Identifier search

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Definitions for CSearchResultSet

Type	Member of	File	Line
class		/include/algo/blast/api/blast_results.hpp	307
function prototype or declaration	CSearchResultSet	/include/algo/blast/api/blast_results.hpp	328
function prototype or declaration	CSearchResultSet	/include/algo/blast/api/blast_results.hpp	334
function prototype or declaration	CSearchResultSet	/include/algo/blast/api/blast_results.hpp	350
function definition	CSearchResultSet	/src/algo/blast/api/blast_results.cpp	481
function definition	CSearchResultSet	/src/algo/blast/api/blast_results.cpp	485
function definition	CSearchResultSet	/src/algo/blast/api/blast_results.cpp	501

7 declarations in 2 files.

References to CSearchResultSet

File	Line
/include/algo/align/ngalign/ngalign_interface.hpp	55 63
/include/algo/align/ngalign/result_set.hpp	57 130 145
/include/algo/blast/api/bl2seq.hpp	142 157 174 205 208 311
/include/algo/blast/api/blast_results.hpp	307 328 334 350
/include/algo/blast/api/deltablast.hpp	112 115 125 150 153
/include/algo/blast/api/local_blast.hpp	91
/include/algo/blast/api/local_search.hpp	66 97
/include/algo/blast/api/psibl2seq.hpp	111
/include/algo/blast/api/psiblast.hpp	122
/include/algo/blast/api/remote_blast.hpp	214 661
/include/algo/blast/api/remote_search.hpp	65 104
/include/algo/blast/api/rpsblast_local.hpp	47 91
/include/algo/blast/api/traceback_stage.hpp	79
/include/algo/blast/api/uniform_search.hpp	239
/include/algo/blast/format/blast_async_format.hpp	55 57
/include/algo/blast/format/blast_format.hpp	253 276 287 381
/include/algo/blast/format/build_archive.hpp	70 82 94
/include/algo/blast/format/data4xml2format.hpp	79 87
/include/algo/blast/format/data4xmlformat.hpp	67 89 289
/include/algo/blast/format/vecscreen_run.hpp	103 173
/include/algo/blast/igblast/igblast.hpp	286 332 342 346 347 350 352 355 356 360 361 365 369 372 375 378 383 385 386 405 406 407 409 410 411 413 414 415 418
/include/algo/blast/proteinkmer/kblastapi.hpp	85
/include/algo/blast/vdb/vdbblast_local.hpp	49 100
/include/algo/structure/cd_utils/cuBlast2Seq.hpp	123
/src/algo/align/ngalign/blast_aligner.cpp	253 264 281 388 398 414
/src/algo/align/ngalign/result_set.cpp	499 608 610
/src/algo/blast/api/bl2seq.cpp	153 160 190 195 228
/src/algo/blast/api/blast_aux_priv.cpp	270 304 339 354 354 361
/src/algo/blast/api/blast_aux_priv.hpp	156 161
/src/algo/blast/api/blast_results.cpp	401 410 412 416 431 481 481 485 485 501 501 517 523 558 609 609 616 618
/src/algo/blast/api/deltablast.cpp	83 147 166 195
/src/algo/blast/api/local_blast.cpp	166 223 223 276
/src/algo/blast/api/local_search.cpp	93 155 171
/src/algo/blast/api/magicblast.cpp	446
/src/algo/blast/api/psibl2seq.cpp	91
/src/algo/blast/api/psiblast.cpp	94
/src/algo/blast/api/psiblast_impl.cpp	121
/src/algo/blast/api/psiblast_impl.hpp	85 115
/src/algo/blast/api/remote_blast.cpp	433 438 2073 2084 2114 2116 2161 2170 2178 2245
/src/algo/blast/api/remote_search.cpp	142 145 229 282 282 340
/src/algo/blast/api/repeats_filter_cxx.cpp	186 238 362 395
/src/algo/blast/api/rpsblast_local.cpp	139 139 141 141 250 259 275 300 300 315 318 374 391 409 426 428
/src/algo/blast/api/traceback_stage.cpp	190
/src/algo/blast/format/blast_async_format.cpp	114
/src/algo/blast/format/blast_format.cpp	1056 1110 1993 2019 2025 2038 2047 2075 2107
/src/algo/blast/format/build_archive.cpp	86 114 158 178 192
/src/algo/blast/format/data4xml2format.cpp	79 97
/src/algo/blast/format/data4xmlformat.cpp	48 76 105
/src/algo/blast/format/vecscreen_run.cpp	266 353 359 548
/src/algo/blast/igblast/igblast.cpp	173 174 190 192 275 277 355 359 363 693 839 842 1169 1170 1319 1320 1321 1425 1454 1455 1456 1473 1500 1501 1561 1595 1596 1645 1646 1668 1904 1908 1935 1937 1948 1957 1957 1992 1995 1999 2003 2070 2073
/src/algo/blast/proteinkmer/demo/kblastthr.cpp	141
/src/algo/blast/proteinkmer/kblastapi.cpp	95 95 97 103 147 147 154 188 188 216 231
/src/algo/blast/unit_tests/api/bl2seq_unit_test.cpp	615 654 744 817 876 906 979 1372 1561 1748 1865 2440 3040 3121 3212 3386 3391
/src/algo/blast/unit_tests/api/blastengine_unit_test.cpp	385
/src/algo/blast/unit_tests/api/delta_unit_test.cpp	234 238 495 499 701
/src/algo/blast/unit_tests/api/psibl2seq_unit_test.cpp	322 345 391 451
/src/algo/blast/unit_tests/api/psiblast_unit_test.cpp	213 299 384 476 573 607 726 845 964 1093 1138 1191
/src/algo/blast/unit_tests/api/remote_blast_unit_test.cpp	1330
/src/algo/blast/unit_tests/api/rps_unit_test.cpp	204 227
/src/algo/blast/unit_tests/api/traceback_unit_test.cpp	839
/src/algo/blast/unit_tests/api/tracebacksearch_unit_test.cpp	249 294 306 395 412
/src/algo/blast/unit_tests/api/uniform_search_unit_test.cpp	74 101 187 203 226 231
/src/algo/blast/unit_tests/blast_format/blast_format_unit_test.cpp	103 151
/src/algo/blast/vdb/vdbblast_local.cpp	139 139 141 141 191 210 224 237 260 278 340 343 674 697 714 728 743 800 804
/src/algo/cobalt/blast.cpp	407
/src/algo/cobalt/rps.cpp	438
/src/algo/structure/cd_utils/cuBlast2Seq.cpp	259 330 448
/src/algo/structure/cd_utils/cuSimpleB2SWrapper.cpp	278
/src/app/blast/blast_app_util.cpp	659 673 728 756
/src/app/blast/blast_app_util.hpp	276
/src/app/blast/blast_formatter.cpp	429 457
/src/app/blast/blastn_app.cpp	284 310
/src/app/blast/blastn_node.cpp	188 210
/src/app/blast/blastp_app.cpp	264 286
/src/app/blast/blastp_node.cpp	164 184
/src/app/blast/blastx_app.cpp	266 289
/src/app/blast/blastx_node.cpp	168 188
/src/app/blast/deltablast_app.cpp	88 299 300 355 370 410 469 499 546
/src/app/blast/psiblast_app.cpp	250 282 352 371
/src/app/blast/rpsblast_app.cpp	201 223
/src/app/blast/rpsblast_node.cpp	162 184
/src/app/blast/rpstblastn_app.cpp	198 217
/src/app/blast/rpstblastn_node.cpp	161 183
/src/app/blast/tblastn_app.cpp	273 300 336
/src/app/blast/tblastn_node.cpp	185 212 249
/src/app/blast/tblastx_app.cpp	183 203
/src/app/blastvdb/blast_formatter_vdb.cpp	299 310
/src/app/blastvdb/blast_vdb_app_util.cpp	50 59
/src/app/blastvdb/blast_vdb_app_util.hpp	55
/src/app/blastvdb/blastn_vdb.cpp	275 288
/src/app/blastvdb/tblastn_vdb.cpp	266 278 301 312
/src/app/cn3d/cn3d_blast.cpp	376
/src/app/igblast/igblastn.hpp	44
/src/app/igblast/igblastn_app.cpp	137 493
/src/app/igblast/igblastp_app.cpp	197 222
/src/app/rmblastn/rmblastn_app.cpp	144 157
/src/gui/widgets/edit/vectorscreen.cpp	162
/src/sample/app/blast/blast_demo.cpp	198
/src/sample/app/blast/remote_blast_demo.cpp	225

406 references in 99 files.