NC_004650 DQ644561 1 TAATATTACCGGTGCCCGCCGCGCCCTTCAAAAGTGGGCCCCACAAGGGG 50 *******|||||||||||||||||||||*||||||||||||||||*|*** 1 -------ACCGGTGCCCGCCGCGCCCTTTAAAAGTGGGCCCCACACG--- 40 51 ACCACGCGTCTTTTCCGTACTCTCTTTAATTATGACATTGCTTTATAAGG 100 *********||||*|*********||||||*||*|||||||||||||||| 41 ---------CTTTGC---------TTTAATGATTACATTGCTTTATAAGG 72 101 ACCAATCCTGTTTC-GCCCTTGGCGCCCAAGTATGGCTGAATTGTGGGAC 149 |||||||**|||*|*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 73 ACCAATCAGGTTACCGCCCTTGGCGCCCAAGTATGGCTGAATTGTGGGAC 122 150 CCTTTGCAGAACCCACTACCAGATACTTTATACGGTTTTAGGTGTATGCT 199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|*|||||||| 123 CCTTTGCAGAACCCACTACCAGATACTTTATACGGTTTCCGTTGTATGCT 172 200 ATCCGTAAAATACTTGCAAAGTATTTTGAAGAAATACGAGCCAGGAACCT 249 |||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||* 173 ATCCGTAAAATACCTGCAAGGTATTTTGAAGAAATACGAGCCAGGAACCC 222 250 TAGGGTTCGAGCTCTGTTCGGAGTTAATCCGTATATTCAGAGTCAGGCAG 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||**|*||* 223 TAGGGTTCGAGCTCTGTTCGGAGTTAATCCGTATATTCAGGGTTCGTCAT 272 300 TATGACAGGGCGAATGCGCGTTTCGCCGAGATTTCATCCATATGGGGGGA 349 |||||||||||||||*||||||*|||*||||||||||||*|||||||||| 273 TATGACAGGGCGAATTCGCGTTACGCGGAGATTTCATCCGTATGGGGGGA 322 350 GACCGGTAAGACGGAGGCTGAACTTCGAGACAGCTATCGTGCCCTACACT 399 **||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 323 CTCCGGCAAGACGGAGGCTGAACTTCGAGACAGCTATCGTGCCCTACACT 372 400 GGGAATGCTGTCCCAATTGCTGCCCGAAGCTATGTCCCGGTTTCAAGAGG 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 373 GGGAATGCTGTCCCAATTGCTGCCCGAAGCTATGTCCCGGTTTCAAGGGG 422 450 CGTCCGGATGAAGAGAAGGAGGGGTGACCGCATCCCGAAGGGATGTGTGG 499 |||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||*|||||*| 423 CGTCCGGATGAAGAGAAAGAGGGGTGACCGCATCCCGAAGGGGTGTGTTG 472 500 GTCCCTGTAAGGTCCAGGACTATGAGTTCAAGATGGACGTTCCCCACACG 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 473 GTCCCTGTAAGGTCCAGGACTATGAGTTCAAGATGGACGTTCCCCACACG 522 550 GGAACGTTTGTCTGTGTCTCGGATTTTACAAGGGGTACTGGGCTTACCCA 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 523 GGAACGTTTGTCTGTGTCTCGGATTTTACAAGGGGGACTGGGCTTACCCA 572 600 TCGCCTGGGTAAGCGTGTTTGTGTGAAGTCCATGGGTATAGATGGGAAGG 649 |||**||||||||*|*||*|||*|*||||||||||||||*|||||*|||| 573 TCGTTTGGGTAAGAGGGTGTGTATTAAGTCCATGGGTATTGATGGTAAGG 622 650 TCTGGATGGATGATAATGTGGCCAAGAGAGATCACACCAATATCATCACG 699 |*|||||||||||*||*||*||||||||*||*||||||||*|||||*||* 623 TTTGGATGGATGACAACGTCGCCAAGAGGGACCACACCAACATCATTACT 672 700 TATTGGTTGATTCGTGACAGAAGGCCCAATAAGGATCCGCTGAACTTTGG 749 ||*||||||||*||*||*||*|||||||||||||||||**|||**|||** 673 TACTGGTTGATCCGAGATAGGAGGCCCAATAAGGATCCATTGACGTTTTT 722 750 CCAGATCTTCACCATGTACGACAATGAGCCCACTACTGCTAAGATCCGAA 799 *|||***||*||*|||||*||*||*||||||||||||||||||||*|||| 723 TCAGGCGTTTACAATGTATGATAACGAGCCCACTACTGCTAAGATTCGAA 772 800 TGGATCTGAGGGATAGAATGCAGGTCTTGAAGAAGTTTTCTGTTACAGTT 849 ||||||||||*||||||||||||||*||||||||*|||||||||||*||| 773 TGGATCTGAGAGATAGAATGCAGGTGTTGAAGAAATTTTCTGTTACTGTT 822 850 TCAGGAGGTCCATACAGCCACAAGGAGCAGGCATTAATTAGGAAGTTTTT 899 ||*||*||*||*||*|*||||||*||||||||*|||*||||||||||||| 823 TCTGGTGGCCCTTATAACCACAAAGAGCAGGCTTTAGTTAGGAAGTTTTT 872 900 TAAGGGTTTGTATAATCATGTTACTTACAATCACAAGGAAGAAGCTAAGT 949 ||||||*||||||||||||||||||||*|||||*|||||*|||||||||| 873 TAAGGGATTGTATAATCATGTTACTTATAATCATAAGGAGGAAGCTAAGT 922 950 ATGAGAATCAATTAGAGAATGCACTTATGCTGTATAGTGCTAGCAGTCAT 999 ||||||||||*|||||*|||||*||||||*|||||||||||||||||||| 923 ATGAGAATCATTTAGAAAATGCTCTTATGTTGTATAGTGCTAGCAGTCAT 972 1000 GCTAGTAATCCTGTGTATCAGACCCTGCGTTGCAGGGCTTATTTCTATGA 1049 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 973 GCTAGCAATCCTGTGTATCAGACCCTGCGTTGCAGGGCTTATTTCTATGA 1022 1050 TTCGCATAATAATTAATAAAATTATATTTTATTAATAGAGTAATACCTTT 1099 ||||||*||||||||||||||||*|||||||||||||*||||||||*||| 1023 TTCGCACAATAATTAATAAAATTTTATTTTATTAATACAGTAATACTTTT 1072 1100 ACATCATCATTACAATCTACAGTATCTAATTCATCTATCCAAGAACATAC 1149 |||||||||*||||||||||*|||||||*|||||||||||||||*||||| 1073 ACATCATCAGTACAATCTACCGTATCTACTTCATCTATCCAAGAGCATAC 1122 1150 TCTTGGAAGATATCTAATAACAAAAACTAAATTAACTAAACTAAAAAACC 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||*|*||||| 1123 TCTTGGAAGATATCTAATAACAAAAACTAAATTAAATAGACTTAGAAACC 1172 1200 CTAAATTTGCTAATTCATTACATATGCGCCATTTAAGGCGTTCCAAAATA 1249 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1173 CTATATTTGCTAATTCATTACATATGCGCCATTTAAGGCGTTCCAAAATA 1222 1250 CCAGTCCAACTGTGAATAGCACCAGTTAGACGGGTCGTCAAGATCCGGAA 1299 ||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1223 CCAGTCGAATTGTGAATAGCACCAGTTAGACGGGTCGTCGAGATCCGGAA 1272 1300 TTGGAGGAAGATCTTGTGGAATCCCAGTTGCCTCCTTTCCCTGTAGTTCA 1349 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||*||*| 1273 TTGGAGGAAGATCTTGTGGTATCCCAGTTGCCTCCTTTCCCTGTAATTGA 1322 1350 CCCTCAGCTGGAATTTGAGGATGGTTCTCCCCTGTGTGCTCTCGTGGACA 1399 |||||||||||||||||||||||||||*|*||||||||||*||||||||| 1323 CCCTCAGCTGGAATTTGAGGATGGTTCCCTCCTGTGTGCTGTCGTGGACA 1372 1400 TACATTATTCTGAGATGGAACGGTGCAGTCCGACCCACAGACATGGGGTT 1449 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1373 TACATTATTCTGAGATGGAATGGTGCAGTCCGACCCACAGACATGGGGTT 1422 1450 GGTGTCGAATTCGACTGCTCTCGTAGTCTGAGCATGACTTATTGATTCCC 1499 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1423 GGTGTCGAATTCGAGTGCTCTCGTAGTCTGAGCATGACTTAGTGATTCCC 1472 1500 CTGTGCGTGAATCCATGCTGGTACTTGCAGGTTGTTGTTATGAAGGCTGA 1549 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||||||||| 1473 CTGTGCGTGAATCCATGCTGGTACTTGCAGTTTGTGGTTATGAAGGCTGA 1522 1550 ACAGCCGCAACCCTTCCACACTATCCTCGTCCTCTGTTCAGGAACTTTCC 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1523 ACAGCCGCAACCCTTCCACACTATCCTCGTCCTCTGTTCAGGAGCTTTCC 1572 1600 TCTTGGCCTTCTTCGCCTCTGTGTGCAGTGGCTCCTGAATGGGACACTTC 1649 ||||||||||||||||**|||*|||*|*|||||||||****||||||||| 1573 TCTTGGCCTTCTTCGCTGCTGCGTGTAATGGCTCCTGCTCCGGACACTTC 1622 1650 CTCTTGTACCCAGAAAGGGGATTGGACATCGCAGAATATAGCGTTTGCTG 1699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1623 CTCTTGTACCCAGAAAGGGGATTGGACATCGCAGAATATAGCGTTTGCTG 1672 1700 TTGCCCAATTCTTGAGTGCTCCTTGCTCTGGTTTGTCCAACCAGAGTTTA 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1673 TTGCCCAATTCTTGAGTGCTCCTTGCTCTGGTTTGTCCAACCAGAGTTTA 1722 1750 AATGAGGATCCCTCTCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATTCCACC 1799 |||||*||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|| 1723 AATGAAGAGCCCTCTCCTGGATTGCATAGGAAGATAGTGGGAATTCCGCC 1772 1800 TTTAATTCGAACTGGCTTTCCGTATTTACAGTTGGATTGCCAGTCCTTCT 1849 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1773 TTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTATTTACAGTTGGATTGCCAGTCCTTCT 1822 1850 GGGCCCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGGTATTGGGGGTTGACGTCA 1899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1823 GGGCCCCCATGAATTCCTTAAAGTGCTTTAGGTATTGGGGGTTGACGTCA 1872 1900 TCAATGACGTTATACCAAGCACTGTTGCTGTATACTTTTGGGCTTAGATC 1949 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1873 TCAATGACGTTATACCAAGCACTGTTGCTGTACACTTTTGGGCTAAGATC 1922 1950 TAAATGCCCACACAAATAATTGTGAGGGCCCAAAGACCTGGCCCATACTG 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1923 TAAATGCCCACACAAATAATTGTGAGGGCCCAAAGACCTGGCCCATACTG 1972 2000 TTTTGCCTATTCTGCTTGGGCCTTCAATAACAATGGAAATGGGTCTATCC 2049 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||| 1973 TTTTGCCTATTCTGCTTGGGCCTTCAATAACAATGGATATAGGTCTATCC 2022 2050 GGCCGCGCAGCGGAATCCATGACATTTTCAGCGGCCCAGTCGCTGATAAT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2023 GGCCGCGCAGCGGAATCCATGACATTTTCAGCGGCCCAGTCGCTGATAAT 2072 2100 GTCAGGAACGGCATTGAAAGAAGAAGACGAAAAAGGGGAAGAATATACAG 2149 |||||||||||||||||||||||||||**|||||||*||||||||||||| 2073 GTCAGGAACGGCATTGAAAGAAGAAGATAAAAAAGGAGAAGAATATACAG 2122 2150 AAGGTGGAGGAGAAAAAATCCTATCTAAATTACTAACTAAATTATGAAAT 2199 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||**||||||||||*|| 2123 AAGGAGGAGGAGAAAAAATCCTATCTAAATTACTACGTAAATTATGATAT 2172 2200 TGAAATAAATATTTTTCAGGGAGTTTCTCCCTGATTATTTGCAACGCAGC 2249 |||||*|*|*|*|*|**|||||||||||||||*||||||||*||*||*|| 2173 TGAAAAATAAAATCTCTAGGGAGTTTCTCCCTAATTATTTGTAATGCTGC 2222 2250 TTCTTTAGAACCTGCGTTTAGAGCCTCTGCGGCTGCGTCGTTAGCAGTCT 2299 |||***|||*||||||||||**||||||||*|||||*||*|||||*|||| 2223 TTCAGCAGAGCCTGCGTTTAAGGCCTCTGCTGCTGCATCATTAGCTGTCT 2272 2300 GCTGGCCTCCTCTAGCAGATCTGCCGTCGACCTGGAATTCACCCCAGGTG 2349 ||||*|||||||||||||||||*||||||||*||*||***|||||||**| 2273 GCTGACCTCCTCTAGCAGATCTTCCGTCGACTTGAAAAGTACCCCAGTCG 2322 2350 ATGGTATCCCCGTCCTTATCGACGTAGGACTTGACATCGGAGCTGGATTT 2399 |||**|||*||||||||*||||*||||||||||||||||||***|||||| 2323 ATGTAATCACCGTCCTTCTCGATGTAGGACTTGACATCGGACGAGGATTT 2372 2400 AGCTCCCTGGATGTTGGGGTGAAAGTGATTCGATCTGTTCGGTGAGACCA 2449 |||||||||||**||*||*||*||*||**|*||*|||||*||******|| 2373 AGCTCCCTGGAAATTTGGATGGAATTGGGTGGAGCTGTTGGGGTGTTGCA 2422 2450 GATCGAAGAATCTGCTATTTGTGCAGACGAATTTGCCTTCGAACTGCACC 2499 |*|||||***||||**||||*|**|***|**|||*||*|*||||||*|** 2423 GGTCGAAATGTCTGGGATTTTTAAATTGGGCTTTACCCTTGAACTGGATG 2472 2500 AACACATGGAGGTGAGGTTCCCCATCCTCGTGCAGTTCTCTTGCTACGTG 2549 |***||||||||||******||||||*|*|||***||||*|*||||**|* 2473 AGAGCATGGAGGTGCAAAGACCCATCTTGGTGTTTTTCT-TGGCTAACTC 2521 2550 T-ATATATTTTTTGTT-GCTGGGT-GTTTG-TATATTTAGGAGTTGGGCT 2595 |*|||*|***|||*|**|*||||**||||**|||*||||**||*|***|* 2522 TGATAAACACTTTATCAGATGGGCAGTTTACTATCTTTAATAGCT---CA 2568 2596 AG-GCAGTCCTCTTTTGAGAGAGAACAGCGTGGATAAGTAATAAAATAAT 2644 ||*||*||**|||||*|||||||||||****||||||||||*|||***|| 2569 AGAGCTGTT-TCTTTAGAGAGAGAACATTTGGGATAAGTAAGAAAGACAT 2617 2645 TTTTGGCCTGAATTTTAAAACGTTTTGGAGGAGCCAT-TTGGAGACACGC 2693 |||||||****|*|*||||||*|**|*||*|||*|||*||||*|*|*|** 2618 TTTTGGCTGAGACTCTAAAACTTGGTTGACGAGGCATATTGGTGTCCCTT 2667 2694 ATAAGTTCAAATGAATTGGAGACT--GGAGACA-ATATATAGTATGTCTC 2740 |*||**||*|**|||||||*|*||**||*|*|**||*||||****|**** 2668 A-AACCTCTACGGAATTGGTGTCTTTGGTGTCCCATTTATACCTGGGACA 2716 2741 CAAATGGCATTCTGGTAATTTAGAAGATCCTTTTAACTTTAATTCAAATT 2790 |*|||||||||*||||||||*||||*|*|********||||||||||||| 2717 CCAATGGCATTTTGGTAATT-AGAACACC--------TTTAATTCAAATT 2757 2791 CCGACAACTCTGGGTCCACCAAAAGGCGGGCACCGTAT------- 2828 |||||||*||||||||||||*|||||||||||||||||******* 2758 CCGACAAATCTGGGTCCACCTAAAGGCGGGCACCGTATTAATATT 2802