NC_001467 AY211884 1 CTCAACTAGAGACACTCTTGAGCATCTCCTCCTATTAATTGGAGACATTA 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 TATAGGTGTCTCTAAATGGCATTCTTGTAATAAGTTGAACTTTAATTTGA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 ATTAAAAGGCTCAAAAGGCTCAGAACACCCAAGGGGCCAACCGTATAATA 150 *********************************************||||| 1 ---------------------------------------------TAATA 5 151 TTACCGGTTGGCCCCGCCCCC-TTTA-ATGTGGTCCCCGCGCACTACTTA 198 |||||||||||||||||||||*||||*|*|||||||||||||||||||*| 6 TTACCGGTTGGCCCCGCCCCCCTTTAGACGTGGTCCCCGCGCACTACTAA 55 199 TGTCGGCCAATCATGATGTAGCTTTAAAGGTTATGTATTAGTGGTGGGCC 248 |||||||||||||||*||||||*|||||||||||*||||||||||||*|| 56 TGTCGGCCAATCATGCTGTAGCGTTAAAGGTTATTTATTAGTGGTGGACC 105 249 ACTATATACTTGCAGGCGAAGTTGTGGCTAGTGCGCAATGTGGGATCCAC 298 ||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||| 106 ACTATATACTTGCAGGCGAAGTCGTTGCTAGTGCGCAATGTGGGATCCAC 155 299 TGGTGAATGAGTTTCCAGACTCGGTGCATGGGCTTAGGTGTATGCTGGCA 348 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 156 TGGTGAATGAGTTTCCAGACTCGGTGCATGGGCTTAGGTGTATGCTTGCA 205 349 ATTAAATATTTGCAGGCCTTAGAGGATACATACGAGCCCAGTACGTTGGG 398 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 206 ATTAAATATTTGCAGGCCTTAGAGGATACATACGAGCCCAGTACTTTGGG 255 399 CCACGAACTGGTGAGGGATCTAGTCTCAGTTATCAGGGCTCGTAATTATG 448 ||||||*|||||*||*|||*|||||||||||||||||||||||||||||| 256 CCACGATCTGGTTAGAGATTTAGTCTCAGTTATCAGGGCTCGTAATTATG 305 449 TCGAAGCGACCAGGAGATATCATCATTTCCACTCCAGGATCCAAGGTTCG 498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 306 TCGAAGCGACCAGGAGATATCATCATTTCCACTCCAGGCTCCAAGGTTCG 355 499 TCGAAGACTGAACTTCGACAGCCCATACAGGAACCGTGCTACTGCCCCCA 548 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 356 TCGAAGGCTGAACTTCGACAGCCCATACAGGAACCGTGCTACTGCCCCCA 405 549 CTGTCCACGTCACAAATCGAAAACGGGCCTGGGTGAACAGGCCCATGTAC 598 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 406 CTGTCCACGTCACAAATCGAAAACGGGCCTGGATGAACAGGCCCATGTAC 455 599 AGAAAGCCCACGATGTACAGGATGTATAGAAGCCCAGACATACCTAGGGG 648 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 456 AGAAAGCCCATGATGTACAGGATGTATAGAAGCCCAGACATACCTAGGGG 505 649 CTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCGTTTGAGCAGAGGGATGATGTGA 698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 506 CTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCGTTTGAGCAGAGGGATGATGTGA 555 699 AGCACCTTGGTATCTGTAAGGTGATTAGTGATGTGACGCGTGGGCCTGGG 748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 556 AGCACCTTGGTATCTGTAAGGTGATTAGTGATGTGACACGTGGGCCTGGG 605 749 CTGACACACAGGGTCGGAAAGAGGTTTTGTATCAAGTCCATTTACATTCT 798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||*|| 606 CTGACACACAGGGTCGGAAAGAGGTTTTGTATCAAGTCCGTTTACATACT 655 799 TGGTAAGATCTGGCTGGATGAAACTATTAAGAAGCAAAATCACACTAATA 848 |||||||||||||*|||||||||*||||||||||||*||||||||||||| 656 TGGTAAGATCTGGATGGATGAAAATATTAAGAAGCAGAATCACACTAATA 705 849 ATGTGATTTTTTACCTGCTTAGGGATAGAAGGCCGTATGGCAATGCGCCC 898 |||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||||| 706 ATGTGATGTTTTACCTGCTTAGGGATAGAAGGCCTTATGGCAATACGCCC 755 899 CAAGACTTCGGGCAGATATTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGTACTGC 948 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 756 CAAGACTTTGGGCAGATATTTAACATGTTTGATAATGAGCCCAGTACTGC 805 949 AACAATTAAGAACGATTTGAGGGATAGGTTTCAGGTGTTGAGGAAATTTC 998 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 806 AACAATTAAGAACGATTTGAGGGATAGGTTTCAGGTGTTGAGGAAATTTC 855 999 ATGCCACTGTTGTTGGTGGTCCATATGGCATGAAGGAGCAGGCGTTGGTG 1048 |||||||||||*||||||||||||*||||||||||||||||||*|||||| 856 ATGCCACTGTTATTGGTGGTCCATCTGGCATGAAGGAGCAGGCTTTGGTG 905 1049 AAAAGGTTTTACAGGTTGAATCATCACGTGACATACAATCATCAGGAGGC 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 906 AAAAGGTTTTACAGGTTGAATCATCACGTGACATATAATCATCAGGAGGC 955 1099 AGGGAAGTATGAGAATCACACAGAGAATGCTTTGCTTCTGTACATGGCAT 1148 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*|||||||||||| 956 AGGGAAGTATGAGAATCATACAGAGAATGCTTTGCTTTTGTACATGGCAT 1005 1149 GTACTCATGCCTCCAATCCTGTATATGCGACGTTGAAAATACGTATATAC 1198 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1006 GTACTCATGCCTCCAATCCTGTATATGCTACGTTGAAAATACGTATATAC 1055 1199 TTCTATGACAGTATTGGCAATTAATAAACATTGAATTTTATTTCATGAGT 1248 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 1056 TTCTATGACAGTATTGGCAATTAATAAATATTGAATTTTATTTCATGAGT 1105 1249 CAACTTGCACTCAATAGTGTTGGCAATTACATTGAACAAAACATGATCAG 1298 |||||**|||||||||||*||**||||||||||||||||||||||||||| 1106 CAACTGACACTCAATAGTTTTTTCAATTACATTGAACAAAACATGATCAG 1155 1299 CAGCTCTAATTACATTGTTAATTGAGATAACACCTATATTATCCAAGTAT 1348 |||||||||||||*|*||||||||||||||||||||||*||||||||||| 1156 CAGCTCTAATTACGTCGTTAATTGAGATAACACCTATAATATCCAAGTAT 1205 1349 TTAATTACTTGGTATCTAAAGACCCTTAAGAAAAGACCAGTCTGAGGCTG 1398 ||||*||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||* 1206 TTAAGTACTTGGTATCTAAAGACCCTTAAGAAACGACCAGTCTGAGGCTT 1255 1399 TAAGGTTGTCCAGATCTGGAAGTTGAGAAAACATTTGTGAATCCCCAGCT 1448 |||||**|||||||*|**|||||||||||||||||||||||||||||||| 1256 TAAGGGCGTCCAGAACCTGAAGTTGAGAAAACATTTGTGAATCCCCAGCT 1305 1449 CCTTCCTCAGGTTGTGATTGAATCGAACCTGGACTGTTATGATGTCCTGG 1498 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1306 CCTTCCGCAGGTTGTGATTGAATCGAACCTGGACTGTTATGATGTCCTGG 1355 1499 TTCAGCAGGAATGGTCGTTGTTGGTGCCTGGTGATTGTGAAATACAGGGG 1548 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 1356 TTCAGCAGGAATGGTCGTTGTTGGTGCCTGGTTATTGTGAAATACAGGGG 1405 1549 ATTGTTTATTTCCCAGGTATACACGCCATTCATTGCTTGAGGAGCAGTGA 1598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1406 ATTGTTTATTTCCCAGGTATACACGCCATTCATTGCTTGAGGAGCAGTGA 1455 1599 TGACTTCCCCTGTGCGTAAATCCATGATTGAAGCAGTTGATATGGAGGTA 1648 |||*||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1456 TGAGTTCCCCTGTGCGTAAATCCATGATTGGAGCAGTTGATATGGAGGTA 1505 1649 ATATGAACATCCACAGACAAGATCCACTCTCCTACGCCGGATGGCTCGCT 1698 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1506 ATATGAACAGCCACAGACAAGATCCACTCTCCTACGCCGGATGGCTCGCT 1555 1699 TCTTGACTTGTCTGTGAGTGACTTTGATTGGAACCTGAGTAGAGTGGTTC 1748 ||||||*||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1556 TCTTGAATTGTCTGTGACTGACTTTGATTGGAACCTGAGTAGAGTGGTTC 1605 1749 TGTGAGGGTGATGAAGATTGCATTCTTTAATGCCCAGGCCTTTAGCGCTT 1798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1606 TGTGAGGGTGATGAAGATTGCATTCTTTAATGCCCAGGCCTTTAGCGCTT 1655 1799 CTTGCTTTTCCTCGGCTAGGAACTCTTTATAGGACGAGGTAGGTCCTGGA 1848 ||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1656 CTTGCTTTTCCTCGTCTAGGAACTCTTTATAGGACGAGGTTGGTCCTGGA 1705 1849 TTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATTCCACCTTTAATTTGAACGGGTTTCCC 1898 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1706 TTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATGCCACCTTTAATTTGAACGGGTTTCCC 1755 1899 GTATTTCGTGTTGGACTGCCAGTCCCTCTGGGACCCCATGAATTCCTTAA 1948 ||||||*|||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1756 GTATTTTGTGTTGGACTGCCAGTCCCGCTGGGACCCCATGAATTCCTTAA 1805 1949 AGTGCTTTAGGTAGTGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCA 1998 ||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||| 1806 AGTGCTTTAGGTAGTGAGGATCGACGTCATCAATGACGTTGTACCAAGCA 1855 1999 GCATTATTGAAGACCTTTGGACTAAGGTCCAGGTGTCCACACAGGTAATT 2048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1856 GCATTATTGAAGACCTTTGGACTAAGGTCCAGGTGTCCACACAGGTAATT 1905 2049 ATGTGGGCCTAAAGATCTGGCCCATATCGTCTTCCCTGTTCTGCTATCAC 2098 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1906 GTGTGGGCCTAAAGATCTGGCCCATATCGTCTTCCCTGTTCTGCTATCAC 1955 2099 CTTCTATGACAATACTATTAGGTCTCCATGGCCGCGCAGCGGAATCCCTA 2148 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||*|||*| 1956 CTTCTATGACAATACTATTGGGTCTCCATGGCCGCGCAGCGGAAGCCCGA 2005 2149 ACATTATCAGCGACCCATTCTTCAATTTCAACAGGAACTTGGTCAAAGGA 2198 |||||||||||||||||||||||||*||||*||||||||||||||||||| 2006 ACATTATCAGCGACCCATTCTTCAAGTTCATCAGGAACTTGGTCAAAGGA 2055 2199 AGAACATGGGAAGGGAGAAACATAAGGAGCTGGTGGCTCTTGGAAAATCC 2248 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*|||||||||| 2056 AGAACATGGGAAGGGAGAAATATAAGGAGCTGGTGGCTCCTGGAAAATCC 2105 2249 TATCTAAATTACTATTTAGATTATGAAACTGAAGTACAAAGTCCTTTGGG 2298 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2106 TTTCTAAATTACTATTTAGATTATGAAACTGAAGTACAAAGTCCTTTGGG 2155 2299 ACTAATTCCCTAATGACATTAAGAGCTTCTGACTTACTGCCGCTGTTAAG 2348 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 2156 ACTAATTCCCTAATGACATTAAGAGCCTCTGACTTACTGCCGCTGTTAAG 2205 2349 CGCTTTGGCGTAAGCATCATTCGCTGATTGTTGACCGCCTCTAGCAGATC 2398 |||||||||||||||||||||*||*||*|||||||||||||||||||||| 2206 CGCTTTGGCGTAAGCATCATTTGCGGACTGTTGACCGCCTCTAGCAGATC 2255 2399 GTCCATCGATTTGAAATTGTCCCCATTCGACGGTGTCGCCGTCCTTATCC 2448 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2256 GTCCATCGATCTGAAATTGTCCCCATTCGACGGTGTCGCCGTCCTTATCC 2305 2449 AGATAGGACTTGACATCCGAGCTTGATTTGGCACCTTGAATGTTGGGGTG 2498 ||*||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 2306 AGGTATGACTTGACATCTGAGCTTGATTTGGCACCTTGAATGTTGGGGTG 2355 2499 GAAACTGGTGCTACAGCTTGGGTGTACACAATCGAAGAGACGATTGTTCG 2548 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 2356 GAAACTGGTGCTACAGCTTGGGTGTAGACAATCGAAGAGACGATTGTTCG 2405 2549 TAATCGTGATTTTACCCTCGAATTGAATGAGGGCATGCAAGTGAGGTTCC 2598 |||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2406 TAATCGTGATTTTGCCCTCGAATTGGATGAGGGCATGCAAGTGAGGTTCC 2455 2599 CCATTCTGATGCAGCTCTCTACAGATTTTAATGAACTTAGGGTTTGATTG 2648 |||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||*| 2456 CCATTCTGATGCAGCTCCCTACAGATTTTAATGAACTTAGGGTTAGATGG 2505 2649 GAGAGAAAGTGTTTGAATGAATGACAGTAGGTGTTCTTTGGGTATAGAAC 2698 ||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||| 2506 GAGAGAGAGTGTTTGAATGAATGACAGCAGGTGTTCTTTGGGGATAGAAC 2555 2699 ACTTTGGGTATGTGAGAAAGACATTCTTGGCTTGAATTCGAAAACGAGGA 2748 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||| 2556 ACTTTGGGTATGTGAGAAAGACATTCTTGGCTTGAACTCTAAAACGAGGA 2605 2749 GTTCTCATGTTGACCAAGTCAATTGGAGACA------------------- 2779 |**|||||*||||||||||||||||||||||******************* 2606 GACCTCATTTTGACCAAGTCAATTGGAGACACTCAACTAGAGACACCCTT 2655 -------------------------------------------------- ************************************************** 2656 GAGCATCTCCTCCTGTTAATTGGAGACATTATATAGGTGTCTCTAAATGG 2705 -------------------------------------------------- ************************************************** 2706 CATTCTGGTAATAAGTTAAACTTTAATTTGAATGAAAAGGCTCAAAAGGC 2755 -------------------------- ************************** 2756 GCGGAACACCCAAGGGGCCAACCGTA 2781