATTTTCATGGCTGCTTCCTTTGTTCCAGAGTTTAGTGCCT 2198 ||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||| 1995 CTCTTTTATGATTTTCATGGCTTCTTCCTTTGTTCCAGAGTTTAATGCCT 2044 2199 CGGCAGCTGCGTCGTTAACTGTCTGCTGGCCCCCTCGAGCACTTCTTCCG 2248 ||||||||||||||||***|||||||||*||*|||||||||||||||||| 2045 CGGCAGCTGCGTCGTTTGATGTCTGCTGTCCGCCTCGAGCACTTCTTCCG 2094 2249 TCAATCTGGAACAAACCCCATTCGATGGTGTCTCCGTCTTTCTCGACATA 2298 ||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||||||||||||||*|| 2095 TCAATCTGGAACAATCCCCATTCGATAGTGTCCCCGTCTTTCTCGACGTA 2144 2299 CGACTTGACATCGGAGCTCGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAAT 2348 *||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2145 GGATTTGACATCGGAGCTCGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAAT 2194 2349 GTGTTGACCTGGTTGGGGACACCAGATCGAACAGTCTGTTATTTGTGCAG 2398 |||||||||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2195 GTGTTGACCAGGTCGGGGACACCAGATCGAACAGTCTGTTATTTGTGCAG 2244 2399 TTGTATTTGCCTTCGAACTGGATAAGAACGTGGAGATGAGGTTCCCCATT 2448 |||*||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2245 TTGAATTTCCCTTCGAACTGGATAAGAACGTGGAGATGAGGTTCCCCATT 2294 2449 CTCGTGAAGTTCTCTGCAAATCTTGATGAATTTCTTGTTGACTGGGATAG 2498 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||* 2295 CTCGTGAAGTTCTCTGCAGATCTTGATGAATTTCTTATTGACTGGGATAT 2344 2499 TTAGGTTTTGAAGTTGGGAAAGTGCTTCTTCTTTGCTAATAGAGCATTGA 2548 ||||||||||*|*||||||||||||*||*||||||||||*||||||*||| 2345 TTAGGTTTTGGATTTGGGAAAGTGCATCCTCTTTGCTAAGAGAGCAATGA 2394 2549 GGATACGTAAGGAAATAATTTTTGGCTTTAATAGAGAACGAACCC----- 2593 |||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||*||*||****** 2395 GGATATGTAAGGAAATAATTTTTGGCTTTTATAGAGAAGGAGCCTTTTCG 2444 -------------------------------------------------- ************************************************** 2445 GGGCATTTTGGTAAAAATGTATGTTCCCCCAATATGTTCCCCCAATAGCT 2494 -------------------------------------------------- ************************************************** 2495 CTGGCTCTCAAAACTCCTATGAATTGGGGGAACTGGGGGAACTTATATAG 2544 -------------------------------------------------- ************************************************** 2545 TAGAAGTTCCTAAAGGCAGATCAACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATAT 2594 - * 2595 T 2595