NC_001468 AY211886 1 CTCAACTGGAGACACACTTGAGCATCTCCTCCTATTAATTGGAGACATTA 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 TATAGGTGTCTCTAAAGGGCATTCTTGTAATAAGTTGAACTTTAATTTCA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 AATAAAAGGCTCAAAAGGCTCAGAACACCCAAGGGGCCAACCGTATAATA 150 *********************************************||||| 1 ---------------------------------------------TAATA 5 151 TTACCGGTTGGCCCCGCCCCTTTTGAAATGTGGACCCCGCGCACTGGTTG 200 ||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||*||||| 6 TTACCGGTTGGCCCCGCCCCTTTTTAAATGTGGTCCCCGCGCACCGGTTG 55 201 GCTTCGTCTCCATTTGAAAGTGGGTCCCCATC---TTTTTCTCTTTCCTG 247 ||**||*||***|||*|||||||||||||*||***|**|||*|||||*|| 56 GCCCCGCCTTGCTTT-AAAGTGGGTCCCCCTCACGTGCTTCGCTTTCTTG 104 248 CAGATACAACGGTGGTCCCCGCATATAGATGTTGTCAGCTATGGATATTG 297 ||||||**|*||||||||||||||**||*|||||||*||||||||||||| 105 CAGATATGATGGTGGTCCCCGCATGCAGGTGTTGTCDGCTATGGATATTG 154 298 CATGTGTGGCCCACATGCAAATAAATAATCTGCGGGCCAATCGAATGACA 347 ||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||| 155 CATGTGTGTCCCACATGCAAATAAATGATCTGCGGGCCTATCGAATGACA 204 348 GCTTGTGATACTAAATTATATTTAGTATATTGTTCATGGCTCTGAGTGTA 397 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||**|||*||*|*|| 205 GCTTGTGCTACTAAATTATATTTAGTATATTGTTCATTCCTCGGAATATA 254 398 ATAAAAGGATATATGTTAGTTAAC-GTTTAATATTAGCCATTCGATATTA 446 ||||||*|*|||||*|||*|||||*||||||||||||||||||||||||| 255 ATAAAATGGTATATTTTATTTAACTGTTTAATATTAGCCATTCGATATTA 304 447 TTGATTGATAGTCGTCAATCTGACAACGACCATTAAGGACAATTAAGGCC 496 *|||||*||||||*|||||||||||||||||||*|||||||||||||||* 305 GTGATTTATAGTCATCAATCTGACAACGACCATAAAGGACAATTAAGGCB 354 497 AGTAGCGTAATTGTTTATGTATTATATATAGGGTGCGAA-ATACAGGAGT 545 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||*|||||||||| 355 AGTAGCGTAATTGTTTATGTATTATATATAGGGTTCTAACATACAGGAGT 404 546 TGGAGAATATCATTTATTGGAAGTATATACATTACGTTGTAATGTATAGT 595 |*||||||||||*||||*||||*||||||||||***|||||||||||||| 405 TTGAGAATATCAGTTATCGGAAATATATACATTGATTTGTAATGTATAGT 454 596 ATCAGGAAGCAGTCTAGAAATCTCCAAAGGAAATGGAACAGCAATATCAC 645 |||||||||||||||||||||*|*||||||||||**||||||||||*||| 455 ATCAGGAAGCAGTCTAGAAATTTGCAAAGGAAATATAACAGCAATACCAC 504 646 TAACAGGTATCCAATTAAGCGTAAGTATGTTGCCGGGCATACGAGACCAT 695 ||||||||||||*||*|**||||||||||||||*||||||||*||||||| 505 TAACAGGTATCCCATCAGACGTAAGTATGTTGCTGGGCATACTAGACCAT 554 696 GTGTTAGGCGAAGATTGTTATATGAGCCAGTGGAGAGACCGTTTGGCCAT 745 ||||||||||||||||||*|*||||||||||||||||||||||*|**||| 555 GTGTTAGGCGAAGATTGTCAAATGAGCCAGTGGAGAGACCGTTGGTTCAT 604 746 AATGTTTTGTGTGAGAAGCAACATGGTGATGTGTTTAATTTGCAGCAGAA 795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 605 AATGTTTTGTGTGAGAAGCAACATGGTGATGTGTTTAATTTGCAGCAGAA 654 796 CACAAGTTACACGTCGTTTGTGACGTATCCTTCCAGGGGACCATCTGGTG 845 |||||||||||||||*|||||||||||||||*||||||||*||||||||| 655 CACAAGTTACACGTCATTTGTGACGTATCCTGCCAGGGGATCATCTGGTG 704 846 ATGGGCGTAGTAGGGATTACATCAAGTTGCAAAGTATGTCTGTTTCGGGA 895 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 705 ATGGGCGTAGTCGGGATTACATCAAGTTGCAAAGTATGTCTGTTTCGGGA 754 896 GTGATACATGCGAAGGCTAATGGCAATGATGATCCTATGGAGGTGTCGCC 945 ||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||* 755 GTGATACATGCGAAGGCTGATGGCAATGATGATCCTATGGAGTTGTCGCA 804 946 TGTGGTTAATGGAGTGTTCCTGTTTAGCTTAATCATGGATACAAAGCCTT 995 *||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||*||||||||*| 805 AGTGGTTAATGGAGTGTTCGTGTTTAGCTTAATCATGGACACAAAGCCGT 854 996 ATTTACCGGCTGGTGTTCAAGCTCTTCCCACATTTGAAGAGTTGTTCGGA 1045 |||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||*|||||||| 855 ATTTACCTGCTGGTGTTCAAGCTCTTCCTACATTTGAAGAGCTGTTCGGA 904 1046 CCATATTCCGCTTGTTACGTTAATTTAAGATTATTGAATAATCAACAGCA 1095 |||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 905 CCATATTCCGCCTGTTACGTTAACTTAAGATTATTGAATAATCAACAGCA 954 1096 TCGATATAGGGTATTGCACAGCGTGAAACGATTCGTTTCATCTTCAGGAG 1145 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||| 955 TCGATATAGGGTATTGCACAGCGTGAAACGTTTCGTTTCATCGTCAGGAG 1004 1146 ATACTAAGGTATCTCAATTTAGGTTTAATAAGCGATTGAGCACCAGGCGA 1195 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1005 ATACTAAGGTATCGCAATTTAGGTTTAATAAGCGATTGAGCACCAGGCGA 1054 1196 TATACTATATGGGCATCATTCCATGATGGGGATCTGGTAAATGCAGGTGG 1245 |||||*||*|||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1055 TATACGATTTGGGCATCATTCCATGATGTGGATCTGGTAAATGCAGGTGG 1104 1246 AAATTATAGGAACATAAGCAAGAATGCTATTCTTGTCAGTTATGCTTTTG 1295 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1105 AAATTATAGGAACATAAGCAAGAATGCTATTCTAGTCAGTTATGCTTTTG 1154 1296 TATCAGAGCATGCAATGTCTTGTAAGCCATTTGTACAAATAGAAACATCC 1345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1155 TATCAGAGCATGCAATGTCTTGTAAGCCATTTGTACAAATAGAAACATCC 1204 1346 TATGTGGGATGATTTATTATTTATAAATCTTTATGGCTACTACCTCTATG 1395 |||||*|||||||||||||*|*|||||||||||||||||||*|||||||| 1205 TATGTTGGATGATTTATTAATCATAAATCTTTATGGCTACTGCCTCTATG 1254 1396 TGCTATTAAGCACTTGTTTACAGTTTGTTCTATAATGCTTTCAATGTCCT 1445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1255 TGCTATTAAGCACTTGTTTACAGTTTGTTCTATAATGCTTTCAATGTCCT 1304 1446 TTTTCGACATGGACTGGGTTTGAGAAATTGAGTCCCCTGGATCTAGGGAA 1495 |||||||||||||*||||||||*||||**||||||||||||||||||||| 1305 TTTTCGACATGGATTGGGTTTGTGAAACGGAGTCCCCTGGATCTAGGGAA 1354 1496 GCTTCAGGTAGCTGGTGTAGCCCTCTAAGTGGGAATTCAGCCTCAGAGGT 1545 ||||||||||||*|||||||*|||||||||||||||||*||||||||||* 1355 GCTTCAGGTAGCCGGTGTAGTCCTCTAAGTGGGAATTCTGCCTCAGAGGC 1404 1546 ATACTGCTTGGAGGATGAGTCGTCGATGTCAATTGGGTTTGGTCTTGTGT 1595 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||*|*|||*|*||||| 1405 ATACTGCTTGGAGGATGAGGCGTCGATGTCAATTGGTTGTGGGCCTGTGT 1454 1596 ATCTCATGCTTGTATAGCGCCCAATTGTGGATTTTGTAGCCCATGTTTCT 1645 |||*||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1455 ATCGCATGCTTGTAGAGCGCCCAATTGTGGATTTTGTAGCCCATGTTTCT 1504 1646 CCTGGTTGGACCGTGATGGGCCTATATTTAGGCCCAGTGTCATAATCTGT 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1505 CCTGGTTGGACCGTGATGGGCCTATATTTAGGCCCAGTGTCATAATCAGT 1554 1696 GCCGGGCTCATTTTGAATGAGCCTTCGAATGGGCTTAGGTTTTCCAACGG 1745 ||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1555 GCCGGGCTCATTCTGAATGAGTCTTCGAATGGGCTTAGGTTTTCCAACGG 1604 1746 ACCAGAAGTCGACACAGTCAGGCCCATAGTCTTTGGATAGTATTTTTATA 1795 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1605 ACCAGAAGTCGACACAGTCAGGCCCATAGTCTTTTGATAGTATTTTTATA 1654 1796 GTGGGCTGTTTAAATTTAATGTCCGTTGAATGTTTGGCAGCTGACAGCTT 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1655 GTGGGCTGTTTAAATTTAATGTCCGTTGAATGTTTGGCAGCTGACAGCTT 1704 1846 AAGTTTTGCCTTAATTTGGGCAAATGTGATTCCATTCTTTACGTTTGAGT 1895 *|||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||*| 1705 CAGTTTTGCCTTAATTTGGGCAAATGTGATACCATTTTTTACGTTTGAAT 1754 1896 CTTCAACCTTATACAGCAGCTGCCATGGTACGTTATCATCAATTGAAAAG 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1755 CTTCAACCTTATACAGCAGCTGCCATGGTACGTTATCATCAATTGAAAAG 1804 1946 TATGATGCAGAGAAATAATGGAGGTCCACATTACACCCTATGGGAAATGT 1995 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1805 TATGATGCAGAGAAATAATGGAGATCCACATTACACCCTATGGGAAATGT 1854 1996 GAACTGGGCTTGATCCTGTTGCTCATCACTGAGTCTAGTGTCCCTAATGG 2045 |||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||*||||| 1855 GAATTGGGCTTGATCCTGTTGCTCATCACTGAGCCTAGTGTCCCGAATGG 1904 2046 TAACAATAACAGAACCTTGTGCATTAAAGGGCACTTGATTCCTGTACTCA 2095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1905 TAACAATAACAGAACCTTGTGCATTAAAGGGCACCTGATTCCTGTACTCA 1954 2096 ATGACTACATGGTCTACCTTCATGCATTTGCCCATGATACGTACCCTTGT 2145 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1955 ATGACGACATGGTCTACCTTCATGCATTTGCCCATGATACGTACCCTTGT 2004 2146 TCTCTCAAGGGTCGAAGGAAATTGAAGTGTAATCGGCGATTCATCATTCG 2195 ||**|||||||||||||||||||||||*||||||*||||||||||||||| 2005 TCGTTCAAGGGTCGAAGGAAATTGAAGCGTAATCSGCGATTCATCATTCG 2054 2196 TCAGTTTGTATTCTGTTCTTGCGGAGTGAATATAATCGCTGGATATGACA 2245 |||**|||||||||||||||||*||*||||||||*||||||||||||||| 2055 TCAAGTTGTATTCTGTTCTTGCCGATTGAATATAGTCGCTGGATATGACA 2104 2246 GGTACAGATGTATCCATGTTCAACACTTTGAGTATAAGCTTGTCAAAGGC 2295 ||||||||||||||||||||*||||||||||*|||||*|||||||||||| 2105 GGTACAGATGTATCCATGTTTAACACTTTGATTATAATCTTGTCAAAGGC 2154 2296 ACAACACCTGTCTCATGAGAAACATGATTAATCTATTGTAAAACTGGCCG 2345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2155 ACAACACCTGTCTCATGAGAAACATGATTAATCTATTGTAAAACTGGCCG 2204 2346 CGCAGCGGAATGGGTTTAATTCAAGATAAATCAGAAGATTTTGTCAACAG 2395 |||||||||||||*||*|||||||||*|||||||||*||||||||||||| 2205 CGCAGCGGAATGGCTTAAATTCAAGACAAATCAGAACATTTTGTCAACAG 2254 2396 GATAAACAGAGTGTCGAAATATAGACATATATTTCTTATCCTATCGGAAA 2445 ||*|||*|||||||*||||||||||||||||||||*|||||||*|||||| 2255 GAGAAAGAGAGTGTAGAAATATAGACATATATTTCGTATCCTACCGGAAA 2304 2446 AATGCTTCTACGTGTAATCCAATTCAAACATA-AGTATATGCATACA-CA 2493 |||||*|*||*||*||||||||||||||||||*||||||||||||||*|| 2305 AATGCGTTTATGTTTAATCCAATTCAAACATATAGTATATGCATACAGCA 2354 2494 TTAGTCGATGAAACATTATATATTTAGAGATATGTACCTTACAATAACTT 2543 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||*|||||||* 2355 TTAGTCGATGAAACATTATTTATTTAGAGATATGTACCTTATAATAACTG 2404 2544 GAATTGGATATCCT-CTGGAGTGGAATGTGGAT-GGTCTTATTATCAAAG 2591 ||*|||||||||*|*||||||||||||||||||*|||||||||||||||* 2405 GATTTGGATATCTTTCTGGAGTGGAATGTGGATAGGTCTTATTATCAAAT 2454 2592 TGGTCATATAAATATGTTTTATATATTTATTAAGGAGTTATCCAACGAGT 2641 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2455 TGGTCATATAAATATGGTTTATATATTTATTAAGGAGTTATCCAACGAGT 2504 2642 GATAGTTTACGTTGTTAGATTTGCATGTTCAAATCTAAAATAAGCAATTA 2691 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 2505 GATAGTTTACGTTGTTAGATTTGCATGTTCAAATCTAAAATAATCAATTA 2554 2692 CATTATAGTGAGAGAAAGTTAGAGAGAGACGCT----------------- 2724 |||||||||||||||||||||||||||||||||***************** 2555 CATTATAGTGAGAGAAAGTTAGAGAGAGACGCTCTCAACTGGAGACACAC 2604 -------------------------------------------------- ************************************************** 2605 TTGAGCATCTCCTCCTGTTAATTGGAGACATTATATAGTTGTCTCCAAAT 2654 -------------------------------------------------- ************************************************** 2655 GGCATTCTCGTAATAAGTGGAACTTTAATTTGAATGAAAAGGCTCAAAAG 2704 --------------------------- *************************** 2705 GCTCAAACACCCAAGGGGCCAACCGTA 2731