NC_001467 AY211885 1 CTCAACTAGAGACACTCTTGAGCATCTCCTCCTATTAATTGGAGACATTA 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 TATAGGTGTCTCTAAATGGCATTCTTGTAATAAGTTGAACTTTAATTTGA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 ATTAAAAGGCTCAAAAGGCTCAGAACACCCAAGGGGCCAACCGTATAATA 150 *********************************************||||| 1 ---------------------------------------------TAATA 5 151 TTACCGGTTGGCCCCGCCCCCTTT--AATGTGGTCCCCGCGCACTACTTA 198 |||||||||||||||||||||*||**||*||||||||||||||||||*|| 6 TTACCGGTTGGCCCCGCCCCCCTTTAAACGTGGTCCCCGCGCACTACGTA 55 199 TGTCGGCCAATCATGATGTAGCTTTAAAGGTTATGTATTAGTGGTGGGCC 248 |||||||||||||||*||||||*|||||||||||*||||||||||||*|| 56 TGTCGGCCAATCATGCTGTAGCGTTAAAGGTTATTTATTAGTGGTGGACC 105 249 ACTATATACTTGCAGGCGAAGTTGTGGCTAGTGCGCAATGTGGGATCCAC 298 |||||||||||*|||||||||||||*||||||||||||||*||||||||| 106 ACTATATACTTACAGGCGAAGTTGTTGCTAGTGCGCAATG-GGGATCCAC 154 299 TGGTGAATGAGTTTCCAGACTCGGTGCATGGGCTTAGGTGTATGCTGGCA 348 ||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||| 155 TGGTGAATGAGTTTCCTGACTCGGTGCATGGGCTTAGGTGTATGCTTGCA 204 349 ATTAAATATTTGCAGGCCTTAGAGGATACATACGAGCCCAGTACGTTGGG 398 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||| 205 ATTAAATATTTGCAGGCCTTAGAGGATACATACGAGCCCAGTACTCTGGG 254 399 CCACGAACTGGTGAGGGATCTAGTCTCAGTTATCAGGGCTCGTAATTATG 448 ||||||*|||||*||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||| 255 CCACGATCTGGTTAGAGATTTAGTCTCAGTTATCAGGGCTCGTAATTATG 304 449 TCGAAGCGACCAGGAGATATCATCATTTCCACTCCAGGATCCAAGGTTCG 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 305 TCGAAGCGACCAGGAGATATCATCATTTCCACTCCAGGCTCCAAGGTTCG 354 499 TCGAAGACTGAACTTCGACAGCCCATACAGGAACCGTGCTACTGCCCCCA 548 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 355 TCGAAGGCTGAACTTCGACAGCCCATACAGGAACCGTGCTACTGCCCCCA 404 549 CTGTCCACGTCACAAATCGAAAACGGGCCTGGGTGAACAGGCCCATGTAC 598 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 405 CTGTCCACGTCACAAATCGAAAACGGGCCTGGATGAACAGGCCCATGTAC 454 599 AGAAAGCCCACGATGTACAGGATGTATAGAAGCCCAGACATACCTAGGGG 648 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 455 AGAAAGCCCATGATGTACAGGATGTATAGAAGCCCAGACATACCCAGGGG 504 649 CTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCGTTTGAGCAGAGGGATGATGTGA 698 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 505 CTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCGTTTGAGCAGAGGGATGATGTTA 554 699 AGCACCTTGGTATCTGTAAGGTGATTAGTGATGTGACGCGTGGGCCTGGG 748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 555 AGCACCTTGGTATCTGTAAGGTGATTAGTGATGTGACACGTGGGCCTGGG 604 749 CTGACACACAGGGTCGGAAAGAGGTTTTGTATCAAGTCCATTTACATTCT 798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 605 CTGACACACAGGGTCGGAAAGAGGTTTTGTATCAAGTCCGTTTACATTCT 654 799 TGGTAAGATCTGGCTGGATGAAACTATTAAGAAGCAAAATCACACTAATA 848 |||||||||||||*|||||||||*||||||||||||*||||||||||||| 655 TGGTAAGATCTGGATGGATGAAAATATTAAGAAGCAGAATCACACTAATA 704 849 ATGTGATTTTTTACCTGCTTAGGGATAGAAGGCCGTATGGCAATGCGCCC 898 |||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||||| 705 ATGTGATGTTTTACCTGCTTAGGGATAGAAGGCCTTATGGCAATACGCCC 754 899 CAAGACTTCGGGCAGATATTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGTACTGC 948 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 755 CAAGACTTTGGGCAGATATTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGTACTGC 804 949 AACAATTAAGAACGATTTGAGGGATAGGTTTCAGGTGTTGAGGAAATTTC 998 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 805 AACAATTAAGAACGATTTGAGGGATAGGTTTCAGGTGTTGAGGAAATTTC 854 999 ATGCCACTGTTGTTGGTGGTCCATATGGCATGAAGGAGCAGGCGTTGGTG 1048 |||||||||||*||||||||||||*||||||||||||||||||*|||||| 855 ATGCCACTGTTATTGGTGGTCCATCTGGCATGAAGGAGCAGGCTTTGGTG 904 1049 AAAAGGTTTTACAGGTTGAATCATCACGTGACATACAATCATCAGGAGGC 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 905 AAAAGGTTTTACAGGTTGAATCATCACGTGACATATAATCATCAGGAGGC 954 1099 AGGGAAGTATGAGAATCACACAGAGAATG-CTTTGCTTCTGTACATGGCA 1147 ||||||||||||||||||||||||*||||*|*||||||*||||||||||| 955 AGGGAAGTATGAGAATCACACAGAAAATGGCGTTGCTTTTGTACATGGCA 1004 1148 TGTACTCATGCCTCCAATCC-TGTATATGCGACGTTGAAAATACGTATAT 1196 |||||||||||||*|||*||*|||||||||*||||****||||||||||| 1005 TGTACTCATGCCTTCAAACCCTGTATATGCTACGTG---AATACGTATAT 1051 1197 ACTT-CTATGACAGTATTGGCAATTAATAAACATTG-------------- 1231 ||||*||||||||||||||||||||||||||*||||************** 1052 ACTTTCTATGACAGTATTGGCAATTAATAAATATTGGATTTTTATTTTCA 1101 1232 ----------AATTTTATTTCATGAGTCAACTTGCACTCAATAGTGTTGG 1271 **********||||||||||||||||||||||**|||||||||||*||** 1102 TGAAGTCAAGAATTTTATTTCATGAGTCAACTGACACTCAATAGTTTTTT 1151 1272 CAATTACATTGAACAAAACATGATCAGCAGCTCTAATTACATTGTTAATT 1321 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||| 1152 CAATTACATTGAACAAAACATGATCAGCAGCTCTAATTACRTSGTTAATT 1201 1322 GAGATAACACCTATATTATCCAAGTATTTAATTACTTGGTATCTAAAGAC 1371 |||||||||||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1202 GAGATAACACCTATAATATCCAAGTATTTAAGTACTTGGTATCTAAAGAC 1251 1372 CCTTAAGAAAAGACCAGTCTGAGGCTGTAAGGTTGTCCAGATCTGGAAGT 1421 ||||||||||*|||||||||||||||*|||||**|||||||*|**||||| 1252 CCTTAAGAAACGACCAGTCTGAGGCTTTAAGGGCGTCCAGAACCTGAAGT 1301 1422 TGAGAAAACATTTGTGAATCCCCAGCTCCTTCCTCAGGTTGTGATTGAAT 1471 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1302 TGAGAAAACATTTGTGAATCCCCAGCTCCTTCCGCAGGTTGTGATTGAAT 1351 1472 CGAACCTGGACTGTTATGATGTCCTGGTTCAGCAGGAATGGTCGTTGTTG 1521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1352 CGAACCTGGACTGTTATGATGTCCTGGTTCAGCAGGAATGGTCGTTGTTG 1401 1522 GTGCCTGGTGATTGTGAAATACAGGGGATTGTTTATTTCCCAGGTATACA 1571 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1402 GTGCCTGGTTATTGTGAAATACAGGGGATTGTTTATTTCCCAGGTATACA 1451 1572 CGCCATTCATTGCTTGAGGAGCAGTGATGACTTCCCCTGTGCGTAAATCC 1621 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1452 CGCCATTCATTGCTTGAGGAGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTAAATCC 1501 1622 ATGATTGAAGCAGTTGATATGGAGGTAATATGAACATCCACAGACAAGAT 1671 |||||||*||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1502 ATGATTGGAGCAGTTGATATGGAGGTAATATGAACAGCCACAGACAAGAT 1551 1672 CCACTCTCCTACGCCGGATGGCTCGCTTCTTGACTTGTCTGTGAGTGACT 1721 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||*||||| 1552 CCACTCTCCTACGCCGGATGGCTCGCTTCTTGAATTGTCTGTGACTGACT 1601 1722 TTGATTGGAACCTGAGTAGAGTGGTTCTGTGAGGGTGATGAAGATTGCAT 1771 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1602 TTGATTGGAACCTGAGTAGAGTGGTTCTGTGAGGGTGATGAAGATTGCAT 1651 1772 TCTTTAATGCCCAGGCCTTTAGCGCTTCTTGCTTTTCCTCGGCTAGGAAC 1821 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1652 TCTTTAATGCCCAGGCCTTTAGCGCTTCTTGCTTTTCCTCGTCTAGGAAC 1701 1822 TCTTTATAGGACGAGGTAGGTCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAAT 1871 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1702 TCTTTATAGGACGAGGTTGGTCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAAT 1751 1872 TCCACCTTTAATTTGAACGGGTTTCCCGTATTTCGTGTTGGACTGCCAGT 1921 *||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1752 GCCACCTTTAATTTGAACGGGTTTCCCGTATTTTGTGTTGGACTGCCAGT 1801 1922 CCCTCTGGGACCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGGTAGTGGGGATCG 1971 |||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1802 CCCGCTRGGACCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGGTAGTGAGGATCG 1851 1972 ACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCAGCATTATTGAAGACCTTTGGACT 2021 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||| 1852 ACGTCATCAATGACGTTGTACCAAGCAGCATTATTRAAGACCTTTGGACT 1901 2022 AAGGTCCAGGTGTCCACACAGGTAATTATGTGGGCCTAAAGATCTGGCCC 2071 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1902 AAGGTCCAGGTGTCCACACAGGTAATTGTGTGGGCCTAAAGATCTGGCCC 1951 2072 ATATCGTCTTCCCTGTTCTGCTATCACCTTCTATGACAATACTATTAGGT 2121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 1952 ATATCGTCTTCCCTGTTCTGCTATCACCTTCTATGACAATACTATTGGGT 2001 2122 CTCCATGGCCGCGCAGCGGAATCCCTAACATTATCAGCGACCCATTCTTC 2171 |||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||||||||||||| 2002 CTCCATGGCCGCGCAGCGGAAGCCCGAACATTATCAGCGACCCATTCTTC 2051 2172 AATTTCAACAGGAACTTGGTCAAAGGAAGAACATGGGAAGGGAGAAACAT 2221 ||*||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 2052 AAGTTCATCAGGAACTTGGTCAAAGGAAGAACATGGGAAGGGAGAAATAT 2101 2222 AAGGAGCTGGTGGCTCTTGGAAAATCCTATCTAAATTACTATTTAGATTA 2271 ||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||| 2102 AAGGAGCTGGTGGCTCCTGGAAAATCCTTTCTAAATTACTATTTAGATTA 2151 2272 TGAAACTGAAGTACAAAGTCCTTTGGGACTAATTCCCTAATGACATTAAG 2321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2152 TGAAACTGAAGTACAAAGTCCTTTGGGACTAATTCCCTAATGACATTAAG 2201 2322 AGCTTCTGACTTACTGCCGCTGTTAAGCGCTTTGGCGTAAGCATCATTCG 2371 |||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 2202 AGCYTCTGACTTACTGCCGCTGTTAAGCGCTTTGGCGTAAGCATCATTTG 2251 2372 CTGATTGTTGACCGCCTCTAGCAGATCGTCCATCGATTTGAAATTGTCCC 2421 |*||*||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 2252 CGGACTGTTGACCGCCTCTAGCAGATCGTCCATCGATCTGAAATTGTCCC 2301 2422 CATTCGACGGTGTCGCCGTCCTTATCCAGATAGGACTTGACATCCGAGCT 2471 |||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||*||||| 2302 CATTCGACGGTGTCGCCGTCCTTATCCAGGTATGACTTGACATCTGAGCT 2351 2472 TGATTTGGCACCTTGAATGTTGGGGTGGAAACTGGTGCTACAGCTTGGGT 2521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2352 TGATTTGGCACCTTGAATGTTGGGGTGGAAACTGGTGCTACAGCTTGGGT 2401 2522 GTACACAATCGAAGAGACGATTGTTCGTAATCGTGATTTTACCCTCGAAT 2571 |||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2402 GTAGACAATCGAAGAGACGATTGTTCGTAATCGTGATTTTGCCCTCGAAT 2451 2572 TGAATGAGGGCATGCAAGTGAGGTTCCCCATTCTGATGCAGCTCTCTACA 2621 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 2452 TGGATGAGGGCATGCAAGTGAGGTTCCCCATTCTGATGCAGCTCCCTACA 2501 2622 GATTTTAATGAACTTAGGGTTTGATTGGAGAGAAAGTGTTTGAATGAATG 2671 |||||||||||||||||||||*|||*|||||||*|||||||||||||||| 2502 GATTTTAATGAACTTAGGGTTAGATGGGAGAGAGAGTGTTTGAATGAATG 2551 2672 ACAGTAGGTGTTCTTTGGGTATAGAACACTTTGGGTATGTGAGAAAGACA 2721 ||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2552 ACAGCAGGTGTTCTTTGGGGATAGAACACTTTGGGTATGTGAGAAAGACA 2601 2722 TTCTTGGCTTGAATTCGAAAACGAGGAGTTCTCATGTTGACCAAGTCAAT 2771 |||||||||||||*||*||||||||||||*|||||*|||||||||||||| 2602 TTCTTGGCTTGAACTCTAAAACGAGGAGTCCTCATTTTGACCAAGTCAAT 2651 2772 TGGAGACA------------------------------------------ 2779 ||||||||****************************************** 2652 TGGAGACACTCAACTAGAGACACTCTTGAGCATCTCCTCCTGTTAATTGG 2701 -------------------------------------------------- ************************************************** 2702 AGACATTATATAGTTGTCTCTAAATGGCATTCTTGTAATAAGTGGAACTT 2751 -------------------------------------------------- ************************************************** 2752 TAATTTGAATGAAAAGGCTCAAAAGGCTCAGAACACCCAAGGGGCCAACC 2801 --- *** 2802 GTA 2804