NCBI C Toolkit Cross Reference

C/data/BLOSUM80

  1 # Entries for the BLOSUM80 matrix at a scale of ln(2)/2.0.
  2    A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  J  Z  X  *
  3 A  5 -2 -2 -2 -1 -1 -1  0 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -1  1  0 -3 -2  0 -2 -2 -1 -1 -6
  4 R -2  6 -1 -2 -4  1 -1 -3  0 -3 -3  2 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 -1 -3  0 -1 -6
  5 N -2 -1  6  1 -3  0 -1 -1  0 -4 -4  0 -3 -4 -3  0  0 -4 -3 -4  5 -4  0 -1 -6
  6 D -2 -2  1  6 -4 -1  1 -2 -2 -4 -5 -1 -4 -4 -2 -1 -1 -6 -4 -4  5 -5  1 -1 -6
  7 C -1 -4 -3 -4  9 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -1 -3 -3 -1 -4 -2 -4 -1 -6
  8 Q -1  1  0 -1 -4  6  2 -2  1 -3 -3  1  0 -4 -2  0 -1 -3 -2 -3  0 -3  4 -1 -6
  9 E -1 -1 -1  1 -5  2  6 -3  0 -4 -4  1 -2 -4 -2  0 -1 -4 -3 -3  1 -4  5 -1 -6
 10 G  0 -3 -1 -2 -4 -2 -3  6 -3 -5 -4 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -4 -4 -4 -1 -5 -3 -1 -6
 11 H -2  0  0 -2 -4  1  0 -3  8 -4 -3 -1 -2 -2 -3 -1 -2 -3  2 -4 -1 -4  0 -1 -6
 12 I -2 -3 -4 -4 -2 -3 -4 -5 -4  5  1 -3  1 -1 -4 -3 -1 -3 -2  3 -4  3 -4 -1 -6
 13 L -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -4 -3  1  4 -3  2  0 -3 -3 -2 -2 -2  1 -4  3 -3 -1 -6
 14 K -1  2  0 -1 -4  1  1 -2 -1 -3 -3  5 -2 -4 -1 -1 -1 -4 -3 -3 -1 -3  1 -1 -6
 15 M -1 -2 -3 -4 -2  0 -2 -4 -2  1  2 -2  6  0 -3 -2 -1 -2 -2  1 -3  2 -1 -1 -6
 16 F -3 -4 -4 -4 -3 -4 -4 -4 -2 -1  0 -4  0  6 -4 -3 -2  0  3 -1 -4  0 -4 -1 -6
 17 P -1 -2 -3 -2 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -3 -1 -3 -4  8 -1 -2 -5 -4 -3 -2 -4 -2 -1 -6
 18 S  1 -1  0 -1 -2  0  0 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -1  5  1 -4 -2 -2  0 -3  0 -1 -6
 19 T  0 -1  0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2  1  5 -4 -2  0 -1 -1 -1 -1 -6
 20 W -3 -4 -4 -6 -3 -3 -4 -4 -3 -3 -2 -4 -2  0 -5 -4 -4 11  2 -3 -5 -3 -3 -1 -6
 21 Y -2 -3 -3 -4 -3 -2 -3 -4  2 -2 -2 -3 -2  3 -4 -2 -2  2  7 -2 -3 -2 -3 -1 -6
 22 V  0 -3 -4 -4 -1 -3 -3 -4 -4  3  1 -3  1 -1 -3 -2  0 -3 -2  4 -4  2 -3 -1 -6
 23 B -2 -1  5  5 -4  0  1 -1 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -2  0 -1 -5 -3 -4  5 -4  0 -1 -6
 24 J -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -4  3  3 -3  2  0 -4 -3 -1 -3 -2  2 -4  3 -3 -1 -6
 25 Z -1  0  0  1 -4  4  5 -3  0 -4 -3  1 -1 -4 -2  0 -1 -3 -3 -3  0 -3  5 -1 -6
 26 X -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -6
 27 * -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6  1

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