Conserved Protein Domain Family
PRK06459

?
PRK06459: PRK06459 (this model, PSSM-Id:180572 is obsolete and has been replaced by 235806)
hydrogenase 4 subunit B; Validated
Statistics
?
PSSM-Id: 180572
Aligned: 12 rows
Threshold Bit Score: -1
Created: 9-Dec-2010
Updated: 15-Dec-2010
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
13542289    2 LPYIGPVLFgVASLLGLFNRKISYLMLSLSSVVFAATQ-FAY--GnYLSYYSVIAAIVWVFAGVYSLSYgERYGKWLASL 78 
48477896    1 MMYIILFFI-IAALISFIFKRTGYIISVISSFLLIIYGiINF--S-YLHFFYIISGTVWALSSWYSISY-DDEKRYLSIL 75 
15897889   44 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 119
146304196   7 LIYILSA---LSLVTSLFSNRISLVLLVLASGILAFYGvQEL--P--MGIFYLVAGLVWVLVALHSL-F-HYSDKWLTMT 77 
229582259   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
229578988   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
229584695   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
227830173   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
227827481   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
238619637   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
284997592   4 LLYTLPPFL-ISIIFSIFNKKAGYILTMISSIILLITSiYEY--NgVLSFFSIISTSVWILASIFSIEY-DHYGKWLSPL 79 
289596448   4 ILIVLSVYL-LAGLLGFKFKMTSYLLTAIGSSLLLYFSfLGEigNeISGYFIILSSIAWLFLSLYSVGY-DKKSGLLAST 81 
13542289   79 MSLTVLGMSIILVGDNYLVLIAGWEIMSVPSYAIVALNKSQKSPAFTFMTFSEFSTVLIIAGSISSFVASKDSSFSFihL 158
48477896   76 YNISILGMVTVLISNNYLMFLAGWETMSISGYLIIALYSNKSYPAFVFSAFSEISTVLIITGFAYAYYITGTFNFVI--I 153
15897889  120 YILTILGMTIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTAKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 193
146304196  78 LSGTVLGIIVVLTSTNYIEFLAGWETMTLFSFVGIAIYRKDWKPALTFLAFGELSTALLLAGFALAYSQTGSLVFER--L 155
229582259  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTAKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 153
229578988  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTAKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 153
229584695  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTAKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 153
227830173  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTAKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 153
227827481  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTVKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 153
238619637  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTVKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIANTTNFNY--L 153
284997592  80 YILTILGMAIVLNSDGYLLFLAGWEIMTIPAYVAIGLTAKNNRPPFVFMAFGELSTVLILAG----FIIVNTTNFNY--L 153
289596448  82 FAFTTGAMTIILTSTNALSFLIGWEGMTIASFVSIYLHKDSKRAAYMFLAFGELSTLLILTGFAWASAESGSIIFSAwhA 161
13542289  159 TTFAPLL--LISFGSLIKMGMSPFMISEWLPIAHGNAPANASAVFSATMTLMGVFLITKMIFLTsdsPALlYIGILLLII 236
48477896  154 KSIVPLI--MVSFGFMTKMGMFPFMISEWLPIGHGNAPANASIILSATMTLMGVYGILKMAMLS---PYNiYLGYILMLI 228
15897889  194 PSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 269
146304196 156 STQLPLI--ITSMGFIVKMGIFPFLVVEWLPIAHGNARSDLSAVLSATVTMTGIYGILKMESLS---PVStYLGIFLLAV 230
229582259 154 PSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
229578988 154 PSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
229584695 154 PSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
227830173 154 PSPVPLI--VVTFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
227827481 154 PSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
238619637 154 PSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
284997592 154 LSPVPLI--VATFGFIIKMGMMPFLVSEWLPIAHGTAPSNFSAILSATMTLMGVYGILKITILTqtiPIG--FSLTIMAI 229
289596448 162 LGNWSLIylLLALGFMIKMAVVPFHI--WLPEAHSKAPANMSSQLSAVMTLMGLFGMISFLQFGipaS---WVGLVILIM 236
13542289  237 GSISILFASIYAYVSENMKMLGGFSTIENQAAILSAFGLYLVTSN---STLREFVLATIIIFSLSHAVSKTGLFLSIGST 313
48477896  229 GAFTVLFAGLYSYLSDHVKSLPAFSTVENNGGILVALGLYISVDD---SLIRIFFLSTVLIFSMAHSLAKTGIFMVSGNV 305
15897889  270 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 349
146304196 231 GAFSNLFGALYSYVSDHVKGLLAFSTIENNGAMLALLGSLELVS----GDLKEFVTFSLFTYVIAHSLAKTGLFLSTGYV 306
229582259 230 GAFNIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
229578988 230 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
229584695 230 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
227830173 230 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
227827481 230 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
238619637 230 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
284997592 230 GAFSIFFGALYGYVNENTKGILAFSTIENNGAILVALSLYMISKQlniTSIEHISLITVILYSFAHSVAKTGLFLSSGLQ 309
289596448 237 GGITAIIGAFYAAVCDHVKKLPAYSTVENDGVLIAMTGALIVTYEv-qQVIGGFILLALLFFAFAHTIAKSLLFAVAGHL 315
13542289  314 RGEYFGEARAPED---RWMRLGTLLSTLSLSGLFPAIGGLAVWMLLESFFMQAy-LGGYIGILAIIVGSIVAISEGMVTG 389
48477896  306 SSRTHEYLFNIEDkksGMTYIGAVILGASLSGLYPTIGGVATWMLLESLFMNA--IYSVYGVYSIIIGAMIALGEGLVSA 383
15897889  350 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFSyvLHNMISILFIMTGAIIAMGEGLATA 424
146304196 307 EGESLTTASSFRY---GLSVLGAVLMAMSLSGLLPTIGGIATWSLLESMFMEAitLPHFINIVPIVAGVMIGMGEGFATG 383
229582259 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFSyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
229578988 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFSyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
229584695 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFLyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
227830173 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFSyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
227827481 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFSyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
238619637 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVASWLLLENLFMFSyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
284997592 310 EKQSITYSKKIRN-----IEIGLTLLASSMSGLLPNIGGVTSWLLLENLFMFSyvLHNVISILFIMTGAIIAMGEGLATA 384
289596448 316 EKSGGEYLGNKYSl-tRWTALAGYLAAISLAGVPPLPGFIGEWAALESMFQSFyiSDILVRLVTVVIGALVALTAGISII 394
13542289  390 SMMKILSFSALFRakKGHASRVETVTVFSVGLTILIFFVISIKLIPSaFLGGI------------PSVLVFKGFTIESRF 457
48477896  384 AYIKYITFSQLFR--KKGRVKIKEQPVIITGALVIILSLLSVLIINRnFISGF------------ESIGIANGFLIESRY 449
15897889  425 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 491
146304196 384 SLAKFVSYTQLTKpiKD-----KQGLILAVSGILVLVTVGLAYLLSP-FRTEV------------SQLGVGLNSLISSQY 445
229582259 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
229578988 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
229584695 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
227830173 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
227827481 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
238619637 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
284997592 385 LLIRYITYTSIFQntREQLSKIKKYPILLSALIVLILGFTLPYLIYP-YKNST------------TILGMLTNSVILTQY 451
289596448 395 AMSKFIVHGVERRerKN--ANLGDIGFGIGAGVLLLAGIFPQYIFSIiSPTVMgitgisskqylgKLLGIPNGMLIIS-- 470
13542289  458 NIADFGLVSPDYVIALITAFSLASYAVFR-KPRTRTAEVWNSGRSLSSEYTSFAYANNIRLMLRRILRTRmgngnqpisi 536
48477896  450 SSGDFGLIAPAYAIAIIAISFLLSLIIFK-KPRIRYNIPWNNGLSYFERYNSIAFTSNIKAMLSKLITEK---------- 518
15897889  492 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 569
146304196 446 -QRSFGGIDPLYILVSWPIIALIVYLSLG-KRKIRVVDPWDNGSAQGFRYTSFGMANNVRLMLRALLRTKtgsl---ets 520
229582259 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 529
229578988 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-payg 529
229584695 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 529
227830173 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 529
227827481 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 529
238619637 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 529
284997592 452 YNTTFGGISPLYIILLLVAFSIVSYLAFG-KPKIRKAETWNNGVNEKEEYTAFAMANNIRQMLKKILRPEeekfl-ptyg 529
289596448 471 -GKGFGVLSPTMIALFIAINFGIVYAAMRaKWKIRKVKPWSGGLR-NEEYPTRGHSSILLLTQKWLFRTEem------kq 542
13542289  537 IDVFWFAMNSIGRGYRWMCKNATQKFMNSSLAWYMIYMIVAFMVVIIMAVVI 588
48477896  519 IDVFWEVMILISVEYRKFAKKLLYKIMSSSMSIYMLYMVLGLFFAIIFVYIF 570
15897889  570 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 621
146304196 521 ADIFWQAMLVLIRWYLKFSRTFSRSFMNGSLRWYMVYMIIAIVVIMVITL-- 570
229582259 530 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
229578988 530 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
229584695 530 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
227830173 530 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
227827481 530 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
238619637 530 LDVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
284997592 530 LEVFWEYLYKLANSIRRFGKIFAKTLINSSISWYIIYIILTLIVVIIVVVMG 581
289596448 543 RDMVHNSYLSISKFAVYSSERFRKALMPGNDRRYVLYILLTLLLIIFVAAYS 594
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap