LOCUS AAGF03001772 12076 bp DNA linear INV 12-SEP-2008
DEFINITION Tetrahymena thermophila SB210 gcontig2_1108821043815 macronuclear,
whole genome shotgun sequence.
ACCESSION AAGF03001772 AAGF03000000
VERSION AAGF03001772.1
DBLINK BioProject: PRJNA12564
BioSample: SAMN02953617
KEYWORDS WGS.
SOURCE Tetrahymena thermophila SB210
ORGANISM Tetrahymena thermophila SB210
Eukaryota; Alveolata; Ciliophora; Intramacronucleata;
Oligohymenophorea; Hymenostomatida; Tetrahymenina; Tetrahymenidae;
Tetrahymena.
REFERENCE 1 (bases 1 to 12076)
AUTHORS Bidwell,S., Michalis,H.M., Zafar,N., Joardar,V., Miao,W., Russ,C.,
Eisen,J., Wu,M., Wu,D., Nierman,W., Orias,E., Delcher,A.,
Salzberg,S. and Coyne,R.
TITLE Annotation update of Tetrahymena thermophila SB210
JOURNAL Unpublished
REFERENCE 2 (bases 1 to 12076)
AUTHORS Eisen,J.A., Wu,M., Wu,D., Nierman,W.C., Orias,E., Delcher,A.L. and
Salzberg,S.L.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (04-FEB-2005) Eukaryotic Genomics, The Institute for
Genomic Research, 9712 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850,
USA
REFERENCE 3 (bases 1 to 12076)
AUTHORS Eisen,J.A., Wu,M., Wu,D., Nierman,W.C., Orias,E., Delcher,A.L. and
Salzberg,S.L.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (11-SEP-2008) J. Craig Venter Institute, 9704 Medical
Center Drive, Rockville, MD 20850, USA
COMMENT The sequences of 871 contigs were updated and 781 new contigs,
AAGF03000998-AAGF03001778, were added in September 2008.
Annotated scaffolds were added in March 2009.
Annotation was updated on the scaffolds in February 2014.
##Genome-Assembly-Data-START##
Assembly Method :: Celera Assembler v. before 2009
Assembly Name :: JCVI-TTA1-2.2
Genome Coverage :: 9.08x
Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing
##Genome-Assembly-Data-END##
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..12076
/organism="Tetrahymena thermophila SB210"
/macronuclear
/mol_type="genomic DNA"
/strain="SB210"
/db_xref="taxon:312017"
ORIGIN
1 aaatattatt taaaggttaa gtttttttct atttggtttt ataaaatatt tacaattagc
61 aaaaaattct tgtgttttag attttttaag aattgacttt gtttatttca agtttttctc
121 aattttgttt agattagact ttgaacctgt ttattagtaa aattaaaaat cattcaaaat
181 ttataagaat taaaaattta attttttact ttctttctct tcagcttcaa aattatacta
241 aaactaaaca cttttttgtt atttaagttt agaattcttc tgtggagatg caatattttc
301 taatttctga ggactttaac ataaaggagt tttctaccca tgtcctaatt cattcaattt
361 actgtctaaa atttattatt attttataaa ttgtgattat ttaaaaagaa atattgtatt
421 tatagtcaag taagttgaaa aagtaataaa tatttaatac taattaaaat atttttgcaa
481 ataagagata gaatttttca ataaaattaa acatgataaa taaacaaaat aaattagaaa
541 aatttattaa ttgtaaaata ttttagaaaa aatatcatat aaatatatac ctattgatga
601 taatgtttta atttaacttt attcaagtgt tcgttctttt ttgatatcaa tttaaatgtc
661 tttttatcca tttttagatt gctaatcagc gctatgttct taatttaact aactgatcat
721 catttcaatt ttttgagaaa tttcttgtaa aaatttggtt atacagtttt ttgatccttt
781 gtattatcta ataacataga aagaaagata tgtttaaaat gattatcatt taaatacttt
841 tacatgctat ctttctcaat ttatttaatt taactgccaa ttttgtctaa aatttgagac
901 aattctttga aggtatccta tataatttac aagtctatgt tgttttaaat tgaatctaga
961 gtcattttcc tttgcacttt gcagatttta aaattagatt attttttgga atttaataat
1021 tatatcagca attaattcac ccagccacaa attttaagtt attttcaaaa caatcttaat
1081 gtagattttc aattatcaat tgtactcaaa tcaagggaac aacgcaagat ttatttattg
1141 agatagatag atacctttca ataaatttta gacacaaatt atttttgtga gcaattatgg
1201 tactctagta ataatgaatt tattaaaaat atcgctttat gtatttaaca tatttagagt
1261 taatcataaa agaaagatta catctattac ctataaccgt tcttatcaaa acaaaaatga
1321 ttaaattttt tttgggaaaa taaaagctat tatttattat attatgaaga agctgtggga
1381 actaaagaaa ttataatcta ttatttagat tttttaaaaa gcagaataat ttgttattat
1441 taatttattc catccagcca ctagaagtaa aaataaataa ataaataaat tctgtttaat
1501 tatattttaa caatatggta catatctttc aagctatata aataaatatc aacaaaatac
1561 taaactggat acataaatta ttttttataa gatttattga attaaatcaa gtgattttaa
1621 aaagtaaaga agcatttatt ttgatatttt taaatagcgc tatcagtaat gataaataaa
1681 taattgaatg aatgaatgaa ttaatttgat attgatgttt tttgataatt cgatttattt
1741 attttaaatg tcaatctaaa ttttgttatc aatttcattt ttaaaaaata aacaaaccct
1801 aaattttgtg agaaatttaa tcatttaatt aaaacaattg aatgtttgtt tatctattta
1861 ctttgctaag aattaggaat aaagcaaaat tttgtggttt ttaatcatat aaaaaaaaat
1921 tattaaaatt ttattagaga atacattcag ctttatcaaa tgagagaagc tgaaaaaaaa
1981 agcaattttt aaagatatta tcattgatac gaatttactt aaatactaat tacttgattt
2041 gagaaaacta atatctattc taagttgtaa attttacatt aatgaagtat tttactaatt
2101 ttctttatta tttttcaatt attaaagctc tttaattact cgcttgaaaa atacacatat
2161 tcgtcatata aaataaaaaa tgagtaggta tttttttaat cttttaaaat aagttgatct
2221 atcaataagt tagtttattt aaataaaaca taaatgtata tcttaaatat ggctttcaat
2281 tttatgataa tatagcaatt tgttatgaga gtaagatgtt aaagacttaa agagagaagt
2341 gtaaattaat aattattgta tcaattttaa taattaatca gctttatttt taaaaatgaa
2401 atctacattt ttagattaat tttcactcta agacttgtaa gaaaaaatta aaattagatt
2461 ttctaaattg ctcaatcaaa aaatgagaag gtgacaaaaa accatcaaac ttaaatcctt
2521 taaaatagct caaattgtct aaataatgaa ttgagcattt gcaaagtttt attatcagct
2581 gcataaaaag tgtagctagc aaaaaatgtg taagtagtgt atgatggaca taaaaaattt
2641 tattaagaaa taaattcaaa attaaaacta tacctgtttg tacatacaag gaatagctgg
2701 acggggtact atcaatcatt gaaactcact tttaccctct aaaatataat caatcctata
2761 aaaattcaaa ataaaatttg cacatttatt taatactcac aatatatata aagtagcctt
2821 aaaatttaga tattattctt taaaacaaaa aattaataac taggagagaa taggattttt
2881 agactacata aataattaaa ttatttagca tattttaagc ataatataaa ttaataaata
2941 tcaatcataa ttttctactc atctaaaaaa aaaactttta tttagatttg ttagatagat
3001 gatgaaaaga aatatattct tattataaaa ttgtagaagt tgaaaaaaat aacaagtcaa
3061 aatctgattt ttttaaataa caaaaattac atgttttttt atctgaatca aacaaggaaa
3121 taataaatca acttaatatt tattaagcaa taatatagta tatatagttt tatataaaca
3181 aaaattgctg catgagtaat aaataaataa ataattgatt cattaattag cttaagaatt
3241 tatcaaaata aaaagaacca tctcataatc atattttatt agattattga agtagtgaaa
3301 agtaaattaa tttatttgtt tctttttttc cccctttaag atgataagct tacttgattt
3361 ataattcaac ctagattgct ataatttttt tattgtttag caaaaaataa gctaaaaagt
3421 actgaagaga tttaatcatt ttcttaaaaa attgaatgat tgacaaatta gaatatttag
3481 accaaaagat aaaaaaatca atgttcttaa attctcctct tttaaaccat ttttattatg
3541 attttttaac aaaataaaga taataatttt tattcatatt aattagagta gtgagtgata
3601 gctcataaag aattttaatt tgttatttaa aattgtcaaa agagcaatta tttattttat
3661 taaattgtgt ttcaaaaaag caaaacaaac aaatttaccc agctatttat tttttagata
3721 acaatagtaa taattacttt ttatttttaa ataaataata tcatcaaaat tttttgctca
3781 ataagtaaat tcttaattta tcagaattaa taagttgatt taaattatca aaaagaatca
3841 gtttttagtt ttagaagttt ttatagaagt gaaaacaaaa tttatttatt taatattctt
3901 catttgagat attaatgact accgtagaat acacaataac tggtaaaata tgatcttaaa
3961 cccagaagta aaaaatttac gatgaatgaa gaattttaag tagcaaaaat aaatagtaat
4021 ttttactagt catcgtatat tctgtggtat ataaatctaa cttgatattt tgtaaattaa
4081 aaaactctta gttggtaggc aggcaggtaa tttatttgtt taactagaaa attggaaacc
4141 ttagcaaatt tagaaactat aatttaattt tctaatataa tatttatagc acagtacgaa
4201 aattagattt aattattaaa tgaattatat gactaacagt gcttaataag ctgtatcaat
4261 ttagatcaat caaattatta ttatcttgca cttataattt ttaatttgca aataaacaaa
4321 tttattatta taaaagttta aaaattaata ttctgttagt ttatttaagc aagttaacat
4381 ataaatattt agtttataag tgataagaaa aaatatttat actaaatact acttgagatt
4441 taattgtgat caataaagct aaaaagcaaa taataaatta aagcaaacaa tgaacagcaa
4501 taatttatta ttattattat atgaattaaa taattaatca gcgtaattta aaaataataa
4561 agctacattt tgatatttcg atataagtta ttaacatttt agacagactg ttaaataaaa
4621 tattatttat tcaattctct tattcaatca aaaatggaaa aattaaaaaa atttatttat
4681 gtttttaaat ttcaacaatt agcataaata aattcagctt gaattgaatg cattttatca
4741 aatattattt ctctctattt tatatccaac tttaatgtaa tgaataatgg taatttaaaa
4801 tttctatacg tttttatgat attttaagtg ggactattct gtgtataaaa gtagacctaa
4861 tcttaaaaaa tcttacctaa agttgtatgg gaatgctttt atttagatta tttgtagttt
4921 ttgcttcagt ttatcaaaat taattttcga ttgttacaag acatatttta agtaatctct
4981 ttcttatcgt ttgtaatatt ttgcttgttt cgttctttct gcattttcta ataaatttct
5041 aaaaatatta aattacaaac aaactgacaa gtaatattag tattattttt tatttagagt
5101 atttattaaa taaataaaaa ctgcaagaaa catagaattt actgatctac agttaatata
5161 aaagtgaaag atatttattg attagaaaca gatcaatcta aaattgataa tctaaattaa
5221 aaatttaaaa agtagcattc ttaaatctaa accaattaat tgtaaaaata ataaatttta
5281 agaaaacttt tattgttaat caattcgtct accaaatata aataatctat tattctgtaa
5341 tacattttta tttaatattt ttctttaaaa aataattaaa aataaattga catgctataa
5401 actttctcat tgacattgat tatatgattt atcatttatt gaacatcctt gatatgataa
5461 tattcatcaa aattaagctt atttatttta ttaaagtgat cagttttcat taaaggactc
5521 aaaatgtttt gaatattcta ttatttatta gtgcttagct tactcttttc aatagtttat
5581 acatataaaa gtacaataag gatacatggt tgcataatta tcacaacaaa aataattttc
5641 aaattcgata acattataat aactattgca aaaaaaatgt cacttaatcg tatttttaaa
5701 atttttattg atatatattc agggcaaaaa atcctcttca tttttttcat caaaatcatt
5761 tctctcatca atttatcaat ttgacatcta ttttaaaaaa taccgtctca aaagacgatt
5821 aaagatgatt aaattttcaa actattgcca aaacttttat ttaattacta attttatttt
5881 ttaatattag agttaaacaa ttacagttta taattaaaca gtatgtacaa tcaaaaatat
5941 tatctatgtt tcatattttt aaatttttat ataacattat tgaaattata tttttctata
6001 tttagactat tgtgatctat cattaagatt ttattagcag attcaatttt tgaattattt
6061 ctattttata tggctttctt aaatatggtt ttctcaataa ttataaataa tcctcaatat
6121 cctcaaatgg aaaattttat tgtctctttc ttgaccaaaa atattaatta ctattcaaat
6181 taattacctt taacggtgat aatcaatata tttccacata gagagactcc atagataaaa
6241 tccccaaaaa tagtactgct taatatatat gaaattccaa ataaatatat attaatataa
6301 atttgtaaag cacaaaggtg taatgtagat ttttcaatta tgacaatttt ttatttttat
6361 tattatttct atcatataaa aaataaaaaa atgttactat ttactttaat agatcatcaa
6421 ttaattaatt atatctgagg tatttttttt cataatatac ccctgatcac ttaatttttt
6481 gtattatgat aatatttatg gattcgaata taggagaata tacagtattt aatcttgctc
6541 aaaatttata tttcaatttg atttacattt aaaagttgaa gtatttattt attattcata
6601 ataaatattt ttaggattaa ttttaaatat tatctgaatt taaattttca tccattttaa
6661 ttcatttttt ataggaaatt aactatggat acaatttttt ttgcactaaa ataccgaagt
6721 gattttttat cataaataat tatttttatt agtatgaata aaatcgaaat gcataagaga
6781 tgtaattata aaaataaggt atgatttttg tagttcaaat aataataaat aataaaaaaa
6841 tatataacat ttaatcaaac aaatagctaa gtattaatta tcaataatca tttaattgtt
6901 aactattatt tactgaaata ttctaaatgt tttgctaata aaggaaagtc atattcactt
6961 tgtaattaga tattaaatat ttcgtatggg ctatctaaag attaaaatta aagtatcctc
7021 gcctcaacat ctttttttaa atatttaact taaagattga cttctatgct gaaactatcc
7081 ttagaaaatt aaataaaatt ttaatcatta ttaatcaata aaatgccatt agatttttta
7141 ttattgttaa tcaaatttgt atggtctttt aaaataaaaa ttttataata ttagtttttg
7201 tccttaaaga ttgagcattt tgtaacgatt tggggtttac tatttttatt ttaaggattt
7261 aattagggct actaagctta tttgtataga atctttggct aaagagtatt taaatagttc
7321 ttaaaaactc tgaaaatgta atctaaaaat tcatttcgat gactaattat caaattcaat
7381 tagaattcat ttttaataac gattgaacac ttttgttttt cattaacatc aataattata
7441 tcattaatat ctttcattaa aaacttttta acgttatcat tattaatttt ttaaggaaaa
7501 acatagaaaa aattttaggt catgcaaatt atcttcaatt cttactttcc agactttgat
7561 aatttagtaa ctgattcact ataaaagtaa ttttctttat tctttgaatt aatttattca
7621 ctttatatca aatttttaat gaattcgtga tttcttaatt cacaataatc tgtatctgcc
7681 atatttgtat taaaaaattt ttaatcttca actggactta tttctaattt ataaataata
7741 aaataattaa aataaattaa agtaattcct ttaaaaattt ataaattata taatgattta
7801 aaattgattt aataaataaa taaattatac atattttaat ttttacaaaa atccaccctt
7861 caaaattttg aaatgtttga ttatattgtt gcgtttattt ataaaattaa cttactagaa
7921 ggggtagaga aggggatcta aaaggaaaga gtttgcagta agttagtaag taaaaattat
7981 tttgatatgt aatatcgaaa aaaaaatttg aattaatctt aaatatgttt accatgatca
8041 aatttatcta gagttttaga ttttttaagt atcgattttg tttattcgac tttacacttt
8101 agactattaa ttgaatgcat tgaacctatt ttttattaaa agggagaata aaatattaga
8161 tcacctattt ttaataacta attactattg taattaaaat attttatcat ttaattctcg
8221 tcatcattct cttcttttta tctactgtca tcaaatatgt ctttttattt tatttatata
8281 taaataaata ctatttaaat gaaaataaaa aaatatattg taattattaa aaaaaatgta
8341 agagcaaaat tgtttagcaa aattaatcac atattttgtt tgttattttg actatatttt
8401 aaattattta ctcagatcaa tatttataaa ataaaatgta atatttttat gattaatgat
8461 ttactttttt cttgaatgct aaactagaat gtaacacttt tttacaattt aagatttgaa
8521 cattatatta tttaaaaggg atggtctata ttctgaggac tttgtttatt aattgatttt
8581 tctgtttctt cttttatatt aaaattaaat ttattaattt tttaatcaat aaaattaata
8641 attcattttg ttagcttcag ttattaaatt tacaaaaaat caaataaaat aaataaggta
8701 gtataatcta ttaaattgaa atttaaaaat ttatataaat aaatgcagat aattaaataa
8761 atctaaaaac aaactttaaa agatgagaat taggataata attcactctc tttaaaaata
8821 tcaatgaaaa aagtataaca aattagattg taatttcaat ttcaccttac cctgaaacaa
8881 gcttttttat tttttttcaa aaattgatcc tttttttata ttggtgcaaa attatgtttc
8941 ttagctttta attttttaat ccttgagatt atgggaattt aatgatctag caatcttttc
9001 aattttctaa ttcagcattt agacatgttt cacaatagcg ttttctgact ttttgtatta
9061 cctaataaaa agtaaaacaa ttaagttgaa aatattttta gatagaaaat gatttattta
9121 ttcttactcg ttatctaatt tgatttatta gatttgctat tcaattttgt caataaattg
9181 agacaatcca ctcaaatcat taattaaaac ttaaatatta gctttattat caagagtttc
9241 tgcagacata tttattattt tccagatttg taaaaaagaa ttcttttaaa aaattaatta
9301 ttataagtgt gtatttctaa tcaatttatt agtacaaaat caaaaaaatt aaaaatatac
9361 acagtaaaaa ttcattataa taaatgtaat caaagctatt ttatttgata aaaataatta
9421 attgattgac aatagaaaac ccctcaaaac atagaattat tttttttata ataaattttc
9481 acagtatata aatgaacaag cataaaaata aaagctaaac ataaattagc attaagtaaa
9541 aataaaatta tttatatgag tttgtttcta aaaatatatc ttcattcgta aatattcgag
9601 aaaataaaat aataatacat attacaagtt tgctttattc atagtgttaa ttttacataa
9661 gtatataaat ttgcaaaaaa aacatctttt agtgaatcat gaagtgaaaa aaactttaaa
9721 aaactgttcc agtcaatact tttttaatga ttgattttgt taaattgaag aactgattat
9781 ttatcattaa gcaaaatatt gcttgtttat aaatttagtt ttaacatttt tactaattta
9841 acaaagttaa aaattaatga ttgatcattc agaaaaatat tcaaacattt aaatattttt
9901 aaatttggtt ttcaattaat aaactaaaaa gagttttggc catttcagtt ttattctttt
9961 caaatgataa atttggttta taattaatta aaacctaaag taataaaatt tgctcttgtt
10021 ttcttgccaa gagttaattt tgagcataaa ttaaagccaa tcaataaaaa agaaatctta
10081 tttaatacac atttttaaat aattttgcaa ataataatta tatatgtatt atataaaatg
10141 ttagtaatat aatattaatt ttattattat ttaatacaaa tttcaagatt ttaatatcag
10201 ttataaagct taattgaaag aattacgaat aattattaat aacaaggttt atttaattta
10261 tatttatttt ttatgttttt gtttttacta aaaactcaag cttattttct ctgtaaaata
10321 tataaaagat atattctatc aaatggaagg aaacatatca aatgatttaa tttcttaaaa
10381 gtcgccaaaa tattcatatt aaatttaatt ttcatttgta ttgtaaaata ttaagtttca
10441 tagctactta atttacatac atttttttcc aaaaaatcac ttaaattatc aaagaaatta
10501 tgatttttta ttgctacaaa atgcttacta taaaagaatg actttaaatt aatttctttt
10561 ttattctagc cataaaaaaa tgcactcaca aattagataa ctaaactgaa agaggggaga
10621 agattttgaa tttatattat aataattttt taatttattt tcactagtaa tggaatttta
10681 ttactttaat tagatctctt tgtttttccc ccctctgttt tataaaaaaa agtaaattaa
10741 tctttttatt attcgaatta tcataaagcc tattttttgt ataataataa gaaggtgaga
10801 aaaatcaaat tattttttag cataaatttt gcttattttg attgatgtaa gtaactctga
10861 gtgctttaat ttattaaaag atattaatat attaattaaa tattacatga tatactttca
10921 atgatatttt gaaatttaag cttacaaatt aggtatttat aataaatgaa atgagtgtta
10981 tattaatcta taaaaaacat tagcactttg cttactattt catcactgtc tcttatgttt
11041 attgaatttg acaattcgtg aattacatca acacaattta agattattta cattttaagc
11101 aatctaaaaa taaataaata aataaatgag tatgtatgtg tgttgatata ttttaagacc
11161 attaaatagc aaaatagaag tcaataagat ataaaatatt cacaaaaaac tctttaaaaa
11221 tttagaacat agcatgcatg ttaaagaaat caaaacttta tgccaaaatc aaaatcaata
11281 acaatttatt ttcaatagaa atttattttt ttaaaaattg cattagcata aaaccaaaaa
11341 taatttaagt tattatgctt ataaattcta aaaatgaata tatttggatc aatcaaacat
11401 aatttttaaa ctagtatcat gataatatta ttcgatataa tattattaaa catttcaaaa
11461 ttagtatttt tgctttttga ttttaaattc atttatcaca atcattattt gtttgattca
11521 aaataaaaat gaatcgtata aataaactaa tcgcatatac ttctttttta aattagaaac
11581 ctatctttgg attttaaact tttaaaagtg agtaaaagct agcatgaaat actttatttc
11641 tagtttctta aaaagtgcta aataataaaa atgtatgtgc attttatttt gtagctgcaa
11701 tctttatgat tatcttaatc aataatataa aaactaaagc agtattttta ttaaaaatct
11761 ttaattaatt attcatgatt ttttactgat tcatatttat atcaaaaaaa tgttaataag
11821 aaataaaaac taaaagattg aggtaataat aaacaaatta aatctaatat tttcttttac
11881 attaaataaa ggcatatttc ttattaacaa attaattaat atgctgaaag tttgtaaatt
11941 aaaatacttc aaaatattaa aaacttaaac attttaagat cacaaaaaaa ttatgaataa
12001 cattttatat ttaaaaatca acctaagaat tataattaat aaatacattt gataaaatca
12061 tatgattaat taatat
//